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大豆GmGLP10基因的克隆及生物信息学分析 被引量:3
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作者 张宇航 李永光 +5 位作者 王雪松 孙铭阳 勾涵 陈薇 李悦 李文滨 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期388-393,共6页
通过PCR的方法从大豆抗菌核病品种Maple Arrow中克隆得到Gm GLP10基因,生物信息学分析结果显示Gm GLP10蛋白由213个氨基酸组成,具有一个糖基化位点和多个磷酸化位点,为胞外分泌蛋白。通过对Gm GLP10基因起始密码子上游1 500 bp序列进行... 通过PCR的方法从大豆抗菌核病品种Maple Arrow中克隆得到Gm GLP10基因,生物信息学分析结果显示Gm GLP10蛋白由213个氨基酸组成,具有一个糖基化位点和多个磷酸化位点,为胞外分泌蛋白。通过对Gm GLP10基因起始密码子上游1 500 bp序列进行顺式作用元件分析,预测Gm GLP10启动子上具有多个与激素和防御胁迫应答相关的顺式作用元件。进化树分析结果表明,Gm GLP10与多个生长素结合蛋白进化距离较近,推断其可能具有相似的功能。Gm GLP10基因在菌核病菌胁迫下的转录本丰度的变化结果表明在菌核胁迫处理后Gm GLP10基因表达量上调明显。Gm GLP10可能作为生长素结合蛋白参与调控大豆的生长发育与抗病防御应答反应。 展开更多
关键词 大豆 GmGLP10基因 克隆 菌核病 生长素结合蛋白
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黑龙江省不同生态区大豆品种育种性状的主成分分析 被引量:17
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作者 李文霞 李柏云 +4 位作者 薛红 吴昊 李琦 李文滨 宁海龙 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期731-734,共4页
为明确黑龙江省不同生态区近30年大豆育成品种主要育种性状的选择目标,利用相关系数、主成分分析方法对育种性状进行了分析。结果表明:第1生态区可同时选择株高与蛋白质含量,第2生态区可同时选择百粒重、蛋白质含量和产量,第3生态... 为明确黑龙江省不同生态区近30年大豆育成品种主要育种性状的选择目标,利用相关系数、主成分分析方法对育种性状进行了分析。结果表明:第1生态区可同时选择株高与蛋白质含量,第2生态区可同时选择百粒重、蛋白质含量和产量,第3生态区可同时选择株高与百粒重,第4、6和9生态区可同时选择脂肪含量与产量,第8生态区可同时选择百粒重与蛋白质含量,第10生态区可同时选择株高与脂肪含量,第11生态区可同时选择蛋白质含量和产量。在主成分分析中,选取累计贡献率为80.12%-90.77%的前3个主成分来评价黑龙江省大豆品种资源。 展开更多
关键词 大豆 生态区 育种性状 主成分分析
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大豆四向重组自交系群体遗传图谱的构建 被引量:7
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作者 宁海龙 李琦 +5 位作者 李文滨 薛红 李柏云 白雪莲 庄煦 李文霞 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期776-781,共6页
以(垦丰14×垦丰15)×(黑农48×垦丰19)衍生的四向重组自交系群体的160个个体为试验材料,构建了一张含有154个SSR引物、包含20条连锁群的大豆遗传图谱,该图谱覆盖基因组长度为3066.5cM,标记间平均长度为16.31cM。... 以(垦丰14×垦丰15)×(黑农48×垦丰19)衍生的四向重组自交系群体的160个个体为试验材料,构建了一张含有154个SSR引物、包含20条连锁群的大豆遗传图谱,该图谱覆盖基因组长度为3066.5cM,标记间平均长度为16.31cM。每个连锁群长度范围为32.0~335.6cM,标记范围在4~15个,D2、L、D1b、C2、O连锁标记比较密集。 展开更多
关键词 大豆 四向重组自交系 遗传图谱
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大豆褐色种皮遗传分析及基因定位 被引量:3
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作者 董全中 蒋炳军 +5 位作者 张勇 薛红 张明明 李微微 韩天富 宁海龙 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期361-369,共9页
为解析大豆籽粒种皮黄色向褐色突变的遗传规律及分子基础,本研究以田间发现的稳定繁殖的黄色种皮大豆中出现褐色种皮突变体及其原始品种为材料,进行田间表型性状鉴定。利用大豆20对染色体上的176个SSR标记对4对自然突变为褐色种皮的突... 为解析大豆籽粒种皮黄色向褐色突变的遗传规律及分子基础,本研究以田间发现的稳定繁殖的黄色种皮大豆中出现褐色种皮突变体及其原始品种为材料,进行田间表型性状鉴定。利用大豆20对染色体上的176个SSR标记对4对自然突变为褐色种皮的突变体及其原始品种进行基因型鉴定。利用种皮色突变体与其原始品种和非原始品种进行正向杂交和反向杂交试验,并对F1、F2种皮色的分离情况进行统计分析。利用A2连锁群上全部72对SSR标记对双亲遗传背景差异大的北豆14×克H09-95的F2群体进行基因型鉴定。研究结果表明:褐色种皮的突变体是其对应的原始品种的近等基因系;褐色突变是可遗传的,受细胞核基因控制,与细胞质遗传无关;黄色种皮对自然突变的褐色种皮表现为显性,经卡方检验,杂种后代中种皮的黄色与褐色分离比例符合3∶1的孟德尔的独立遗传规律,与经典遗传学的遗传方式是一致的。突变发生在A2连锁群的sat162和SSR53区间内。在大豆公共物理图谱(http://www.soybase.org)上SSR53和sat162区间包含GmIRCHS结构(曾被预测为I基因)区间,因此可证明参与控制种皮或种脐颜色性状的A2染色体上的经典位点I位点自然突变是黄色种皮变为褐色的原因。在研究的过程中,开发了A2染色体上的1个新的控制种皮颜色的标记SSR53。 展开更多
关键词 大豆 褐色种皮 I基因 基因定位
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大豆荚数垂直分布的遗传分析与QTL定位 被引量:2
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作者 杜晶 李文霞 +5 位作者 董全中 王萍 苏代群 孙明明 宁海龙 李文滨 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期360-370,共11页
大豆荚数类型和空间分布决定产量的形成。以有一个共同亲本的两个重组自交系群体为遗传材料,按照植株的上、中、下3个部位调查一粒荚、二粒荚、三粒荚和四粒荚的数量,采用完备复合区间作图法进行QTL定位。结果表明:在两个群体中一粒荚... 大豆荚数类型和空间分布决定产量的形成。以有一个共同亲本的两个重组自交系群体为遗传材料,按照植株的上、中、下3个部位调查一粒荚、二粒荚、三粒荚和四粒荚的数量,采用完备复合区间作图法进行QTL定位。结果表明:在两个群体中一粒荚、二粒荚、三粒荚、四粒荚在空间分布存在极显著的变异,部位间不同豆荚类型组成有显著差异,并且两个群体不同类型豆荚在不同部位分布的遗传基础不同,共检测到59个控制荚数性状的QTL,解释了0~11.45%的表型变异;两个群体检测到的荚数QTL中有30个QTL是本研究首次发现的。 展开更多
关键词 大豆 荚数 垂直分布 遗传分析 QTL
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大豆不育系育性稳定性研究概况 被引量:8
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作者 张井勇 赵丽梅 +2 位作者 孙寰 彭宝 李文滨 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期712-716,共5页
不育系的育性稳定性是大豆杂种优势利用中不可忽视的问题之一,本文较为详细地叙述了大豆细胞核雄性不育系和细胞质雄性不育系育性稳定性的研究进展。在细胞核雄性不育系中,隐性单基因控制的雄性不育系育性较稳定,个别不育系ms8、ms9育... 不育系的育性稳定性是大豆杂种优势利用中不可忽视的问题之一,本文较为详细地叙述了大豆细胞核雄性不育系和细胞质雄性不育系育性稳定性的研究进展。在细胞核雄性不育系中,隐性单基因控制的雄性不育系育性较稳定,个别不育系ms8、ms9育性受光周期、温度影响;核基因控制的部分雄性不育或不完全不育系的育性不稳定,如p2、msp、Arkansas突变体等,在光周期和温度发生变化时,育性也会随之变化;大豆光(温)敏雄性不育系88-428BY-827的育性主要受日照长度控制:在短日照(13.5~14.0 h·d^-1)下雄性不育;在长日照(14.5~15.2 h·d^-1)下雄性可育。在细胞质雄性不育中,RN型细胞质不育多数不育系育性稳定,个别不育系受光温影响育性不稳定;N8855型细胞质雄性不育系NJCMS1A育性在不同环境条件下较稳定;M型细胞质雄性不育系,在不同的光温条件下育性也较稳定,后两种类型雄性不育仅对个别不育系做了相关报道,没有针对细胞质来源相同但细胞核来源不同的大量不育系做更深入研究。本文还阐述了大豆不育系育性稳定性研究的重要性及研究展望。 展开更多
关键词 大豆 细胞核雄性不育 细胞质雄性不育 育性稳定性
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大豆菌核病菌丝侵染茎叶过程扫描电镜观察研究 被引量:7
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作者 孙明明 吕世翔 +5 位作者 李智媛 王萍 王冠 赵雪 韩英鹏 李文滨 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期123-129,共7页
为充分了解大豆菌核病菌丝侵染过程,促进大豆菌核病耐性品种筛选及致病机理研究,本研究以感病品种合丰25和耐病品种Mapple Arrow为材料,对离体叶片和茎秆菌丝接种后,采用扫描电镜对菌丝特性、茎叶组织变化、侵染特征等进行系统观察。结... 为充分了解大豆菌核病菌丝侵染过程,促进大豆菌核病耐性品种筛选及致病机理研究,本研究以感病品种合丰25和耐病品种Mapple Arrow为材料,对离体叶片和茎秆菌丝接种后,采用扫描电镜对菌丝特性、茎叶组织变化、侵染特征等进行系统观察。结果表明:不同耐性品种菌丝侵染速度及组织病斑大小表现出明显差异。接种后菌丝迅速进行分枝繁殖,分枝的尖端形成椭圆形膨大,类似"侵染胞"的结构,接种后5 d菌丝缺乏营养来源,生长活力下降,组织干瘪,侵染能力降低。菌丝接种后第3天,感病品种合丰25,叶片表层物质几乎全部消失,叶肉细胞出现明显皱缩,耐病品种Mapple Arrow叶片表层物质基本完整保留,除个别细胞出现凹陷皱缩,其余细胞形状仍较为完好;茎秆在第3天表现与叶片相似,感病品种表层物质消失,耐病品种仍基本保留。叶片和茎秆侵染过程中,气孔为直接侵入通道,菌丝也可以侵入组织细胞内部。 展开更多
关键词 大豆 菌核病 菌丝 浸染 扫描电镜
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大豆四向重组自交系群体生育进程稳定QTL定位 被引量:3
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作者 宁海龙 庄煦 +5 位作者 杨畅 方艳龙 王萍 李文滨 薛红 李文霞 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期692-698,共7页
以垦丰14、垦丰15、垦丰19和黑农48为亲本,构建了含160个株系的四向重组自交系群体(four-way recombinant inbred lines,FW-RIL)为试验材料,通过构建分子遗传连锁图谱,对大豆四向重组自交系群体生育期各阶段进行QTL定位,旨在为大豆生育... 以垦丰14、垦丰15、垦丰19和黑农48为亲本,构建了含160个株系的四向重组自交系群体(four-way recombinant inbred lines,FW-RIL)为试验材料,通过构建分子遗传连锁图谱,对大豆四向重组自交系群体生育期各阶段进行QTL定位,旨在为大豆生育期性状的分子辅助育种提供理论基础和技术支撑,在分子水平探索与大豆生育期相关基因的遗传机理。通过区间作图法等分析方法,应用275个SSR分子标记对2013、2014与2015年在克山和哈尔滨3年3个环境下的生育期各阶段进行QTL定位,结果表明:大豆四向杂交群体的各生育期阶段易受到环境条件的影响,生育期相关性状在Fw-RIL群体中存在真实的遗传变异。76个与生育期各阶段相关的QTL分布在18个连锁群上,分别是A1、A2、B1、B2、C1、C2、D1a、D1b、D2、F、G、H、J、K、L、M、N和O连锁群;17个与生育期各阶段相关的QTL能够在2个以上环境中被重复定位到,分别为qST-B2-1、qST-C1-1、qST-C2-1、qST-C2-2、qST-D1b-1、qST-D1b-2、qST-G-1、qST-H-1、qST-K-1、qST-K-2、qST-L-1、qST-L-2、qST-M-1、qST-M-2、qST-M-3、qST-N-1、qST-O-1。其中,新发现10个与生育期相关的QTLs,qST-C2-2,qST-D1b-1,qST-k1,qST-M2和qST-N1是高效QTL。 展开更多
关键词 大豆 生育进程 四向重组自交系群体 QTL
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大豆四向重组自交系群体全生育期QTL的单标记分析 被引量:1
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作者 宁海龙 吴昊 +5 位作者 李文滨 薛红 李柏云 李琦 白雪莲 李文霞 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期1081-1084,1089,共5页
以含有160个株系的四向重组自交系为试验材料,通过188个SSR标记鉴定个体基因型,利用单标记分析方法,分析了2年4点试验获得全生育期表型数据,对该群体的全生育期进行了QTL定位分析。结果表明:在2013和2014年哈尔滨、克山3个环境下定位... 以含有160个株系的四向重组自交系为试验材料,通过188个SSR标记鉴定个体基因型,利用单标记分析方法,分析了2年4点试验获得全生育期表型数据,对该群体的全生育期进行了QTL定位分析。结果表明:在2013和2014年哈尔滨、克山3个环境下定位了控制大豆全生育期的14个QTL,分别定位在大豆20个连锁群中的A2、B2、C1、C2、D1b、E、F、G、K、L、N共11个连锁群上,遗传率为1.34%~9.19%。可延长全生育期的优异等位基因型有BARCSOYSSR_08_0966(Q3Q3)、Sat_177(Q2Q2)、Sct_186(Q3Q3)、Satt307(Q3Q3)、Satt557(Q1Q1)、Satt577(Q2Q2)、Sat_351(Q1Q1)、Satt268(Q1Q1)、Sct_199(Q1Q1)、Satt273(Q3Q3)、Satt229(Q1Q1)、Satt664(Q1Q1)、Satt125(Q4Q4),能够缩短全生育期的优异等位基因型有BARCSOYSSR_08_0966(Q2Q2)、Sat_177(Q1Q1)、Sct_186(Q1Q1)、Satt307(Q2Q2)、Satt557(Q2Q2)、Satt577(Q4Q4)、Sat_351(Q2Q2)、Satt268(Q3Q3)、Sct_199(Q3Q3)、Satt273(Q2Q2)、Satt229(Q3Q3)、Satt664(Q3Q3)、Satt125(Q3Q3)。Satt307、Satt199和Satt125这3个QTL在2个环境重复检测到,其中Satt199在两个环境中的遗传率和等位基因的遗传效应差异较小,受环境条件的影响较小,可用于分子设计育种。 展开更多
关键词 大豆 四向重组自交系群体 全生育期 QTL 优异等位基因型
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超早熟大豆杂交后代种皮颜色选择效率的研究 被引量:2
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作者 杨明亮 王勇 《黑龙江农业科学》 2020年第1期12-18,共7页
为提高超早熟大豆杂交后代的种皮颜色选择效率,本研究选择4个不同种皮颜色品种配置3个杂交组合,利用经过改良的系谱法(PM)、混合法(MSM)、单粒传法(SSDM)3种后代选择方法对后代群体的种皮颜色、生育期、株高、百粒重、蛋白质含量、产量... 为提高超早熟大豆杂交后代的种皮颜色选择效率,本研究选择4个不同种皮颜色品种配置3个杂交组合,利用经过改良的系谱法(PM)、混合法(MSM)、单粒传法(SSDM)3种后代选择方法对后代群体的种皮颜色、生育期、株高、百粒重、蛋白质含量、产量等主要农艺性状进行定向选择,用以比较不同杂交组合、不同选择方法对以上性状选择的影响。结果表明:(1)种皮颜色后代分离广泛,包括黑、黄、绿、褐、红、双色、以及各种中间颜色,其中黑、褐、黄、红、绿等颜色在F 6基本趋于稳定,双色及中间颜色后代分离严重,不易稳定。(2)三个组合后代群体生育期的选择,黑、黄色种皮MSM法最高,绿色种皮PM法最低,褐色种皮后代群体生育期变异小,接近于母本生育期,红色种皮3种方法选择后代生育期无显著差异更接近于父本;后代群体百粒重的选择,黑、绿、褐色种皮运用MSM和PM法选择的后代群体百粒重更大,易获得大粒型品种;蛋白质含量后代群体选择以MSM法为最高;株高后代群体选择以PM法为最佳,株高最低,效果最好;单株产量后代群体选择以PM法为最高,黑、褐、绿色种皮后代单株产量显著高于黄、红色种皮后代。(3)SSDM法变异系数普遍较大,MSM法次之,PM法选择的后代群体变异系数普遍较小。可根据不同育种目标,运用不同后代选择方法,或结合选择目标性状特点在不同世代运用不同方法进行选择,提高选择效率。 展开更多
关键词 大豆 种皮色 选择方法 选择效率
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大豆GmGBP1基因启动子的光周期响应元件TCT-motif功能分析 被引量:6
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作者 李英华 王阔 +7 位作者 郑艳红 李敏敏 许崇晶 杨雪 王春生 张妍 李文滨 赵琳 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期592-596,共5页
GmGBP1基因启动子的多态性位点SNP-796与生育期密切相关,SNP-796G为缩短大豆生育期的优异等位基因。本研究运用生物信息学手段分析发现,等位基因SNP-796 G→A变异会导致TCT-motif光效应元件的变异。将包括SNP-796位点的GmGBP1基因的启... GmGBP1基因启动子的多态性位点SNP-796与生育期密切相关,SNP-796G为缩短大豆生育期的优异等位基因。本研究运用生物信息学手段分析发现,等位基因SNP-796 G→A变异会导致TCT-motif光效应元件的变异。将包括SNP-796位点的GmGBP1基因的启动子片段与双萤光素酶(luciferase)报告基因融合构建植物表达载体并转化烟草,结合烟草叶片中的农杆菌瞬时表达试验,分析了该启动子中TCT-motif顺式作用元件的功能。结果显示,TCT-motif受短日照条件诱导,引起Luciferase基因显著上调表达。在短日照条件下,TCT-motif可能通过增加GmGBP1基因mRNA的表达量,从而缩短大豆品种的生育期。 展开更多
关键词 大豆 GmGBPl基因启动子 光周期 TCT-motif
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不同施氮条件下大豆形态与产量相关性状的QTL分析 被引量:5
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作者 苏代群 张楷歆 +1 位作者 李文霞 宁海龙 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期198-204,共7页
大豆形态与产量相关性状是重要的育种目标,对于不同施氮条件有不同的生态类型。为明确不同氮肥水平下大豆形态与产量相关性状的QTL遗传基础,本研究利用由大豆杂交组合东农L13×合农60的RIL群体(156个株系)为遗传材料,在3个不同地点... 大豆形态与产量相关性状是重要的育种目标,对于不同施氮条件有不同的生态类型。为明确不同氮肥水平下大豆形态与产量相关性状的QTL遗传基础,本研究利用由大豆杂交组合东农L13×合农60的RIL群体(156个株系)为遗传材料,在3个不同地点采用正常施氮与不施氮处理,利用株高、主茎节数、单株荚数、单株粒数、百粒重和单株粒重进行QTL定位。结果表明:两亲本在各个性状上存在显著差异,RIL群体符合正态分布,满足数量性状遗传特征,QTL分析共检测到71个调控相关性状的QTL,解释了3.88%~41.12%的表型变异。有6个QTL可在正常施氮肥和不施用氮肥条件下检测到,有29个QTL可在不施氮肥条件下检测到,42个QTL可在施氮肥条件下检测到。检测到调控相关性状的QTL中有45个是本研究新发现的。研究结果将为大豆氮肥适应生态类型的分子育种提供理论基础和技术支撑。 展开更多
关键词 大豆 氮肥 形态性状 产量相关性状 QTL分析
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GmXTH23基因的克隆及抗旱性鉴定 被引量:6
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作者 陈龙 张沿政 +1 位作者 李永光 李文滨 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期898-905,共8页
【目的】木葡聚糖内转糖苷酶(XTH)与细胞壁的生理活动及抗逆性密切相关。课题组前期对干旱胁迫下大豆转录组的结果进行分析,发现大豆Glyma.13G095000(GmXTH23)基因是一个编码木葡聚糖内转糖苷酶(XTH)的基因,基于GmXTH23基因表达量受干... 【目的】木葡聚糖内转糖苷酶(XTH)与细胞壁的生理活动及抗逆性密切相关。课题组前期对干旱胁迫下大豆转录组的结果进行分析,发现大豆Glyma.13G095000(GmXTH23)基因是一个编码木葡聚糖内转糖苷酶(XTH)的基因,基于GmXTH23基因表达量受干旱胁迫影响显著的事实,通过生物信息学、表达模式分析及抗性鉴定试验等研究,为进一步探究GmXTH23基因的功能提供依据,为大豆抗逆的遗传改良提供理论参考。【方法】以垦丰16大豆为试验材料克隆GmXTH23基因;利用qRT-PCR方法探究基因的表达模式;利用基因枪法进行亚细胞定位;将GmXTH23基因转入拟南芥中,并进行干旱胁迫下的表型试验;用茚三酮比色法测定游离脯氨酸含量,氮蓝四唑法测定超氧化物歧化酶含量,硫代巴比妥酸比色法测定丙二醛含量。【结果】GmXTH23在大豆各组织中皆有表达,在茎中的表达量最高;亚细胞定位的结果表明该基因蛋白定位于细胞膜上;干旱胁迫下的表型试验结果表明,过表达GmXTH23基因的拟南芥植株发芽率、根长皆高于野生型拟南芥,复水后恢复正常的植株比例也相对较高;过表达株系与野生型株系相比其PRO含量与SOD含量较高,MDA含量较低。【结论】与野生型拟南芥相比,过表达GmXTH23基因使得拟南芥在干旱胁迫下的耐受性增强。在干旱胁迫下GmXTH23通过提高脯氨酸与超氧化物歧化酶含量、降低植物细胞在胁迫下的损伤来提高植物的抗旱性。 展开更多
关键词 大豆 GmXTH23 木葡聚糖内转糖苷酶 基因克隆 胁迫响应
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