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东南沿海短绒野大豆两种代表性生境自然种群的空间遗传结构特征:种群内取样策略研究
1
作者
王浩辰
王克晶
+1 位作者
韩娟
李向华
《作物学报》
北大核心
2025年第11期2875-2885,共11页
短绒野大豆为国家二级保护植物,是我国重要的遗传资源,对栽培大豆育种有潜在的利用价值。由于自花授粉特性的基因流限制及环境异质性,短绒野大豆居群内的个体在空间分布格局上往往会出现遗传斑块。为探究短绒野大豆在人为干扰程度低的...
短绒野大豆为国家二级保护植物,是我国重要的遗传资源,对栽培大豆育种有潜在的利用价值。由于自花授粉特性的基因流限制及环境异质性,短绒野大豆居群内的个体在空间分布格局上往往会出现遗传斑块。为探究短绒野大豆在人为干扰程度低的普通天然居群和干扰程度高的墓地居群中的遗传结构差异,也为制定受干扰程度不同的居群样本取样策略,本研究利用24对新开发的物种特异SSR分子标记,分析了受干扰程度不同的短绒野大豆2个天然居群的遗传多样性和空间遗传结构。结果显示:(1)干扰程度高的墓地群天然居群(B)平均遗传多样性水平不低于干扰程度低的平地天然居群(A);(2)空间自相关分析表明,短绒野大豆居群内个体在遗传背景上存在空间遗传斑块,2种受干扰程度不同的生境居群遗传斑块大小存在差异:居群A在17.44 m空间范围内个体有显著亲缘关系,而居群B在14.59 m空间范围内个体有显著亲缘关系;(3)空间自相关分析和Mantel检验显示,人为干扰程度高的居群其植株个体间的遗传亲缘关系在空间距离维度上降低,空间自相关距离显著缩短;(4)通过使用Python模拟不同的取样数量,当Nei氏基因多样性指数、香农信息指数和有效等位基因数均达到居群总体的95%时,居群A取样至少需要20、30和30株,而居群B取样需要20、35和50株。根据本文的研究,建议通常的短绒野大豆种质居群取样时,取样数量至少保证30株,株间距离保持15~18 m。
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关键词
取样策略
遗传结构
遗传多样性
SSR标记
短绒野大豆
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职称材料
小豆SSR引物在绿豆基因组中的通用性分析
被引量：
29
2
作者
王丽侠
程须珍
+2 位作者
王素华
刘长友
梁辉
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第5期816-820,共5页
分析了187对小豆SSR引物在绿豆基因组中的可转移性,以期为绿豆分子遗传育种研究提供分析工具。结果表明,约75%的小豆SSR引物可在绿豆中有效扩增,但不同小豆连锁群SSR引物的可转移率存在差异。多态性分析发现80对引物中有28对在60份绿豆...
分析了187对小豆SSR引物在绿豆基因组中的可转移性,以期为绿豆分子遗传育种研究提供分析工具。结果表明,约75%的小豆SSR引物可在绿豆中有效扩增,但不同小豆连锁群SSR引物的可转移率存在差异。多态性分析发现80对引物中有28对在60份绿豆种质中可以检测到多态性,等位变异数从2-7不等,平均为2.9,PIC指数从0.02-0.69,平均为0.36。UPGMA聚类及主坐标分析表明,尽管同一省份的种质不能紧密聚在一起,但大多在聚类图上成簇状分布,说明相同来源的绿豆种质具有相似的遗传背景;此外,国外及我国边远地区的绿豆种质在遗传背景上与内部省份间存在明显差异。这些多态性SSR不仅可以有效用于绿豆分子遗传学研究,还可以用于不同来源绿豆种质资源的辅助鉴别。
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关键词
小豆
绿豆
SSR
可转移性
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职称材料
题名
东南沿海短绒野大豆两种代表性生境自然种群的空间遗传结构特征:种群内取样策略研究
1
作者
王浩辰
王克晶
韩娟
李向华
机构
中国农业科学院作物科学研究所资源中心
西北农林科技大学农
学院
出处
《作物学报》
北大核心
2025年第11期2875-2885,共11页
基金
国家重点研发计划项目(2021YFD1200103)资助。
文摘
短绒野大豆为国家二级保护植物,是我国重要的遗传资源,对栽培大豆育种有潜在的利用价值。由于自花授粉特性的基因流限制及环境异质性,短绒野大豆居群内的个体在空间分布格局上往往会出现遗传斑块。为探究短绒野大豆在人为干扰程度低的普通天然居群和干扰程度高的墓地居群中的遗传结构差异,也为制定受干扰程度不同的居群样本取样策略,本研究利用24对新开发的物种特异SSR分子标记,分析了受干扰程度不同的短绒野大豆2个天然居群的遗传多样性和空间遗传结构。结果显示:(1)干扰程度高的墓地群天然居群(B)平均遗传多样性水平不低于干扰程度低的平地天然居群(A);(2)空间自相关分析表明,短绒野大豆居群内个体在遗传背景上存在空间遗传斑块,2种受干扰程度不同的生境居群遗传斑块大小存在差异:居群A在17.44 m空间范围内个体有显著亲缘关系,而居群B在14.59 m空间范围内个体有显著亲缘关系;(3)空间自相关分析和Mantel检验显示,人为干扰程度高的居群其植株个体间的遗传亲缘关系在空间距离维度上降低,空间自相关距离显著缩短;(4)通过使用Python模拟不同的取样数量,当Nei氏基因多样性指数、香农信息指数和有效等位基因数均达到居群总体的95%时,居群A取样至少需要20、30和30株,而居群B取样需要20、35和50株。根据本文的研究,建议通常的短绒野大豆种质居群取样时,取样数量至少保证30株,株间距离保持15~18 m。
关键词
取样策略
遗传结构
遗传多样性
SSR标记
短绒野大豆
Keywords
sampling strategy
genetic structure
genetic diversity
SSR markers
Glycine tomentella
分类号
Q948 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
小豆SSR引物在绿豆基因组中的通用性分析
被引量：
29
2
作者
王丽侠
程须珍
王素华
刘长友
梁辉
机构
中国农业科学院作物科学研究所资源中心
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第5期816-820,共5页
基金
农业部行业专项(nyhyzx07-017
3-32)
+1 种基金
中央级科研院所社会公益研究专项(082060302-14)
国家自然科学基金项目(30871565)资助
文摘
分析了187对小豆SSR引物在绿豆基因组中的可转移性,以期为绿豆分子遗传育种研究提供分析工具。结果表明,约75%的小豆SSR引物可在绿豆中有效扩增,但不同小豆连锁群SSR引物的可转移率存在差异。多态性分析发现80对引物中有28对在60份绿豆种质中可以检测到多态性,等位变异数从2-7不等,平均为2.9,PIC指数从0.02-0.69,平均为0.36。UPGMA聚类及主坐标分析表明,尽管同一省份的种质不能紧密聚在一起,但大多在聚类图上成簇状分布,说明相同来源的绿豆种质具有相似的遗传背景;此外,国外及我国边远地区的绿豆种质在遗传背景上与内部省份间存在明显差异。这些多态性SSR不仅可以有效用于绿豆分子遗传学研究,还可以用于不同来源绿豆种质资源的辅助鉴别。
关键词
小豆
绿豆
SSR
可转移性
Keywords
Adzuki bean, Mungbean
SSR
Transferability
分类号
S522 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
东南沿海短绒野大豆两种代表性生境自然种群的空间遗传结构特征:种群内取样策略研究
王浩辰
王克晶
韩娟
李向华
《作物学报》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
小豆SSR引物在绿豆基因组中的通用性分析
王丽侠
程须珍
王素华
刘长友
梁辉
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
29
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职称材料
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