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题名多枝柽柳叶片响应NaCl胁迫的转录组分析
被引量：5
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作者
陈亚辉
张师瑒
杨庆山
宋志忠
姜姜
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机构
南京林业大学林学院
不列颠哥伦比亚大学理学院
山东省林业科学研究院盐碱地造林试验站
鲁东大学农林工程研究院
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出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022年第5期1188-1202,共15页
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基金
山东省农业良种工程项目(2019LZGC009)
国家自然科学基金面上项目(32071612)
国家留学基金委项目(202108320311)。
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文摘
在转录组层面解析盐生植物多枝柽柳响应盐胁迫的分子机制,为进一步挖掘耐盐关键基因提供参考。用200 mmol/L NaCl处理多枝柽柳0 h、48 h、168 h后,采集叶片进行转录组测序,分析差异表达基因(DEGs)并进行qRT-PCR验证。转录组测序原始数据拼接出Unigenes 105702个,同时在KEGG、KOG、NR和SwissProt 4大功能数据库中检索到注释的Unigenes为27670个。NaCl胁迫处理48 h后,多枝柽柳叶片中6374个基因的表达水平上调,5380个基因的表达水平下调;NaCl胁迫处理168 h后,叶片中有3837个基因的表达水平上调,7808个基因的表达水平下调。根据注释到KEGG通路中的DEGs,筛选获得8个表达差异极其显著的DEGs,主要编码WRKY和bZIP家族转录因子。此外,由KEGG通路分析可知,MAPK信号转导途径可能参与多枝柽柳生长发育及其对NaCl胁迫的应答反应。本研究通过测定和解析在高盐胁迫下多枝柽柳叶片转录组信息,揭示了盐胁迫激活MAPK信号转导途径以及WRKY、MYB和bZIP等转录因子参与耐盐调控过程,为进一步研究多枝柽柳耐盐分子机制奠定了基础。
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关键词
多枝柽柳
NACL胁迫
转录组测序
转录因子
MAPK信号传导途径
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Keywords
Tamarix ramosissima
NaCl stress
transcriptome sequencing
transcription factor
MAPK signal transduction pathway
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分类号
Q753
[生物学—分子生物学]
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