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2008年-2015年我国猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株遗传进化分析
被引量:
2
1
作者
张硕
张倩
+6 位作者
顾小雪
徐琦
宋晓晖
王传彬
吴佳俊
刘金华
周智
《动物医学进展》
北大核心
2021年第10期1-8,共8页
对2008年-2015年分离的56个PRRSV毒株进行全基因测序和序列比对,并对主要易变区Nsp2、GP5和非编码区进行分析。全基因分析结果显示,56个PRRSV均为美洲型PRRSV,其中54个毒株为高致病性PRRSV变异株,另外2个为类NADC30 PRRSV。54个高致病性...
对2008年-2015年分离的56个PRRSV毒株进行全基因测序和序列比对,并对主要易变区Nsp2、GP5和非编码区进行分析。全基因分析结果显示,56个PRRSV均为美洲型PRRSV,其中54个毒株为高致病性PRRSV变异株,另外2个为类NADC30 PRRSV。54个高致病性PRRSV变异株之间的同源性为95.2%~99.9%,与高致病性PRRSV变异株代表毒株JXA1的同源性为97.2%~99.3%。2个类NADC30分离株之间的同源性为99.9%,与NADC30 PRRSV代表毒株NADC30的同源性为95.4%。主要易变基因分析结果显示,非结构蛋白Nsp2和结构蛋白GP5仍在不断变异中。54个PRRSV变异毒株中有48个PRRSV变异株在非结构蛋白Nsp2发生30aa的不连续缺失,此外有6个高致病性PRRSV变异株在Nsp2区域还发生了其他缺失(其中1株多缺失12个核苷酸,1株多缺失19个核苷酸,2株多缺失29个核苷酸,1株多缺失48个核苷酸,1株多缺失120个核苷酸)。2个类NADC30 PRRSV非结构蛋白Nsp2存在131个核苷酸的不连续缺失。大部分分离株在重要结构蛋白GP5发生aa突变,尤其是糖基化位点的位置和数量发生了不同程度的变化。
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关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒
分离株
遗传变异
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职称材料
题名
2008年-2015年我国猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株遗传进化分析
被引量:
2
1
作者
张硕
张倩
顾小雪
徐琦
宋晓晖
王传彬
吴佳俊
刘金华
周智
机构
中国农业大学农业部动物流行病学与人畜共患病重点实验室
中国
动物
疫病预防控制中心国家/OIE猪繁殖与呼吸综合征参考
实验室
出处
《动物医学进展》
北大核心
2021年第10期1-8,共8页
基金
“十三五”国家重点研发计划项目(2018YFD0500800)。
文摘
对2008年-2015年分离的56个PRRSV毒株进行全基因测序和序列比对,并对主要易变区Nsp2、GP5和非编码区进行分析。全基因分析结果显示,56个PRRSV均为美洲型PRRSV,其中54个毒株为高致病性PRRSV变异株,另外2个为类NADC30 PRRSV。54个高致病性PRRSV变异株之间的同源性为95.2%~99.9%,与高致病性PRRSV变异株代表毒株JXA1的同源性为97.2%~99.3%。2个类NADC30分离株之间的同源性为99.9%,与NADC30 PRRSV代表毒株NADC30的同源性为95.4%。主要易变基因分析结果显示,非结构蛋白Nsp2和结构蛋白GP5仍在不断变异中。54个PRRSV变异毒株中有48个PRRSV变异株在非结构蛋白Nsp2发生30aa的不连续缺失,此外有6个高致病性PRRSV变异株在Nsp2区域还发生了其他缺失(其中1株多缺失12个核苷酸,1株多缺失19个核苷酸,2株多缺失29个核苷酸,1株多缺失48个核苷酸,1株多缺失120个核苷酸)。2个类NADC30 PRRSV非结构蛋白Nsp2存在131个核苷酸的不连续缺失。大部分分离株在重要结构蛋白GP5发生aa突变,尤其是糖基化位点的位置和数量发生了不同程度的变化。
关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒
分离株
遗传变异
Keywords
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus
isolates
genetic variation
分类号
S852.659.6 [农业科学—基础兽医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2008年-2015年我国猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株遗传进化分析
张硕
张倩
顾小雪
徐琦
宋晓晖
王传彬
吴佳俊
刘金华
周智
《动物医学进展》
北大核心
2021
2
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