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基于结直肠癌发病机制的中医药防治效应靶点
被引量：
2
1
作者
陈雪
何善泉
李卫东
《世界中医药》
CAS
2023年第21期3118-3124,共7页
结直肠癌是常见的恶性肿瘤之一,目前主要采用放疗或化疗的治疗方案,虽然能在一定程度上缓解患者的症状,但是治疗过程产生的不良反应严重影响了疗效的发挥。中医药在防治结直肠癌方面具有疗效确切和安全性高的优势,是结直肠癌防治的补充...
结直肠癌是常见的恶性肿瘤之一,目前主要采用放疗或化疗的治疗方案,虽然能在一定程度上缓解患者的症状,但是治疗过程产生的不良反应严重影响了疗效的发挥。中医药在防治结直肠癌方面具有疗效确切和安全性高的优势,是结直肠癌防治的补充替代疗法。笔者将肠癌的发病机制作为切入点,从基因突变、信号通路调控异常、炎性微环境等3方面对中医药防治肠癌的可能作用靶点进行系统总结,归纳出Wnt/β-catenin信号通路、单磷酸腺苷活化蛋白激酶(AMPK)、Stat3基因、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、P53基因等主要作用靶点,以期进一步为临床中医药防治肠癌和有效药物的研发提供思路和线索。
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关键词
肠癌
中医药
防治
靶点
基因突变
信号通路
炎性微环境
作用机制
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职称材料
基于熵值的冠心病基因网络模块划分方法评价与模块功能相似度分析
被引量：
4
2
作者
顾浩
陈寅萤
+1 位作者
王朋倩
王忠
《中国药理学与毒理学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第5期377-384,共8页
目的解决网络模块划分方法优选问题,并对划分结果进行功能解析和评价。方法利用多种常用模块划分方法,包括MCLi QUE,Cluster one,NCMine,PEWCC,Fuzzifier cluster,Community cluster,Connected component cluster,MCL cluster,MCODE clu...
目的解决网络模块划分方法优选问题,并对划分结果进行功能解析和评价。方法利用多种常用模块划分方法,包括MCLi QUE,Cluster one,NCMine,PEWCC,Fuzzifier cluster,Community cluster,Connected component cluster,MCL cluster,MCODE cluster,Spectral clusters of protein sequences和AP等,对冠心病基因网络进行模块划分,通过网络结构熵值计算进行评价,优选出一种方法进行划分模块。基于基因功能富集分析对模块的通路功能进行富集,并利用杰卡德相似指数分析方法,对模块与总网络的功能进行比较和分析。结果用MCODE cluster方法划分出11个模块,网络熵值为4.33637,在几种方法中熵值最小,最适于冠心病基因网络模块的识别。基于基因功能富集分析和杰卡德相似指数分析方法,发现11个模块能涵盖冠心病相关通路中的38条,覆盖率达到73.1%。其中,模块3,4和7能用较少的基因富集到较多的功能。结论网络信息熵可以为模块划分方法的评价提供一种可行方案。划分后的模块可以代表原疾病网络的大部分功能,并在功能富集上有一定优势,对进一步简化和理解疾病网络具有实际意义。
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关键词
冠心病
基因网络
模块划分
熵值
功能相似度
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职称材料
题名
基于结直肠癌发病机制的中医药防治效应靶点
被引量：
2
1
作者
陈雪
何善泉
李卫东
机构
中国中医科学院
广安门
医院
中国中医科学院广安门医院科研处
出处
《世界中医药》
CAS
2023年第21期3118-3124,共7页
基金
国家自然科学基金面上项目(82174464)
中国中医科学院科技创新工程重大攻关项目(CI2021A01806)。
文摘
结直肠癌是常见的恶性肿瘤之一,目前主要采用放疗或化疗的治疗方案,虽然能在一定程度上缓解患者的症状,但是治疗过程产生的不良反应严重影响了疗效的发挥。中医药在防治结直肠癌方面具有疗效确切和安全性高的优势,是结直肠癌防治的补充替代疗法。笔者将肠癌的发病机制作为切入点,从基因突变、信号通路调控异常、炎性微环境等3方面对中医药防治肠癌的可能作用靶点进行系统总结,归纳出Wnt/β-catenin信号通路、单磷酸腺苷活化蛋白激酶(AMPK)、Stat3基因、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、P53基因等主要作用靶点,以期进一步为临床中医药防治肠癌和有效药物的研发提供思路和线索。
关键词
肠癌
中医药
防治
靶点
基因突变
信号通路
炎性微环境
作用机制
Keywords
Intestinal cancer
Traditional Chinese medicine
Prevention and treatment
Targets
Gene mutation
Signaling pathway
Inflammatory microenvironment
Function mechanism
分类号
R273 [医药卫生—中西医结合]
R735 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
基于熵值的冠心病基因网络模块划分方法评价与模块功能相似度分析
被引量：
4
2
作者
顾浩
陈寅萤
王朋倩
王忠
机构
中国中医科学院
中医
临床基础医学研究所
中国中医科学院广安门医院科研处
中国中医科学院
中药研究所
出处
《中国药理学与毒理学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第5期377-384,共8页
基金
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助(Z0469)
国家科技重大专项(2017ZX09301059)
国家自然科学基金(81603401)~~
文摘
目的解决网络模块划分方法优选问题,并对划分结果进行功能解析和评价。方法利用多种常用模块划分方法,包括MCLi QUE,Cluster one,NCMine,PEWCC,Fuzzifier cluster,Community cluster,Connected component cluster,MCL cluster,MCODE cluster,Spectral clusters of protein sequences和AP等,对冠心病基因网络进行模块划分,通过网络结构熵值计算进行评价,优选出一种方法进行划分模块。基于基因功能富集分析对模块的通路功能进行富集,并利用杰卡德相似指数分析方法,对模块与总网络的功能进行比较和分析。结果用MCODE cluster方法划分出11个模块,网络熵值为4.33637,在几种方法中熵值最小,最适于冠心病基因网络模块的识别。基于基因功能富集分析和杰卡德相似指数分析方法,发现11个模块能涵盖冠心病相关通路中的38条,覆盖率达到73.1%。其中,模块3,4和7能用较少的基因富集到较多的功能。结论网络信息熵可以为模块划分方法的评价提供一种可行方案。划分后的模块可以代表原疾病网络的大部分功能,并在功能富集上有一定优势,对进一步简化和理解疾病网络具有实际意义。
关键词
冠心病
基因网络
模块划分
熵值
功能相似度
Keywords
coronary heart disease
gene network
module division
entropy calculation
functional similarity analysis
分类号
R966 [医药卫生—药理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于结直肠癌发病机制的中医药防治效应靶点
陈雪
何善泉
李卫东
《世界中医药》
CAS
2023
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于熵值的冠心病基因网络模块划分方法评价与模块功能相似度分析
顾浩
陈寅萤
王朋倩
王忠
《中国药理学与毒理学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018
4
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职称材料
已选择
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