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基于全基因组SNP位点和性状特征解析我国野生肺形侧耳的遗传多样性
1
作者
岳园园
胡哲源
+3 位作者
何琪
黄晨阳
郑素月
赵梦然
《生物技术通报》
北大核心
2025年第3期282-293,共12页
【目的】探究我国野生肺形侧耳(Pleurotus pulmonarius)的遗传变异水平,以期为新品种选育提供优异亲本材料和数据支撑。【方法】利用全基因组重测序技术获得的SNP标记对37个野生肺形侧耳菌株进行遗传多样性分析,同时观测其菌丝培养特征...
【目的】探究我国野生肺形侧耳(Pleurotus pulmonarius)的遗传变异水平,以期为新品种选育提供优异亲本材料和数据支撑。【方法】利用全基因组重测序技术获得的SNP标记对37个野生肺形侧耳菌株进行遗传多样性分析,同时观测其菌丝培养特征和结实性等表型性状。【结果】在供试野生菌株中检测到的SNP数量范围在71 521-114 390个之间,菌株间遗传距离的平均值为0.180;聚类分析发现,大部分来自同一采集地点的菌株亲缘关系更为接近,与云南相比,采自陕西、四川、新疆地区的菌株亲缘关系较为接近。野生菌株在菌丝生长适宜温度、菌丝温度敏感性、菌丝恢复生长等培养特征上以及原基形成和分化、子实体成熟、菌盖颜色等结实特性方面呈现出丰富的表型多样性,基于表型特征的聚类分析结果表明,所有菌株在SM相似系数为0.52水平上能够按照原基能否正常分化分成两大组,这与主成分分析的类群划分结果高度一致。【结论】我国肺形侧耳野生种质资源遗传多样性丰富,具有良好的驯化利用潜力,野生菌株基因组水平上的遗传分化程度可能与其地理分布有关,与表型特征无明显相关性。
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关键词
秀珍菇
遗传变异
单核苷酸多态性
表型特征
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题名
基于全基因组SNP位点和性状特征解析我国野生肺形侧耳的遗传多样性
1
作者
岳园园
胡哲源
何琪
黄晨阳
郑素月
赵梦然
机构
河北工程大学园林与生态工程
学院
中国农业科学院农业资源与农业区划研究所、农业农村部农业微生物资源收集与保藏重点实验室、北方干旱半干旱耕地高效利用全国重点实验室
出处
《生物技术通报》
北大核心
2025年第3期282-293,共12页
基金
国家重点研发计划(2022YFD1200600)
现代农业产业技术体系建设专项(CARS20)。
文摘
【目的】探究我国野生肺形侧耳(Pleurotus pulmonarius)的遗传变异水平,以期为新品种选育提供优异亲本材料和数据支撑。【方法】利用全基因组重测序技术获得的SNP标记对37个野生肺形侧耳菌株进行遗传多样性分析,同时观测其菌丝培养特征和结实性等表型性状。【结果】在供试野生菌株中检测到的SNP数量范围在71 521-114 390个之间,菌株间遗传距离的平均值为0.180;聚类分析发现,大部分来自同一采集地点的菌株亲缘关系更为接近,与云南相比,采自陕西、四川、新疆地区的菌株亲缘关系较为接近。野生菌株在菌丝生长适宜温度、菌丝温度敏感性、菌丝恢复生长等培养特征上以及原基形成和分化、子实体成熟、菌盖颜色等结实特性方面呈现出丰富的表型多样性,基于表型特征的聚类分析结果表明,所有菌株在SM相似系数为0.52水平上能够按照原基能否正常分化分成两大组,这与主成分分析的类群划分结果高度一致。【结论】我国肺形侧耳野生种质资源遗传多样性丰富,具有良好的驯化利用潜力,野生菌株基因组水平上的遗传分化程度可能与其地理分布有关,与表型特征无明显相关性。
关键词
秀珍菇
遗传变异
单核苷酸多态性
表型特征
Keywords
Xiuzhengu
genetic variation
single nucleotide polymorphism
phenotypic characteristics
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
S646 [农业科学—蔬菜学]
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作者
出处
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1
基于全基因组SNP位点和性状特征解析我国野生肺形侧耳的遗传多样性
岳园园
胡哲源
何琪
黄晨阳
郑素月
赵梦然
《生物技术通报》
北大核心
2025
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