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卵巢成熟期和退化期星斑川鲽脑垂体和下丘脑组织的转录组比较分析
被引量：
2
1
作者
周江
王丽娟
+2 位作者
王波
郑凤荣
王长海
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期346-355,共10页
为了解星斑川鲽(Starry Flounder,Platichthys stellatus)脑组织基因表达与卵巢发育调控的关系,发掘相关功能基因,研究提取卵巢成熟期和退化期星斑川鲽雌鱼脑垂体和下丘脑组织总RNA,运用Hi Seq 2000高通量测序技术进行转录组测序分析。...
为了解星斑川鲽(Starry Flounder,Platichthys stellatus)脑组织基因表达与卵巢发育调控的关系,发掘相关功能基因,研究提取卵巢成熟期和退化期星斑川鲽雌鱼脑垂体和下丘脑组织总RNA,运用Hi Seq 2000高通量测序技术进行转录组测序分析。测序结果经拼接组装后共获得30640条Unigenes,Blast同源性比对显示,其中24128条Unigenes获得注释;经egg Nog功能注释后29137条Unigenes序列分为26类,分别涉及信号转导、翻译机制等生理生化过程。KEGG pathway数据比对显示,卵巢成熟期涉及98种代谢途径,135条序列表达上调;卵巢退化期涉及192种代谢途径,648条序列表达上调。Unigenes表达量及表达差异分析表明在卵巢成熟期334条序列表达上调,卵巢退化期987条序列表达上调。获得功能注释的Unigene中,408条涉及生殖调控和内分泌调控,参与生殖调控的信号分子有1508条。试验采用实时定量PCR研究了涉及生殖调控和内分泌调控基因促性腺激素释放激素(Gn RH)、神经激肽B(NKB)、促性腺激素(Gt H)、促滤泡激素(FSH)、肿瘤转移抑制因子(Kiss)以及催乳素释放肽受体(Pr RPR)在卵巢两个不同发育时期脑垂体和下丘脑的表达情况,结果表明除FSH外,其余均在卵巢退化期时期脑组织中表达升高,与转录组测序结果趋势一致。
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关键词
星斑川鲽
脑组织
转录组测序
实时定量PCR
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题名
卵巢成熟期和退化期星斑川鲽脑垂体和下丘脑组织的转录组比较分析
被引量：
2
1
作者
周江
王丽娟
王波
郑凤荣
王长海
机构
南京农业大学资源与环境学院
中华人民共和国盐城出入境检验检疫局
国家海洋
局
第一海洋研究所
出处
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期346-355,共10页
基金
国家高技术发展计划“863项目”(2012AA10A413、2012AA10A408)
国家海洋公益性行业科研专项(201305005)资助~~
文摘
为了解星斑川鲽(Starry Flounder,Platichthys stellatus)脑组织基因表达与卵巢发育调控的关系,发掘相关功能基因,研究提取卵巢成熟期和退化期星斑川鲽雌鱼脑垂体和下丘脑组织总RNA,运用Hi Seq 2000高通量测序技术进行转录组测序分析。测序结果经拼接组装后共获得30640条Unigenes,Blast同源性比对显示,其中24128条Unigenes获得注释;经egg Nog功能注释后29137条Unigenes序列分为26类,分别涉及信号转导、翻译机制等生理生化过程。KEGG pathway数据比对显示,卵巢成熟期涉及98种代谢途径,135条序列表达上调;卵巢退化期涉及192种代谢途径,648条序列表达上调。Unigenes表达量及表达差异分析表明在卵巢成熟期334条序列表达上调,卵巢退化期987条序列表达上调。获得功能注释的Unigene中,408条涉及生殖调控和内分泌调控,参与生殖调控的信号分子有1508条。试验采用实时定量PCR研究了涉及生殖调控和内分泌调控基因促性腺激素释放激素(Gn RH)、神经激肽B(NKB)、促性腺激素(Gt H)、促滤泡激素(FSH)、肿瘤转移抑制因子(Kiss)以及催乳素释放肽受体(Pr RPR)在卵巢两个不同发育时期脑垂体和下丘脑的表达情况,结果表明除FSH外,其余均在卵巢退化期时期脑组织中表达升高,与转录组测序结果趋势一致。
关键词
星斑川鲽
脑组织
转录组测序
实时定量PCR
Keywords
Platichthys stellatus
Brain tissue
Transcriptome sequencing
qRT-PCR
分类号
S961.6 [农业科学—水产养殖]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
卵巢成熟期和退化期星斑川鲽脑垂体和下丘脑组织的转录组比较分析
周江
王丽娟
王波
郑凤荣
王长海
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
2
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