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甜菜品种(系)的ISSR标记数字指纹图谱构建及聚类分析(英文)
被引量:
19
1
作者
刘巧红
程大友
+3 位作者
杨林
罗成飞
孔凡江
吴玉梅
《农业工程学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2012年第S2期280-284,共5页
本文针对来源于荷兰的4个引进甜菜品种和国内的6个甜菜品系(其中2个为一年生野生甜菜)进行了ISSR指纹图谱构建和聚类分析研究。筛选出稳定性高且多态性好的6个引物用于试验。利用筛选的6条引物ISSR-PCR共扩增出51个条带,其中多态性条带...
本文针对来源于荷兰的4个引进甜菜品种和国内的6个甜菜品系(其中2个为一年生野生甜菜)进行了ISSR指纹图谱构建和聚类分析研究。筛选出稳定性高且多态性好的6个引物用于试验。利用筛选的6条引物ISSR-PCR共扩增出51个条带,其中多态性条带百分率为86.3%.利用该6条引物ISSR-PCR建立的指纹图谱能将试验中的全部甜菜品种都鉴定区分开。只利用2条引物L1和UBC846扩增的8个多态性条带构建了10个甜菜品种(系)的数字指纹识别码,该数字指纹图谱能完全区分10个甜菜品种(系),结果显示ISSR指纹图谱能非常有效的鉴定不同的甜菜品种。利用生物软件NTSYS-pc针对10个试验甜菜品种(系)的ISSR扩增条带进行遗传相似性聚类分析,结果显示10个甜菜品种(系)的相似系数为0.43与0.83之间,平均为0.62。利用非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析,结果显示10个甜菜品种(系)聚类为2个组和3个亚组。UPGMA聚类分析能清楚的显示10个甜菜群体间的遗传关系并且聚类结果与10个甜菜群体的特性一致,说明ISSR标记能用于甜菜不同群体间遗传距离的评估。
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关键词
主成分分析
农产品
品质控制
甜菜
ISSR标记
指纹图谱
遗传相似性
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职称材料
题名
甜菜品种(系)的ISSR标记数字指纹图谱构建及聚类分析(英文)
被引量:
19
1
作者
刘巧红
程大友
杨林
罗成飞
孔凡江
吴玉梅
机构
哈尔滨工业大学食品
科学
与工程
学院
中国农业科学院东北地理生态研究所
中国农业科学院
甜菜
研究所
出处
《农业工程学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2012年第S2期280-284,共5页
基金
National Natural Science Foundation,China(No.31071526)
National Natural Science Foundation of Heilongjiang Province,China(No.C201027,No.C200807)
Modern Agriculture Industry Technology Construction Special Fund,China(No.CARS2105)
文摘
本文针对来源于荷兰的4个引进甜菜品种和国内的6个甜菜品系(其中2个为一年生野生甜菜)进行了ISSR指纹图谱构建和聚类分析研究。筛选出稳定性高且多态性好的6个引物用于试验。利用筛选的6条引物ISSR-PCR共扩增出51个条带,其中多态性条带百分率为86.3%.利用该6条引物ISSR-PCR建立的指纹图谱能将试验中的全部甜菜品种都鉴定区分开。只利用2条引物L1和UBC846扩增的8个多态性条带构建了10个甜菜品种(系)的数字指纹识别码,该数字指纹图谱能完全区分10个甜菜品种(系),结果显示ISSR指纹图谱能非常有效的鉴定不同的甜菜品种。利用生物软件NTSYS-pc针对10个试验甜菜品种(系)的ISSR扩增条带进行遗传相似性聚类分析,结果显示10个甜菜品种(系)的相似系数为0.43与0.83之间,平均为0.62。利用非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析,结果显示10个甜菜品种(系)聚类为2个组和3个亚组。UPGMA聚类分析能清楚的显示10个甜菜群体间的遗传关系并且聚类结果与10个甜菜群体的特性一致,说明ISSR标记能用于甜菜不同群体间遗传距离的评估。
关键词
主成分分析
农产品
品质控制
甜菜
ISSR标记
指纹图谱
遗传相似性
Keywords
cluster analysis
agricultural products
quality control
sugar beet
ISSR markers
fingerprinting
genetic similarity
分类号
S1 [农业科学—农业基础科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甜菜品种(系)的ISSR标记数字指纹图谱构建及聚类分析(英文)
刘巧红
程大友
杨林
罗成飞
孔凡江
吴玉梅
《农业工程学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2012
19
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参考文献
引证文献
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