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基于RNA-Seq的油茶种子α-亚麻酸代谢途径及相关基因分析被引量：17: 1; 作者江南谭晓风 +1 位作者张琳曾艳玲《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第8期68-75,共8页; 以油茶果实膨大期和油脂合成高峰期的种子为材料,进行转录组测序和表达谱数据库构建,并对油茶种子α-亚麻酸代谢途径相关基因进行分析。转录组测序获得油茶种子α-亚麻酸代谢非冗余基因Unigenes序列共112条,与α-亚麻酸代谢密切相关的... 展开更多; 关键词油茶转录组表达谱 α-亚麻酸代谢基因表达; 在线阅读下载PDF 职称材料

油茶长链脂肪酰基CoA合成酶基因1(CoLACS1)分子特征与表达分析被引量：8: 2; 作者江南谭晓风 +3 位作者张琳李泽蒋瑶黄丽媛《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期139-147,共9页; 长链脂肪酰基Co A合成酶(LACS)在脂肪酸的合成与分解代谢中起着重要作用。本研究以油茶(Camellia oleifera Abel)国家审定品种华硕(Camellia oleifera Huashuo)种仁转录组数据为基础,根据LACS基因Unigene序列设计引物,分离克隆了油茶LA... 展开更多; 关键词油茶长链脂肪酰基CoA合成酶基因表达油脂积累; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于油脂合成期油桐种仁转录组数据的α-亚麻酸代谢途径解析被引量：9: 3; 作者陈昊谭晓风《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第3期41-48,共8页; 【目的】油桐种仁中产出的桐油经济利用价值极高。桐油中α-桐酸的含量高达70%,然而植物体内α-桐酸代谢通路的研究还未见报道,这对直接筛选油桐α-桐酸代谢通路相关酶基因造成一定的困难。α-亚麻酸作为α-桐酸的同分异构体,其代谢通... 展开更多; 关键词油桐转录组测序 α-亚麻酸代谢基因表达模式; 在线阅读下载PDF 职称材料

油桐种子脂肪酸延长代谢的转录表达与代谢调控机理研究被引量：2: 4; 作者刘美兰谭晓风龙洪旭《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期1053-1059,共7页; 油桐是我国四大木本油料植物之一,当前对油桐的研究主要集中在栽培选优及低产林改造方面,而对油桐脂肪酸延长代谢的分子机理研究尚未见报道。本研究以油桐果实膨大期、油脂转化初期和油脂转化高峰期的种子为材料,采用高通量RNA测序技术... 展开更多; 关键词油桐转录组脂肪酸延长代谢高通量RNA测序基因表达; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于RNA-Seq的油茶种子α-亚麻酸代谢途径及相关基因分析被引量：17: 1; 作者江南谭晓风张琳曾艳玲; 机构中南林业科技大学经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南工业大学; 出处《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第8期68-75,共8页; 基金国家自然科学基金面上项目(31070603) 国家自然科学基金项目(31100497) 湖南省科技计划项目(2012NK3065); 文摘以油茶果实膨大期和油脂合成高峰期的种子为材料,进行转录组测序和表达谱数据库构建,并对油茶种子α-亚麻酸代谢途径相关基因进行分析。转录组测序获得油茶种子α-亚麻酸代谢非冗余基因Unigenes序列共112条,与α-亚麻酸代谢密切相关的不饱和脂肪酸合成途径非冗余基因Unigenes序列94条,包含12种调控α-亚麻酸代谢主要酶基因。表达谱数据分析显示,果实膨大期和油脂合成高峰期的α-亚麻酸合成代谢途径相关基因具有不同的表达模式,参与油茶种子α-亚麻酸的合成及形成多种不饱和脂肪酸的物质转化。采用实时荧光定量PCR方法验证油茶种子LOX,AOS,ACOX,AOC,OPR,AACT,PLA2,HPL,DOX,MFP,FAD2,FAD3等关键基因在油茶种子油脂合成不同时期的相对表达量,结果表明各基因表达规律与表达谱数据分析结果一致。克隆、调控这些相关基因将会为提高α-亚麻酸含量的油茶育种提供依据。; 关键词油茶转录组表达谱 α-亚麻酸代谢基因表达; Keywords Camellia oleifera transcriptome expression profile α-linolenic acid metabolism gene expression; 分类号 S718.46 [农业科学—林学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名油茶长链脂肪酰基CoA合成酶基因1(CoLACS1)分子特征与表达分析被引量：8: 2; 作者江南谭晓风张琳李泽蒋瑶黄丽媛; 机构中南林业科技大学经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室/经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南工业大学包装与材料工程学院中南林业科技大学/湖南工业大学经济林培育与利用湖南省; 出处《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期139-147,共9页; 基金国家林业公益性行业科研专项重大项目(201404702) 湖南省自然科学基金项目(2016JJ5031) 国家自然科学基金项目(31470684); 文摘长链脂肪酰基Co A合成酶(LACS)在脂肪酸的合成与分解代谢中起着重要作用。本研究以油茶(Camellia oleifera Abel)国家审定品种华硕(Camellia oleifera Huashuo)种仁转录组数据为基础,根据LACS基因Unigene序列设计引物,分离克隆了油茶LACS1基因全长c DNA序列,命名为CoLACS1(Gene Bank登录号:KJ960228),全长2114 bp,开放阅读框2088 bp,编码695个氨基酸;生物信息学分析显示CoLACS1具有3个B1ock,从分子特征可判断CoLACS1属于LACS家族;氨基酸同源比对显示与其他物种的LACS氨基酸序列具有较高的相似性,其中与拟南芥LACS7相似性为78%,与麻风树、大豆、毛果杨等物种LACS6(peroxisomal)相似性可达80%以上;对CoLACS1进行原核表达分析,构建的p ET30a-CoLACS1载体成功转化至BL21(DE3)中经1 mmol/L IPTG诱导表达,菌液检测获得预测的目的蛋白(分子量约为76 k D);分析转录组数据中CoLACS1的Unigene序列RTKM值并对CoLACS1进行实时荧光定量PCR分析,结果表明CoLACS1在油茶华硕种子发育各时期平稳表达,表达丰度变化不大,荧光定量结果变化规律与转录组数据分析一致;同时分析华硕种仁不同时期含油率和脂肪酸成分变化,双变量统计分析发现CoLACS1表达模式与油茶油脂积累规律呈显著相关性。本研究为进一步研究油茶油脂积累与代谢的基因调控提供理论依据。; 关键词油茶长链脂肪酰基CoA合成酶基因表达油脂积累; Keywords Camellia oleifera C. Abel long chain fatty acid acyl-CoA synthetase gene expression lipid accumulation; 分类号 S794.4 [农业科学—林木遗传育种]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于油脂合成期油桐种仁转录组数据的α-亚麻酸代谢途径解析被引量：9: 3; 作者陈昊谭晓风; 机构中南林业科技大学经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室经济林育种与栽培国家林业局重点实验室; 出处《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第3期41-48,共8页; 基金国家林业公益性行业科研专项重大项目(201204403) 中南林业科技大学引进高层次人才科研启动基金(2013RJ003); 文摘【目的】油桐种仁中产出的桐油经济利用价值极高。桐油中α-桐酸的含量高达70%,然而植物体内α-桐酸代谢通路的研究还未见报道,这对直接筛选油桐α-桐酸代谢通路相关酶基因造成一定的困难。α-亚麻酸作为α-桐酸的同分异构体,其代谢通路的研究则较为深入,能为α-桐酸代谢通路的解析提供参考。因此,本研究期望在油桐种仁转录组数据的基础上,解析油桐的α-亚麻酸代谢途径,为油桐α-桐酸代谢机理的阐明提供理论参考。此外,通过调控这些基因的表达模式以及开发与之紧密连锁的分子标记,可大大加快油桐遗传改良和分子育种的进程。【方法】采用RNA-Seq技术对油桐种仁3个不同油脂合成期的转录组进行比较,获得大量差异表达的Unigene,并将这些Unigene归类于128个代谢途径。在此基础上,通过GO分类和Pathway富集性分析,解析油桐α-亚麻酸代谢通路并分析通路中相关酶基因在油脂合成期的表达变化规律。【结果】通过对Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ期的油桐种仁RNA测序,共获得长度为200-3000个核苷酸的非冗余Unigene序列58 439条,其中能够比对到公共数据库中已知基因序列的Unigene共有41059条,占所有非冗余基因的70.3%。不同长度的非冗余Unigene序列与数据库中序列匹配的效率不同,越长的序列匹配效率越高。序列长度大于2000 bp的序列匹配效率达到98.28%,而500-1000 bp和100-500 bp的序列分别只有78.86%和48.99%的匹配效率。3个种仁油脂合成期的转录组数据中共有105个Unigene可被富集于α-亚麻酸代谢途径,占所有非冗余Unigene的0.47%。从3个转录组数据的两两比较中鉴别出一些差异表达Unigene,其中也有一些可被富集于α-亚麻酸代谢途径。通过在KEGG数据库中进行检索后发现,105个Unigene序列分别对应于14个α-亚麻酸代谢途径关键酶基因,这些基因在其他物种中都有同源基因与之对应。通过基因表达模式分析发现,整体上与合成代谢相关的基因在油脂合成期呈现上调的表达模式,而与分解代谢相关的基因则呈现下调的表达模式。【结论】在油桐种仁转录组数据的基础上,解析油桐α-亚麻酸代谢途径,获得与α-亚麻酸代谢相关的重要酶基因并分析它们在油脂合成期的表达模式,这对后续研究具有重要的启示作用。; 关键词油桐转录组测序 α-亚麻酸代谢基因表达模式; Keywords Vernicia fordii transcriptome sequencing α-linolenic acid metabolism gene expression profiles; 分类号 S718.46 [农业科学—林学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名油桐种子脂肪酸延长代谢的转录表达与代谢调控机理研究被引量：2: 4; 作者刘美兰谭晓风龙洪旭; 机构中南林业科技大学经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室/经济林育种与栽培国家林业局重点实验室; 出处《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期1053-1059,共7页; 基金国家林业公益性行业科研专项重大项目(201204403); 文摘油桐是我国四大木本油料植物之一,当前对油桐的研究主要集中在栽培选优及低产林改造方面,而对油桐脂肪酸延长代谢的分子机理研究尚未见报道。本研究以油桐果实膨大期、油脂转化初期和油脂转化高峰期的种子为材料,采用高通量RNA测序技术对油桐种子脂肪酸延长代谢的3个不同时期转录组进行比较,以nr、Swiss-Prot、KEGG和COG 4个蛋白数据库为参考,对油桐种子脂肪酸延长代谢进行了综合性分析。研究结果表明,参与油桐种子脂肪酸延长代谢途径的非冗余基因序列共37条,涉及的主要酶功能基因有9种;在果实膨大期、油脂转化初期和油脂转化高峰期中,调控脂肪酸延长代谢途径的基因存在明显的表达差异。综合分析结果绘制了油桐种子脂肪酸延长代谢途径,揭示了调控油桐种子脂肪酸延长代谢过程的基因作用规律。这些研究结果为油脂合成的遗传改良提供了资源和技术基础,同时为油桐分子设计育种提供了一定的科学依据。; 关键词油桐转录组脂肪酸延长代谢高通量RNA测序基因表达; Keywords tung oil tree transcriptome fatty acid elongation metabolism RNA-seq expressed genes; 分类号 S794.3 [农业科学—林木遗传育种]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于RNA-Seq的油茶种子α-亚麻酸代谢途径及相关基因分析	江南谭晓风张琳曾艳玲	《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心	2014	17	在线阅读下载PDF 职称材料
2	油茶长链脂肪酰基CoA合成酶基因1(CoLACS1)分子特征与表达分析	江南谭晓风张琳李泽蒋瑶黄丽媛	《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心	2017	8	在线阅读下载PDF 职称材料
3	基于油脂合成期油桐种仁转录组数据的α-亚麻酸代谢途径解析	陈昊谭晓风	《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心	2015	9	在线阅读下载PDF 职称材料
4	油桐种子脂肪酸延长代谢的转录表达与代谢调控机理研究	刘美兰谭晓风龙洪旭	《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心	2014	2	在线阅读下载PDF 职称材料