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应用DNA条形码ITS2序列对市售药材黄柏的鉴定研究 被引量:15
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作者 汤欢 向丽 +2 位作者 赵莎 孙伟 叶萌 《世界科学技术-中医药现代化》 2016年第2期184-190,共7页
目的:应用DNA条形码ITS2序列鉴定市售黄柏药材及其混伪品,保障药材质量及用药安全。方法:对90份药材及其基原植物样品进行DNA提取,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增ITS2序列并进行双向测序,运用CodonCode Aligner V3.7.1对测序峰图进行校对... 目的:应用DNA条形码ITS2序列鉴定市售黄柏药材及其混伪品,保障药材质量及用药安全。方法:对90份药材及其基原植物样品进行DNA提取,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增ITS2序列并进行双向测序,运用CodonCode Aligner V3.7.1对测序峰图进行校对拼接,去除低质量区和引物区,得到ITS2序列,运用MEGA 6.1对序列进行比对分析,基于K2P遗传距离构建系统聚类树。结果:90份实验样品均能提取到DNA,其DNA经PCR扩增、测序,序列拼接剪切后均能得到高质量ITS2序列。川黄柏和关黄柏基原物种黄皮树和黄檗的种内最大K2P遗传距离分别为0.018和0.004,均远小于其与混伪品的种间最小K2P遗传距离(0.051和0.056);NJ树结果显示川黄柏和关黄柏聚为一支,其混伪品各自聚为一支。结论:基于ITS2序列的DNA条形码技术可准确、有效地鉴定市售黄柏药材及其混伪品,为其市场监管及用药安全提供了一种高效的技术方法。 展开更多
关键词 DNA条形码 ITS2序列 黄柏 混伪品
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动物药材DNA提取方法优化和市售药材DNA条形码鉴定研究 被引量:5
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作者 刘旭朝 刘金欣 +3 位作者 孙伟 宋经元 石林春 孙稚颖 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 2017年第4期602-609,共8页
目的:对动物药材DNA提取方法进行优化,利用优化方法提取市售动物药材DNA并进行DNA条形码鉴定。方法:基于SDS法DNA提取原理,比较裂解液中不同EDTA浓度(0.025、0.25、0.5 mol·L^(-1))、是否含Na Cl和Triton X-100等因素对不同用药部... 目的:对动物药材DNA提取方法进行优化,利用优化方法提取市售动物药材DNA并进行DNA条形码鉴定。方法:基于SDS法DNA提取原理,比较裂解液中不同EDTA浓度(0.025、0.25、0.5 mol·L^(-1))、是否含Na Cl和Triton X-100等因素对不同用药部位动物药材DNA提取质量的影响,筛选得到最佳裂解液配方;使用优化的裂解液配方提取121份市售动物药材DNA并进行基原物种鉴定。结果:裂解液配方为1%SDS、0.03 mol·L^(-1)Tris-HCl、0.25 mol·L^(-1)EDTA、0.2 mol·L^(-1)Na Cl对不同用药部位动物药材DNA提取效果最佳,并可实现对蝉蜕等提取困难样本DNA的提取;利用优化裂解液提取的121份市售动物药材DNA满足中药材分子鉴定后续实验要求,所有市售动物药材均可准确鉴定到基原物种。结论:本研究优化的裂解液配方可用于除壳类、分泌物类、加工品外不同用药部位动物药材的DNA提取,为动物药材分子鉴定提供了技术支持。 展开更多
关键词 动物药材 DNA条形码 DNA提取 裂解液 EDTA
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基于GMPGIS的檀香全球产地生态适宜性研究 被引量:8
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作者 汤欢 李西文 +4 位作者 向丽 孙莉 沈亮 高锐坤 叶萌 《世界科学技术-中医药现代化》 2016年第8期1265-1271,共7页
目的:本研究主要对檀香在全球的产地生态适宜性进行分析,以期促进檀香区划研究和生产。方法:以檀香的主产地印度、澳大利亚等131个样点为基点,应用药用植物全球产地生态适宜性区划信息系统(GMPGIS)分析檀香在全球的产地生态适宜性。结果... 目的:本研究主要对檀香在全球的产地生态适宜性进行分析,以期促进檀香区划研究和生产。方法:以檀香的主产地印度、澳大利亚等131个样点为基点,应用药用植物全球产地生态适宜性区划信息系统(GMPGIS)分析檀香在全球的产地生态适宜性。结果:巴西、印度、刚果(金)、澳大利亚、中国、印度尼西亚等120个国家和地区境内都有适宜檀香生长的区域,能对发展檀香生产、确定檀香区划、保证檀香品质提供科学指导。结论:GMPGIS分析结果将为进一步的檀香资源调查及其全球产地区划提供科学依据。 展开更多
关键词 檀香 生态因子 产地适宜性 GMPGIS
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乌拉尔甘草TIFY基因家族鉴定及调控分析 被引量:3
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作者 秦振芬 孟祥霄 +5 位作者 温东 朱雪雯 王艳 Botir Khaitov Atia tul Wahab 孙伟 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2022年第5期1855-1864,共10页
目的 为了探索乌拉尔甘草(Glycyrrhiza uralensis Fisch.)TIFY基因家族的特征并预测其功能,本研究在全基因组层面,应用生物信息学方法对乌拉尔甘草TIFY基因家族进行鉴定和分析。方法 在乌拉尔甘草全基因组数据基础上,利用NCBI、MEME及TB... 目的 为了探索乌拉尔甘草(Glycyrrhiza uralensis Fisch.)TIFY基因家族的特征并预测其功能,本研究在全基因组层面,应用生物信息学方法对乌拉尔甘草TIFY基因家族进行鉴定和分析。方法 在乌拉尔甘草全基因组数据基础上,利用NCBI、MEME及TBtools等工具,结合基因保守结构域,对乌拉尔甘草TIFY基因家族的序列特征、分类、系统发育和基因表达模式进行分析。结果 在乌拉尔甘草中鉴定到TIFY家族基因成员18个(GurTIFY1-GurTIFY18),分别属于TIFY、JAZ、PPD、ZML四个亚家族,编码的核苷酸长度为444-1266 bp,氨基酸长度在147-421 aa之间,等电点为4.57-9.68,分子质量为16741.11-44426.5 Da,含有10个保守基序和4个保守结构域。基因表达结果表明GurTIFY基因中GurTIFY15、GurTIFY4、GurTIFY1、GurTIFY11等在乌拉尔甘草叶和根中的表达水平具有显著差异性。结论 本研究为深入理解TIFY基因响应非生物胁迫的调控机制和参与次生代谢物质累积的功能奠定基础,并为乌拉尔甘草优质品种选育提供科学参考。 展开更多
关键词 生物信息学 乌拉尔甘草 TIFY基因家族 鉴定 功能分析
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葡萄辅助因子VvVQ10负调控白藜芦醇生物合成分子机理研究
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作者 刘先菊 刘安 姜金铸 《中外葡萄与葡萄酒》 北大核心 2023年第3期18-23,共6页
为探究葡萄辅助因子VvVQ10在调控白藜芦醇生物合成中的作用机制,通过分析已发表转录组数据、叶片瞬时遗传转化及酵母双杂交等方法进行作用机制解析。结果表明,葡萄VQ家族成员中VvVQ10在正常生长状况下呈高表达,紫外光处理呈上调表达,而... 为探究葡萄辅助因子VvVQ10在调控白藜芦醇生物合成中的作用机制,通过分析已发表转录组数据、叶片瞬时遗传转化及酵母双杂交等方法进行作用机制解析。结果表明,葡萄VQ家族成员中VvVQ10在正常生长状况下呈高表达,紫外光处理呈上调表达,而伤害与霜霉菌侵染处理则显著下调;在山葡萄叶片中瞬时沉默VvVQ10,白藜芦醇及其糖苷(虎杖苷)含量显著升高;酵母双杂交分析表明,VvVQ10蛋白可与VvWRKY8蛋白互作,且结合位点在VvWRKY8的N段或包含DNA结合区的C段。以上结果表明,VvVQ10可通过与VvWRKY8蛋白互作的方式负调控葡萄白藜芦醇的生物合成。 展开更多
关键词 葡萄 辅助因子 白藜芦醇 VQ蛋白 负调控
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