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题名大豆GmST1基因的生物信息学分析
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作者
井妍
孙晶
高赛男
赵雪
滕卫丽
韩英鹏
李文滨
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机构
东北农业大学农学院/大豆生物学教育部重点实验室/东北农业大学农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室
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出处
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期394-401,共8页
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基金
国家现代农业产业技术体系(CARS-04-PS04)
国家自然科学基金(31301339)
+1 种基金
黑龙江省教育厅科学技术研究项目(12541049)
黑龙江省普通高等学校新世纪优秀人才培养计划(1253-NCET-005)
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文摘
磺基转移酶(sulfotransferase,SULT)基因是一个基因超家族。对大豆磺基转移酶基因GmST1(Glyma.13G191400)进行基于生物信息学的基因结构分析与功能预测,结果表明:GmST1(Williams82)基因序列全长1 439 bp,CDS区长1 035 bp,编码344个氨基酸。通过序列比对,分析出在感病Williams 82和抗病品种东农93-046中,GmST1序列存在着非同义SNP,导致氨基酸改变。利用Plant CARE分析启动子元件,发现在基因启动子序列中含有多个与光诱导、生长素、水杨酸、干旱等相关的元件。在BAR数据库中分析了GmST1的拟南芥同源基因在不同逆境胁迫条件下基因表达情况,表明该基因表达具有组织表达特异性,参与盐胁迫、干旱胁迫和抗病等相关反应。
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关键词
大豆
GmST1
磺基转移酶
蛋白质结构分析
功能预测
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Keywords
Soybean
GmST1
SULT
Protein structure analysis
Functional prediction
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分类号
S565.1
[农业科学—作物学]
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