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人肾高亲和力钠离子依赖性二羧酸转运蛋白基因的克隆和生物信息学分析
被引量：
8
1
作者
白雪源
陈香美
邱强
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第4期404-410,共7页
为探讨人高亲和力钠离子依赖性二羧酸转运蛋白 (humanhigh affinitysodium dependentdicar boxylatetransporter,hSDCT2orhNaDC3 )基因在人体内的生理功能及其与疾病的关系 ,借助生物信息学成功地从人肾中克隆了hSDCT2基因 (GenBank接收...
为探讨人高亲和力钠离子依赖性二羧酸转运蛋白 (humanhigh affinitysodium dependentdicar boxylatetransporter,hSDCT2orhNaDC3 )基因在人体内的生理功能及其与疾病的关系 ,借助生物信息学成功地从人肾中克隆了hSDCT2基因 (GenBank接收号 :AY0 72 810 ) .首先将大鼠SDCT2cDNA与人EST数据库进行同源性比较 ,获得具有高度同源性EST片段并用DNAstar软件将它们拼接成EST重叠群 .在重叠群上设计PCR引物从人肾总RNA中用RT PCR扩增出hSDCT2基因并测序 ,然后用软件对其结构特性、组织分布及基因定位进行分析 .序列测定结果显示 ,hSDCT2开放阅读框为180 9bp ,共编码 6 0 2个氨基酸 .蛋白同源性分析表明 ,其氨基酸序列与大鼠及小鼠SDCT2分别有85 %和 87%相同 .二级结构分析显示 ,该蛋白有 12个跨膜螺旋区 .Northern分析显示 ,该基因可在肾、肝、脑、胎盘等多种组织中表达 ,并定位于 2 0号染色体的q12～q13
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关键词
人肾
亲和力
钠离子依赖性二羧酸转运蛋白基因
克隆
生物信息学分析
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职称材料
人钠依赖性二羧酸转运蛋白2(hSDCT2)的组织表达谱分析
被引量：
1
2
作者
朱晗玉
陈香美
+4 位作者
刘章锁
何娅妮
彭丽霞
洪权
孙雪蜂
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第5期552-557,共6页
利用DNA重组技术 ,构建重组表达质粒pGEX hSDCT2 .IPTG诱导其表达后 ,采用谷胱甘肽 Sepharose 4B亲和层析 ,获得纯化的谷胱甘肽S 转移酶 (GST) hSDCT2重组融合蛋白 .以此为免疫原免疫兔制备GST hSDCT2融合蛋白抗体 .多组织Northern印...
利用DNA重组技术 ,构建重组表达质粒pGEX hSDCT2 .IPTG诱导其表达后 ,采用谷胱甘肽 Sepharose 4B亲和层析 ,获得纯化的谷胱甘肽S 转移酶 (GST) hSDCT2重组融合蛋白 .以此为免疫原免疫兔制备GST hSDCT2融合蛋白抗体 .多组织Northern印迹法结果显示 ,3 6kb的hSDCT2基因转录产物 ,在心、骨骼肌、胸腺、小肠、肺和外周血白细胞等组织中几乎不表达 ,在脑、结肠、脾、肝和胎盘中仅有少量表达 ,但在肾脏中大量表达 ;并且在肾脏和脾脏中还存在着另一种约 4 3kb的转录产物 .Western印迹法证实 ,hSDCT2蛋白以类似方式于上述组织表达 .免疫组化双重染色结果发现 ,与分布于近端肾小管刷状缘的hSDCT1不同 ,hSDCT2主要分布于近端肾小管的基底膜侧 .这些结果为进一步研究人钠依赖性二羧酸转运蛋白 2的结构和功能奠定了基础 .
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关键词
人钠依赖性二羧酸转运蛋白2
组织表达谱
抗体
表达质粒
跨膜转运蛋白
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职称材料
题名
人肾高亲和力钠离子依赖性二羧酸转运蛋白基因的克隆和生物信息学分析
被引量：
8
1
作者
白雪源
陈香美
邱强
机构
中国人民解放军
肾病
研究
中心
暨
重点
实验室
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第4期404-410,共7页
基金
国家重点基础研究发展规划 (No .G2 0 0 0 0 5 70 0 3 )
国家自然科学基金 (No .3 9870 3 2 3
No .3 0 0 70 2 88)资助项目
文摘
为探讨人高亲和力钠离子依赖性二羧酸转运蛋白 (humanhigh affinitysodium dependentdicar boxylatetransporter,hSDCT2orhNaDC3 )基因在人体内的生理功能及其与疾病的关系 ,借助生物信息学成功地从人肾中克隆了hSDCT2基因 (GenBank接收号 :AY0 72 810 ) .首先将大鼠SDCT2cDNA与人EST数据库进行同源性比较 ,获得具有高度同源性EST片段并用DNAstar软件将它们拼接成EST重叠群 .在重叠群上设计PCR引物从人肾总RNA中用RT PCR扩增出hSDCT2基因并测序 ,然后用软件对其结构特性、组织分布及基因定位进行分析 .序列测定结果显示 ,hSDCT2开放阅读框为180 9bp ,共编码 6 0 2个氨基酸 .蛋白同源性分析表明 ,其氨基酸序列与大鼠及小鼠SDCT2分别有85 %和 87%相同 .二级结构分析显示 ,该蛋白有 12个跨膜螺旋区 .Northern分析显示 ,该基因可在肾、肝、脑、胎盘等多种组织中表达 ,并定位于 2 0号染色体的q12～q13
关键词
人肾
亲和力
钠离子依赖性二羧酸转运蛋白基因
克隆
生物信息学分析
Keywords
sodium dependent dicarboxylate transporter,bioinformatics analysis,energy metabolism
分类号
Q493.8 [生物学—生理学]
Q75 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
人钠依赖性二羧酸转运蛋白2(hSDCT2)的组织表达谱分析
被引量：
1
2
作者
朱晗玉
陈香美
刘章锁
何娅妮
彭丽霞
洪权
孙雪蜂
机构
中国人民解放军肾病中心暨重点实验室
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第5期552-557,共6页
基金
国家 973重点基础研究发展规划资助项目(No.G2 0 0 0 0 5 70 0 3 )
国家自然科学基金项目 (No .3 0 0 70 2 88
+1 种基金
No.3 0 2 70 5 0 5 )
国家自然科学基金创新研究群体项目(No .3 0 12 10 0 5 )~~
文摘
利用DNA重组技术 ,构建重组表达质粒pGEX hSDCT2 .IPTG诱导其表达后 ,采用谷胱甘肽 Sepharose 4B亲和层析 ,获得纯化的谷胱甘肽S 转移酶 (GST) hSDCT2重组融合蛋白 .以此为免疫原免疫兔制备GST hSDCT2融合蛋白抗体 .多组织Northern印迹法结果显示 ,3 6kb的hSDCT2基因转录产物 ,在心、骨骼肌、胸腺、小肠、肺和外周血白细胞等组织中几乎不表达 ,在脑、结肠、脾、肝和胎盘中仅有少量表达 ,但在肾脏中大量表达 ;并且在肾脏和脾脏中还存在着另一种约 4 3kb的转录产物 .Western印迹法证实 ,hSDCT2蛋白以类似方式于上述组织表达 .免疫组化双重染色结果发现 ,与分布于近端肾小管刷状缘的hSDCT1不同 ,hSDCT2主要分布于近端肾小管的基底膜侧 .这些结果为进一步研究人钠依赖性二羧酸转运蛋白 2的结构和功能奠定了基础 .
关键词
人钠依赖性二羧酸转运蛋白2
组织表达谱
抗体
表达质粒
跨膜转运蛋白
Keywords
human sodium dependent dicarboxylate transporter2, antibody, tissue expression profile
分类号
Q26 [生物学—细胞生物学]
Q73 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人肾高亲和力钠离子依赖性二羧酸转运蛋白基因的克隆和生物信息学分析
白雪源
陈香美
邱强
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2002
8
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职称材料
2
人钠依赖性二羧酸转运蛋白2(hSDCT2)的组织表达谱分析
朱晗玉
陈香美
刘章锁
何娅妮
彭丽霞
洪权
孙雪蜂
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003
1
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