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江苏省2013年甲型H1N1(09pdm)流感病毒血凝素和神经氨酸酶分子特征分析
被引量：
14
1
作者
资海荣
郭艳
+5 位作者
邓斐
余慧燕
王慎骄
汤奋扬
祁贤
卫平民
《南京医科大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期812-822,共11页
目的 ：分析江苏省2013年甲型H1N1（09pdm）流感病毒血凝素（hemagglutinin,HA）和神经氨酸酶（neuraminidase,NA）变异情况,分析其遗传进化特征。方法 ：按照流感样病例定义,收集江苏省各哨点医院流感样病例标本,阳性样本经病毒分离培...
目的 ：分析江苏省2013年甲型H1N1（09pdm）流感病毒血凝素（hemagglutinin,HA）和神经氨酸酶（neuraminidase,NA）变异情况,分析其遗传进化特征。方法 ：按照流感样病例定义,收集江苏省各哨点医院流感样病例标本,阳性样本经病毒分离培养及亚型鉴定。选取2013年不同时间段、不同地区具有代表性的14株甲型H1N1（09pdm）阳性毒株,利用特异性引物扩增HA、NA基因,测序并分析其遗传进化特征。结果 ：14株分离毒株与疫苗株A/California/07/2009（H1N1）的HA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为97.6%~98.4%和96.5%~98.0%。NA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为98.4%~98.9%和97.0%~98.5%。遗传进化分析表明,14株分离株HA和NA基因分属于不同的进化谱系。分子特征表现为HA氨基酸序列出现D114N、K300E、E516K的变异,NA分子特征表现为N44S位点变异。从2013年左右开始甲型H1N1（09pdm）流感基因多样性增加;通过FEL模型得到一个正向压力选择HA氨基酸位点310,一个正向压力选择NA氨基酸位点4,通过REL模型得到9个正向压力选择HA氨基酸位点179、180、239、301、303、310、311、312、313（含位点310）,5个正向压力选择NA氨基酸位点4、23、52、287、374（含位点4）。HA蛋白具有9个潜在糖基化位点,7个位于HA1上,2个位于HA2上;NA蛋白共有9个潜在糖基化位点。14株分离毒株在NA蛋白酶活性中心及周围辅助位点上均未发现变异。结论：2013年江苏省甲型H1N1（09pdm）流感HA、NA基因变异加快,遗传多样性增加,未来的遗传进化值得进一步关注。
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关键词
甲型H1N1(09pdm)
血凝素
神经氨酸酶
分子特征
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职称材料
多因子共线性的主成分logistic回归分析
被引量：
14
2
作者
陈雄飞
董晓梅
+1 位作者
汪宁
方积乾
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2003年第4期212-215,共4页
目的 采用主成分改进的条件logistic解决原发性开角型青光眼病因研究中的共线性问题。方法 采用1∶3配比病例对照设计 ,利用多重线性回归中的共线性诊断技术进行共线性诊断 ,以主成分改进的条件logistic回归分析解决共线性。结果 主...
目的 采用主成分改进的条件logistic解决原发性开角型青光眼病因研究中的共线性问题。方法 采用1∶3配比病例对照设计 ,利用多重线性回归中的共线性诊断技术进行共线性诊断 ,以主成分改进的条件logistic回归分析解决共线性。结果 主成分条件logistic回归能改善参数估计 ,显著降低标准误。 结论 主成分改进的条件logistic能很好地解决原发性开角型青光眼病因研究中的共线性问题。
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关键词
开角型青光眼
发病原因
发病机制
共线性
LOGISTIC回归分析
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职称材料
题名
江苏省2013年甲型H1N1(09pdm)流感病毒血凝素和神经氨酸酶分子特征分析
被引量：
14
1
作者
资海荣
郭艳
邓斐
余慧燕
王慎骄
汤奋扬
祁贤
卫平民
机构
东南大学公共卫生学院流行病学教研室
江苏省疾病预防控制中心
出处
《南京医科大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期812-822,共11页
基金
国家自然科学基金项目(81273143)
江苏省医学重点人才基金项目(RC2011084)
江苏省自然科学基金项目(BK20131450)
文摘
目的 ：分析江苏省2013年甲型H1N1（09pdm）流感病毒血凝素（hemagglutinin,HA）和神经氨酸酶（neuraminidase,NA）变异情况,分析其遗传进化特征。方法 ：按照流感样病例定义,收集江苏省各哨点医院流感样病例标本,阳性样本经病毒分离培养及亚型鉴定。选取2013年不同时间段、不同地区具有代表性的14株甲型H1N1（09pdm）阳性毒株,利用特异性引物扩增HA、NA基因,测序并分析其遗传进化特征。结果 ：14株分离毒株与疫苗株A/California/07/2009（H1N1）的HA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为97.6%~98.4%和96.5%~98.0%。NA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为98.4%~98.9%和97.0%~98.5%。遗传进化分析表明,14株分离株HA和NA基因分属于不同的进化谱系。分子特征表现为HA氨基酸序列出现D114N、K300E、E516K的变异,NA分子特征表现为N44S位点变异。从2013年左右开始甲型H1N1（09pdm）流感基因多样性增加;通过FEL模型得到一个正向压力选择HA氨基酸位点310,一个正向压力选择NA氨基酸位点4,通过REL模型得到9个正向压力选择HA氨基酸位点179、180、239、301、303、310、311、312、313（含位点310）,5个正向压力选择NA氨基酸位点4、23、52、287、374（含位点4）。HA蛋白具有9个潜在糖基化位点,7个位于HA1上,2个位于HA2上;NA蛋白共有9个潜在糖基化位点。14株分离毒株在NA蛋白酶活性中心及周围辅助位点上均未发现变异。结论：2013年江苏省甲型H1N1（09pdm）流感HA、NA基因变异加快,遗传多样性增加,未来的遗传进化值得进一步关注。
关键词
甲型H1N1(09pdm)
血凝素
神经氨酸酶
分子特征
Keywords
A/H 1N 1 （09pdm）
hemagglutinin
neuraminidase
molecular characteristics
分类号
R373.1 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
多因子共线性的主成分logistic回归分析
被引量：
14
2
作者
陈雄飞
董晓梅
汪宁
方积乾
机构
中山
大学
公共
卫生
学院
医
学
统计与
流行病
学
系
暨南
大学
流行病
学
教研室
东南大学公共卫生学院流行病学教研室
出处
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2003年第4期212-215,共4页
文摘
目的 采用主成分改进的条件logistic解决原发性开角型青光眼病因研究中的共线性问题。方法 采用1∶3配比病例对照设计 ,利用多重线性回归中的共线性诊断技术进行共线性诊断 ,以主成分改进的条件logistic回归分析解决共线性。结果 主成分条件logistic回归能改善参数估计 ,显著降低标准误。 结论 主成分改进的条件logistic能很好地解决原发性开角型青光眼病因研究中的共线性问题。
关键词
开角型青光眼
发病原因
发病机制
共线性
LOGISTIC回归分析
Keywords
Co-linearity, Principal component analysis, Logistic regression, Glaucoma, Open-angle
分类号
R181.3 [医药卫生—流行病学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
江苏省2013年甲型H1N1(09pdm)流感病毒血凝素和神经氨酸酶分子特征分析
资海荣
郭艳
邓斐
余慧燕
王慎骄
汤奋扬
祁贤
卫平民
《南京医科大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2015
14
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
多因子共线性的主成分logistic回归分析
陈雄飞
董晓梅
汪宁
方积乾
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2003
14
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职称材料
已选择
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统计分析
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