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基于网络药理学对麻花秦艽治疗脑缺血的机制研究 被引量:2
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作者 呼田 张嘉豪 +7 位作者 周雪薇 孙欠欠 赵安东 赵勤 王颖婷 王川 刘继平 王斌 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS 北大核心 2023年第S01期15-16,共2页
目的基于网络药理学从分子水平探讨麻花秦艽抗缺血性脑卒中的物质基础及作用机制。方法中国知网、万方数据库相关文献收集麻花秦艽化学成分,通过TCMSP数据库进行筛选并搜素复制符合条件的化学成分对应靶点名,通过Uniprot数据库对靶点进... 目的基于网络药理学从分子水平探讨麻花秦艽抗缺血性脑卒中的物质基础及作用机制。方法中国知网、万方数据库相关文献收集麻花秦艽化学成分,通过TCMSP数据库进行筛选并搜素复制符合条件的化学成分对应靶点名,通过Uniprot数据库对靶点进行标准化,利用OMIM、TTD和GeneCards数据库收集脑缺血相关靶点,Venny数据库取其交集,Cytoscape软件构建“药物—活性成分—交集基因网络图”,STRING数据库构建PPI靶点互作图,DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析。结果麻花秦艽有效成分主要参与RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、基因表达的正调控、DNA转录的正调控等生物过程作用于TNF、IL-17、Relaxin、HIF-1等信号通路;对网络图分析得到齐墩果酸、草木犀苷、邻苯二甲酸二丁酯、槲皮素、落干酸等核心成分和STAT3、JUN、AKT1、TP53、RELA、IL-6、MAPK14等关键靶点。结论麻花秦艽可能通过调控炎症反应、细胞凋亡和氧化应激等途径发挥抗脑缺血的作用。 展开更多
关键词 缺血性脑卒中 网络药理学 麻花秦艽 作用机制
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基于网络药理学与实验验证探讨黄芩苷/栀子苷抗脑缺血后血管内皮功能障碍的作用及其机制 被引量:8
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作者 张行行 赵麓 +5 位作者 孙欠欠 赵安东 刘继平 史永恒 王川 王斌 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS 北大核心 2023年第S01期19-19,共1页
目的通过网络药理学预测和实验验证结合,探讨黄芩苷(BC)/栀子苷(GD)能否通过抗脑缺血后血管内皮功能障碍发挥治疗作用。方法收集BC、GD预测靶点和脑缺血后血管内皮功能障碍疾病靶点,取交集靶点进行蛋白质互作分析,并进行GO功能注释和KEG... 目的通过网络药理学预测和实验验证结合,探讨黄芩苷(BC)/栀子苷(GD)能否通过抗脑缺血后血管内皮功能障碍发挥治疗作用。方法收集BC、GD预测靶点和脑缺血后血管内皮功能障碍疾病靶点,取交集靶点进行蛋白质互作分析,并进行GO功能注释和KEGG通路富集分析。利用离体血管环与在体实验对网络药理结果进行验证。结果共收集到BC/GD抗脑缺血后内皮功能障碍107个靶基因,主要涉及IL-17、TNF、NOD样、MAPK等信号通路,取NOD样信号通路中最具代表性NLRP3炎性小体进行实验验证,结果表明,BC/GD呈部分内皮依赖性舒张脑基底血管环;MCAO大鼠神经功能评分、脑梗死体积明显降低,脑血流量增加,缺血侧皮层和脑基底动脉内皮病理状态改善,缺血侧皮层中NLRP3、胱天蛋白酶1和IL-1β蛋白表达被抑制,脑基底动脉中iNOS蛋白表达下调、eNOS蛋白表达上调,皮层中ROS水平降低、NO水平升高,血清中IL-1β、IL-18水平降低。结论BC/GD可能通过下调NLRP3炎性小体的活化,抑制炎症反应,改善血管内皮功能,增加脑血流量,降低脑梗死体积,改善脑缺血损伤。 展开更多
关键词 网络药理学 脑缺血 黄芩苷 栀子苷 内皮障碍
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基于网络药理学探讨清热类中药治疗缺血性脑病的物质基础和作用机制 被引量:1
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作者 赵安东 孙欠欠 +3 位作者 张嘉豪 呼田 周雪薇 王斌 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS 北大核心 2023年第S01期20-20,共1页
目的基于信息定量统计方法和网络药理学探讨清热类中药抗缺血性脑病的活性成分以及作用机制。方法在PubMed、CNKI、https://db.yaozh.com/chufang、http://www.zhongyoo.com/fangji/数据库中收集防治缺血性脑病的中药处方,就其中清热类... 目的基于信息定量统计方法和网络药理学探讨清热类中药抗缺血性脑病的活性成分以及作用机制。方法在PubMed、CNKI、https://db.yaozh.com/chufang、http://www.zhongyoo.com/fangji/数据库中收集防治缺血性脑病的中药处方,就其中清热类中药应用频次予以统计分析,并根据统计结果按中药学功效予以分类,总结不同生物活性成分抗脑缺血作用机制;采用网络数据库获取清热类中药成分及其对应的作用靶点、缺血性卒中的疾病靶点,Venny2.1.0获取成分-疾病靶点交集,Cytoscape构建“药物-活性成分-靶点网络图”,DAVID进行GO和KEGG富集分析。结果文献和数据库筛选后涉及处方149条,共有中药269味,单味清热类中药20味,用药频率排在前5的是赤芍、黄芩、黄连、地黄、栀子;网络药理学所得主要成分有β-谷甾醇、汉黄芩素、小檗碱、柳杉酚、黄芩苷等,富集分析得到PI3K-AKT、Ca^(2+)、cAMP、MAPK、Relax⁃in等信号通路。结论清热类中药抗缺血性脑病的主要成分包括黄酮类、生物碱类、萜类、苯丙素类和挥发油类;其作用机制主要有抑制兴奋性氨基酸毒性、减轻炎症、抗氧化应激、抗神经细胞凋亡以及保护血脑屏障。 展开更多
关键词 缺血性脑病 清热类中药 网络药理学 活性成分 信号通路
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基于网络药理学和分子对接探讨郁金散加减方治疗猪传染性胃肠炎的作用机制 被引量:3
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作者 郭紫艳 宋延平 +1 位作者 年霞 苏敏 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期809-819,共11页
[目的]基于网络药理学和分子对接技术探讨郁金散加减方治疗猪传染性胃肠炎(TGE)的作用靶点及机制。[方法]在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)搜索郁金散加减方的活性成分及靶点并经UniProt平台转换,在比较毒理基因组学数据库(CTD... [目的]基于网络药理学和分子对接技术探讨郁金散加减方治疗猪传染性胃肠炎(TGE)的作用靶点及机制。[方法]在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)搜索郁金散加减方的活性成分及靶点并经UniProt平台转换,在比较毒理基因组学数据库(CTD)中搜索TGE相关靶点,将两者交集靶点导入Cytoscape 3.9.1软件中构建郁金散加减方-成分-靶点-疾病网络关系图,在STRING数据库和Cytoscape 3.9.1软件中进行蛋白互作(PPI)网络分析,在DAVID数据库中进行GO功能和KEGG信号通路富集分析,用AutoDock软件进行分子对接。[结果]共收集到郁金散加减方包括槲皮素、芒柄花黄素在内的126个活性成分,得到郁金散加减方治疗TGE的相关靶点74个。郁金散加减方-成分-靶点-疾病网络关系图结果显示,郁金散加减方治疗TGE的核心成分为槲皮素、山奈酚等;PPI结果表明,郁金散加减方治疗TGE的核心靶点为抑癌基因P53(TP53)、癌基因FOS、肿瘤坏死因子(TNF)、基质金属蛋白酶9(MMP9)及胱天蛋白酶3(CASP3)等;GO功能和KEGG信号通路分析结果显示,郁金散加减方治疗TGE的作用机制涉及到免疫反应、抗炎等过程,并调控MAPK、IL17、TNF、TH-17细胞分化、抗炎症性肠病和NF-κB等信号通路。核心成分与关键受体氨肽酶N(APN)分子对接表明,郁金散加减方与APN具有良好的结合能力。[结论]郁金散加减方主要是利用槲皮素、4′-甲氧基光甘草定、芒柄花黄素等核心成分作用于TP53、FOS、TNF、MMP9、CASP3等靶点,调控MAPK、IL7、TNF、TH-17细胞分化、抗炎症性肠病、NF-κB等信号通路来发挥对TGE的治疗作用。 展开更多
关键词 网络药理学 分子对接 郁金散加减方 猪传染性胃肠炎 作用机制
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SARS-CoV-2刺突糖蛋白对神经细胞的损伤效应及机制 被引量:1
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作者 王娇 李佳佳 +3 位作者 肖文一 韦冬晖 蒋宁 周文霞 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第5期375-383,共9页
目的探讨严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)刺突糖蛋白(S蛋白)对人神经母细胞瘤细胞(SH-SY5Y)的损伤效应及其机制。方法用S蛋白0(细胞对照组),25,50,75和100 mg·L^(-1)处理SH-SY5Y 24 h,CCK-8法检测细胞活力;比色法检测乳... 目的探讨严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)刺突糖蛋白(S蛋白)对人神经母细胞瘤细胞(SH-SY5Y)的损伤效应及其机制。方法用S蛋白0(细胞对照组),25,50,75和100 mg·L^(-1)处理SH-SY5Y 24 h,CCK-8法检测细胞活力;比色法检测乳酸脱氢酶(LDH)释放率;EdU试剂盒检测细胞增殖;荧光素酶发光法检测细胞内ATP含量;JC-1荧光探针法检测细胞线粒体膜电位(MMP);Seahorse XF检测细胞糖酵解及线粒体氧化磷酸化水平。结果与细胞对照组相比,S蛋白25,50,75和100 mg·L^(-1)组细胞活力显著降低(P<0.01),半数抑制浓度(IC_(50))为65.05 mg·L^(-1);LDH释放率显著增加(P<0.01);EdU阳性细胞比例显著降低(P<0.01);S蛋白75和100 mg·L^(-1)组细胞内ATP含量显著降低(P<0.01);S蛋白50和75 mg·L^(-1)组细胞内MMP显著降低(P<0.05,P<0.01);S蛋白50 mg·L^(-1)组基础糖酵解水平和糖酵解能力的最大值显著升高(P<0.05,P<0.01),S蛋白25和50 mg·L^(-1)组呼吸能力最大值显著升高(P<0.05,P<0.01)。SH-SY5Y细胞活力与细胞内ATP含量和MMP均呈正相关(r^(2)=0.9209,P=0.001;r^(2)=0.6170,P=0.0025);与反映细胞糖酵解水平的细胞基础糖酵解水平和糖酵解能力最大值呈负相关(r^(2)=0.5194,P=0.0285;r^(2)=0.6664,P=0.0073),与反映线粒体氧化磷酸化水平的ATP生成能力呈负相关(r^(2)=0.8204,P=0.0008)。结论S蛋白使SH-SY5Y细胞活力下降,抑制细胞增殖,其机制可能与干扰神经细胞内能量代谢密切相关。 展开更多
关键词 严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2) 刺突糖蛋白 人神经母细胞瘤细胞 神经损伤 糖酵解 能量代谢
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