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桉树Genomic-SSR和EST-SSR引物的快速筛选与通用性研究
被引量:
12
1
作者
刘果
张党权
+2 位作者
谢耀坚
谷振军
章怀云
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期127-133,共7页
桉树是桃金娘科(Myrtaceae)桉属(Eucalyptus)、杯果木属(Angophora)和伞房属(Corymbia)3个属的树种总称,约有945种。桉树具有生长迅速、轮伐期短、耐干旱、耐贫瘠、适应性广等优良特性,且用途广、经济效益高,因此,桉树现已被世...
桉树是桃金娘科(Myrtaceae)桉属(Eucalyptus)、杯果木属(Angophora)和伞房属(Corymbia)3个属的树种总称,约有945种。桉树具有生长迅速、轮伐期短、耐干旱、耐贫瘠、适应性广等优良特性,且用途广、经济效益高,因此,桉树现已被世界近百个国家与地区引种,遍布于地中海地区、东南亚、美洲和非洲,目前已经成为世界第二大类造林树种(陈少雄等,2008;欧阳乐军等,2008;祈述雄,2006)。
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关键词
SSR标记
桉树
引物筛选
基因组DNA混合池
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职称材料
基于20种桉树叶绿体matK基因序列的系统发育分析
被引量:
4
2
作者
刘果
谢耀坚
+2 位作者
张党权
罗建中
曾艳飞
《桉树科技》
2014年第3期1-9,共9页
随着公共数据库信息量的不断丰富,桉树基因组序列的公布数据也逐渐增多。本文利用NCBI数据库下载的21条桉树叶绿体matK基因序列进行分析研究,发现软件构建的系统发育树树与学术界承认和使用的Hill&Johnson形态分类学状态有一定的差...
随着公共数据库信息量的不断丰富,桉树基因组序列的公布数据也逐渐增多。本文利用NCBI数据库下载的21条桉树叶绿体matK基因序列进行分析研究,发现软件构建的系统发育树树与学术界承认和使用的Hill&Johnson形态分类学状态有一定的差异,可能与下载的序列数据不够全面、覆盖的信息量不能代表该种基因组序列有关。通过对MP法、ML法、NJ法、UPGMA法和Bayes法等5种方法构建系统发育树、序列信息位点分析和形态学分类状态的比较,UPGMA法构建的系统发育树与序列的信息位点分析结果较为一致,MP法构建的系统发育树较为可信,但进一步的信息确认还需后续的研究证实。
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关键词
桉树
叶绿体
MATK基因
系统发育分析
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职称材料
题名
桉树Genomic-SSR和EST-SSR引物的快速筛选与通用性研究
被引量:
12
1
作者
刘果
张党权
谢耀坚
谷振军
章怀云
机构
国家林业局
桉树研究开发中心
中南林业科技大学林业生物技术湖南省重点实验室经济林育种与栽培国家林业局重点实验室经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室
出处
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期127-133,共7页
基金
林业公益性行业科研专项(201104003)
863计划课题(2011AA100202)
+1 种基金
湖南省科技厅重点项目(2010NK2008,2011NK2019)
广东省林业创新专项(2011KJCX019)
文摘
桉树是桃金娘科(Myrtaceae)桉属(Eucalyptus)、杯果木属(Angophora)和伞房属(Corymbia)3个属的树种总称,约有945种。桉树具有生长迅速、轮伐期短、耐干旱、耐贫瘠、适应性广等优良特性,且用途广、经济效益高,因此,桉树现已被世界近百个国家与地区引种,遍布于地中海地区、东南亚、美洲和非洲,目前已经成为世界第二大类造林树种(陈少雄等,2008;欧阳乐军等,2008;祈述雄,2006)。
关键词
SSR标记
桉树
引物筛选
基因组DNA混合池
Keywords
SSR marker
Eucalyptus
primer screening
genomic DNA pooling
分类号
S718.46 [农业科学—林学]
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
基于20种桉树叶绿体matK基因序列的系统发育分析
被引量:
4
2
作者
刘果
谢耀坚
张党权
罗建中
曾艳飞
机构
国家林业局
桉树研究开发中心
中南林业科技大学林业生物技术湖南省重点实验室经济林育种与栽培国家林业局重点实验室经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室
中国
林业
科学研究院
林业
研究所
国家林业局
林木
培育
重点
实验室
出处
《桉树科技》
2014年第3期1-9,共9页
基金
"十二五"农村领域国家科技计划课题"白桦
桉树等分子育种与品种创制"(2011AA100202)
文摘
随着公共数据库信息量的不断丰富,桉树基因组序列的公布数据也逐渐增多。本文利用NCBI数据库下载的21条桉树叶绿体matK基因序列进行分析研究,发现软件构建的系统发育树树与学术界承认和使用的Hill&Johnson形态分类学状态有一定的差异,可能与下载的序列数据不够全面、覆盖的信息量不能代表该种基因组序列有关。通过对MP法、ML法、NJ法、UPGMA法和Bayes法等5种方法构建系统发育树、序列信息位点分析和形态学分类状态的比较,UPGMA法构建的系统发育树与序列的信息位点分析结果较为一致,MP法构建的系统发育树较为可信,但进一步的信息确认还需后续的研究证实。
关键词
桉树
叶绿体
MATK基因
系统发育分析
Keywords
Eucalyptus
chloroplast
matK gene
phylogenetic analysis
分类号
S722.39 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
桉树Genomic-SSR和EST-SSR引物的快速筛选与通用性研究
刘果
张党权
谢耀坚
谷振军
章怀云
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013
12
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职称材料
2
基于20种桉树叶绿体matK基因序列的系统发育分析
刘果
谢耀坚
张党权
罗建中
曾艳飞
《桉树科技》
2014
4
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职称材料
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