中国三系杂交稻恢复系资源的遗传多样性 被引量：9

1

作者 丁立 齐永文 +4 位作者 张洪亮 张冬玲 王美兴 李自超 汤圣祥 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第10期1587-1594,共8页

以来自全国6个稻区16个省(市、自治区)及外引的128份三系杂交稻恢复系为试验材料,采用均匀分布于水稻12条染色体的36对SSR引物及9个表型性状标记进行遗传多样性分析。根据SSR标记检测结果,基于遗传距离的Neighbor-jointing聚类显示128... 以来自全国6个稻区16个省(市、自治区)及外引的128份三系杂交稻恢复系为试验材料,采用均匀分布于水稻12条染色体的36对SSR引物及9个表型性状标记进行遗传多样性分析。根据SSR标记检测结果,基于遗传距离的Neighbor-jointing聚类显示128份恢复系可分为6个类群,籼亚种(83.2%)和野败型(82.6%)大多数分布于类群1和类群2,粳亚种(81.5%)和BT型(78.6%)大部分聚在类群3,红莲型(75%)相对集中于类群1。系谱分析显示,含有IR24血缘的材料分布于4个聚类群,而明恢63及其衍生系则分布非常集中。36对SSR引物在128份恢复系中共检测出281个等位变异,平均每个位点8.0个,平均遗传多样性指数(He)为0.6190,其中籼亚种(0.5770)略高于粳亚种(0.5656),但未达显著水平。按恢保类型,BT型(0.5816)>野败型(0.5705)>红莲型(0.4989),野败型与BT型无显著差异,但二者均显著高于红莲型。按不同地理来源,He呈现南方稻区大于北方稻区,以华中双单季稻稻区(0.6057)最高,与其他稻区差异极显著;其次为西南高原单双季稻稻区(0.5326);华北单季稻稻区(0.3902)最小,与其他稻区也差异极显著。表型性状检测的标记表明,平均Shannon-Weiner多样性指数为1.3980,其中籼、粳亚种分别为1.3746和1.3789,未达显著差异;不同恢保类型表现为BT型(1.4026)>野败型(1.3567)>红莲型(1.1732)。表型性状与SSR标记结果表现出一致性,相关系数分别为0.9981*(按亚种)、0.9418(按恢保类型)和0.8835**(按稻区)。 展开更多

关键词 三系杂交稻 恢复系 遗传多样性

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水稻不同基因型全生育期耐低磷能力的鉴定、评价指标 被引量：10

2

作者 李华慧 辜琼瑶 +2 位作者 严洪斌 卢义宣 李自超 《西南农业学报》 CSCD 2007年第5期1036-1039,共4页

本试验对前人用不同方法筛选出的98份耐低磷种质在同一条件下进行全生育期耐低磷能力研究,结果表明各品种在低磷条件下生长,各性状均表现出不同程度的减弱。具体表现为抽穗期延迟,株高变矮,分蘖减弱,籽粒重减轻,生物重降低。通过水稻主... 本试验对前人用不同方法筛选出的98份耐低磷种质在同一条件下进行全生育期耐低磷能力研究,结果表明各品种在低磷条件下生长,各性状均表现出不同程度的减弱。具体表现为抽穗期延迟,株高变矮,分蘖减弱,籽粒重减轻,生物重降低。通过水稻主要农艺性状相对值的变异范围、平均值以及它们之间的相关性分析,认为以相对单株籽粒重和相对分蘖数相结合作为水稻全生育期耐低磷能力的鉴定指标即可。同时鉴定出23个典型耐低磷品种。这些材料可以作为进一步进行耐低磷的机理及其分子研究的基础材料。 展开更多

关键词 水稻 全生育期 耐低磷 鉴定 评价 指标

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转mtlD基因和BADH基因旱稻苗期耐盐性研究 被引量：3

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作者 张丽 张洪亮 李自超 《西南农业学报》 CSCD 2005年第5期621-624,共4页

对同时含有mtlD和BADH基因的旱稻,只含mtlD基因或只含BADH基因的旱稻,非转基因旱稻三者在盐胁迫下的表型,生长速率,相对电导率以及K+/Na+含量的比较,发现它们的耐盐性的关系是:同时含有mtlD和BADH基因旱稻>只含mtlD基因或只含BADH旱... 对同时含有mtlD和BADH基因的旱稻,只含mtlD基因或只含BADH基因的旱稻,非转基因旱稻三者在盐胁迫下的表型,生长速率,相对电导率以及K+/Na+含量的比较,发现它们的耐盐性的关系是:同时含有mtlD和BADH基因旱稻>只含mtlD基因或只含BADH旱稻>非转基因旱稻,从而推断出mtlD基因和BADH基因在旱稻的耐盐性方面具有协同(或累加)效应。通过试验比较,还发现只含有mtlD基因和只含有BADH基因的旱稻的耐盐性没有明显差别,从而推断出mtlD基因和BADH基因对植物的耐盐性的贡献差异不显著。此外,已经得到的转基因材料也可以继续作为进一步转化的材料,这为我们进行多基因转化改良植物提供了一条新的途径。 展开更多

关键词 早稻 1-磷酸甘露醇脱氢酶(mtlD) 甜菜碱醛脱氢酶(BADH) 耐盐性

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野生型和Msp1突变体水稻减数分裂期转录水平上的基因表达分析(英文)

4

作者 周维 赵继新 +4 位作者 楼辰军 Krishna Jagadish 周雷 John Bennett 李自超 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2009年第11期69-78,共10页

【目的】深入探索水稻减数分裂期间配子体发育的分子机理,大规模发掘与水稻配子体发育相关的基因,以便更有把握地利用基因工程手段改造水稻配子体发育的进程。【方法】利用22KAilentcDNA芯片,在全基因组水平上对野生型水稻和Msp1突变体... 【目的】深入探索水稻减数分裂期间配子体发育的分子机理,大规模发掘与水稻配子体发育相关的基因,以便更有把握地利用基因工程手段改造水稻配子体发育的进程。【方法】利用22KAilentcDNA芯片,在全基因组水平上对野生型水稻和Msp1突变体在减数分裂期间表达基因的表达情况进行研究和分析。【结果】有208个基因在野生型和Msp1突变体中的表达差异极显著(P≤0.01,lgRatio≥0.2);对这些基因的核酸序列进行分析、GO(GeneOntology)注释以及功能预测后,将其划归为18个大类,分别涉及到GTP、DNABinding、细胞壁、激酶活性、叶绿体、减数分裂、胚珠、染色体、花粉囊、内膜、细胞分裂、泛素、转运、代谢、蛋白解、Ca2+结合、RNA结合、以及未知功能等;统计分析表明,有99个基因与染色体有关,占总数的47.60%;39个基因与内膜系统有关,占总数的18.75%;有1个基因与减数分裂紧密相关,3个基因与Ca2+结合过程有关;另外有3个基因在Msp1突变体中的表达极显著高于野生型,表明这3个基因很可能参与了绒粘层的发育调控。基因芯片和RT-PCR检测结果表明,水稻基因AK070642特异于绒粘层,说明其参与了绒粘层的发育调控。【结论】研究通过基因芯片技术,将野生型水稻与其Msp1突变体在减数分裂期间表达基因的表达情况进行大规模对比后发现,有208个基因分别从细胞代谢、绒毡层的发育、离子转运、核酸代谢、激酶活性等方面调控水稻的减数分裂过程,为深入理解水稻减数分裂和配子体发育的分子机理提供了实验支撑。 展开更多

关键词 水稻 cDNA基因芯片 Msp1突变体 野生型 减数分裂 配子体发育

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水、旱栽培条件下稻谷粒型和粒重的相关分析及其QTL定位 被引量：25

5

作者 郭咏梅 穆平 +2 位作者 刘家富 李自超 卢义宣 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期50-56,共7页

为了解水、旱栽培条件下水稻粒形和粒重的表型及QTL变化，以陆稻品种IRAT109和水稻品种越富构建的双单倍体群体为材料，系统分析了稻谷粒长、粒宽、粒重及长宽比在水、旱栽培条件下的相关性，并进行了数量性状基因位点的比较定位。结果... 为了解水、旱栽培条件下水稻粒形和粒重的表型及QTL变化，以陆稻品种IRAT109和水稻品种越富构建的双单倍体群体为材料，系统分析了稻谷粒长、粒宽、粒重及长宽比在水、旱栽培条件下的相关性，并进行了数量性状基因位点的比较定位。结果表明，水、旱条件下，粒长与长宽比和粒重均呈极显著正相关；粒宽与长宽比呈极显著负相关，与粒重极显著正相关，4个性状在水、旱条件间相关性都达极显著正相关。其中粒长的相关系数最高，达0．817，粒宽的相关系数最低，为0．457。表明粒长受水分影响最小而粒宽受水分影响较大。粒重、长宽比介于二者之间。两种条件下共检测到14个QTLs，分布于水稻1、5、6、7、10和12染色体上，其中控制粒长的5个，LOD值为1．93—5．11，贡献率为5．97％-28．85％；控制粒宽的1个，LOD值为2．39，贡献率为12．76％；控制长宽比的3个，LOD值为2．08-4．60。贡献率为7．78％。21．89％；控制粒重的5个，LOD值为2．68—9．45，贡献率为4．1％-14．8％。其中控制粒长的qGL-5及控制粒重的qGWt-1a和qGWt-1b在水、旱条件下均能检测到，在抗旱育种中可用于分子标记辅助选择籽粒性状。QTL分析的结果进一步验证了表型分析结果，粒宽相对易受土壤水分影响，粒长、粒重和长宽比，受水分胁迫影响较小，遗传比较稳定。 展开更多

关键词 水稻 粒型 粒重 加倍单倍体群体(DH系) 数量性状基因座位(QTL) 水、旱栽培

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杂交稻部分不育系与恢复系的SSR分类 被引量：31

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作者 贺浩华 罗小金 +5 位作者 朱昌兰 贺晓鹏 傅军如 孙俊立 张洪亮 李自超 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期169-175,共7页

选用分布于水稻(Oryza sativaL.)12条染色体上的36对SSR(simple sequence repeats)引物,分析了5个光温敏核不育系、7个细胞质雄性不育系及54份来自不同生态类型的恢复系或品种的遗传差异。在供试材料中共检测出300条多态性片段,平均每对... 选用分布于水稻(Oryza sativaL.)12条染色体上的36对SSR(simple sequence repeats)引物,分析了5个光温敏核不育系、7个细胞质雄性不育系及54份来自不同生态类型的恢复系或品种的遗传差异。在供试材料中共检测出300条多态性片段,平均每对SSR引物检测到8.33条。分析结果表明:(1)SSR标记明确地把供试的66份水稻材料中的65份区分开来,和已知系谱的亲缘关系多数吻合,与表型性状聚类结果也有一定的相似性。(2)以GD=0.73为标准,可准确地将籼稻、粳稻、野生稻三大类区分开;以GD=0.63为标准,又可区分出籼稻大类中带有粳稻或野生稻血缘的品种。表明SSR标记对籼稻、粳稻、野生稻品种的分类灵敏度高、结果可靠;并筛选出可用于鉴别水稻籼粳类型的10对特异性引物。(3)以GD=0.56为标准,将供试材料划分在8个生态类型中,为生产上杂优组合亲本的选配提供了一些有益的参考。同时,生产上常用的一些杂交稻亲本划分在不同的生态类型中,表明强优势组合亲本间的遗传差异一般较大。 展开更多

关键词 杂交水稻 分类 SSR标记 杂种优势生态型 DNA指纹图谱

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水、旱栽培条件下稻米主要品质性状的比较研究 被引量：24

7

作者 郭咏梅 穆平 +2 位作者 刘家富 卢义宣 李自超 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第11期1443-1448,共6页

以旱稻品种IRAT109与水稻品种越富杂交构建的DH群体的116个株系及其亲本,在水、旱2种栽培条件下种植,研究了稻米加工、外观、蒸煮和营养等品质性状的变化规律及其各品质性状间的相关性。结果表明,在11个稻米品质性状中,蛋白质含量、整... 以旱稻品种IRAT109与水稻品种越富杂交构建的DH群体的116个株系及其亲本,在水、旱2种栽培条件下种植,研究了稻米加工、外观、蒸煮和营养等品质性状的变化规律及其各品质性状间的相关性。结果表明,在11个稻米品质性状中,蛋白质含量、整精米率、胶稠度和碱消值等4个性状,水、旱2种不同栽培条件下差异较大,说明这些性状受水分条件影响较大;粒长、粒宽、直链淀粉含量和垩白率也有一定的差异,一定程度受土壤水分环境影响。旱栽条件下稻米蛋白质含量、整精米率、胶稠度、碱消值等均有不同程度的升高,其中蛋白质含量平均提高37.9%,平均增加3.02个含量百分点,而垩白率下降,稻米米粒变小,总体上旱栽稻米品质有变优趋势。糙米率、精米率和长宽比在2种栽培条件下没有差异,基本上不受土壤水分环境影响。此外,对同一品质性状在水、旱2种不同栽培条件下相关性分析,表明加工品质性状的基因与环境互作较大,外观、蒸煮和营养等品质性状比较稳定。因此,通过水稻和旱稻相互杂交,可将旱稻的抗旱基因导入外观品质、蒸煮、食用品质以及营养品质优良的目标水稻亲本中,选育出抗旱、优质的水稻或旱稻品种。 展开更多

关键词 水稻 水 旱种植 品质性状 双单倍体(DH)群体 相关分析

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低磷胁迫下水稻产量性状变化及其QTL定位 被引量：20

8

作者 穆平 黄超 +3 位作者 李君霞 刘立峰 刘弋菊 李自超 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期1137-1142,共6页

为研究低磷胁迫对水稻产量及其构成因素QTL表达的影响,以耐低磷旱稻IRAT109和磷敏感水稻越富杂交的116个株系的DH群体为材料,在低磷和正常栽培条件下,调查了千粒重、结实率、有效穗数、穗粒数及单株产量等性状。结果表明,结实率、有效... 为研究低磷胁迫对水稻产量及其构成因素QTL表达的影响,以耐低磷旱稻IRAT109和磷敏感水稻越富杂交的116个株系的DH群体为材料,在低磷和正常栽培条件下,调查了千粒重、结实率、有效穗数、穗粒数及单株产量等性状。结果表明,结实率、有效穗数和单株产量对低磷胁迫的敏感性较大,而千粒重、穗粒数对低磷胁迫的敏感性较小。利用水稻分子连锁图中94个RFLP标记和71个SSR标记,依据以上5性状低磷胁迫下与对照的差值进行QTL定位。共检测出17个QTL,其中12个对表型变异的贡献率大于10%。3、6和7号染色体上3个标记区域存在QTL成簇分布,这些高贡献率QTL及成簇分布QTL可作为水稻耐低磷产量性状分子育种的重要候选区域。 展开更多

关键词 水稻 低磷胁迫 产量性状 QTL

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水、旱稻根基粗和抗旱系数QTL的标记辅助选择及验证(英文) 被引量：5

9

作者 刘立峰 穆平 +3 位作者 张洪亮 王毅 曲延英 李自超 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期189-196,共8页

利用水、早稻杂交、回交所产生的4个分离群体对RIL群体定位到的抗旱相关的根基粗、抗旱系数2个QTL进行了选择验证。结果表明，根基粗、抗旱系数QTL的两侧标记在不同群体、不同的遗传背景中遗传稳定。在旱田种植条件下，YIBC1、JIBC1和JI... 利用水、早稻杂交、回交所产生的4个分离群体对RIL群体定位到的抗旱相关的根基粗、抗旱系数2个QTL进行了选择验证。结果表明，根基粗、抗旱系数QTL的两侧标记在不同群体、不同的遗传背景中遗传稳定。在旱田种植条件下，YIBC1、JIBC1和JIF2 3个分离群体携带有根基粗QTL brt4．1两侧标记有利等位基因的个体与未携带brt4．1两侧标记有利等位基因的个体均值差为0．05～0．06mm，均达到显著或极显著水平，MAS效应为5．05％～6．12％；利用抗旱系数QTL idr6．1两侧标记进行选择时，入选个体的单株产量均值差为5．04～8．18g，均达到显著或极显著水平，MAS效应为34．89％～58．88％。用根基粗、抗旱系数2个QTL的两侧标记同时进行选择时，入选个体的根基粗、单株产量均值差分别为0．06～0．08mm、4．88～11．15g，同样达到显著或极显著水平，MAS效应分别高达6．06％～8．16％和39．91％～70．48％。旱田3个分离群体基于双标记、单标记选择结果表明，发生在brt4．1、idr6．1标记区间的单交换值分别为4．32％、10．27％，利用brt4．1、idr6．1单侧标记进行选择也获得了较好的选果。在水田种植条件下，YIBC1群体携带有根基粗、抗旱系数QTL两侧标记有利等位基因的个体与没有携带QTL有利等位基因的个体均值差异均不显著，表明brt4．1和idr6．1为旱田特异表达。4个分离群体的选择结果验证了QTL定位的真实性、可靠性。另外，还对QTL及其两侧标记的选择效应及水旱稻抗旱育种策略进行了探讨。 展开更多

关键词 水稻 旱稻 根基粗 抗旱系数 QTL 标记辅助选择 验证

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云南软米品质特性比较研究 被引量：9

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作者 辜琼瑶 刘家富 +3 位作者 李自超 卢义宣 涂建 班洪兴 《西南农业学报》 CSCD 2006年第5期787-790,共4页

软米是云南特有的优质米资源，但目前对软米的品质特征仅限于定性的描述。因此，为更有效地利用云南省这一独特的优质米资源，本研究将云南软米与粘米、糯米进行外观品质、碾磨品质、蒸煮食味品质以及营养品质的比较研究。经方差分析表... 软米是云南特有的优质米资源，但目前对软米的品质特征仅限于定性的描述。因此，为更有效地利用云南省这一独特的优质米资源，本研究将云南软米与粘米、糯米进行外观品质、碾磨品质、蒸煮食味品质以及营养品质的比较研究。经方差分析表明，3种类型的稻米在粒长、粒宽、长／宽、直链淀粉含量、胶稠度以及蛋白质含量上存在显著差异，尤其在直链淀粉含量上差异极显著（F=119．485^＊＊）。指出可以把粒型〉3．0，直链淀粉含量7．1％-15．0％，胶稠度45～80mm，蛋白质含量〈9％，并且亲本的系谱中有云南软米地方品种的材料初步鉴定为软米材料。并提出一些加快云南软米资源研究及育种方向的建议，旨在为加快软米育种与生产提供参考。 展开更多

关键词 软米 外观品质 碾磨品质 蒸煮食味品质 营养品质

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以水稻“云恢290”为背景的导入系的构建及筛选鉴定

11

作者 辜琼瑶 卢义宣 +6 位作者 谭春艳 李华慧 李自超 刘晓利 奎丽梅 郭咏梅 张竹仙 《西南农业学报》 CSCD 2007年第1期6-10,共5页

对从国际网络征集的100份材料，进行了农艺性状的考察，稻瘟病和白叶枯病的鉴定，筛选出了一批农艺性状优良，抗稻瘟病、白叶枯病和双抗性较好的资源，为分子育种亲本材料的有效利用和后代的筛选提供参考。同时对用籼型优质软米品种“云... 对从国际网络征集的100份材料，进行了农艺性状的考察，稻瘟病和白叶枯病的鉴定，筛选出了一批农艺性状优良，抗稻瘟病、白叶枯病和双抗性较好的资源，为分子育种亲本材料的有效利用和后代的筛选提供参考。同时对用籼型优质软米品种“云恢290”为受体材料，以从国际网络征集的100份材料为供体材料。进行了大规模的杂交，2—3次回交，2～3次自交，所构建的约2510份近等基因导入系。进行了抗稻瘟病、抗旱、耐寒和蒸煮食味品质方面的筛选鉴定，获得了一批有目标性状的近等基因导入系，为新基因的发掘、新品种的选育提供了重要的基础材料。并选育了2个新品种，其中有1个已通过品种审定。 展开更多

关键词 近等基因导入系 筛选 分子育种 水稻

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旱稻导入系碾磨品质和垩白粒率的QTL定位及其与土壤水分的互作分析 被引量：2

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作者 李俊周 付春阳 李自超 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期831-838,共8页

以优质水稻品种越富为遗传背景,具有旱稻品种IRAT109导入片段的271份导入系为材料,在水、旱田2个土壤水分环境下调查糙米率、精米率、整精米率和垩白粒率4个品质性状,研究旱田栽培对稻米品质性状的影响,进行QTL定位及基因型与环境的互... 以优质水稻品种越富为遗传背景,具有旱稻品种IRAT109导入片段的271份导入系为材料,在水、旱田2个土壤水分环境下调查糙米率、精米率、整精米率和垩白粒率4个品质性状,研究旱田栽培对稻米品质性状的影响,进行QTL定位及基因型与环境的互作分析。结果表明,整精米率和垩白粒率易受土壤水分环境的影响,糙米率和精米率相对稳定。适当水分胁迫能提高稻米的整精米率,减少垩白粒率。利用混合线性模型,在水、旱田条件下共检测到4个品质性状的10个加性QTL和2对上位性互作QTL,分别位于第3、4、7、8和9染色体。3个加性QTL(qMR9、qHMR7和qHMR9)和一对上位性互作QTL(qHMR3～qHMR9)的贡献率大于10%。7个QTL与前人研究结果相一致。第4染色体RM1112～RM1272和第9染色体RM1189～RM410是QTL集中分布的区域。根据不同性状对干旱胁迫的反应特点,分别选择水、旱田条件下贡献率大、稳定的QTL或者具有旱田特异性的QTL,进行标记辅助聚合育种是培育抗旱、优质稻的一个有效途径。 展开更多

关键词 稻米 碾磨品质 垩白粒率 QTL与环境互作 导入系

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