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基因芯片检测拉米夫定引起的乙型肝炎病毒基因YMDD变异的研究
被引量:
3
1
作者
曹新民
赵伟
+5 位作者
刘伟
刘全俊
张林
张汉荣
刘新珏
周镇先
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第9期637-640,共4页
目的:建立乙型肝炎病毒(HBV)变异基因诊断芯片,对拉米夫定治疗慢性乙型肝炎过程中出现的肝炎病毒P基因区YMDD变异进行快速准确的检测诊断。方法:设计特异性寡核苷酸探针。用点样法制备HBV变异基因诊断芯片。选择住院患者30例服用拉米夫...
目的:建立乙型肝炎病毒(HBV)变异基因诊断芯片,对拉米夫定治疗慢性乙型肝炎过程中出现的肝炎病毒P基因区YMDD变异进行快速准确的检测诊断。方法:设计特异性寡核苷酸探针。用点样法制备HBV变异基因诊断芯片。选择住院患者30例服用拉米夫定后,HBVDNA转阴[<500拷贝(opies/ml)]68周后又反跳≥5000copies/ml的患者进行基因芯片杂交检测。同时用PCR直接测序法对30例患者血清标本进行双盲HBVDNA聚合酶活性区域测序对照。结果:30例服药后HBVDNA反跳患者中基因芯片测得HBVYMDD变异21例,其中YVDD变异11例,YIDD变异10例。直接序列测定发现有核苷酸A741变为G,使氨基酸由蛋氨酸552变为缬氨酸(氨基酸基序由YMDD变为YVDD)11例,有6例核苷酸A669变为C,使氨基酸由亮氨酸528变为蛋氨酸;核苷酸G743变为T,使氨基酸由蛋氨酸552变为异亮氨酸(氨基酸基序由YMDD变为YIDD)10例。其中有3例伴有核苷酸T781变为C,使氨基酸由亮氨酸565变为脯氨酸。其结果与基因芯片完全一致。结论:HBV变异基因诊断芯片可以同时检测YVDD、YIDD变异,同PCR直接测序法比较,准确率达100%,无假阳性。
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关键词
基因芯片
拉米夫定
病毒变异
乙型肝炎病毒
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职称材料
题名
基因芯片检测拉米夫定引起的乙型肝炎病毒基因YMDD变异的研究
被引量:
3
1
作者
曹新民
赵伟
刘伟
刘全俊
张林
张汉荣
刘新珏
周镇先
机构
东南大学医学院附属南京市第二医院肝内科
东南大学
分子与生物电子国家重点实验室
出处
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第9期637-640,共4页
基金
江苏省科技厅重点资助项目
江苏省卫生厅重点资助项目(BS2000028)
文摘
目的:建立乙型肝炎病毒(HBV)变异基因诊断芯片,对拉米夫定治疗慢性乙型肝炎过程中出现的肝炎病毒P基因区YMDD变异进行快速准确的检测诊断。方法:设计特异性寡核苷酸探针。用点样法制备HBV变异基因诊断芯片。选择住院患者30例服用拉米夫定后,HBVDNA转阴[<500拷贝(opies/ml)]68周后又反跳≥5000copies/ml的患者进行基因芯片杂交检测。同时用PCR直接测序法对30例患者血清标本进行双盲HBVDNA聚合酶活性区域测序对照。结果:30例服药后HBVDNA反跳患者中基因芯片测得HBVYMDD变异21例,其中YVDD变异11例,YIDD变异10例。直接序列测定发现有核苷酸A741变为G,使氨基酸由蛋氨酸552变为缬氨酸(氨基酸基序由YMDD变为YVDD)11例,有6例核苷酸A669变为C,使氨基酸由亮氨酸528变为蛋氨酸;核苷酸G743变为T,使氨基酸由蛋氨酸552变为异亮氨酸(氨基酸基序由YMDD变为YIDD)10例。其中有3例伴有核苷酸T781变为C,使氨基酸由亮氨酸565变为脯氨酸。其结果与基因芯片完全一致。结论:HBV变异基因诊断芯片可以同时检测YVDD、YIDD变异,同PCR直接测序法比较,准确率达100%,无假阳性。
关键词
基因芯片
拉米夫定
病毒变异
乙型肝炎病毒
Keywords
gene chip
lamivudine
HBV YMDD motif mutation
HBV
分类号
R575.2 [医药卫生—消化系统]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基因芯片检测拉米夫定引起的乙型肝炎病毒基因YMDD变异的研究
曹新民
赵伟
刘伟
刘全俊
张林
张汉荣
刘新珏
周镇先
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2005
3
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