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MICA基因多态性及其单核苷酸多态性位点与玫瑰痤疮易感性的相关性
被引量:
1
1
作者
尹湘丽
朱权
+2 位作者
李吉
邹义洲
罗奇志
《中南大学学报(医学版)》
北大核心
2025年第3期319-330,共12页
目的:主要组织相容性复合体Ⅰ类链相关基因A(major histocompatibility complex class Ⅰ chain-related gene A,MICA)是人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)基因的重要组成部分,其基因多态性与肿瘤、自身免疫性疾病等多种疾...
目的:主要组织相容性复合体Ⅰ类链相关基因A(major histocompatibility complex class Ⅰ chain-related gene A,MICA)是人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)基因的重要组成部分,其基因多态性与肿瘤、自身免疫性疾病等多种疾病的发生和发展密切相关。玫瑰痤疮是一种慢性炎症性皮肤病,其发病机制复杂,与遗传、自身免疫异常等因素有关。本研究分析MICA基因多态性及其单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点与玫瑰痤疮易感性的关系,旨在为玫瑰痤疮的发病机制提供新的见解。方法:收集2017年11月至2019年11月在中南大学湘雅医院皮肤科门诊就诊的84例玫瑰痤疮患者(玫瑰痤疮组)外周血DNA样本,另收集223名健康志愿者(对照组)外周血DNA样本。采用聚合酶链反应-直接测序法(polymerase chain reaction-sequencing-based typing,PCR-SBT)和二代测序(the next-generation sequencing,NGS)技术分析MICA基因多态性分型,并比较2种分型方法的准确性。比较玫瑰痤疮组与对照组MICA等位基因分布频率的差异。对所有MICA多态性分子进行氨基酸聚类分析和SNP位点分析,确定相关连锁SNP位点,并对MICA多态性分子进行分类。比较玫瑰痤疮组与对照组不同分类MICA多态性分子的分布频率差异。结果:玫瑰痤疮患者血生化检测结果以中性粒细胞计数轻度升高为主要特征,淋巴细胞计数无显著变化。PCR-SBT和NGS均能准确地鉴定MICA等位基因分型,其中MICA*010:01、MICA*008:04和MICA*019:01是玫瑰痤疮组最常见的等位基因;玫瑰痤疮组等位基因MICA*002:01、MICA*027分布频率均低于对照组(6.55%vs 18.16%、 1.19%vs 5.38%), MICA*009:01、 MICA*010:01分布频率均高于对照组(7.74%vs 3.36%、 31.55%vs18.61%),差异均有统计学意义(均P<0.05)。本研究检测到5种短串联重复序列(short tandem repeats,STR)等位基因,其中玫瑰痤疮组MICA-A4、MICA-A9分布频率均低于对照组(16.07%vs 23.32%、7.74%vs 17.26%),MICA-A6分布频率高于对照组(10.12%vs 4.03%),差异均有统计学意义(均P<0.05)。通过氨基酸序列聚类分析和SNP位点分析发现MICA基因存在6个连锁SNP位点,并据此将MICA多态性分子分为Ⅰ型(C36+M129+K173+G206+W210+S215)和Ⅱ型(Y36+V129+E173+S206+R210+T215)。玫瑰痤疮患者I型MICA多态性分子与玫瑰痤疮易感性密切相关。结论:MICA基因多态性与玫瑰痤疮易感性相关。MICA基因存在6个连锁SNP位点,可据此将MICA多态性分子分为I型和II型,其中I型与玫瑰痤疮发病密切相关。
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关键词
主要组织相容性复合体Ⅰ类链相关基因A
人类白细胞抗原
玫瑰痤疮
等位基因
基因多态性
单核苷酸多态性
聚合酶链反应-直接测序法
二代测序
短串联重复序列
在线阅读
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职称材料
MICA分子在器官移植免疫反应中的作用
被引量:
1
2
作者
李婷婷
邹义洲
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期551-555,共5页
MICA(Major histocompatibility complex classⅠrelated chain A)是人类主要组织相容复合体(MHC)Ⅰ类相关基因A编码的多态性细胞膜糖蛋白分子。MICA基因位于人类第六号染色体MHC基因复合体Ⅰ类区域,包含长而紧密开放的阅读框,编码M...
MICA(Major histocompatibility complex classⅠrelated chain A)是人类主要组织相容复合体(MHC)Ⅰ类相关基因A编码的多态性细胞膜糖蛋白分子。MICA基因位于人类第六号染色体MHC基因复合体Ⅰ类区域,包含长而紧密开放的阅读框,编码MICA分子[1]。该基因由6个外显子组成。分别编码L-信号肽,胞膜外α1、α2和α3结构域。
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关键词
器官移植免疫
基因复合体
MICA分子
外显子组
抗体检测
细胞膜糖蛋白
信号肽
结构域
阅读框
抗原表位
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职称材料
题名
MICA基因多态性及其单核苷酸多态性位点与玫瑰痤疮易感性的相关性
被引量:
1
1
作者
尹湘丽
朱权
李吉
邹义洲
罗奇志
机构
中南大学湘雅基础医学院免疫系
中南大学
湘雅
医院皮肤科
出处
《中南大学学报(医学版)》
北大核心
2025年第3期319-330,共12页
基金
国家自然科学基金(82171763)
湖南省自然科学基金(2020JJ4768)
湖南省教育科学“十三五”规划课题(ND206997)。
文摘
目的:主要组织相容性复合体Ⅰ类链相关基因A(major histocompatibility complex class Ⅰ chain-related gene A,MICA)是人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)基因的重要组成部分,其基因多态性与肿瘤、自身免疫性疾病等多种疾病的发生和发展密切相关。玫瑰痤疮是一种慢性炎症性皮肤病,其发病机制复杂,与遗传、自身免疫异常等因素有关。本研究分析MICA基因多态性及其单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点与玫瑰痤疮易感性的关系,旨在为玫瑰痤疮的发病机制提供新的见解。方法:收集2017年11月至2019年11月在中南大学湘雅医院皮肤科门诊就诊的84例玫瑰痤疮患者(玫瑰痤疮组)外周血DNA样本,另收集223名健康志愿者(对照组)外周血DNA样本。采用聚合酶链反应-直接测序法(polymerase chain reaction-sequencing-based typing,PCR-SBT)和二代测序(the next-generation sequencing,NGS)技术分析MICA基因多态性分型,并比较2种分型方法的准确性。比较玫瑰痤疮组与对照组MICA等位基因分布频率的差异。对所有MICA多态性分子进行氨基酸聚类分析和SNP位点分析,确定相关连锁SNP位点,并对MICA多态性分子进行分类。比较玫瑰痤疮组与对照组不同分类MICA多态性分子的分布频率差异。结果:玫瑰痤疮患者血生化检测结果以中性粒细胞计数轻度升高为主要特征,淋巴细胞计数无显著变化。PCR-SBT和NGS均能准确地鉴定MICA等位基因分型,其中MICA*010:01、MICA*008:04和MICA*019:01是玫瑰痤疮组最常见的等位基因;玫瑰痤疮组等位基因MICA*002:01、MICA*027分布频率均低于对照组(6.55%vs 18.16%、 1.19%vs 5.38%), MICA*009:01、 MICA*010:01分布频率均高于对照组(7.74%vs 3.36%、 31.55%vs18.61%),差异均有统计学意义(均P<0.05)。本研究检测到5种短串联重复序列(short tandem repeats,STR)等位基因,其中玫瑰痤疮组MICA-A4、MICA-A9分布频率均低于对照组(16.07%vs 23.32%、7.74%vs 17.26%),MICA-A6分布频率高于对照组(10.12%vs 4.03%),差异均有统计学意义(均P<0.05)。通过氨基酸序列聚类分析和SNP位点分析发现MICA基因存在6个连锁SNP位点,并据此将MICA多态性分子分为Ⅰ型(C36+M129+K173+G206+W210+S215)和Ⅱ型(Y36+V129+E173+S206+R210+T215)。玫瑰痤疮患者I型MICA多态性分子与玫瑰痤疮易感性密切相关。结论:MICA基因多态性与玫瑰痤疮易感性相关。MICA基因存在6个连锁SNP位点,可据此将MICA多态性分子分为I型和II型,其中I型与玫瑰痤疮发病密切相关。
关键词
主要组织相容性复合体Ⅰ类链相关基因A
人类白细胞抗原
玫瑰痤疮
等位基因
基因多态性
单核苷酸多态性
聚合酶链反应-直接测序法
二代测序
短串联重复序列
Keywords
major histocompatibility complex class I chain-related gene A
human leukocyte antigen
rosacea
allele
gene polymorphisms
single nacleotide polymorphism
polymerase chain reaction-sequencing-based typing
the next-generation sequencing
short tandem repeats
分类号
R758.73 [医药卫生—皮肤病学与性病学]
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职称材料
题名
MICA分子在器官移植免疫反应中的作用
被引量:
1
2
作者
李婷婷
邹义洲
机构
中南大学
湘雅
基础
医学院
免疫
学
系
出处
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期551-555,共5页
基金
国家自然科学基金项目(81273265)
湖南省科技重点项目(2013FJ2005)
湖南省医学卫生科技项目(B2013-003)等资助
文摘
MICA(Major histocompatibility complex classⅠrelated chain A)是人类主要组织相容复合体(MHC)Ⅰ类相关基因A编码的多态性细胞膜糖蛋白分子。MICA基因位于人类第六号染色体MHC基因复合体Ⅰ类区域,包含长而紧密开放的阅读框,编码MICA分子[1]。该基因由6个外显子组成。分别编码L-信号肽,胞膜外α1、α2和α3结构域。
关键词
器官移植免疫
基因复合体
MICA分子
外显子组
抗体检测
细胞膜糖蛋白
信号肽
结构域
阅读框
抗原表位
分类号
R392.45 [医药卫生—免疫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
MICA基因多态性及其单核苷酸多态性位点与玫瑰痤疮易感性的相关性
尹湘丽
朱权
李吉
邹义洲
罗奇志
《中南大学学报(医学版)》
北大核心
2025
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
MICA分子在器官移植免疫反应中的作用
李婷婷
邹义洲
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015
1
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职称材料
已选择
0
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