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利用SSR标记分析水稻亲本间遗传距离与杂种优势的关系
被引量：
30
1
作者
罗小金
贺浩华
+4 位作者
彭小松
余秋英
孙俊立
张洪亮
李自超
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
2006年第2期209-214,共6页
利用5个光温敏核不育系与40个恢复系(品种)配制了200个组合,应用SSR标记估算了这5个不育系与40个恢复系之间的遗传距离,分析了遗传距离与杂种优势的关系。结果表明:(1)不同材料、不同遗传距离范围之间,遗传距离与单株产量以及有效穗数...
利用5个光温敏核不育系与40个恢复系(品种)配制了200个组合,应用SSR标记估算了这5个不育系与40个恢复系之间的遗传距离,分析了遗传距离与杂种优势的关系。结果表明:(1)不同材料、不同遗传距离范围之间,遗传距离与单株产量以及有效穗数、穗长、每穗粒数、着粒密度、结实率、千粒重、单株产量7个性状超亲优势的相关性有很大差别,表现出很复杂的关系。(2)田丰S与父本遗传距离在0.6286～2.5257之间时,F1单株产量及其超亲优势与遗传距离极显著相关;培矮64S与父本遗传距离在0.8247～1.5315之间时,F1单株产量与遗传距离显著相关。(3)所有两系组合亲本间遗传距离在0.5333～1.5之间时,F1单株产量超亲优势与遗传距离显著相关;遗传距离在0.5333～1.0之间时,F1单株产量与遗传距离显著相关,遗传距离分别在1.0～1.5、0.5333～1.5和0.5333～2.5257之间时极显著相关。(4)另外,F1单株产量与遗传距离的相关程度普遍高于其超亲优势与遗传距离的相关程度。
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关键词
SSR标记
遗传距离
水稻杂种优势
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职称材料
利用极端材料定位水稻粒形性状数量基因位点
被引量：
15
2
作者
张强
姚国新
+3 位作者
胡广隆
汤波
陈超
李自超
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第5期784-792,共9页
利用极端大粒材料GSL156(千粒重71.9g)与特小粒材料川七(千粒重12.1g,轮回亲本)杂交、回交获得的BC2F2 216个个体为作图群体,在北京进行稻谷粒长、粒宽、粒厚、长宽比、千粒重等粒形性状的鉴定。采用单标记分析和复合区间作图法,利用SS...
利用极端大粒材料GSL156(千粒重71.9g)与特小粒材料川七(千粒重12.1g,轮回亲本)杂交、回交获得的BC2F2 216个个体为作图群体,在北京进行稻谷粒长、粒宽、粒厚、长宽比、千粒重等粒形性状的鉴定。采用单标记分析和复合区间作图法,利用SSR标记对粒形性状进行数量性状基因座检测。结果表明,上述粒形性状在BC2F2群体均呈正态连续分布,表现为由多基因控制的数量性状;共检测到与粒形性状相关的QTL28个,分布于第1、第2、第3、第4、第5、第6和第12染色体上。其中qGL3-2、qGL3-3、qGT12-1、qGT2-1、qGT5-1、qGW1-1、qGW12-1、qGW2-1、qGW5-1、qRLW3-1、qTGW12-1、qTGW2-1、qTGW3-3和qTGW5-1对表型变异的贡献率分别为13.70%、52.51%、21.13%、18.79%、20.92%、14.59%、18.33%、30.03%、20.05%、24.53%、13.47%、11.43%、21.30%和15.68%,为主效QTL。其中,第3染色体上检测出来的QTL最多。在所有检测到的28个QTL中,6个QTL的增效等位基因来源于小粒亲本川七,而其余QTL的增效等位基因均来源于大粒亲本GSL156,基因作用方式主要表现为加性或部分显性。第3染色体RM7580～RM8208区间是分别与粒宽、长宽比和千粒重相关的3个主效QTL的共同标记区间,第2染色体的RM7636～RM5812区间、第5染色体的RM3351～RM26区间和第12染色体的RM1103～RM17区间是分别与粒宽、粒厚和千粒重相关的3个主效QTL的共同标记区间,这些区间对粒形贡献率较大,为进一步精细定位或克隆这些新的粒重或粒形QTL奠定了基础。同时大粒亲本对稻谷粒长、粒宽、粒厚和千粒重等性状的增效作用显著。
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关键词
水稻
粒形性状
微卫星标记
数量性状基因座
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职称材料
水稻(Oryza sativa L.)α-淀粉酶基因的进化及组织表达模式
被引量：
10
3
作者
廖登群
张洪亮
+1 位作者
李自超
John BENNETT
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期17-27,共11页
α-淀粉酶在植物特别是谷类萌发种子淀粉降解中具有重要作用。水稻α-淀粉酶基因的结构、进化和表达研究已有报道,但多集中于OsAmy1和OsAmy3这两个亚族内基因间以及发芽种子中。不同亚族间的基因结构、进化及更多组织和时期的表达特点...
α-淀粉酶在植物特别是谷类萌发种子淀粉降解中具有重要作用。水稻α-淀粉酶基因的结构、进化和表达研究已有报道,但多集中于OsAmy1和OsAmy3这两个亚族内基因间以及发芽种子中。不同亚族间的基因结构、进化及更多组织和时期的表达特点尚缺乏细致研究。本研究通过TblastN同源性比对及保守结构域分析揭示水稻基因组含有11个α-淀粉酶基因。生物信息学分析、系统进化树构建及半定量RT-PCR分析表明,该家族基因在结构上发生了明显的分化,具有清晰的进化层次,OsAmy5A和OsAmy4A是家族中较原始状态的基因;在表达和功能上也发生了明显分化,进化水平较高的基因发生了明显的时空表达特异性分化。OsAmy1A、OsAmy3A及OsAmy3D和OsAmy3E分别在保证种子植物世代传递、维持种子休眠过程中胚的微弱生命活动及保证种子萌发过程中能量的稳定持续供应上具有重要作用。
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关键词
水稻
Α-淀粉酶
基因结构
进化
表达
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职称材料
题名
利用SSR标记分析水稻亲本间遗传距离与杂种优势的关系
被引量：
30
1
作者
罗小金
贺浩华
彭小松
余秋英
孙俊立
张洪亮
李自超
机构
江西
农业
大学
作物
遗传
育种研究室
中国农业大学农业部作物基因组学与遗传改良重点实验室/北京市作物遗传改良重点实验室
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
2006年第2期209-214,共6页
基金
江西省自然科学基金项目(0430062)
江西省攻关计划项目
文摘
利用5个光温敏核不育系与40个恢复系(品种)配制了200个组合,应用SSR标记估算了这5个不育系与40个恢复系之间的遗传距离,分析了遗传距离与杂种优势的关系。结果表明:(1)不同材料、不同遗传距离范围之间,遗传距离与单株产量以及有效穗数、穗长、每穗粒数、着粒密度、结实率、千粒重、单株产量7个性状超亲优势的相关性有很大差别,表现出很复杂的关系。(2)田丰S与父本遗传距离在0.6286～2.5257之间时,F1单株产量及其超亲优势与遗传距离极显著相关;培矮64S与父本遗传距离在0.8247～1.5315之间时,F1单株产量与遗传距离显著相关。(3)所有两系组合亲本间遗传距离在0.5333～1.5之间时,F1单株产量超亲优势与遗传距离显著相关;遗传距离在0.5333～1.0之间时,F1单株产量与遗传距离显著相关,遗传距离分别在1.0～1.5、0.5333～1.5和0.5333～2.5257之间时极显著相关。(4)另外,F1单株产量与遗传距离的相关程度普遍高于其超亲优势与遗传距离的相关程度。
关键词
SSR标记
遗传距离
水稻杂种优势
Keywords
SSR marker
Genetic distance
Rice heterosis
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
利用极端材料定位水稻粒形性状数量基因位点
被引量：
15
2
作者
张强
姚国新
胡广隆
汤波
陈超
李自超
机构
中国农业大学农业部作物基因组学与遗传改良重点实验室/北京市作物遗传改良重点实验室
吉林省
农业
科
学
院水稻研究所
孝感
学
院生命科
学
学
院
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第5期784-792,共9页
基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2010CB129504)
国家科技支撑计划项目(2009BADA2B01)
+2 种基金
国家自然科学基金项目(30671281
31000699)
引进国际先进农业科学技术计划(948计划)项目(2011-G2B)资助
文摘
利用极端大粒材料GSL156(千粒重71.9g)与特小粒材料川七(千粒重12.1g,轮回亲本)杂交、回交获得的BC2F2 216个个体为作图群体,在北京进行稻谷粒长、粒宽、粒厚、长宽比、千粒重等粒形性状的鉴定。采用单标记分析和复合区间作图法,利用SSR标记对粒形性状进行数量性状基因座检测。结果表明,上述粒形性状在BC2F2群体均呈正态连续分布,表现为由多基因控制的数量性状;共检测到与粒形性状相关的QTL28个,分布于第1、第2、第3、第4、第5、第6和第12染色体上。其中qGL3-2、qGL3-3、qGT12-1、qGT2-1、qGT5-1、qGW1-1、qGW12-1、qGW2-1、qGW5-1、qRLW3-1、qTGW12-1、qTGW2-1、qTGW3-3和qTGW5-1对表型变异的贡献率分别为13.70%、52.51%、21.13%、18.79%、20.92%、14.59%、18.33%、30.03%、20.05%、24.53%、13.47%、11.43%、21.30%和15.68%,为主效QTL。其中,第3染色体上检测出来的QTL最多。在所有检测到的28个QTL中,6个QTL的增效等位基因来源于小粒亲本川七,而其余QTL的增效等位基因均来源于大粒亲本GSL156,基因作用方式主要表现为加性或部分显性。第3染色体RM7580～RM8208区间是分别与粒宽、长宽比和千粒重相关的3个主效QTL的共同标记区间,第2染色体的RM7636～RM5812区间、第5染色体的RM3351～RM26区间和第12染色体的RM1103～RM17区间是分别与粒宽、粒厚和千粒重相关的3个主效QTL的共同标记区间,这些区间对粒形贡献率较大,为进一步精细定位或克隆这些新的粒重或粒形QTL奠定了基础。同时大粒亲本对稻谷粒长、粒宽、粒厚和千粒重等性状的增效作用显著。
关键词
水稻
粒形性状
微卫星标记
数量性状基因座
Keywords
Rice
Grain trait
SSR marker
Quantitative trait locus
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
水稻(Oryza sativa L.)α-淀粉酶基因的进化及组织表达模式
被引量：
10
3
作者
廖登群
张洪亮
李自超
John BENNETT
机构
中国农业大学
/
农业部
作物
基因组
学
与遗传
改良
重点
实验室
/北京市
作物
遗传
改良
重点
实验室
Plant Breeding
School of Biological Sciences
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期17-27,共11页
基金
2003 Theme 1 Budget of the Challenge Program for Water and Food
国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2006AA10Z158)资助
文摘
α-淀粉酶在植物特别是谷类萌发种子淀粉降解中具有重要作用。水稻α-淀粉酶基因的结构、进化和表达研究已有报道,但多集中于OsAmy1和OsAmy3这两个亚族内基因间以及发芽种子中。不同亚族间的基因结构、进化及更多组织和时期的表达特点尚缺乏细致研究。本研究通过TblastN同源性比对及保守结构域分析揭示水稻基因组含有11个α-淀粉酶基因。生物信息学分析、系统进化树构建及半定量RT-PCR分析表明,该家族基因在结构上发生了明显的分化,具有清晰的进化层次,OsAmy5A和OsAmy4A是家族中较原始状态的基因;在表达和功能上也发生了明显分化,进化水平较高的基因发生了明显的时空表达特异性分化。OsAmy1A、OsAmy3A及OsAmy3D和OsAmy3E分别在保证种子植物世代传递、维持种子休眠过程中胚的微弱生命活动及保证种子萌发过程中能量的稳定持续供应上具有重要作用。
关键词
水稻
Α-淀粉酶
基因结构
进化
表达
Keywords
Rice
α-Amylase
Gene structure
Evolution
Expression profiling
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用SSR标记分析水稻亲本间遗传距离与杂种优势的关系
罗小金
贺浩华
彭小松
余秋英
孙俊立
张洪亮
李自超
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
2006
30
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
利用极端材料定位水稻粒形性状数量基因位点
张强
姚国新
胡广隆
汤波
陈超
李自超
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
15
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
水稻(Oryza sativa L.)α-淀粉酶基因的进化及组织表达模式
廖登群
张洪亮
李自超
John BENNETT
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
10
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职称材料
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