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辣椒GMS育性相关miRNA的鉴定和表达分析
1
作者
刘思月
刘辰
+2 位作者
郭金菊
达凤娇
沈火林
《中国瓜菜》
北大核心
2015年第4期6-12,共7页
研究辣椒花药中sRNA分布,筛选育性相关miRNA,通过miRNA及其靶基因的表达分析探讨miRNA对雄性育性的调控。利用高通量测序技术对辣椒细胞核雄性不育两用系处于小孢子单核靠边期的花药进行sRNA测序,同时分析两材料间miRNA的表达差异。通过...
研究辣椒花药中sRNA分布,筛选育性相关miRNA,通过miRNA及其靶基因的表达分析探讨miRNA对雄性育性的调控。利用高通量测序技术对辣椒细胞核雄性不育两用系处于小孢子单核靠边期的花药进行sRNA测序,同时分析两材料间miRNA的表达差异。通过qRT-PCR技术验证差异分析结果,并对miRNA及其靶基因在小孢子发育不同时期的表达模式进行分析。在构建的不育株和可育株两个文库中共发掘出857个可信度高的miRNA;筛选得到42个表达差异显著的miRNA;通过靶基因预测与注释,预测出的差异表达miRNA的靶基因中与繁殖有关的基因有152个,与生殖过程有关的基因有151个。通过qRT-PCR验证了选出的9条miRNA的存在,其表达差异与测序分析结果基本一致;单核靠边期多数miRNA负调控其靶基因,不同发育时期其调控模式会发生变化。本研究为揭示辣椒miRNA与雄性育性的关系提供了重要信息。
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关键词
辣椒
细胞核雄性不育
MIRNA
高通量测序
QRT-PCR
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职称材料
题名
辣椒GMS育性相关miRNA的鉴定和表达分析
1
作者
刘思月
刘辰
郭金菊
达凤娇
沈火林
机构
中国农业大学农学与生物技术学院·设施蔬菜生长发育调控北京市重点实验室
出处
《中国瓜菜》
北大核心
2015年第4期6-12,共7页
基金
国家自然科学基金项目(项目编号:31171972)
现代农业产业技术体系北京市果类蔬菜创新团队项目
文摘
研究辣椒花药中sRNA分布,筛选育性相关miRNA,通过miRNA及其靶基因的表达分析探讨miRNA对雄性育性的调控。利用高通量测序技术对辣椒细胞核雄性不育两用系处于小孢子单核靠边期的花药进行sRNA测序,同时分析两材料间miRNA的表达差异。通过qRT-PCR技术验证差异分析结果,并对miRNA及其靶基因在小孢子发育不同时期的表达模式进行分析。在构建的不育株和可育株两个文库中共发掘出857个可信度高的miRNA;筛选得到42个表达差异显著的miRNA;通过靶基因预测与注释,预测出的差异表达miRNA的靶基因中与繁殖有关的基因有152个,与生殖过程有关的基因有151个。通过qRT-PCR验证了选出的9条miRNA的存在,其表达差异与测序分析结果基本一致;单核靠边期多数miRNA负调控其靶基因,不同发育时期其调控模式会发生变化。本研究为揭示辣椒miRNA与雄性育性的关系提供了重要信息。
关键词
辣椒
细胞核雄性不育
MIRNA
高通量测序
QRT-PCR
Keywords
Pepper
Genic male sterility
miRNA
High-throughput sequencing
qRT-PCR
分类号
S641.3 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
辣椒GMS育性相关miRNA的鉴定和表达分析
刘思月
刘辰
郭金菊
达凤娇
沈火林
《中国瓜菜》
北大核心
2015
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