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傣药方在治疗新型冠状病毒肺炎中作用的网络药理学和分子对接分析
被引量:
2
1
作者
王晨钰
韩涵
+2 位作者
郭磊
刘同祥
唐丽
《中国测试》
CAS
北大核心
2021年第9期70-81,共12页
采用网络药理学和分子对接技术分析源自“瘴疠之区”丰富认识的傣医药在治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)中所发挥的作用。基于文献调研,确定傣医药对COVID-19治疗方案中三种傣药方的化学成分;采用中药系统药理分析平台、中药化学成分数...
采用网络药理学和分子对接技术分析源自“瘴疠之区”丰富认识的傣医药在治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)中所发挥的作用。基于文献调研,确定傣医药对COVID-19治疗方案中三种傣药方的化学成分;采用中药系统药理分析平台、中药化学成分数据库和Swiss target prediction数据库对每个药方中主要化学成分的潜在靶点进行整理;在基因挖掘软件(GenCLiP3)和GeneCard数据库搜索COVID-19相关靶点,绘制中药调控网络图;使用STRING数据库构建靶点蛋白质蛋白质相互作用(PPI)网络;同时进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并对关键化学成分与靶蛋白严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)3CL水解酶和血管紧张素转化酶2(ACE2)进行分子对接。研究结果表明,傣药方所含化合物以黄酮类、萜类等为主,主要活性成分β-谷甾醇、槲皮素、儿茶素等可作用于周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)等多个靶点,调节MAPK信号通路、白介素-17(IL-17)信号通路、酪氨酸激酶-转录因子(JAK-STAT)信号通路、核转录因子(NF)-κB信号通路、花生四烯酸代谢通路等多条通路。药方1核心靶点包括MAPK1、JAK1等,以抗炎、病毒感染细胞的通路为主,以提高机体免疫能力;药方2核心靶点则包括环加氧酶1(PTGS1)、一氧化氮合酶2(NOS2)等,集中于病原菌、病毒感染通路、抗炎信号通路等,对临床上所出现的发热不退等症状可协同调控;药方3核心靶点包括磷脂酰肌醇-3-激酶催化亚基α(PIK3CA)、IL-6等,以炎症信号通路、细胞的增殖凋亡通路为主,对抗更为严重的临床症状。靶点、通路的差异可作为这三种药方对COVID-19分别对症下药的初步理论依据。
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关键词
网络药理学
分子对接
傣药
新型冠状病毒肺炎(COVID-19)
SARS-CoV-23CL水解酶
ACE2
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职称材料
耳鸣相关脑电研究
被引量:
3
2
作者
张驰
王晓光
+5 位作者
蒋晴晴
马晓彦
曹伟
王方园
申卫东
杨仕明
《中华耳科学杂志》
CSCD
北大核心
2020年第6期1077-1081,共5页
耳鸣作为耳科临床常见的疾病之一,极大地困扰了患者的生活。随着计算技术的的发展,基于活体的脑科学研究呈现快速增长的趋势,许多技术在基础研究和临床方面已得到应用,关于耳鸣中枢机制的研究目前主要集中在脑电、功能核磁等领域。脑电...
耳鸣作为耳科临床常见的疾病之一,极大地困扰了患者的生活。随着计算技术的的发展,基于活体的脑科学研究呈现快速增长的趋势,许多技术在基础研究和临床方面已得到应用,关于耳鸣中枢机制的研究目前主要集中在脑电、功能核磁等领域。脑电作为一种经济、无创且具有高时间分辨率的研究工具目前被广泛应用于脑功能相关研究中。本文主要从耳鸣相关脑电特征、基于脑电的耳鸣相关因素研究以及基于脑电的耳鸣治疗策略几个方面阐述脑电在耳鸣发生发展机制的研究中的应用,为进一步探寻其在耳鸣诊断和治疗中的可能意义与价值提供指导。
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关键词
耳鸣
脑电
前扣带回皮层
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职称材料
过氧化物酶体特异性绿色荧光蛋白腺病毒载体的构建
3
作者
江天行
刘育鹏
+5 位作者
李阳
宋晓伟
赵仙先
郭志福
史承勇
吴弘
《海军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期1315-1320,共6页
目的构建一种特异性标记过氧化物酶体的GFP腺病毒载体。方法设计含过氧化物酶体信号肽的GFP序列,PCR法扩增该序列片段,并将其与腺病毒穿梭质粒载体pAdTrack连接,然后将连接产物转化到大肠埃希菌DH5α感受态细胞中获得重组质粒并测序鉴...
目的构建一种特异性标记过氧化物酶体的GFP腺病毒载体。方法设计含过氧化物酶体信号肽的GFP序列,PCR法扩增该序列片段,并将其与腺病毒穿梭质粒载体pAdTrack连接,然后将连接产物转化到大肠埃希菌DH5α感受态细胞中获得重组质粒并测序鉴定。重组质粒经限制性内切酶PmeⅠ酶切线性化后,转化到含腺病毒骨架质粒pAdEasy-1的BJ5183感受态细胞中进行同源重组。重组腺病毒质粒经限制性内切酶PacⅠ酶切线性化后感染293A细胞,进行病毒包装,得到含过氧化物酶体信号肽的Ad-GFP-Peroxi重组腺病毒颗粒。用腺病毒Ad-GFP-Peroxi和不含过氧化物酶体信号肽的腺病毒Ad-GFP感染培养的大鼠心肌细胞H9C2,48 h后在荧光显微镜下观察绿色荧光强弱。将用Ad-GFP-Peroxi腺病毒感染的H9C2细胞分为正常培养组和1%O2浓度培养组,培养24 h后于共聚焦显微镜下观察,并进行荧光信号聚集情况分析。结果含过氧化物酶体信号肽的GFP腺病毒载体构建成功。与不含过氧化物酶体信号肽的腺病毒Ad-GFP相比,含过氧化物酶体信号肽的腺病毒Ad-GFP-Peroxi能够特异性显示大鼠心肌细胞H9C2内过氧化物酶体的分布,且缺氧培养的H9C2细胞内过氧化物酶体分布出现聚集现象。结论利用同源重组方法成功构建了过氧化物酶体特异性GFP腺病毒,其对大鼠心肌细胞H9C2有较高的感染效率,共聚焦显微镜下可以明确显示心肌细胞内过氧化物酶体的分布情况。
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关键词
心肌细胞
腺病毒
绿色荧光蛋白
过氧化物酶体
共聚焦显微镜
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职称材料
题名
傣药方在治疗新型冠状病毒肺炎中作用的网络药理学和分子对接分析
被引量:
2
1
作者
王晨钰
韩涵
郭磊
刘同祥
唐丽
机构
民族医药教育部重点实验室(
中
央民族大学)
军事科学院军事医学研究院毒物药物研究所抗毒药物与毒理学国家重点实验室
中国人民解放军总医院京中医疗区
礼士路门诊部
出处
《中国测试》
CAS
北大核心
2021年第9期70-81,共12页
基金
国家自然科学基金项目(81873397)
河北省自然科学基金项目(B2019209330)。
文摘
采用网络药理学和分子对接技术分析源自“瘴疠之区”丰富认识的傣医药在治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)中所发挥的作用。基于文献调研,确定傣医药对COVID-19治疗方案中三种傣药方的化学成分;采用中药系统药理分析平台、中药化学成分数据库和Swiss target prediction数据库对每个药方中主要化学成分的潜在靶点进行整理;在基因挖掘软件(GenCLiP3)和GeneCard数据库搜索COVID-19相关靶点,绘制中药调控网络图;使用STRING数据库构建靶点蛋白质蛋白质相互作用(PPI)网络;同时进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并对关键化学成分与靶蛋白严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)3CL水解酶和血管紧张素转化酶2(ACE2)进行分子对接。研究结果表明,傣药方所含化合物以黄酮类、萜类等为主,主要活性成分β-谷甾醇、槲皮素、儿茶素等可作用于周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)等多个靶点,调节MAPK信号通路、白介素-17(IL-17)信号通路、酪氨酸激酶-转录因子(JAK-STAT)信号通路、核转录因子(NF)-κB信号通路、花生四烯酸代谢通路等多条通路。药方1核心靶点包括MAPK1、JAK1等,以抗炎、病毒感染细胞的通路为主,以提高机体免疫能力;药方2核心靶点则包括环加氧酶1(PTGS1)、一氧化氮合酶2(NOS2)等,集中于病原菌、病毒感染通路、抗炎信号通路等,对临床上所出现的发热不退等症状可协同调控;药方3核心靶点包括磷脂酰肌醇-3-激酶催化亚基α(PIK3CA)、IL-6等,以炎症信号通路、细胞的增殖凋亡通路为主,对抗更为严重的临床症状。靶点、通路的差异可作为这三种药方对COVID-19分别对症下药的初步理论依据。
关键词
网络药理学
分子对接
傣药
新型冠状病毒肺炎(COVID-19)
SARS-CoV-23CL水解酶
ACE2
Keywords
network pharmacology
molecular docking
Dai medicine
novel coronavirus pneumonia(COVID-19)
SARS-CoV-23CL hydrolase
ACE2
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
耳鸣相关脑电研究
被引量:
3
2
作者
张驰
王晓光
蒋晴晴
马晓彦
曹伟
王方园
申卫东
杨仕明
机构
中国人民解放军总医院
耳鼻咽喉头颈外科医学部
国家耳鼻咽喉疾病临床医学研究
中
心
聋病教育部重点实验室
聋病防治北
京
市重点实验室
中国人民解放军总医院京中医疗区
旃檀寺门诊部
出处
《中华耳科学杂志》
CSCD
北大核心
2020年第6期1077-1081,共5页
基金
国家重点研发计划课题任务书,2019YFC0121302
国家重点研发计划课题任务书,2019YFC0840707
北京市科技新星计划,Z201100006820133。
文摘
耳鸣作为耳科临床常见的疾病之一,极大地困扰了患者的生活。随着计算技术的的发展,基于活体的脑科学研究呈现快速增长的趋势,许多技术在基础研究和临床方面已得到应用,关于耳鸣中枢机制的研究目前主要集中在脑电、功能核磁等领域。脑电作为一种经济、无创且具有高时间分辨率的研究工具目前被广泛应用于脑功能相关研究中。本文主要从耳鸣相关脑电特征、基于脑电的耳鸣相关因素研究以及基于脑电的耳鸣治疗策略几个方面阐述脑电在耳鸣发生发展机制的研究中的应用,为进一步探寻其在耳鸣诊断和治疗中的可能意义与价值提供指导。
关键词
耳鸣
脑电
前扣带回皮层
Keywords
Tinnitus
EEG
Anterior Cingulate Cortex
分类号
R764 [医药卫生—耳鼻咽喉科]
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职称材料
题名
过氧化物酶体特异性绿色荧光蛋白腺病毒载体的构建
3
作者
江天行
刘育鹏
李阳
宋晓伟
赵仙先
郭志福
史承勇
吴弘
机构
海军军医大学(第二军医大学)第一附属
医院
心血管内科
中国人民解放军总医院京中医疗区
中国人民解放军
联勤保障部队第九〇三
医院
心内科
出处
《海军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期1315-1320,共6页
基金
国家自然科学基金(82070419)。
文摘
目的构建一种特异性标记过氧化物酶体的GFP腺病毒载体。方法设计含过氧化物酶体信号肽的GFP序列,PCR法扩增该序列片段,并将其与腺病毒穿梭质粒载体pAdTrack连接,然后将连接产物转化到大肠埃希菌DH5α感受态细胞中获得重组质粒并测序鉴定。重组质粒经限制性内切酶PmeⅠ酶切线性化后,转化到含腺病毒骨架质粒pAdEasy-1的BJ5183感受态细胞中进行同源重组。重组腺病毒质粒经限制性内切酶PacⅠ酶切线性化后感染293A细胞,进行病毒包装,得到含过氧化物酶体信号肽的Ad-GFP-Peroxi重组腺病毒颗粒。用腺病毒Ad-GFP-Peroxi和不含过氧化物酶体信号肽的腺病毒Ad-GFP感染培养的大鼠心肌细胞H9C2,48 h后在荧光显微镜下观察绿色荧光强弱。将用Ad-GFP-Peroxi腺病毒感染的H9C2细胞分为正常培养组和1%O2浓度培养组,培养24 h后于共聚焦显微镜下观察,并进行荧光信号聚集情况分析。结果含过氧化物酶体信号肽的GFP腺病毒载体构建成功。与不含过氧化物酶体信号肽的腺病毒Ad-GFP相比,含过氧化物酶体信号肽的腺病毒Ad-GFP-Peroxi能够特异性显示大鼠心肌细胞H9C2内过氧化物酶体的分布,且缺氧培养的H9C2细胞内过氧化物酶体分布出现聚集现象。结论利用同源重组方法成功构建了过氧化物酶体特异性GFP腺病毒,其对大鼠心肌细胞H9C2有较高的感染效率,共聚焦显微镜下可以明确显示心肌细胞内过氧化物酶体的分布情况。
关键词
心肌细胞
腺病毒
绿色荧光蛋白
过氧化物酶体
共聚焦显微镜
Keywords
cardiomyocytes
adenovirus
greenfluorescence protein
peroxisomes
confocal microscope
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
傣药方在治疗新型冠状病毒肺炎中作用的网络药理学和分子对接分析
王晨钰
韩涵
郭磊
刘同祥
唐丽
《中国测试》
CAS
北大核心
2021
2
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职称材料
2
耳鸣相关脑电研究
张驰
王晓光
蒋晴晴
马晓彦
曹伟
王方园
申卫东
杨仕明
《中华耳科学杂志》
CSCD
北大核心
2020
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
过氧化物酶体特异性绿色荧光蛋白腺病毒载体的构建
江天行
刘育鹏
李阳
宋晓伟
赵仙先
郭志福
史承勇
吴弘
《海军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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