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微卫星标记在刺参(Apostichopus japonicus)人工繁育中亲本识别的应用
被引量:
8
1
作者
李雪燕
孙国华
+4 位作者
杨建敏
刘兆存
韦秀梅
王卫军
郭婷婷
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第5期1263-1269,共7页
选取8个高多态性的微卫星位点,对240只刺参(Apostichopus japonicus)幼体和14只疑似亲本进行了亲缘关系的鉴定。通过检测,8个微卫星位点共得到53个等位基因,平均等位基因数为6.63;观察杂合度在0.730—0.902;各位点的多态信息含量为0.696...
选取8个高多态性的微卫星位点,对240只刺参(Apostichopus japonicus)幼体和14只疑似亲本进行了亲缘关系的鉴定。通过检测,8个微卫星位点共得到53个等位基因,平均等位基因数为6.63;观察杂合度在0.730—0.902;各位点的多态信息含量为0.696—0.836。通过亲缘关系分析软件CERVUS 3.0分析,微卫星位点累积排除概率分别为0.9934、0.9997、0.99999。基于排除法个体基因型判定,有37个子代有1个候选亲本,194个子代有2个及以上候选亲本;基于似然法判定,置信度为80%时,有198个子代个体找到最似亲本。综合排除法和似然法的亲权鉴定,成功为229个子代个体找到它们的亲本,鉴定成功率达95%以上。本研究结果可为刺参育种工作中亲本识别及家系分析提供技术支持和理论依据。
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关键词
刺参
微卫星
亲权鉴定
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职称材料
题名
微卫星标记在刺参(Apostichopus japonicus)人工繁育中亲本识别的应用
被引量:
8
1
作者
李雪燕
孙国华
杨建敏
刘兆存
韦秀梅
王卫军
郭婷婷
机构
上海海洋大学
水产
与生命学院
山东省海洋
水产
研究所山东省海洋生态修复重点实验室
东营市河口华春水产技术开发有限责任公司
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第5期1263-1269,共7页
基金
山东省自然科学基金项目,ZR2011CM036号
山东省现代农业产业技术体系刺参创新团队刺参育种岗位,2012-2014
+1 种基金
海洋经济创新发展区域示范项目,20130125号
山东省优秀中青年科学家基金,Y231041011号
文摘
选取8个高多态性的微卫星位点,对240只刺参(Apostichopus japonicus)幼体和14只疑似亲本进行了亲缘关系的鉴定。通过检测,8个微卫星位点共得到53个等位基因,平均等位基因数为6.63;观察杂合度在0.730—0.902;各位点的多态信息含量为0.696—0.836。通过亲缘关系分析软件CERVUS 3.0分析,微卫星位点累积排除概率分别为0.9934、0.9997、0.99999。基于排除法个体基因型判定,有37个子代有1个候选亲本,194个子代有2个及以上候选亲本;基于似然法判定,置信度为80%时,有198个子代个体找到最似亲本。综合排除法和似然法的亲权鉴定,成功为229个子代个体找到它们的亲本,鉴定成功率达95%以上。本研究结果可为刺参育种工作中亲本识别及家系分析提供技术支持和理论依据。
关键词
刺参
微卫星
亲权鉴定
Keywords
Apostichopus japonicus microsatellite parentage testing
分类号
Q346 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
微卫星标记在刺参(Apostichopus japonicus)人工繁育中亲本识别的应用
李雪燕
孙国华
杨建敏
刘兆存
韦秀梅
王卫军
郭婷婷
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2013
8
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