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利用CRISPR/Cas9技术编辑GmphyA2基因创制大豆早熟突变体
被引量：
1
1
作者
张祥
韩佳楠
+3 位作者
于莉莉
周雅
王晓波
邱丽娟
《植物遗传资源学报》
北大核心
2025年第3期602-610,共9页
大豆对光周期的敏感性限制了优良大豆品种的推广种植。本研究通过降低大豆对光周期的敏感性,创制早熟且产量稳定的大豆新品种,扩大优良品种的种植范围。利用CRISPR/Cas9技术获得3个大豆GmphyA2基因纯合突变体。创制的GmphyA2突变体由于...
大豆对光周期的敏感性限制了优良大豆品种的推广种植。本研究通过降低大豆对光周期的敏感性,创制早熟且产量稳定的大豆新品种,扩大优良品种的种植范围。利用CRISPR/Cas9技术获得3个大豆GmphyA2基因纯合突变体。创制的GmphyA2突变体由于碱基缺失导致移码突变,均编码无PHY结构域的截短蛋白。本研究比较了GmphyA2突变体和野生型‘Jack’的生育期、株系和产量相关性状。与野生型相比,GmphyA2突变体在开花前期的GmFT2a和GmFT5a基因表达量显著提高,导致其开花时间提前5~6d,成熟期也提前了6~11d。尽管整体生育期有所缩短,但GmphyA2突变体的有效分枝数和单株粒数都显著增加,且单株粒重与野生型相比没有明显差异。这些结果表明,利用CRISPR/Cas9技术编辑GmphyA2创制了生育期缩短单株产量不变的大豆新种质,为早熟高产育种提供了新的基因资源。
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关键词
GmphyA2
早熟
产量
基因编辑
大豆
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职称材料
水稻抽穗期基因OsFD1的遗传多样性及单倍型分析
2
作者
王银婷
周雷娜
+3 位作者
吴比
李梓萱
逄洪波
郑晓明
《植物遗传资源学报》
北大核心
2025年第9期1744-1753,I0010-I0019,共20页
水稻(Oryza sativa L.)是全球重要的粮食作物,其抽穗期直接影响区域适应性和产量。OsFD1是调控水稻抽穗期的关键基因,但其遗传多样性及功能变异尚未充分研究。通过重测序技术对192份栽培稻和58份野生稻样本进行OsFD1基因的核苷酸多态性...
水稻(Oryza sativa L.)是全球重要的粮食作物,其抽穗期直接影响区域适应性和产量。OsFD1是调控水稻抽穗期的关键基因,但其遗传多样性及功能变异尚未充分研究。通过重测序技术对192份栽培稻和58份野生稻样本进行OsFD1基因的核苷酸多态性和单倍型分析,并结合抽穗期数据探讨其功能。结果表明,OsFD1基因编码区和启动子区共包含1个InDel和18个SNP变异,形成7种编码区单倍型(Chap,coding region haplotype)和6种启动子区单倍型(Phap,promoter region haplotype)。功能单倍型分析表明,OsFD1编码区的5个变异(21292259 bp,CCT缺失;21292352 bp,C→A;21292370 bp,T→C;21292477 bp,G→A;21292634 bp,T→C)与栽培稻抽穗期显著相关,且CCT缺失导致FAC^(Hd3a)形成过程中氢键缺失。启动子区分析发现,Aus稻在21289993 bp处发生T→A变异,导致GATA-motif元件缺失,而粳稻保留了完整的GATA-motif元件,可能与亚种间抽穗期差异相关。野生稻在OsFD1编码区未发现特有变异,表明栽培稻驯化过程中不同变异逐步固定于不同群体,同时栽培稻产生了新的变异,导致抽穗期多样性。OsFD1的自然变异和单倍型多样性为水稻适应不同光周期和气候条件提供了遗传基础,反映了水稻的适应性进化,并为分子育种提供了潜在靶点。进一步研究OsFD1的功能和调控机制将有助于精准调控抽穗期,推动水稻品种改良。
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关键词
水稻
抽穗期
OsFD1
单倍型
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职称材料
二项分布双边收尾概率和假设检验统计量的几处修正
3
作者
王建康
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期1361-1372,共12页
二项分布是广泛存在的一种离散型概率分布。服从二项分布B(n,p)的一个随机变量等于n个相互独立且服从贝努利分布B(1,p)的随机变量之和,二项分布包含参数p的估计与检验等同于贝努利分布参数p的估计与检验。本文修正常见教科书中有关二项...
二项分布是广泛存在的一种离散型概率分布。服从二项分布B(n,p)的一个随机变量等于n个相互独立且服从贝努利分布B(1,p)的随机变量之和,二项分布包含参数p的估计与检验等同于贝努利分布参数p的估计与检验。本文修正常见教科书中有关二项分布双边收尾概率计算和假设检验统计量构建中存在的3处问题。(1)对二项分布B(n,p)的取值概率pk(k=0,1,…,n)从小到大排序,排序后的概率用p_((k))表示,观测值k的双边收尾精确概率等于■;(2)二项分布B(n,p)参数p与给定值p0的差异显著性检验统计量被修正为■,该统计量在大样本条件下近似服从正态分布N(p–p0,1);(3)二项分布B(n1,p1)和B(n2,p2)的参数p1和p2差异显著性检验统计量被修正为■,该统计量在大样本条件下近似服从正态分布N(p1–p2,1)。修正后的双边收尾概率是精确值,不会出现概率大于1的问题。修正后的2个检验统计量无论原假设是否成立,其大样本近似正态分布的方差均为1,有利于准确研究备择假设条件下检验统计量的功效。此外,文中还介绍了小样本条件下二项分布参数的精确检验,对比分析了准确检验与近似检验的异同;讨论了修正统计量的理论基础,给出了小概率和大样本的判定标准,列出了贝努利分布参数检验与正态分布均值检验的异同。期望读者能够从中了解到假设检验与统计推断作为统计学核心研究内容的全貌。
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关键词
二项分布
正态分布
假设检验
检验统计量
修正
检验功效
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职称材料
题名
利用CRISPR/Cas9技术编辑GmphyA2基因创制大豆早熟突变体
被引量：
1
1
作者
张祥
韩佳楠
于莉莉
周雅
王晓波
邱丽娟
机构
安徽
农业
大学农
学院
中国农业科学院作物科学研究所/作物基因资源与育种国家重点实验室
出处
《植物遗传资源学报》
北大核心
2025年第3期602-610,共9页
基金
中国农业科学院重大科技任务(CAAS-ZDRW202301)。
文摘
大豆对光周期的敏感性限制了优良大豆品种的推广种植。本研究通过降低大豆对光周期的敏感性,创制早熟且产量稳定的大豆新品种,扩大优良品种的种植范围。利用CRISPR/Cas9技术获得3个大豆GmphyA2基因纯合突变体。创制的GmphyA2突变体由于碱基缺失导致移码突变,均编码无PHY结构域的截短蛋白。本研究比较了GmphyA2突变体和野生型‘Jack’的生育期、株系和产量相关性状。与野生型相比,GmphyA2突变体在开花前期的GmFT2a和GmFT5a基因表达量显著提高,导致其开花时间提前5~6d,成熟期也提前了6~11d。尽管整体生育期有所缩短,但GmphyA2突变体的有效分枝数和单株粒数都显著增加,且单株粒重与野生型相比没有明显差异。这些结果表明,利用CRISPR/Cas9技术编辑GmphyA2创制了生育期缩短单株产量不变的大豆新种质,为早熟高产育种提供了新的基因资源。
关键词
GmphyA2
早熟
产量
基因编辑
大豆
Keywords
GmphyA2
early maturity
yield
gene editing
soybean
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
水稻抽穗期基因OsFD1的遗传多样性及单倍型分析
2
作者
王银婷
周雷娜
吴比
李梓萱
逄洪波
郑晓明
机构
中国农业科学院作物科学研究所/作物基因资源与育种国家重点实验室
/
农业
农村部粮食
作物
遗传
资源
评价与利用
重点
实验室
崖州湾
国家
实验室
中国农业科学院
国家
南繁
研究
院
沈阳师范大学生命
科学
学院
出处
《植物遗传资源学报》
北大核心
2025年第9期1744-1753,I0010-I0019,共20页
基金
国家自然基金国际(地区)合作与交流项目(32261143465)
三亚崖州湾科技城科技专项(SCKJ-JYRC-2023-47)
海南省重点研发计划(ZDYF2022XDNY260)。
文摘
水稻(Oryza sativa L.)是全球重要的粮食作物,其抽穗期直接影响区域适应性和产量。OsFD1是调控水稻抽穗期的关键基因,但其遗传多样性及功能变异尚未充分研究。通过重测序技术对192份栽培稻和58份野生稻样本进行OsFD1基因的核苷酸多态性和单倍型分析,并结合抽穗期数据探讨其功能。结果表明,OsFD1基因编码区和启动子区共包含1个InDel和18个SNP变异,形成7种编码区单倍型(Chap,coding region haplotype)和6种启动子区单倍型(Phap,promoter region haplotype)。功能单倍型分析表明,OsFD1编码区的5个变异(21292259 bp,CCT缺失;21292352 bp,C→A;21292370 bp,T→C;21292477 bp,G→A;21292634 bp,T→C)与栽培稻抽穗期显著相关,且CCT缺失导致FAC^(Hd3a)形成过程中氢键缺失。启动子区分析发现,Aus稻在21289993 bp处发生T→A变异,导致GATA-motif元件缺失,而粳稻保留了完整的GATA-motif元件,可能与亚种间抽穗期差异相关。野生稻在OsFD1编码区未发现特有变异,表明栽培稻驯化过程中不同变异逐步固定于不同群体,同时栽培稻产生了新的变异,导致抽穗期多样性。OsFD1的自然变异和单倍型多样性为水稻适应不同光周期和气候条件提供了遗传基础,反映了水稻的适应性进化,并为分子育种提供了潜在靶点。进一步研究OsFD1的功能和调控机制将有助于精准调控抽穗期,推动水稻品种改良。
关键词
水稻
抽穗期
OsFD1
单倍型
Keywords
rice
heading date
OsFD1
haplotype
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
二项分布双边收尾概率和假设检验统计量的几处修正
3
作者
王建康
机构
中国农业科学院作物科学研究所/作物基因资源与育种国家重点实验室
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期1361-1372,共12页
基金
国家自然科学基金项目(31861143003)
中国农业科学院创新工程项目资助。
文摘
二项分布是广泛存在的一种离散型概率分布。服从二项分布B(n,p)的一个随机变量等于n个相互独立且服从贝努利分布B(1,p)的随机变量之和,二项分布包含参数p的估计与检验等同于贝努利分布参数p的估计与检验。本文修正常见教科书中有关二项分布双边收尾概率计算和假设检验统计量构建中存在的3处问题。(1)对二项分布B(n,p)的取值概率pk(k=0,1,…,n)从小到大排序,排序后的概率用p_((k))表示,观测值k的双边收尾精确概率等于■;(2)二项分布B(n,p)参数p与给定值p0的差异显著性检验统计量被修正为■,该统计量在大样本条件下近似服从正态分布N(p–p0,1);(3)二项分布B(n1,p1)和B(n2,p2)的参数p1和p2差异显著性检验统计量被修正为■,该统计量在大样本条件下近似服从正态分布N(p1–p2,1)。修正后的双边收尾概率是精确值,不会出现概率大于1的问题。修正后的2个检验统计量无论原假设是否成立,其大样本近似正态分布的方差均为1,有利于准确研究备择假设条件下检验统计量的功效。此外,文中还介绍了小样本条件下二项分布参数的精确检验,对比分析了准确检验与近似检验的异同;讨论了修正统计量的理论基础,给出了小概率和大样本的判定标准,列出了贝努利分布参数检验与正态分布均值检验的异同。期望读者能够从中了解到假设检验与统计推断作为统计学核心研究内容的全貌。
关键词
二项分布
正态分布
假设检验
检验统计量
修正
检验功效
Keywords
binomial distribution
normal distribution
hypothesis test
testing statistic
correction
testing power
分类号
O212.1 [理学—概率论与数理统计]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用CRISPR/Cas9技术编辑GmphyA2基因创制大豆早熟突变体
张祥
韩佳楠
于莉莉
周雅
王晓波
邱丽娟
《植物遗传资源学报》
北大核心
2025
1
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职称材料
2
水稻抽穗期基因OsFD1的遗传多样性及单倍型分析
王银婷
周雷娜
吴比
李梓萱
逄洪波
郑晓明
《植物遗传资源学报》
北大核心
2025
0
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下载PDF
职称材料
3
二项分布双边收尾概率和假设检验统计量的几处修正
王建康
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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