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维生素D在糖尿病及其常见并发症中的研究进展 被引量:7
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作者 夏征 张红红 《中国骨质疏松杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期452-457,共6页
维生素D作为一类类固醇类激素原,可通过其代谢产物调节细胞代谢以控制多种生物功能。越来越多的研究表明,维生素D通过多种方式影响着糖尿病发生和发展,补充维生素D不仅可用于预防和控制糖尿病,还能预防或减轻糖尿病相关并发症的发生。... 维生素D作为一类类固醇类激素原,可通过其代谢产物调节细胞代谢以控制多种生物功能。越来越多的研究表明,维生素D通过多种方式影响着糖尿病发生和发展,补充维生素D不仅可用于预防和控制糖尿病,还能预防或减轻糖尿病相关并发症的发生。本文将对维生素D在糖尿病及其常见并发症中的研究进展进行综述。 展开更多
关键词 维生素D 糖尿病 并发症
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丙戊酸钠抗癫痫疗效相关枢纽基因鉴定 被引量:5
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作者 杨炯 张明华 +3 位作者 耿淼 艾伦娜 田磊 范皎 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期1408-1415,共8页
目的采用加权基因共表达网络分析探索抗癫痫药物丙戊酸钠疗效相关的基因模块及核心枢纽基因。方法从GEO数据库下载表达谱数据,构建基因共表达网络;采用Pearson相关性检验筛选与抗癫痫药物丙戊酸钠疗效显著相关的基因模块,根据模块内的... 目的采用加权基因共表达网络分析探索抗癫痫药物丙戊酸钠疗效相关的基因模块及核心枢纽基因。方法从GEO数据库下载表达谱数据,构建基因共表达网络;采用Pearson相关性检验筛选与抗癫痫药物丙戊酸钠疗效显著相关的基因模块,根据模块内的连接性筛选枢纽基因;利用GO功能富集分析和KEGG通路分析对模块进行功能注释。结果根据基因表达的相关性,共构建了12个基因共表达模块,其中分别选出与是否采取丙戊酸钠药物治疗表型明显相关(r=0.57,P<0.0001)和与丙戊酸钠治疗是否有效表型显著相关(r=-0.53,P<0.0001)的两个基因模块;发现包含S1PR5、SARM1等基因以及MAGED1、FBXO31等基因分别在两个模块中处于核心地位;通过生物注释功能发现,两个模块中的基因主要富集在免疫调控、MAPK通路等生物学过程中。结论丙戊酸钠用药引起癫痫患者体内免疫和代谢通路变化,其疗效是否显著可能与MAGED1、FBXO31等基因功能相关。 展开更多
关键词 癫痫 丙戊酸钠 疗效 加权基因共表达网络分析 枢纽基因 免疫反应
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基于加权基因共表达网络分析阿尔茨海默病相关的核心基因 被引量:1
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作者 薛继国 刘静 +3 位作者 耿淼 岳敬伟 贺浩宸 范皎 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期1752-1762,共11页
目的采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)探索阿尔茨海默病(AD)相关的差异基因模块及其枢纽基因,并对差异基因模块进行生物功能注释。方法从GEO数据库下载转录组测序数据,根据基因的相关性,当关联系数阈值设定为0.85时,参数β=8,以此构... 目的采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)探索阿尔茨海默病(AD)相关的差异基因模块及其枢纽基因,并对差异基因模块进行生物功能注释。方法从GEO数据库下载转录组测序数据,根据基因的相关性,当关联系数阈值设定为0.85时,参数β=8,以此构建基因共表达网络;采用Pearson相关性检验计算模块基因与临床表型相关性,筛选出与AD显著相关的基因模块,根据模块内的连接性筛选枢纽基因;利用GO功能富集分析和KEGG通路分析对模块进行功能注释。进一步建立β-淀粉样蛋白(Aβ1-42)诱导SH-SY5Y细胞损伤模型,在模型组和对照组中检测枢纽基因的表达水平。结果根据基因表达的相关性,共构建了10个基因共表达模块,其中brown和turquoise模块与AD组显著相关(brown:r=0.66,P<0.001;turquoise:r=-0.68,P<0.001);结果显示48个基因在共表达网络中处于核心地位;通过生物注释功能发现,两模块中的基因主要富集在DNA损伤修复通路和代谢相关通路等生物学过程中。基因的差异表达分析显示,DNASE1、TEKT2、MTSS1L等基因在AD组中高表达,ACP2、LANCL2、GMPR2等基因在AD组中低表达;体外实验进一步验证了在Aβ1-42诱导的SH-SY5Y细胞损伤过程中DNASE1、TEKT2、MTSS1L表达上调(P<0.01),ACP2、LANCL2、GMPR2表达下调(P<0.01)。结论brown和turquoise模块与AD高度相关,并从模块中筛选出MTSS1L、GMPR2、ACP2、ACTG1、LANCL2等枢纽基因,可能通过调节DNA损伤和修复参与AD发病机制。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 加权基因共表达网络分析 枢纽基因 DNA损伤修复
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