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玉米ZmWRKY36基因的生物信息学及功能分析
1
作者
王文丽
穆春华
+7 位作者
张发军
刘霞
冷冰莹
姚国旗
闫振伟
刘巍
王昀
张恩盈
《山东农业科学》
北大核心
2023年第12期1-8,共8页
作为植物转录因子家族最大的成员之一,WRKY蛋白在植物的生长发育、防御反应以及胁迫响应中都发挥着极为关键的作用.本研究以玉米自交系B73为材料,克隆了一个玉米WRKY转录因子Zm-WRKY36,并对其进行生物信息学与功能分析.结果表明,ZmWRKY3...
作为植物转录因子家族最大的成员之一,WRKY蛋白在植物的生长发育、防御反应以及胁迫响应中都发挥着极为关键的作用.本研究以玉米自交系B73为材料,克隆了一个玉米WRKY转录因子Zm-WRKY36,并对其进行生物信息学与功能分析.结果表明,ZmWRKY36基因的开放阅读框为1002 bp,编码333个氨基酸.ZmWRKY36蛋白分子量为35.8 kDa,理论等电点为5.66,属于酸性蛋白;不稳定系数为67.16,为极不稳定蛋白;亲水指数为-0.526,为亲水性蛋白;具有1个WRKY结构域和1个C2 HC锌指结构基序,属于WRKY转录因子Ⅲ类亚家族成员;与高粱SbWRKY64、稷PmWRKY4和狗尾草SvWRKY4有着较近的亲缘关系.进一步分析发现,ZmWRKY36蛋白定位于细胞核内,并且有着较强的转录激活活性.qRT-PCR结果显示,ZmWRKY36基因在玉米根和叶中表达量较高,具有组织特异性;并且受到干旱胁迫和盐胁迫的显著诱导,表明转录因子ZmWRKY36可能在玉米抵御外界干旱胁迫和盐胁迫的过程中发挥着重要作用.
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关键词
玉米
ZmWRKY36
生物信息学分析
功能分析
干旱胁迫
盐胁迫
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职称材料
题名
玉米ZmWRKY36基因的生物信息学及功能分析
1
作者
王文丽
穆春华
张发军
刘霞
冷冰莹
姚国旗
闫振伟
刘巍
王昀
张恩盈
机构
青岛农业大学农学院
山东省农业科学院玉米研究所/小麦玉米国家工程实验室/农业部黄淮海北部玉米生物学与遗传育种重点实验室
中化化肥有限公司吉林分公司
安丘市农产品质量安全管理服务中心
出处
《山东农业科学》
北大核心
2023年第12期1-8,共8页
基金
山东省重点研发计划项目“玉米抗锈病机制及绿色防控体系集成与应用”(2022CXGC010607)
国家自然科学基金青年基金项目“细胞分裂素调控植物气孔发育分子机理的研究”(31900249)
山东省农业科学院农业科技创新工程项目(CXGC2022E02)。
文摘
作为植物转录因子家族最大的成员之一,WRKY蛋白在植物的生长发育、防御反应以及胁迫响应中都发挥着极为关键的作用.本研究以玉米自交系B73为材料,克隆了一个玉米WRKY转录因子Zm-WRKY36,并对其进行生物信息学与功能分析.结果表明,ZmWRKY36基因的开放阅读框为1002 bp,编码333个氨基酸.ZmWRKY36蛋白分子量为35.8 kDa,理论等电点为5.66,属于酸性蛋白;不稳定系数为67.16,为极不稳定蛋白;亲水指数为-0.526,为亲水性蛋白;具有1个WRKY结构域和1个C2 HC锌指结构基序,属于WRKY转录因子Ⅲ类亚家族成员;与高粱SbWRKY64、稷PmWRKY4和狗尾草SvWRKY4有着较近的亲缘关系.进一步分析发现,ZmWRKY36蛋白定位于细胞核内,并且有着较强的转录激活活性.qRT-PCR结果显示,ZmWRKY36基因在玉米根和叶中表达量较高,具有组织特异性;并且受到干旱胁迫和盐胁迫的显著诱导,表明转录因子ZmWRKY36可能在玉米抵御外界干旱胁迫和盐胁迫的过程中发挥着重要作用.
关键词
玉米
ZmWRKY36
生物信息学分析
功能分析
干旱胁迫
盐胁迫
Keywords
Maize
ZmWRKY36
Bioinformatics analysis
Functional analysis
Drought stress
Salt stress
分类号
S513 [农业科学—作物学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
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1
玉米ZmWRKY36基因的生物信息学及功能分析
王文丽
穆春华
张发军
刘霞
冷冰莹
姚国旗
闫振伟
刘巍
王昀
张恩盈
《山东农业科学》
北大核心
2023
0
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