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基于SSR分子标记的安徽黄山地区野生刺葡萄的遗传多样性分析
被引量:
7
1
作者
张萌
练春兰
+2 位作者
松木悠
王三红
陶建敏
《江西农业学报》
CAS
2012年第6期9-12,17,共5页
利用8对SSR分子标记引物分析了安徽黄山地区40份野生刺葡萄资源的遗传多样性,结果表明:8对SSR引物扩增的等位基因数(Na)为36个,每个引物扩增等位基因数(Na)为2~10个,有效等位基因数(Ne)为1.285~5.378个;观测杂合度(Ho)为0.250~0.775...
利用8对SSR分子标记引物分析了安徽黄山地区40份野生刺葡萄资源的遗传多样性,结果表明:8对SSR引物扩增的等位基因数(Na)为36个,每个引物扩增等位基因数(Na)为2~10个,有效等位基因数(Ne)为1.285~5.378个;观测杂合度(Ho)为0.250~0.775,期望杂合度(He)为0.224~0.824;Nei’s多样性指数(H)为0.222~0.814;香农多样性指数(I)为0.417~1.884;多态性信息含量(PIC)为0.202~0.789。依据地理位置将黄山地区刺葡萄资源分为3个群体(POP1,POP2,POP3),3个群体之间遗传相似度为0.829~0.912,遗传距离为0.093~0.188,表明黄山地区刺葡萄资源的遗传差异较少。通过UPGMA方法对黄山地区40份刺葡萄和湖南、福建的3份刺葡萄进行聚类,在遗传相似系数为0.62时,黄山地区刺葡萄聚为一类,湖南、福建的刺葡萄聚为一类。这些结果表明,刺葡萄的基因流限制于短距离,黄山地区刺葡萄主要以有性繁殖为主。
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关键词
野生刺葡萄
SSR
遗传多样性
黄山
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题名
基于SSR分子标记的安徽黄山地区野生刺葡萄的遗传多样性分析
被引量:
7
1
作者
张萌
练春兰
松木悠
王三红
陶建敏
机构
南京农业
大学
园艺学院
东京大学生物资源环境研究中心
出处
《江西农业学报》
CAS
2012年第6期9-12,17,共5页
基金
国家"948"项目(2011-G28)
江苏省自主创新基金项目[cx(10)110]
文摘
利用8对SSR分子标记引物分析了安徽黄山地区40份野生刺葡萄资源的遗传多样性,结果表明:8对SSR引物扩增的等位基因数(Na)为36个,每个引物扩增等位基因数(Na)为2~10个,有效等位基因数(Ne)为1.285~5.378个;观测杂合度(Ho)为0.250~0.775,期望杂合度(He)为0.224~0.824;Nei’s多样性指数(H)为0.222~0.814;香农多样性指数(I)为0.417~1.884;多态性信息含量(PIC)为0.202~0.789。依据地理位置将黄山地区刺葡萄资源分为3个群体(POP1,POP2,POP3),3个群体之间遗传相似度为0.829~0.912,遗传距离为0.093~0.188,表明黄山地区刺葡萄资源的遗传差异较少。通过UPGMA方法对黄山地区40份刺葡萄和湖南、福建的3份刺葡萄进行聚类,在遗传相似系数为0.62时,黄山地区刺葡萄聚为一类,湖南、福建的刺葡萄聚为一类。这些结果表明,刺葡萄的基因流限制于短距离,黄山地区刺葡萄主要以有性繁殖为主。
关键词
野生刺葡萄
SSR
遗传多样性
黄山
Keywords
Wild Vitis davidii
SSR
Genetic diversity
Huangshan
分类号
S663.1 [农业科学—果树学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于SSR分子标记的安徽黄山地区野生刺葡萄的遗传多样性分析
张萌
练春兰
松木悠
王三红
陶建敏
《江西农业学报》
CAS
2012
7
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