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大豆巢式关联作图(NAM)群体构建及花色和种皮色遗传分析
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作者 宋健 熊亚俊 +21 位作者 陈伊洁 徐瑞新 刘康林 郭庆元 洪慧龙 高华伟 谷勇哲 张丽娟 郭勇 阎哲 刘章雄 关荣霞 李英慧 王晓波 郭兵福 孙如建 闫龙 王好让 姬月梅 常汝镇 王俊 邱丽娟 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期556-575,共20页
巢式关联作图(Nested Association Mapping,NAM)群体在作物学遗传与育种研究中具有广泛的应用。本研究在前期大豆种质资源评价基础上,利用35份不同地区来源的代表性种质与中豆41(公共母本)杂交,构建了一套大豆NAM群体。PCA和聚类分析发... 巢式关联作图(Nested Association Mapping,NAM)群体在作物学遗传与育种研究中具有广泛的应用。本研究在前期大豆种质资源评价基础上,利用35份不同地区来源的代表性种质与中豆41(公共母本)杂交,构建了一套大豆NAM群体。PCA和聚类分析发现,不同亲本组合的RIL群体基本聚在一起,显示出清晰的遗传结构。利用该NAM群体亲本间花色和种皮色具有显著差异的RIL群体进行全基因组关联分析,定位到1个主要位点qFC13-1与花色显著关联,该位点与W1位点重合;定位到12个位点与种皮色显著相关,其中9个位点为3种以上方法共定位,3个位点为2种方法共定位,包括4个已知位点和8个新位点。研究结果表明,构建的NAM群体适于进行大豆相关性状遗传分析,为大豆复杂性状的遗传解析和育种实践提供了良好的基础材料。 展开更多
关键词 大豆 NAM群体 花色 种皮色 遗传分析
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低磷胁迫下大豆苗期根系性状全基因组关联分析 被引量:2
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作者 孙畅 刘美玲 +7 位作者 刘子君 杨光 梁腾月 周宣汝 赵悦如 张洛桐 谷勇哲 敖雪 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期663-676,共14页
大豆是喜磷作物,缺磷会导致大豆减产甚至无法正常生长。大豆根系性状是鉴定大豆耐低磷性的重要指标,因此,挖掘调控大豆低磷胁迫功能的相关基因对提高大豆低磷耐受性和大豆育种尤为关键。利用206份大豆种质资源,在低磷和常磷处理下对大... 大豆是喜磷作物,缺磷会导致大豆减产甚至无法正常生长。大豆根系性状是鉴定大豆耐低磷性的重要指标,因此,挖掘调控大豆低磷胁迫功能的相关基因对提高大豆低磷耐受性和大豆育种尤为关键。利用206份大豆种质资源,在低磷和常磷处理下对大豆根系形态性状进行表型鉴定,以低磷处理下根重、总根长、根总表面积、根总体积和相对根重、相对总根长、相对根总表面积、相对根总体积作为耐低磷性状鉴定指标,基于93 436个SNPs(single nucleotide polymorphisms)进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),筛选显著关联的SNPs位点并挖掘候选基因。结果表明:不同大豆种质的耐低磷性差异明显,低磷处理下的根重、总根长、根总体积和根总表面积的变化范围分别为0.04~0.75 g、700.95~4 300.12 cm、0.96~8.56 cm3和91.54~614.58 cm2,相对根重、相对总根长、相对根总体积和相对根总表面积的变化范围分别为0.34~2.07,0.49~1.78,0.52~1.96,0.4~1.67。全基因组关联分析共鉴定出49个与大豆耐低磷性显著相关的SNP位点,其中与低磷处理下根重、根总表面积、根总体积相关的SNP位点共有10个,与相对根重、相对根长、相对根总表面积和相对根总体积相关的SNP位点共有39个。通过单倍型分析与LD block分析得到候选基因2个,分别是在根中特异性表达为编码磷酸泛乙炔基转移酶相关的基因和α-葡聚糖磷酸化酶。qRT-PCR结果显示,低磷处理后GmYB1和GmYB3的表达量在耐低磷品种中显著高于低磷敏感品种。研究结果为深入了解大豆耐低磷胁迫的分子机制提供了理论参考及基因资源。 展开更多
关键词 大豆 低磷胁迫 根系性状 SNP GWAS 候选基因
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