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生物信息学方法大规模筛选肿瘤差异表达基因
被引量：
1
1
作者
刘妍
李官成
《西安交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期694-700,共7页
目的利用数据库中已有的基因信息快速筛选鉴定出潜在的肿瘤相关基因。方法利用EST数据库中的基因信息,采用数字化差异显示(DDD)方法,对17种不同肿瘤组织的全基因组进行筛选。结果获得了130个上调基因和159个下调基因,大多为编码细胞骨...
目的利用数据库中已有的基因信息快速筛选鉴定出潜在的肿瘤相关基因。方法利用EST数据库中的基因信息,采用数字化差异显示(DDD)方法,对17种不同肿瘤组织的全基因组进行筛选。结果获得了130个上调基因和159个下调基因,大多为编码细胞骨架蛋白、核糖体亚单位的基因以及与物质代谢、细胞周期、信号传导、调节转录和翻译过程有密切关系的基因。这些基因在12号染色体上出现频率最高,而在21号和Y染色体上很少出现。结论生物信息学筛选是一种快速有效的筛选方法。本实验所得结果对今后肿瘤标志物的鉴定奠定了基础,也为肿瘤标志物的筛选策略提供了新的思路。
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关键词
生物信息学
肿瘤
数字化差异显示
EST
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题名
生物信息学方法大规模筛选肿瘤差异表达基因
被引量：
1
1
作者
刘妍
李官成
机构
中南大学肿瘤研究所肿瘤免疫室
出处
《西安交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期694-700,共7页
文摘
目的利用数据库中已有的基因信息快速筛选鉴定出潜在的肿瘤相关基因。方法利用EST数据库中的基因信息,采用数字化差异显示(DDD)方法,对17种不同肿瘤组织的全基因组进行筛选。结果获得了130个上调基因和159个下调基因,大多为编码细胞骨架蛋白、核糖体亚单位的基因以及与物质代谢、细胞周期、信号传导、调节转录和翻译过程有密切关系的基因。这些基因在12号染色体上出现频率最高,而在21号和Y染色体上很少出现。结论生物信息学筛选是一种快速有效的筛选方法。本实验所得结果对今后肿瘤标志物的鉴定奠定了基础,也为肿瘤标志物的筛选策略提供了新的思路。
关键词
生物信息学
肿瘤
数字化差异显示
EST
Keywords
in silico
tumor
digital differential display
EST
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
生物信息学方法大规模筛选肿瘤差异表达基因
刘妍
李官成
《西安交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2009
1
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