期刊文献+
共找到22篇文章
< 1 2 >
每页显示 20 50 100
高海拔生境下怀玉山高山马铃薯和怀玉山本土农家薯块茎的转录组分析 被引量:7
1
作者 尹明华 谭鑫 +5 位作者 郑亚娇 徐迎昕 邱梦琴 曾清华 蔡红 陈荣华 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期1330-1339,共10页
为探究高海拔生境下怀玉山高山马铃薯的适应机制,本研究以怀玉山高山马铃薯(麻籽洋芋)和怀玉山本土农家薯的采后块茎为试验材料进行转录组分析。结果表明,怀玉山高山马铃薯上调的差异基因956个,下调的差异基因2 262个,总数为3 218个;怀... 为探究高海拔生境下怀玉山高山马铃薯的适应机制,本研究以怀玉山高山马铃薯(麻籽洋芋)和怀玉山本土农家薯的采后块茎为试验材料进行转录组分析。结果表明,怀玉山高山马铃薯上调的差异基因956个,下调的差异基因2 262个,总数为3 218个;怀玉山高山马铃薯和怀玉山本土农家薯与叶绿素结合、光系统Ⅰ、光合作用和光捕获、光系统Ⅱ、血红素结合、氧化还原酶活性等光合系统相关的GO term富集显著;怀玉山高山马铃薯和怀玉山本土农家薯与光合作用-天线蛋白、丙烷合成、光合作用、苯丙氨酸代谢等Pathway也富集显著,说明怀玉山高山马铃薯和怀玉山本土农家薯在怀玉山高海拔生境下主要是涉及到光合作用基因的差异表达。本研究结果为怀玉山高山马铃薯适应高海拔生境相关基因的挖掘与应用提供了一定的理论参考。 展开更多
关键词 高海拔生境 怀玉山高山马铃薯 怀玉山本土农家薯 块茎 转录组分析
在线阅读 下载PDF
盐胁迫对怀玉山三叶青2个栽培种试管苗生理特性和次生代谢产物的影响 被引量:8
2
作者 洪森荣 陈轩宇 +5 位作者 李文丽 张座栋 刘军 刘佳 蔡红 陈荣华 《山东农业科学》 北大核心 2021年第9期38-45,共8页
为探究盐胁迫对怀玉山三叶青2个栽培种(‘怀玉1号’‘怀玉2号’)试管苗生理特性和次生代谢产物的影响,为其大棚基质高效栽培提供依据,本研究设置不同质量浓度(0、2、4、6、8、10 g·L^(-1))的NaCl胁迫处理,分析其对怀玉山三叶青2个... 为探究盐胁迫对怀玉山三叶青2个栽培种(‘怀玉1号’‘怀玉2号’)试管苗生理特性和次生代谢产物的影响,为其大棚基质高效栽培提供依据,本研究设置不同质量浓度(0、2、4、6、8、10 g·L^(-1))的NaCl胁迫处理,分析其对怀玉山三叶青2个栽培种试管苗生长及生理特性的影响。结果表明:(1)低盐胁迫(2~4 g·L^(-1))时,怀玉山三叶青2个栽培种试管苗无死亡,对株高和植株干质量无显著影响;中高盐胁迫(6~10 g·L^(-1))时,2个栽培种试管苗的死亡率显著提高,株高、地上和地下部干质量显著下降。(2)随着盐胁迫浓度的升高,怀玉山三叶青2个栽培种试管苗的游离脯氨酸(Pro)、可溶性蛋白(SP)、可溶性糖(SS)含量以及超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)和过氧化氢酶(CAT)活性均先升高后降低,除‘怀玉1号’可溶性糖含量在0.2 g·L^(-1) NaCl处理时最高外,‘怀玉1号’‘怀玉2号’各指标分别在4、6 g·L^(-1) NaCl处理时达到峰值;MDA含量和相对电导率均持续升高;‘怀玉1号’‘怀玉2号’叶绿素a和叶绿素b及总叶绿素含量分别在2~4、2~6 g·L^(-1) NaCl处理时与对照差异不显著,而后均显著下降。综合分析,‘怀玉1号’‘怀玉2号’试管苗的耐盐阈值分别为4、6 g·L^(-1)。(3)隶属函数分析和主成分分析结果表明,怀玉山三叶青2个栽培种试管苗的耐盐性为‘怀玉2号’>‘怀玉1号’。(4)随着盐胁迫的不断加重,‘怀玉1号’和‘怀玉2号’试管苗叶片的黄酮和多酚含量呈先升后降趋势,而多糖含量则呈直线下降趋势。本试验探究了盐胁迫对怀玉山三叶青试管苗生理特性和次生代谢产物的影响,可为今后解决其高山大棚栽培中可能遇到的盐胁迫问题提供理论依据。 展开更多
关键词 盐胁迫 怀玉山三叶青 栽培种 试管苗 生理特性 次生代谢产物
在线阅读 下载PDF
怀玉山三叶青2个栽培种块根的转录组分析 被引量:5
3
作者 洪森荣 黄丹丹 +5 位作者 黄诗慧 黄夏梦 蒋椰 李万平 蔡红 陈荣华 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期24-35,共12页
【目的】筛选怀玉山三叶青2个栽培种:怀玉1号(HY1组)和怀玉2号(HY2组)与黄酮类化合物合成相关差异表达基因。【方法】以怀玉山三叶青怀玉1号(HY1组)和怀玉2号(HY2组)的块根为试验材料进行转录组分析。【结果】HY1组和HY2组的Clean read... 【目的】筛选怀玉山三叶青2个栽培种:怀玉1号(HY1组)和怀玉2号(HY2组)与黄酮类化合物合成相关差异表达基因。【方法】以怀玉山三叶青怀玉1号(HY1组)和怀玉2号(HY2组)的块根为试验材料进行转录组分析。【结果】HY1组和HY2组的Clean reads分别为42 311 662和41 411 202。2组样品Q30碱基百分比均不小于95.75%。HY1组和HY2组的转录因子家族多为MYB-superfamily、 bHLH、 AP2/ERF、 NAC、 C2C2、 WRKY等。HY1组和HY2组表达量FPKM的对数值在0-2。HY1组和HY2组表达量密度在0-0.7。HY1组和HY2组表达的共有基因数为22 367,HY1组单独表达的基因数为18 196,HY2组单独表达的基因数为8 137。HY1组和HY2组表达量的相关系数为0.913,样本间相关性好。HY1组和HY2组共产生差异表达基因12 199个。与HY1组比较,HY2组上调基因数为3 551,下调基因数为8 648。GO富集分析显示,差异基因主要注释到光合作用光系统I光捕获、光合作用捕获、叶绿素代谢过程、蛋白质发色团连锁、前体代谢产物和能量的产生、叶绿素生物合成过程、氧化应激反应、α-氨基酸代谢过程、光合作用、质体小叶、光系统Ⅰ、光系统Ⅱ、质体类核仁、光系统、叶绿素结合、单加氧酶活性、铁离子结合、血红素结合、裂解酶活性功能。KEGG富集分析显示,差异基因主要注释到光合作用-天线蛋白、核糖体、乙醛酸和二元酸代谢、苯丙酸生物合成、二苯乙烯类、二芳基庚烷类和姜辣素的生物合成、类黄酮生物合成、光合作用、光合生物的固碳作用、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢、植物激素信号转导、谷胱甘肽代谢、丙酮酸代谢、苯丙氨酸代谢、植物昼夜节律、黄酮和黄酮醇的生物合成、半胱氨酸与蛋氨酸代谢、氰胺酸代谢、类胡萝卜素生物合成、α-亚麻酸代谢、卟啉与叶绿素代谢等代谢途径。【结论】与黄酮类化合物相关差异表达基因如芪合酶(stilbenesynthase)、无色花色素双加氧酶(leucoanthocyanidindioxygenase)、查尔酮异构酶蛋白(CHI protein)、查尔酮合酶2(chalcone synthase 2)、黄烷酮3-羟化酶(flavanone 3-hydroxylase)、无色花色素还原酶(1leucoanthocyanidin reductase 1)、类黄酮3’-羟化酶(flavonoid 3’-hydroxylase)基因在怀玉2号(HY2组)块根中上调,而查尔酮合酶(chalcone synthase)、黄酮醇合酶(flavonol synthase)、类黄酮3’,5’-甲基转移酶(flavonoid 3’, 5’-methyltransferase)基因在怀玉2号(HY2组)块根中下调,导致怀玉山三叶青怀玉1号(HY1组)和怀玉2号(HY2组)块根总黄酮含量的差异。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 栽培种 块根 转录组分析
在线阅读 下载PDF
三叶青种质资源遗传多样性的随机扩增多态性DNA分析 被引量:3
4
作者 尹明华 占学林 +3 位作者 徐文慧 谢妮妮 蔡红 陈荣华 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第11期1839-1848,共10页
利用RAPD技术对64个三叶青种质资源样本进行遗传多样性分析,从40对引物中筛选出10对引物进行批量PCR实验。结果表明:64个三叶青样本的观测等位基因数(Na)为1. 666 7~2. 000 0,有效等位基因数(Ne)为1. 247 9~1. 701 3,Nei’s基因多样... 利用RAPD技术对64个三叶青种质资源样本进行遗传多样性分析,从40对引物中筛选出10对引物进行批量PCR实验。结果表明:64个三叶青样本的观测等位基因数(Na)为1. 666 7~2. 000 0,有效等位基因数(Ne)为1. 247 9~1. 701 3,Nei’s基因多样性指数为0. 167 0~0. 398 4,Shannon多样性指数(I)为0. 262 8~0. 583 0,平均多态位点为7. 5,平均多态百分数为93. 145%;在遗传相似系数0. 720 56处,可以将64个三叶青样本分成11大类;在遗传相似系数0. 697 04处,则可将64个三叶青样本分成4大类;聚类分析的结果与种源的地理距离存在不一致性,这可能与种质资源库的地形、气候等自然因素有关。表明所测三叶青种质资源遗传多样性丰富,具有一定的开发利用价值,可为合理保护三叶青的基因资源及其遗传改良提供科学依据。 展开更多
关键词 三叶青 种质资源 遗传多样性 随机扩增多态性DNA
在线阅读 下载PDF
怀玉山三叶青2个栽培种试管苗对干旱胁迫的生理响应及相关基因的表达 被引量:1
5
作者 洪森荣 柯维忠 +6 位作者 陶月琴 戴云龙 安永盼 符卉卉 阿提克穆·麦麦提 蔡红 陈荣华 《江苏农业科学》 北大核心 2022年第4期117-125,共9页
为了探究怀玉山三叶青2个栽培种试管苗对干旱胁迫的生理响应,为其高山大棚有效栽培提供理论依据。以怀玉山三叶青怀玉1号、怀玉2号试管苗为试验材料,进行PEG-6000模拟干旱胁迫处理,通过主成分分析和隶属函数法综合评价怀玉山三叶青2个... 为了探究怀玉山三叶青2个栽培种试管苗对干旱胁迫的生理响应,为其高山大棚有效栽培提供理论依据。以怀玉山三叶青怀玉1号、怀玉2号试管苗为试验材料,进行PEG-6000模拟干旱胁迫处理,通过主成分分析和隶属函数法综合评价怀玉山三叶青2个栽培种试管苗抗旱性的强弱,并通过荧光定量PCR分析干旱胁迫下怀玉山三叶青2个栽培种试管苗相关基因的表达情况。结果表明,随着PEG-6000浓度的增加,怀玉1号、怀玉2号试管苗的株高和生物量整体上呈先稳后降的趋势,可溶性蛋白(SP)、可溶性糖(SS)、游离脯氨酸(Pro)和K^(+)含量以及抗氧化酶[超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)和过氧化氢酶(CAT)]活性整体上呈先升后降的趋势,而相对电导率(RC)、丙二醛(MDA)含量和Na^(+)含量则呈显著提高的态势,茎、根Ca^(2+)含量无显著变化。根据隶属函数分析结果,怀玉山三叶青2个栽培种试管苗的耐旱性为怀玉2号>怀玉1号;主成分分析结果表明,第1个主成分中较大的指标有POD、CAT活性和Pro含量,第2个主成分中较大的指标有RC、SOD活性和MDA含量,第3个主成分中较大的指标有SS、K^(+)和Ca^(2+)含量;轻度干旱和中度干旱有助于脱落酸、茉莉酸、乙烯、赤霉素、生长素等内源激素含量的提高,也有利于怀玉山三叶青黄酮醇和查尔酮的合成,但不利于怀玉山三叶青烟草花叶病毒的增殖。由研究结果可知,适度干旱胁迫可以提高内源激素和次生代谢物的含量,抑制病毒增殖,促进怀玉山三叶青的生长发育,相关研究结果可为怀玉山三叶青抗旱种源的筛选提供参考依据。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 栽培种 试管苗 干旱胁迫 生理响应 相关基因表达
在线阅读 下载PDF
三叶青种质资源遗传多样性的SRAP分析 被引量:2
6
作者 尹明华 石光禹 +5 位作者 郁雪婷 陈茂光 廖玉 万志庭 蔡红 陈荣华 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期1222-1228,共7页
对我国三叶青种质资源64个样本的遗传多样性进行SRAP分析。结果表明,从30条引物中筛选出10条条带清晰、重复性好的引物对64份供试材料的基因组DNA进行扩增.扩增出了57个多态位点,多态百分数为66. 67%~100%(均值为90. 38%),每条引物扩增... 对我国三叶青种质资源64个样本的遗传多样性进行SRAP分析。结果表明,从30条引物中筛选出10条条带清晰、重复性好的引物对64份供试材料的基因组DNA进行扩增.扩增出了57个多态位点,多态百分数为66. 67%~100%(均值为90. 38%),每条引物扩增得到的多态位点为4~10(均值为5. 7);平均检测等位基因数(Na)、平均有效等位基因数(Ne)、平均Nei's基因多样性指数(H)、平均Shannon多样性指数(I)分别为1. 9038、1. 5150、0. 3009和0. 45259;遗传相似系数的变异范围为0. 4603~0. 9206。通过UPGMA法聚类,在遗传相似性系数为0. 7256处,64份供试材料可分为9组;在江西三叶青种质中,既可与湖北、湖南、福建、广西等地三叶青种质聚为一类,也可与浙江三叶青种质聚为一类。此外,根据引物EM3ME3、EM13ME13和EM14ME14构建了64个基因型的指纹图谱。这些数据可为我国三叶青种质资源的评价、鉴定和新品种选育提供参考。 展开更多
关键词 三叶青 种质资源 遗传多样性 SRAP分析
在线阅读 下载PDF
怀玉山高山马铃薯脱落酸和环境胁迫诱导蛋白基因的克隆和序列分析 被引量:2
7
作者 尹明华 卢咏琪 +7 位作者 罗怿文 潘巧玲 邱梦婷 苏格 谭佳思 涂慧 蔡红 陈荣华 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2021年第6期1181-1187,共7页
【目的】对怀玉山高山马铃薯脱落酸和环境胁迫诱导蛋白基因进行克隆和序列分析,为揭示怀玉山马铃薯脱落酸和环境胁迫诱导蛋白的生物学功能提供理论依据。【方法】通过怀玉山高山马铃薯试管苗转录组数据库筛选到脱落酸与环境胁迫诱导蛋... 【目的】对怀玉山高山马铃薯脱落酸和环境胁迫诱导蛋白基因进行克隆和序列分析,为揭示怀玉山马铃薯脱落酸和环境胁迫诱导蛋白的生物学功能提供理论依据。【方法】通过怀玉山高山马铃薯试管苗转录组数据库筛选到脱落酸与环境胁迫诱导蛋白基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆怀玉山高山马铃薯脱落酸与环境胁迫诱导蛋白基因,并采用生物信息学方法进行序列分析。【结果】怀玉山高山马铃薯脱落酸与环境胁迫诱导蛋白基因cDNA总长度为423 bp, G+C含量为52.25%;怀玉山高山马铃薯脱落酸与环境胁迫诱导蛋白由140个氨基酸组成,分子量14 534.01Da,等电点7.07,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(21.43%)、β-片层(24.29%)、无规则卷曲(54.29%)构成;三级结构为单聚体,主要存在细胞核中。怀玉山高山马铃薯脱落酸与环境胁迫诱导蛋白在进化上与马铃薯(Solanum ltuberosum)和副溶血性弧菌(Vibrio parahaemolyticus)的亲缘关系较近,尤其是与马铃薯(S.ltuberosum)TAS14-like在进化上具有最高的亲缘关系。【结论】怀玉山高山马铃薯脱落酸与环境胁迫诱导蛋白基因具有典型脱落酸与环境胁迫诱导蛋白基因的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度高,在进化上高度保守,对进一步揭示该酶生物学功能具有重要意义。 展开更多
关键词 怀玉山高山马铃薯 试管苗 ABA和环境胁迫诱导蛋白基因 克隆 序列分析
在线阅读 下载PDF
怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白3基因克隆和功能分析 被引量:2
8
作者 尹明华 陈佳雯 +5 位作者 陈瑞 樊凡 辜婷婷 何思捷 陈荣华 蔡红 《江苏农业科学》 北大核心 2022年第6期32-41,共10页
通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白3基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆该病毒增殖蛋白3基因,并进行序列分析、亚细胞定位、器官表达分析和功能分析。结果表明:怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白3基因c... 通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白3基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆该病毒增殖蛋白3基因,并进行序列分析、亚细胞定位、器官表达分析和功能分析。结果表明:怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白3基因cDNA总长度为873 bp,G+C含量为44.22%;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白3由290个氨基酸组成,分子量33374.79 u,等电点9.72,为疏水性蛋白;二级结构由α-螺旋(57.24%)、β-片层(10.69%)、无规则卷曲(32.07%)构成;三级结构为单体;预测怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白3主要存在质膜、液泡膜、内质网中;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白3与葡萄烟草病毒增殖蛋白3(GenBank:XP_002275179.1、GenBank:XP_034684444.1)的同源性最高,同源性达到94.83%。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,烟草病毒增殖蛋白3定位于细胞质(可能包括细胞膜)和细胞核膜中。实时定量PCR结果显示,烟草病毒增殖蛋白3基因在怀玉山三叶青2个栽培种中的表达存在器官特异性,怀玉2号和怀玉1号均在叶中表达量最高;烟草病毒增殖蛋白3转基因阳性烟草的三叶青花叶病毒表达量显著高于烟草病毒增殖蛋白3转基因阴性烟草;与烟草病毒增殖蛋白3转基因阴性烟草相比较,烟草病毒增殖蛋白3转基因阳性烟草的净光合速率(P_(n))、气孔导度(G_(s))、蒸腾速率(T_(r))、最大光化学效率(F_(v)/F_(m))、实际光化学量子效率(ΦPSⅡ)、光化学淬灭系数(q_(P))及电子传递效率(ETR)显著下降,而非光化学淬灭系数(NPQ)显著上升。怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白3具有典型烟草病毒增殖蛋白3的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度高,进化上高度保守,且可促进三叶青烟草花叶病毒的增殖,降低植株的光合作用效率。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 烟草病毒增殖蛋白3 基因克隆 功能分析 蛋白结构
在线阅读 下载PDF
怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1基因克隆、亚细胞定位和组织表达分析 被引量:1
9
作者 洪森荣 向琼钰 +5 位作者 谢颖 熊晨露 徐晨慧 徐璐珂 陈荣华 蔡红 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第6期1193-1204,共12页
通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1基因的核心片段,利用反转录PCR(RT-PCR)技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1基因,并采用生物信息学方法和实时荧光定量PCR进行序列分析和器官表达分析。结果... 通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1基因的核心片段,利用反转录PCR(RT-PCR)技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1基因,并采用生物信息学方法和实时荧光定量PCR进行序列分析和器官表达分析。结果表明,怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1基因cDNA总长度为888 bp,G+C含量为51.58%;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1由295个氨基酸组成,分子量33173.36 u,等电点9.16,为疏水性蛋白;二级结构由α-螺旋(43.73%)、β-片层(21.69%)、无规则卷曲(34.58%)构成;三级结构为单体;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1主要存在于内质网、内质网-质膜、细胞外、细胞质、线粒体和质膜中;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1在进化上与Aegilops tauschii subsp.tauschill(节节麦)、Triticum turgidum subsp.durum(硬粒小麦)、Hordeum vulgare(大麦)的亲缘关系较近,尤其是与Aegilops tauschii subsp.tauschill(节节麦)烟草病毒增殖蛋白1在进化上具有最高的亲缘关系。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,烟草病毒增殖蛋白1定位于细胞质(可能包括细胞膜)和细胞核膜中。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果显示,烟草病毒增殖蛋白1基因在怀玉山三叶青2个栽培种中的表达存在器官特异性,怀玉2号在叶中表达量最高,怀玉1号在茎中表达量最高。怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1具有典型烟草病毒增殖蛋白1的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度高,在进化上高度保守,对进一步揭示该酶生物学功能具有重要意义。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 烟草病毒增殖蛋白1 基因克隆 亚细胞定位 表达分析
在线阅读 下载PDF
怀玉山三叶青TOM2BisoformX1基因克隆和功能分析 被引量:2
10
作者 尹明华 胡嘉琦 +7 位作者 胡明艳 胡蓉 胡燕荣 黄舒绮 江梦芝 姜梦真 陈荣华 蔡红 《山东农业科学》 北大核心 2021年第8期1-10,共10页
为揭示怀玉山三叶青TOM2BisoformX1(tobamovirusmultiplicationprotein2BisoformX1)的生物学功能提供理论依据,本研究通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青TOM2BisoformX1基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆了该基因,... 为揭示怀玉山三叶青TOM2BisoformX1(tobamovirusmultiplicationprotein2BisoformX1)的生物学功能提供理论依据,本研究通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青TOM2BisoformX1基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆了该基因,并采用生物信息学、转基因瞬时表达和实时定量PCR方法对其进行序列分析、亚细胞定位、组织表达分析和功能分析。结果表明,怀玉山三叶青TOM2BisoformX1基因cDNA总长度为432bp,G+C含量为50.46%;编码143个氨基酸,分子量15392.36Da,等电点7.87,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(50.35%)、β-片层(2.10%)、无规则卷曲(47.55%)构成;三级结构为单体;预测怀玉山三叶青TOM2BisoformX1主要存在于细胞核中;怀玉山三叶青TOM2BisoformX1与葡萄(Vitis vinifera)TOM2BisoformX1(GenBank:XP_010664025.1)的同源性最高,达到83.92%。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,TOM2BisoformX1定位于细胞质和细胞核中。实时定量PCR结果显示,TOM2BisoformX1基因在怀玉山三叶青两个栽培种中的表达存在器官特异性,‘怀玉2号’和‘怀玉1号’均在叶中表达量最高;TOM2BisoformX1转基因阳性烟草的三叶青花叶病毒表达量显著高于TOM2BisoformX1转基因阴性烟草;与转基因阴性烟草相比,转基因阳性烟草的净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)、蒸腾速率(Tr)、最大光化学效率(Fv/Fm)、实际光化学量子效率(ΦPSⅡ)、光化学淬灭系数(qP)及电子传递效率(ETR)显著下降,而非光化学淬灭系数(NPQ)显著上升。怀玉山三叶青TOM2BisoformX1具有典型TOM2BisoformX1的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度高,进化上高度保守,且可促进三叶青烟草花叶病毒的增殖,降低植株的光合作用效率。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 TOM2BisoformX1 基因克隆 功能分析
在线阅读 下载PDF
怀玉山高山马铃薯胁迫相关蛋白基因的克隆和序列分析
11
作者 洪森荣 余淑铃 +7 位作者 曾欣怡 赵海玲 郑怡婷 周军 朱金晶 朱丽倩 蔡红 陈荣华 《天津师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2021年第5期46-51,共6页
为了揭示怀玉山高山马铃薯胁迫相关蛋白的生物学功能,从试管苗转录组数据库中筛选到胁迫相关基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆出怀玉山高山马铃薯的胁迫相关蛋白基因,并采用生物信息学方法进行序列分析.结果表明,怀玉山高山马铃薯胁... 为了揭示怀玉山高山马铃薯胁迫相关蛋白的生物学功能,从试管苗转录组数据库中筛选到胁迫相关基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆出怀玉山高山马铃薯的胁迫相关蛋白基因,并采用生物信息学方法进行序列分析.结果表明,怀玉山高山马铃薯胁迫相关蛋白基因的cDNA总长度为681 bp,G+C含量为47.58%;该蛋白由226个氨基酸组成,相对分子质量为24781.71,等电点为9.16,是亲水性蛋白.怀玉山高山马铃薯胁迫相关蛋白的二级结构由α-螺旋(42.48%)、β-片层(15.93%)以及无规则卷曲(41.59%)构成,C端含有无规则卷曲,N端含有β-片层和无规则卷曲,且无规则卷曲、β-片层和α-螺旋散布于整个蛋白质中;三级结构为二聚体.胁迫相关蛋白主要存在于细胞核、叶绿体、细胞质、线粒体和细胞外.怀玉山高山马铃薯胁迫相关蛋白在进化上与Solanum tuberosum(马铃薯)胁迫相关蛋白亲缘关系最近. 展开更多
关键词 怀玉山高山马铃薯 试管苗 胁迫相关蛋白基因 克隆 序列分析
在线阅读 下载PDF
怀玉山高山马铃薯蔗糖合酶基因的克隆和分析
12
作者 洪森荣 邓雨晴 +5 位作者 吴洪婷 陈婷 郭淑贞 杨于萱 蔡红 陈荣华 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期148-156,共9页
【目的】蔗糖合酶是植物蔗糖代谢途径中的关键酶,在植物的生长发育过程中具有重要作用。分析蔗糖合酶的核酸序列信息,预测其蛋白结构与功能,以期揭示该酶生物学功能。【方法】通过怀玉山高山马铃薯(Solanum tuberosum L.cv.Huaiyushan,... 【目的】蔗糖合酶是植物蔗糖代谢途径中的关键酶,在植物的生长发育过程中具有重要作用。分析蔗糖合酶的核酸序列信息,预测其蛋白结构与功能,以期揭示该酶生物学功能。【方法】通过怀玉山高山马铃薯(Solanum tuberosum L.cv.Huaiyushan,缩写S.tuberosum L.cv.Huaiyushan)试管苗转录组数据库筛选到蔗糖合酶基因的核心片段(PGSC0003DMG400002895,SuSy 4),利用RT-PCR技术克隆怀玉山高山马铃薯蔗糖合酶基因,并采用生物信息学方法进行序列分析。【结果】怀玉山高山马铃薯蔗糖合酶基因cDNA总长度为2418 bp,G+C含量为45.08%;怀玉山高山马铃薯蔗糖合酶由805个氨基酸组成,分子量92471.33 Da,等电点5.87,为亲水性蛋白;怀玉山高山马铃薯蔗糖合酶的二级结构包括α-螺旋(45.84%)、β-片层(15.16%)、无规则卷曲(39.01%),C端和N端含β-片层和α-螺旋,而无规则卷曲、延伸链、β-片层和α-螺旋则散布于整个蛋白质中;怀玉山高山马铃薯蔗糖合酶的三级结构为四聚体;怀玉山高山马铃薯蔗糖合酶主要存在细胞质、线粒体和叶绿体中;怀玉山高山马铃薯与番茄(Solanum lycopersicum)、潘那利番茄(Solanum pennellii)、智利番茄(Solanum chilense)、马铃薯(Solanum tuberosum)、辣椒(Capsicum annuum)、风铃辣椒(Capsicum baccatum)等6种植物在一个大分支下,这说明怀玉山高山马铃薯蔗糖合酶基因在进化上与这6种植物的亲缘关系较近,尤其是与马铃薯的进化上具有最高的亲缘关系。【结论】怀玉山高山马铃薯蔗糖合酶基因具有典型蔗糖合酶的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度高,在进化上高度保守,对进一步揭示该酶生物学功能具有重要意义。 展开更多
关键词 怀玉山高山马铃薯 试管苗 蔗糖合酶 克隆 序列分析
在线阅读 下载PDF
怀玉山高山马铃薯抗TMV蛋白基因的克隆和序列分析
13
作者 洪森荣 曾晓健 +8 位作者 魏杰 温倩文 谢微 杨玉琪 姚梦 易奥情 于小姣 蔡红 陈荣华 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2021年第3期487-494,共8页
【目的】对怀玉山高山马铃薯抗TMV蛋白基因进行克隆和序列分析,为揭示怀玉山马铃薯抗TMV蛋白的生物学功能提供理论依据。【方法】通过怀玉山高山马铃薯试管苗转录组数据库筛选到抗TMV蛋白基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆怀玉山高山... 【目的】对怀玉山高山马铃薯抗TMV蛋白基因进行克隆和序列分析,为揭示怀玉山马铃薯抗TMV蛋白的生物学功能提供理论依据。【方法】通过怀玉山高山马铃薯试管苗转录组数据库筛选到抗TMV蛋白基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆怀玉山高山马铃薯抗TMV蛋白基因,并采用生物信息学方法进行序列分析。【结果】怀玉山高山马铃薯抗TMV蛋白基因cDNA总长度为4335 bp,G+C含量为38.22%;怀玉山高山马铃薯抗TMV蛋白由1444个氨基酸组成,分子量165229.13 Da,等电点5.78,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(43.77%)、β-片层(12.47%)、无规则卷曲(43.77%)构成;高山马铃薯抗TMV蛋白主要存在细胞核中;怀玉山高山马铃薯抗TMV蛋白在进化上与马铃薯、番茄和野生种潘那利番茄的亲缘关系较近,尤其是与Solanum tuberosum(马铃薯)TMV resistance protein N-like isoform X1(类TMV抗性蛋白N亚型X1)和S.tuberosum(马铃薯)TMV resistance protein N-like isoform X2(类TMV抗性蛋白N亚型X2)在进化上具有最高的亲缘关系。【结论】怀玉山高山马铃薯抗TMV蛋白具有典型抗TMV蛋白的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度高,在进化上高度保守,对进一步揭示该蛋白生物学功能具有重要意义。 展开更多
关键词 怀玉山高山马铃薯 试管苗 抗TMV蛋白基因 克隆 序列分析
在线阅读 下载PDF
怀玉山三叶青查尔酮合酶基因克隆和表达分析
14
作者 洪森荣 刘佳 +3 位作者 刘军 刘依婷 陈荣华 蔡红 《山东农业科学》 北大核心 2021年第10期8-16,共9页
本研究通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到其查尔酮合酶基因的核心片段,利用qRT-PCR技术克隆到其查尔酮合酶基因,并采用生物信息学方法和实时定量PCR进行序列分析和器官表达分析,以期为揭示怀玉山三叶青查尔酮合酶的生物学功能... 本研究通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到其查尔酮合酶基因的核心片段,利用qRT-PCR技术克隆到其查尔酮合酶基因,并采用生物信息学方法和实时定量PCR进行序列分析和器官表达分析,以期为揭示怀玉山三叶青查尔酮合酶的生物学功能提供理论依据。结果表明,怀玉山三叶青查尔酮合酶基因cDNA总长度为1143 bp,G+C含量为65.27%;由380个氨基酸组成,分子量41809.23 Da,等电点6.19,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(37.37%)、β-片层(19.47%)、无规则卷曲(43.16%)构成,三级结构为二聚体;该酶主要存在于细胞核和线粒体中,在进化上与硬粒小麦(Triticum turgidum subsp.durum)、节节麦(Aegilops tauschii subsp.tauschill)、小麦(Triticum aestivum)的亲缘关系较近,尤其与硬粒小麦的未命名蛋白产物(VAH38240.1)亲缘关系最近。实时定量PCR结果显示,查尔酮合酶基因在怀玉山三叶青2个栽培种‘怀玉2号’和‘怀玉1号’中的表达存在器官特异性,均在根中表达量最高。综上,怀玉山三叶青查尔酮合酶具有查尔酮合酶的典型结构特征,氨基酸序列及核苷酸序列与同源物种相似度高,在进化上高度保守,这对进一步揭示该酶的生物学功能具有重要意义。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 查尔酮合酶 基因克隆 表达分析
在线阅读 下载PDF
三叶青根多糖提取工艺优化、分离纯化及结构表征 被引量:8
15
作者 郭南生 江和栋 +2 位作者 张兵 邓泽元 蔡红 《食品与机械》 CSCD 北大核心 2018年第7期143-147,210,共6页
采用水浴提取三叶青根多糖(Polysaccharides from roots of Radix Tetrastigma,RTP),以多糖提取得率为响应指标,在单因素试验的基础上,通过响应面分析方法确定三叶青根多糖提取的最佳工艺为:提取温度96℃、液料比34:1(mL/g)、提取时间2h... 采用水浴提取三叶青根多糖(Polysaccharides from roots of Radix Tetrastigma,RTP),以多糖提取得率为响应指标,在单因素试验的基础上,通过响应面分析方法确定三叶青根多糖提取的最佳工艺为:提取温度96℃、液料比34:1(mL/g)、提取时间2h,该条件下三叶青根多糖提取得率为(21.23±0.77)%。通过Sevage法除蛋白,并依次经DEAE-52离子交换柱、Sepharose CL-4B凝胶柱分级纯化,得到组分RTP-3-1。高效液相凝胶渗透色谱分析RTP-3-1为高纯度多糖,其分子量为1 244.2kDa,傅里叶红外光谱分析显示RTP-3-1是酸性多糖,核磁共振氢谱显示RTP-3-1为α型多糖。 展开更多
关键词 三叶青根 多糖 水浴提取 纯化 结构
在线阅读 下载PDF
三叶青2个ThBLH转录因子cDNA的克隆及其对光质与光周期信号的响应 被引量:2
16
作者 闻静 刘俊 +4 位作者 段华平 林国卫 蔡红 张莉 赵刚 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 2021年第6期1065-1073,共9页
为探究三叶青ThBLH转录因子在块根发育不同时期、不同光质及光周期处理下相对表达量差异,分析光信号与ThBLH转录因子相对表达量及三叶青块根发育之间的关系,利用基础生物信息学分析软件对转录组中的ThBLH序列进行核酸及推测蛋白质序列... 为探究三叶青ThBLH转录因子在块根发育不同时期、不同光质及光周期处理下相对表达量差异,分析光信号与ThBLH转录因子相对表达量及三叶青块根发育之间的关系,利用基础生物信息学分析软件对转录组中的ThBLH序列进行核酸及推测蛋白质序列的生物信息学分析,对所筛选到的ThBLH的cDNA进行PCR克隆验证,利用qRT-PCR法检测不同处理中ThBLH相对表达量。生物信息学分析表明,克隆的ThBLH cDNA所编码的蛋白质具有典型的BEL1-lIKE保守域及相关的保守氨基酸序列;块根中2个ThBLH基因的cDNA表达水平显著高于纤维根;ThBLH1相对表达量在短日处理中显著高于其他光周期处理,ThBLH2在短日处理及24 h光照处理下分别在20:00及次日4:00出现了表达高峰;红光可以促进ThBLH1在叶片中的表达,蓝光处理下块根中该基因相对表达量显著低于其他处理;白光处理下块根中ThBLH2相对表达量显著高于其他处理。本研究中的ThBLH基因的表达水平与块根的发育表现出正相关性,光周期及蓝光处理中ThBLH1的表达模式呈现出规律性。 展开更多
关键词 三叶青 块根发育 光周期 光质 BLH转录因子
在线阅读 下载PDF
三叶青野生种与怀玉山三叶青栽培种光合特征和叶绿素荧光参数的比较 被引量:2
17
作者 熊克冰 洪森荣 +1 位作者 蔡红 陈荣华 《湖北农业科学》 2022年第18期11-15,28,共6页
选取了三叶青(Tetrastigma hemsleyanum Diels et Gilg)野生种FJ-WYS以及怀玉山三叶青栽培种怀玉2号作为研究对象,研究其光合特征、叶绿素荧光参数、叶绿素含量、叶长、叶宽和叶型指数的差异。结果表明,怀玉2号的胞间CO_(2)浓度(Ci)、... 选取了三叶青(Tetrastigma hemsleyanum Diels et Gilg)野生种FJ-WYS以及怀玉山三叶青栽培种怀玉2号作为研究对象,研究其光合特征、叶绿素荧光参数、叶绿素含量、叶长、叶宽和叶型指数的差异。结果表明,怀玉2号的胞间CO_(2)浓度(Ci)、稳态荧光(F_(s))、叶绿素含量(SPAD)、叶长、叶型指数显著高于FJ-WYS,而FJ-WYS的气孔限制值(L_(s))、水分利用效率(WUE)、净光合速率(P_(n))、瞬时羧化速率(CUE)、最小初始荧光(F_(o))、叶宽均显著高于怀玉2号。怀玉2号的光合作用弱于FJ-WYS,且光合作用与叶绿素含量和叶型指数无正相关关系。 展开更多
关键词 三叶青(Tetrastigma hemsleyanum Diels et Gilg) 光合特征 叶绿素荧光参数
在线阅读 下载PDF
重庆潼南三叶青与安徽黄山三叶青光合特性和叶绿素荧光参数比较 被引量:1
18
作者 彭保江 尹明华 +1 位作者 蔡红 陈荣华 《山西农业科学》 2022年第3期356-363,共8页
为了探究不同产地三叶青光合特性和叶绿素荧光参数的差异性,为三叶青品种的种质创新提供理论依据,试验以重庆潼南三叶青(CQ-TN)和安徽黄山三叶青(ANH-HSH)为材料,测定其叶长、叶宽、叶绿素含量、光合特性和叶绿素荧光参数。结果表明,CQ... 为了探究不同产地三叶青光合特性和叶绿素荧光参数的差异性,为三叶青品种的种质创新提供理论依据,试验以重庆潼南三叶青(CQ-TN)和安徽黄山三叶青(ANH-HSH)为材料,测定其叶长、叶宽、叶绿素含量、光合特性和叶绿素荧光参数。结果表明,CQ-TN和ANH-HS间的叶长差异不显著,而CQ-TN和ANH-HS间的叶宽存在极显著差异;CQ-TN的平均叶形指数极显著小于ANH-HSH;CQ-TN的净光合速率(Pn)、胞间CO_(2)浓度(Ci)、瞬时羧化速率(CUE)极显著低于ANH-HSH,而CQ-TN的气孔导度(Gs)、蒸腾速率(Tr)、气孔限制值(Ls)和水分利用效率(WUE)均高于ANH-HSH,但差异不显著;CQ-TN的Fv/Fm、Fv/Fo、PSⅡ实际光化学效率(ΦPSⅡ)、开放的PSII反应中心捕获激发能效率(Fv’/Fm’)和光化学淬灭系数(qP)均小于ANHHSH,而CQ-TN的非光化学淬灭系数(NPQ)大于ANH-HSH,但均无显著性差异;CQ-TN的叶绿素含量平均值显著高于ANH-HSH。 展开更多
关键词 三叶青 重庆潼南(CQ-TN) 安徽黄山(ANH-HSH) 光合特性 叶绿素荧光参数 叶形指数
在线阅读 下载PDF
怀玉山三叶青一年生和四年生地栽扦插苗的光合特性和荧光参数比较 被引量:1
19
作者 程绘颖 蔡红 +1 位作者 陈荣华 尹明华 《湖北农业科学》 2022年第16期112-115,共4页
比较了怀玉山三叶青(Tetrastigma hemsleyanum Diels et Gilg)怀玉2号一年生和四年生地栽扦插苗的光合特性、叶绿素荧光参数、叶绿素含量和叶形指数。结果表明,一年生地栽扦插苗的气孔导度、胞间二氧化碳浓度显著低于四年生地栽扦插苗,... 比较了怀玉山三叶青(Tetrastigma hemsleyanum Diels et Gilg)怀玉2号一年生和四年生地栽扦插苗的光合特性、叶绿素荧光参数、叶绿素含量和叶形指数。结果表明,一年生地栽扦插苗的气孔导度、胞间二氧化碳浓度显著低于四年生地栽扦插苗,而一年生地栽扦插苗的气孔限制值、光合速率和水分利用效率显著高于四年生地栽扦插苗,两者之间的蒸腾速率和瞬时羧化速率无显著性差异。一年生和四年生地栽扦插苗的叶绿素荧光参数各项指数均无显著性差异。一年生地栽扦插苗的叶绿素含量显著高于四年生地栽扦插苗,但两者的叶长、叶宽和叶形指数均无显著性差异。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青(Tetrastigma hemsleyanum Diels et Gilg) 一年生地栽扦插苗 四年生地栽扦插苗 光合特性 叶绿素荧光参数
在线阅读 下载PDF
三叶青一年生实生苗与五年生扦插苗叶片的光合特性研究 被引量:2
20
作者 柯月娟 蔡红 +1 位作者 陈荣华 尹明华 《湖南农业科学》 2021年第11期39-42,共4页
对大棚种植的怀玉山三叶青一年生实生苗和五年生扦插苗的叶片形态和光合特性参数进行比较分析,结果表明:五年生扦插苗叶长和叶宽显著高于一年生实生苗,但二者的叶形指数差异不显著;五年生扦插苗叶片的叶绿素相对含量稍高于一年生实生苗... 对大棚种植的怀玉山三叶青一年生实生苗和五年生扦插苗的叶片形态和光合特性参数进行比较分析,结果表明:五年生扦插苗叶长和叶宽显著高于一年生实生苗,但二者的叶形指数差异不显著;五年生扦插苗叶片的叶绿素相对含量稍高于一年生实生苗,但无显著性差异;五年生扦插苗的初始荧光(Fo)、最大荧光值(Fm)以及最大光化学效率(Fv/Fm)稍高于一年生实根苗,但均无显著性差异;一年生实生苗的净光合速率(Pn)、胞间CO_(2)浓度(Ci)、气孔限制值(Ls)、水分利用效率(WUE)均高于五年生扦插苗,且具有显著性差异。这表明一年生实生苗的光合作用强于五年生扦插苗,且叶绿素含量和叶形指数与生长年限无正相关关系。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 叶绿素含量 光合特性 叶绿素荧光参数 叶形指数
在线阅读 下载PDF
上一页 1 2 下一页 到第
使用帮助 返回顶部