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怀玉山三叶青两个栽培种块根内生菌、根际微生物群落分布及其化感物质的比较分析 被引量:2
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作者 夏瑾华 刘彩艳 +4 位作者 刘佳仪 刘金玲 刘乐 彭雅婷 尹明华 《山东农业科学》 北大核心 2022年第7期93-103,共11页
本试验利用Illumina高通量测序技术研究怀玉山三叶青两个栽培种块根内生菌、根际微生物群落分布,利用LC-MS技术比较分析其化感物质含量差异。结果表明:怀玉1号块根内生菌和根际土壤微生物物种数量均少于怀玉2号。怀玉1号块根(WT_G)和怀... 本试验利用Illumina高通量测序技术研究怀玉山三叶青两个栽培种块根内生菌、根际微生物群落分布,利用LC-MS技术比较分析其化感物质含量差异。结果表明:怀玉1号块根内生菌和根际土壤微生物物种数量均少于怀玉2号。怀玉1号块根(WT_G)和怀玉2号根际土壤(LM)的物种数和物种多样数较高。怀玉2号根际土壤(LM)、怀玉1号根际土壤(WT)、怀玉2号块根(LM_G)和怀玉1号块根(WT_G)的优势群落均为子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota)。怀玉1号根际土壤(WT)的龙胆酸、香草醛酸和水杨酸含量高于怀玉2号根际土壤(LM),而丁香酸、没食子酸和阿魏酸含量低于怀玉2号根际土壤(LM)。本试验结果可为怀玉山三叶青两个栽培种的大棚高效栽培提供理论依据。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 栽培种 块根 内生菌 根际微生物 化感物质
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盐胁迫对怀玉山三叶青2个栽培种试管苗生理特性和次生代谢产物的影响 被引量:8
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作者 洪森荣 陈轩宇 +5 位作者 李文丽 张座栋 刘军 刘佳 蔡红 陈荣华 《山东农业科学》 北大核心 2021年第9期38-45,共8页
为探究盐胁迫对怀玉山三叶青2个栽培种(‘怀玉1号’‘怀玉2号’)试管苗生理特性和次生代谢产物的影响,为其大棚基质高效栽培提供依据,本研究设置不同质量浓度(0、2、4、6、8、10 g·L^(-1))的NaCl胁迫处理,分析其对怀玉山三叶青2个... 为探究盐胁迫对怀玉山三叶青2个栽培种(‘怀玉1号’‘怀玉2号’)试管苗生理特性和次生代谢产物的影响,为其大棚基质高效栽培提供依据,本研究设置不同质量浓度(0、2、4、6、8、10 g·L^(-1))的NaCl胁迫处理,分析其对怀玉山三叶青2个栽培种试管苗生长及生理特性的影响。结果表明:(1)低盐胁迫(2~4 g·L^(-1))时,怀玉山三叶青2个栽培种试管苗无死亡,对株高和植株干质量无显著影响;中高盐胁迫(6~10 g·L^(-1))时,2个栽培种试管苗的死亡率显著提高,株高、地上和地下部干质量显著下降。(2)随着盐胁迫浓度的升高,怀玉山三叶青2个栽培种试管苗的游离脯氨酸(Pro)、可溶性蛋白(SP)、可溶性糖(SS)含量以及超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)和过氧化氢酶(CAT)活性均先升高后降低,除‘怀玉1号’可溶性糖含量在0.2 g·L^(-1) NaCl处理时最高外,‘怀玉1号’‘怀玉2号’各指标分别在4、6 g·L^(-1) NaCl处理时达到峰值;MDA含量和相对电导率均持续升高;‘怀玉1号’‘怀玉2号’叶绿素a和叶绿素b及总叶绿素含量分别在2~4、2~6 g·L^(-1) NaCl处理时与对照差异不显著,而后均显著下降。综合分析,‘怀玉1号’‘怀玉2号’试管苗的耐盐阈值分别为4、6 g·L^(-1)。(3)隶属函数分析和主成分分析结果表明,怀玉山三叶青2个栽培种试管苗的耐盐性为‘怀玉2号’>‘怀玉1号’。(4)随着盐胁迫的不断加重,‘怀玉1号’和‘怀玉2号’试管苗叶片的黄酮和多酚含量呈先升后降趋势,而多糖含量则呈直线下降趋势。本试验探究了盐胁迫对怀玉山三叶青试管苗生理特性和次生代谢产物的影响,可为今后解决其高山大棚栽培中可能遇到的盐胁迫问题提供理论依据。 展开更多
关键词 盐胁迫 怀玉山三叶青 栽培种 试管苗 生理特性 次生代谢产物
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怀玉山三叶青2个栽培种块根的转录组分析 被引量:5
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作者 洪森荣 黄丹丹 +5 位作者 黄诗慧 黄夏梦 蒋椰 李万平 蔡红 陈荣华 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期24-35,共12页
【目的】筛选怀玉山三叶青2个栽培种:怀玉1号(HY1组)和怀玉2号(HY2组)与黄酮类化合物合成相关差异表达基因。【方法】以怀玉山三叶青怀玉1号(HY1组)和怀玉2号(HY2组)的块根为试验材料进行转录组分析。【结果】HY1组和HY2组的Clean read... 【目的】筛选怀玉山三叶青2个栽培种:怀玉1号(HY1组)和怀玉2号(HY2组)与黄酮类化合物合成相关差异表达基因。【方法】以怀玉山三叶青怀玉1号(HY1组)和怀玉2号(HY2组)的块根为试验材料进行转录组分析。【结果】HY1组和HY2组的Clean reads分别为42 311 662和41 411 202。2组样品Q30碱基百分比均不小于95.75%。HY1组和HY2组的转录因子家族多为MYB-superfamily、 bHLH、 AP2/ERF、 NAC、 C2C2、 WRKY等。HY1组和HY2组表达量FPKM的对数值在0-2。HY1组和HY2组表达量密度在0-0.7。HY1组和HY2组表达的共有基因数为22 367,HY1组单独表达的基因数为18 196,HY2组单独表达的基因数为8 137。HY1组和HY2组表达量的相关系数为0.913,样本间相关性好。HY1组和HY2组共产生差异表达基因12 199个。与HY1组比较,HY2组上调基因数为3 551,下调基因数为8 648。GO富集分析显示,差异基因主要注释到光合作用光系统I光捕获、光合作用捕获、叶绿素代谢过程、蛋白质发色团连锁、前体代谢产物和能量的产生、叶绿素生物合成过程、氧化应激反应、α-氨基酸代谢过程、光合作用、质体小叶、光系统Ⅰ、光系统Ⅱ、质体类核仁、光系统、叶绿素结合、单加氧酶活性、铁离子结合、血红素结合、裂解酶活性功能。KEGG富集分析显示,差异基因主要注释到光合作用-天线蛋白、核糖体、乙醛酸和二元酸代谢、苯丙酸生物合成、二苯乙烯类、二芳基庚烷类和姜辣素的生物合成、类黄酮生物合成、光合作用、光合生物的固碳作用、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢、植物激素信号转导、谷胱甘肽代谢、丙酮酸代谢、苯丙氨酸代谢、植物昼夜节律、黄酮和黄酮醇的生物合成、半胱氨酸与蛋氨酸代谢、氰胺酸代谢、类胡萝卜素生物合成、α-亚麻酸代谢、卟啉与叶绿素代谢等代谢途径。【结论】与黄酮类化合物相关差异表达基因如芪合酶(stilbenesynthase)、无色花色素双加氧酶(leucoanthocyanidindioxygenase)、查尔酮异构酶蛋白(CHI protein)、查尔酮合酶2(chalcone synthase 2)、黄烷酮3-羟化酶(flavanone 3-hydroxylase)、无色花色素还原酶(1leucoanthocyanidin reductase 1)、类黄酮3’-羟化酶(flavonoid 3’-hydroxylase)基因在怀玉2号(HY2组)块根中上调,而查尔酮合酶(chalcone synthase)、黄酮醇合酶(flavonol synthase)、类黄酮3’,5’-甲基转移酶(flavonoid 3’, 5’-methyltransferase)基因在怀玉2号(HY2组)块根中下调,导致怀玉山三叶青怀玉1号(HY1组)和怀玉2号(HY2组)块根总黄酮含量的差异。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 栽培种 块根 转录组分析
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怀玉山三叶青2个栽培种试管苗对干旱胁迫的生理响应及相关基因的表达 被引量:1
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作者 洪森荣 柯维忠 +6 位作者 陶月琴 戴云龙 安永盼 符卉卉 阿提克穆·麦麦提 蔡红 陈荣华 《江苏农业科学》 北大核心 2022年第4期117-125,共9页
为了探究怀玉山三叶青2个栽培种试管苗对干旱胁迫的生理响应,为其高山大棚有效栽培提供理论依据。以怀玉山三叶青怀玉1号、怀玉2号试管苗为试验材料,进行PEG-6000模拟干旱胁迫处理,通过主成分分析和隶属函数法综合评价怀玉山三叶青2个... 为了探究怀玉山三叶青2个栽培种试管苗对干旱胁迫的生理响应,为其高山大棚有效栽培提供理论依据。以怀玉山三叶青怀玉1号、怀玉2号试管苗为试验材料,进行PEG-6000模拟干旱胁迫处理,通过主成分分析和隶属函数法综合评价怀玉山三叶青2个栽培种试管苗抗旱性的强弱,并通过荧光定量PCR分析干旱胁迫下怀玉山三叶青2个栽培种试管苗相关基因的表达情况。结果表明,随着PEG-6000浓度的增加,怀玉1号、怀玉2号试管苗的株高和生物量整体上呈先稳后降的趋势,可溶性蛋白(SP)、可溶性糖(SS)、游离脯氨酸(Pro)和K^(+)含量以及抗氧化酶[超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)和过氧化氢酶(CAT)]活性整体上呈先升后降的趋势,而相对电导率(RC)、丙二醛(MDA)含量和Na^(+)含量则呈显著提高的态势,茎、根Ca^(2+)含量无显著变化。根据隶属函数分析结果,怀玉山三叶青2个栽培种试管苗的耐旱性为怀玉2号>怀玉1号;主成分分析结果表明,第1个主成分中较大的指标有POD、CAT活性和Pro含量,第2个主成分中较大的指标有RC、SOD活性和MDA含量,第3个主成分中较大的指标有SS、K^(+)和Ca^(2+)含量;轻度干旱和中度干旱有助于脱落酸、茉莉酸、乙烯、赤霉素、生长素等内源激素含量的提高,也有利于怀玉山三叶青黄酮醇和查尔酮的合成,但不利于怀玉山三叶青烟草花叶病毒的增殖。由研究结果可知,适度干旱胁迫可以提高内源激素和次生代谢物的含量,抑制病毒增殖,促进怀玉山三叶青的生长发育,相关研究结果可为怀玉山三叶青抗旱种源的筛选提供参考依据。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 栽培种 试管苗 干旱胁迫 生理响应 相关基因表达
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怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白3基因克隆和功能分析 被引量:2
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作者 尹明华 陈佳雯 +5 位作者 陈瑞 樊凡 辜婷婷 何思捷 陈荣华 蔡红 《江苏农业科学》 北大核心 2022年第6期32-41,共10页
通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白3基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆该病毒增殖蛋白3基因,并进行序列分析、亚细胞定位、器官表达分析和功能分析。结果表明:怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白3基因c... 通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白3基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆该病毒增殖蛋白3基因,并进行序列分析、亚细胞定位、器官表达分析和功能分析。结果表明:怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白3基因cDNA总长度为873 bp,G+C含量为44.22%;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白3由290个氨基酸组成,分子量33374.79 u,等电点9.72,为疏水性蛋白;二级结构由α-螺旋(57.24%)、β-片层(10.69%)、无规则卷曲(32.07%)构成;三级结构为单体;预测怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白3主要存在质膜、液泡膜、内质网中;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白3与葡萄烟草病毒增殖蛋白3(GenBank:XP_002275179.1、GenBank:XP_034684444.1)的同源性最高,同源性达到94.83%。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,烟草病毒增殖蛋白3定位于细胞质(可能包括细胞膜)和细胞核膜中。实时定量PCR结果显示,烟草病毒增殖蛋白3基因在怀玉山三叶青2个栽培种中的表达存在器官特异性,怀玉2号和怀玉1号均在叶中表达量最高;烟草病毒增殖蛋白3转基因阳性烟草的三叶青花叶病毒表达量显著高于烟草病毒增殖蛋白3转基因阴性烟草;与烟草病毒增殖蛋白3转基因阴性烟草相比较,烟草病毒增殖蛋白3转基因阳性烟草的净光合速率(P_(n))、气孔导度(G_(s))、蒸腾速率(T_(r))、最大光化学效率(F_(v)/F_(m))、实际光化学量子效率(ΦPSⅡ)、光化学淬灭系数(q_(P))及电子传递效率(ETR)显著下降,而非光化学淬灭系数(NPQ)显著上升。怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白3具有典型烟草病毒增殖蛋白3的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度高,进化上高度保守,且可促进三叶青烟草花叶病毒的增殖,降低植株的光合作用效率。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 烟草病毒增殖蛋白3 基因克隆 功能分析 蛋白结构
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怀玉山三叶青黄酮醇合酶基因克隆和表达分析 被引量:1
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作者 洪森荣 陈正梦 +1 位作者 戴慧珍 邓曼蕾 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期2061-2068,共8页
【目的】对怀玉山三叶青黄酮醇合酶基因进行克隆和表达分析,为进一步揭示怀玉山三叶青黄酮醇合酶的生物学功能奠定基础。【方法】怀玉山三叶青黄酮醇合酶基因的核心片段通过其转录组数据库进行筛选,怀玉山三叶青黄酮醇合酶基因利用逆转... 【目的】对怀玉山三叶青黄酮醇合酶基因进行克隆和表达分析,为进一步揭示怀玉山三叶青黄酮醇合酶的生物学功能奠定基础。【方法】怀玉山三叶青黄酮醇合酶基因的核心片段通过其转录组数据库进行筛选,怀玉山三叶青黄酮醇合酶基因利用逆转录PCR进行克隆,序列分析采用生物信息学进行分析,器官表达采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)进行比较。【结果】怀玉山三叶青黄酮醇合酶基因cDNA总长度为987 bp,G+C含量为47.92%。怀玉山三叶青黄酮醇合酶由329个氨基酸组成,分子量37578.03 Da,理论等电点5.39,为亲水性蛋白;其二级结构中α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲的比例分别占27.66%、21.88%和50.46%。怀玉山三叶青黄酮醇合酶主要存在内质网中,在进化上与山甜菜(Nekemias grossedentata)、河岸葡萄(Vitis riparia)和葡萄(Vitis vinifera)的亲缘关系较近,尤其是与山甜菜(N.grossedentata)黄酮醇合酶在进化上具有最高的亲缘关系。qRT-PCR分析结果表明,怀玉山三叶青黄酮醇合酶基因的表达在2个栽培种中存在器官特异性表达,怀玉2号在根中的相对表达量最高,怀玉1号在茎中的相对表达量最高。【结论】怀玉山三叶青黄酮醇合酶具有典型黄酮醇合酶的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度高,在进化上高度保守,且怀玉山三叶青黄酮醇合酶基因的表达存在组织器官差异性。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 黄酮醇合酶 基因克隆 表达分析
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怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1基因克隆、亚细胞定位和组织表达分析 被引量:1
7
作者 洪森荣 向琼钰 +5 位作者 谢颖 熊晨露 徐晨慧 徐璐珂 陈荣华 蔡红 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第6期1193-1204,共12页
通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1基因的核心片段,利用反转录PCR(RT-PCR)技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1基因,并采用生物信息学方法和实时荧光定量PCR进行序列分析和器官表达分析。结果... 通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1基因的核心片段,利用反转录PCR(RT-PCR)技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1基因,并采用生物信息学方法和实时荧光定量PCR进行序列分析和器官表达分析。结果表明,怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1基因cDNA总长度为888 bp,G+C含量为51.58%;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1由295个氨基酸组成,分子量33173.36 u,等电点9.16,为疏水性蛋白;二级结构由α-螺旋(43.73%)、β-片层(21.69%)、无规则卷曲(34.58%)构成;三级结构为单体;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1主要存在于内质网、内质网-质膜、细胞外、细胞质、线粒体和质膜中;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1在进化上与Aegilops tauschii subsp.tauschill(节节麦)、Triticum turgidum subsp.durum(硬粒小麦)、Hordeum vulgare(大麦)的亲缘关系较近,尤其是与Aegilops tauschii subsp.tauschill(节节麦)烟草病毒增殖蛋白1在进化上具有最高的亲缘关系。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,烟草病毒增殖蛋白1定位于细胞质(可能包括细胞膜)和细胞核膜中。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果显示,烟草病毒增殖蛋白1基因在怀玉山三叶青2个栽培种中的表达存在器官特异性,怀玉2号在叶中表达量最高,怀玉1号在茎中表达量最高。怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白1具有典型烟草病毒增殖蛋白1的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度高,在进化上高度保守,对进一步揭示该酶生物学功能具有重要意义。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 烟草病毒增殖蛋白1 基因克隆 亚细胞定位 表达分析
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怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因克隆和功能分析 被引量:1
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作者 尹明华 曾淑琴 +3 位作者 曾荧 张彩霞 张慧博 张丽佳 《种子》 北大核心 2022年第3期45-51,共7页
通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因,并采用生物信息学方法、转基因瞬时表达和实时定量PCR进行序列分析、亚细胞定位和... 通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因,并采用生物信息学方法、转基因瞬时表达和实时定量PCR进行序列分析、亚细胞定位和器官表达分析。结果表明,怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因cDNA总长度为858 bp,G+C含量为49.53%;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A由285个氨基酸组成,分子量31437.53 Da,等电点5.77,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(28.77%)、β-片层(16.14%)、无规则卷曲(55.09%)构成;三级结构为单体;预测怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A主要存在细胞核、线粒体、叶绿体和细胞质中;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A在进化上与硬粒小麦、节节麦、乌拉尔图小麦、大麦、二穗短柄草的亲缘关系较近,尤其是与硬粒小麦未命名蛋白产物(VAH 15508.1)在进化上具有最高的亲缘关系。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,烟草病毒增殖蛋白2 A定位于细胞质和细胞核中。实时定量PCR结果显示,烟草病毒增殖蛋白2 A基因在怀玉山三叶青2个栽培种中的表达存在器官特异性,怀玉2号和怀玉1号均在叶中表达量最高。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 烟草病毒增殖蛋白2 A 基因克隆 亚细胞定位 表达分析
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怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like基因克隆及其功能分析 被引量:1
9
作者 夏瑾华 李丹丹 +4 位作者 李然 刘贤泥 刘子捷 罗冰 欧丽佳 《江苏农业科学》 北大核心 2023年第2期36-43,共8页
通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选得到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like基因的核心片段,利用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like基因,并对其进行序列分析、亚细胞定位和器官表达分析... 通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选得到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like基因的核心片段,利用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like基因,并对其进行序列分析、亚细胞定位和器官表达分析。结果表明,怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like基因cDNA总长度为828 bp,G+C含量为46.50%;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like由275个氨基酸组成,分子量为30728.97 u,等电点为5.39,为疏水性蛋白;二级结构由α-螺旋(28.36%)、β-片层(20.73%)、无规则卷曲(50.91%)构成;三级结构为单体跨膜蛋白;预测怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like主要存在液泡膜中;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like与葡萄烟草病毒增殖蛋白2A(GenBank:XP_034708140.1、XP_002279170.2)的同源性最高,同源性达到86.79%。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,烟草病毒增殖蛋白2A-like定位于细胞质和细胞核中。实时定量PCR结果显示,烟草病毒增殖蛋白2A-like基因在怀玉山三叶青2个栽培种中的表达存在器官特异性,怀玉2号和怀玉1号均在叶中表达量最高。怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like具有典型烟草病毒增殖蛋白2A的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度较高,进化上较为保守,且可降低植株的光合作用效率。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 烟草病毒增殖蛋白2A-like 基因克隆 表达分析 亚细胞定位
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怀玉山三叶青TOM2BisoformX1基因克隆和功能分析 被引量:2
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作者 尹明华 胡嘉琦 +7 位作者 胡明艳 胡蓉 胡燕荣 黄舒绮 江梦芝 姜梦真 陈荣华 蔡红 《山东农业科学》 北大核心 2021年第8期1-10,共10页
为揭示怀玉山三叶青TOM2BisoformX1(tobamovirusmultiplicationprotein2BisoformX1)的生物学功能提供理论依据,本研究通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青TOM2BisoformX1基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆了该基因,... 为揭示怀玉山三叶青TOM2BisoformX1(tobamovirusmultiplicationprotein2BisoformX1)的生物学功能提供理论依据,本研究通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青TOM2BisoformX1基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆了该基因,并采用生物信息学、转基因瞬时表达和实时定量PCR方法对其进行序列分析、亚细胞定位、组织表达分析和功能分析。结果表明,怀玉山三叶青TOM2BisoformX1基因cDNA总长度为432bp,G+C含量为50.46%;编码143个氨基酸,分子量15392.36Da,等电点7.87,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(50.35%)、β-片层(2.10%)、无规则卷曲(47.55%)构成;三级结构为单体;预测怀玉山三叶青TOM2BisoformX1主要存在于细胞核中;怀玉山三叶青TOM2BisoformX1与葡萄(Vitis vinifera)TOM2BisoformX1(GenBank:XP_010664025.1)的同源性最高,达到83.92%。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,TOM2BisoformX1定位于细胞质和细胞核中。实时定量PCR结果显示,TOM2BisoformX1基因在怀玉山三叶青两个栽培种中的表达存在器官特异性,‘怀玉2号’和‘怀玉1号’均在叶中表达量最高;TOM2BisoformX1转基因阳性烟草的三叶青花叶病毒表达量显著高于TOM2BisoformX1转基因阴性烟草;与转基因阴性烟草相比,转基因阳性烟草的净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)、蒸腾速率(Tr)、最大光化学效率(Fv/Fm)、实际光化学量子效率(ΦPSⅡ)、光化学淬灭系数(qP)及电子传递效率(ETR)显著下降,而非光化学淬灭系数(NPQ)显著上升。怀玉山三叶青TOM2BisoformX1具有典型TOM2BisoformX1的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度高,进化上高度保守,且可促进三叶青烟草花叶病毒的增殖,降低植株的光合作用效率。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 TOM2BisoformX1 基因克隆 功能分析
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怀玉山三叶青查尔酮合酶基因克隆和表达分析
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作者 洪森荣 刘佳 +3 位作者 刘军 刘依婷 陈荣华 蔡红 《山东农业科学》 北大核心 2021年第10期8-16,共9页
本研究通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到其查尔酮合酶基因的核心片段,利用qRT-PCR技术克隆到其查尔酮合酶基因,并采用生物信息学方法和实时定量PCR进行序列分析和器官表达分析,以期为揭示怀玉山三叶青查尔酮合酶的生物学功能... 本研究通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到其查尔酮合酶基因的核心片段,利用qRT-PCR技术克隆到其查尔酮合酶基因,并采用生物信息学方法和实时定量PCR进行序列分析和器官表达分析,以期为揭示怀玉山三叶青查尔酮合酶的生物学功能提供理论依据。结果表明,怀玉山三叶青查尔酮合酶基因cDNA总长度为1143 bp,G+C含量为65.27%;由380个氨基酸组成,分子量41809.23 Da,等电点6.19,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(37.37%)、β-片层(19.47%)、无规则卷曲(43.16%)构成,三级结构为二聚体;该酶主要存在于细胞核和线粒体中,在进化上与硬粒小麦(Triticum turgidum subsp.durum)、节节麦(Aegilops tauschii subsp.tauschill)、小麦(Triticum aestivum)的亲缘关系较近,尤其与硬粒小麦的未命名蛋白产物(VAH38240.1)亲缘关系最近。实时定量PCR结果显示,查尔酮合酶基因在怀玉山三叶青2个栽培种‘怀玉2号’和‘怀玉1号’中的表达存在器官特异性,均在根中表达量最高。综上,怀玉山三叶青查尔酮合酶具有查尔酮合酶的典型结构特征,氨基酸序列及核苷酸序列与同源物种相似度高,在进化上高度保守,这对进一步揭示该酶的生物学功能具有重要意义。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 查尔酮合酶 基因克隆 表达分析
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三叶青野生种与怀玉山三叶青栽培种光合特征和叶绿素荧光参数的比较 被引量:2
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作者 熊克冰 洪森荣 +1 位作者 蔡红 陈荣华 《湖北农业科学》 2022年第18期11-15,28,共6页
选取了三叶青(Tetrastigma hemsleyanum Diels et Gilg)野生种FJ-WYS以及怀玉山三叶青栽培种怀玉2号作为研究对象,研究其光合特征、叶绿素荧光参数、叶绿素含量、叶长、叶宽和叶型指数的差异。结果表明,怀玉2号的胞间CO_(2)浓度(Ci)、... 选取了三叶青(Tetrastigma hemsleyanum Diels et Gilg)野生种FJ-WYS以及怀玉山三叶青栽培种怀玉2号作为研究对象,研究其光合特征、叶绿素荧光参数、叶绿素含量、叶长、叶宽和叶型指数的差异。结果表明,怀玉2号的胞间CO_(2)浓度(Ci)、稳态荧光(F_(s))、叶绿素含量(SPAD)、叶长、叶型指数显著高于FJ-WYS,而FJ-WYS的气孔限制值(L_(s))、水分利用效率(WUE)、净光合速率(P_(n))、瞬时羧化速率(CUE)、最小初始荧光(F_(o))、叶宽均显著高于怀玉2号。怀玉2号的光合作用弱于FJ-WYS,且光合作用与叶绿素含量和叶型指数无正相关关系。 展开更多
关键词 三叶青(Tetrastigma hemsleyanum Diels et Gilg) 光合特征 叶绿素荧光参数
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重庆潼南三叶青与安徽黄山三叶青光合特性和叶绿素荧光参数比较 被引量:1
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作者 彭保江 尹明华 +1 位作者 蔡红 陈荣华 《山西农业科学》 2022年第3期356-363,共8页
为了探究不同产地三叶青光合特性和叶绿素荧光参数的差异性,为三叶青品种的种质创新提供理论依据,试验以重庆潼南三叶青(CQ-TN)和安徽黄山三叶青(ANH-HSH)为材料,测定其叶长、叶宽、叶绿素含量、光合特性和叶绿素荧光参数。结果表明,CQ... 为了探究不同产地三叶青光合特性和叶绿素荧光参数的差异性,为三叶青品种的种质创新提供理论依据,试验以重庆潼南三叶青(CQ-TN)和安徽黄山三叶青(ANH-HSH)为材料,测定其叶长、叶宽、叶绿素含量、光合特性和叶绿素荧光参数。结果表明,CQ-TN和ANH-HS间的叶长差异不显著,而CQ-TN和ANH-HS间的叶宽存在极显著差异;CQ-TN的平均叶形指数极显著小于ANH-HSH;CQ-TN的净光合速率(Pn)、胞间CO_(2)浓度(Ci)、瞬时羧化速率(CUE)极显著低于ANH-HSH,而CQ-TN的气孔导度(Gs)、蒸腾速率(Tr)、气孔限制值(Ls)和水分利用效率(WUE)均高于ANH-HSH,但差异不显著;CQ-TN的Fv/Fm、Fv/Fo、PSⅡ实际光化学效率(ΦPSⅡ)、开放的PSII反应中心捕获激发能效率(Fv’/Fm’)和光化学淬灭系数(qP)均小于ANHHSH,而CQ-TN的非光化学淬灭系数(NPQ)大于ANH-HSH,但均无显著性差异;CQ-TN的叶绿素含量平均值显著高于ANH-HSH。 展开更多
关键词 三叶青 重庆潼南(CQ-TN) 安徽黄山(ANH-HSH) 光合特性 叶绿素荧光参数 叶形指数
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怀玉山三叶青一年生和四年生地栽扦插苗的光合特性和荧光参数比较 被引量:1
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作者 程绘颖 蔡红 +1 位作者 陈荣华 尹明华 《湖北农业科学》 2022年第16期112-115,共4页
比较了怀玉山三叶青(Tetrastigma hemsleyanum Diels et Gilg)怀玉2号一年生和四年生地栽扦插苗的光合特性、叶绿素荧光参数、叶绿素含量和叶形指数。结果表明,一年生地栽扦插苗的气孔导度、胞间二氧化碳浓度显著低于四年生地栽扦插苗,... 比较了怀玉山三叶青(Tetrastigma hemsleyanum Diels et Gilg)怀玉2号一年生和四年生地栽扦插苗的光合特性、叶绿素荧光参数、叶绿素含量和叶形指数。结果表明,一年生地栽扦插苗的气孔导度、胞间二氧化碳浓度显著低于四年生地栽扦插苗,而一年生地栽扦插苗的气孔限制值、光合速率和水分利用效率显著高于四年生地栽扦插苗,两者之间的蒸腾速率和瞬时羧化速率无显著性差异。一年生和四年生地栽扦插苗的叶绿素荧光参数各项指数均无显著性差异。一年生地栽扦插苗的叶绿素含量显著高于四年生地栽扦插苗,但两者的叶长、叶宽和叶形指数均无显著性差异。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青(Tetrastigma hemsleyanum Diels et Gilg) 一年生地栽扦插苗 四年生地栽扦插苗 光合特性 叶绿素荧光参数
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三叶青一年生实生苗与五年生扦插苗叶片的光合特性研究 被引量:2
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作者 柯月娟 蔡红 +1 位作者 陈荣华 尹明华 《湖南农业科学》 2021年第11期39-42,共4页
对大棚种植的怀玉山三叶青一年生实生苗和五年生扦插苗的叶片形态和光合特性参数进行比较分析,结果表明:五年生扦插苗叶长和叶宽显著高于一年生实生苗,但二者的叶形指数差异不显著;五年生扦插苗叶片的叶绿素相对含量稍高于一年生实生苗... 对大棚种植的怀玉山三叶青一年生实生苗和五年生扦插苗的叶片形态和光合特性参数进行比较分析,结果表明:五年生扦插苗叶长和叶宽显著高于一年生实生苗,但二者的叶形指数差异不显著;五年生扦插苗叶片的叶绿素相对含量稍高于一年生实生苗,但无显著性差异;五年生扦插苗的初始荧光(Fo)、最大荧光值(Fm)以及最大光化学效率(Fv/Fm)稍高于一年生实根苗,但均无显著性差异;一年生实生苗的净光合速率(Pn)、胞间CO_(2)浓度(Ci)、气孔限制值(Ls)、水分利用效率(WUE)均高于五年生扦插苗,且具有显著性差异。这表明一年生实生苗的光合作用强于五年生扦插苗,且叶绿素含量和叶形指数与生长年限无正相关关系。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 叶绿素含量 光合特性 叶绿素荧光参数 叶形指数
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三叶青怀玉1号与怀玉2号光合特性和表型比较 被引量:1
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作者 张艳 蔡红 +1 位作者 陈荣华 洪森荣 《浙江农业科学》 2022年第4期708-712,共5页
本文以怀玉山三叶青2个栽培种怀玉1号和怀玉2号为试材,对其光合参数、叶绿素荧光参数、叶绿素含量、叶长、叶宽以及叶形指数进行测量和比较,分析这2个栽培种的光合作用能力,为其在怀玉山种植基地的种植提供理论依据。结果表明:怀玉1号... 本文以怀玉山三叶青2个栽培种怀玉1号和怀玉2号为试材,对其光合参数、叶绿素荧光参数、叶绿素含量、叶长、叶宽以及叶形指数进行测量和比较,分析这2个栽培种的光合作用能力,为其在怀玉山种植基地的种植提供理论依据。结果表明:怀玉1号的净光合速率、气孔限制值、水分利用效率、瞬时羧化速率、稳态荧光产量、叶宽均值均显著高于怀玉2号,而怀玉1号的细胞间CO2浓度、光化学猝灭系数、PSⅡ实际光化学效率、叶绿素含量、叶长、叶形指数均值均显著低于怀玉2号,因此,怀玉1号叶形为椭圆形,怀玉2号叶形为披针形,且栽培种怀玉1号光合能力和抗旱能力较怀玉2号强。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 光合特性 叶绿素荧光 叶绿素含量 叶长 叶宽 叶形指数
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三叶青1年生实生苗和6年生扦插苗光合效应比较
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作者 符丽纳 洪森荣 《山西农业科学》 2022年第4期517-524,共8页
为了解怀玉山三叶青1年生实生苗和6年生扦插苗二者之间光合效率的差异,采用Li-6400光合仪和SPAD-502Plus便携式叶绿素测定仪对怀玉山三叶青1年生实生苗和6年生扦插苗二者之间的叶绿素含量、光合特性和叶绿素荧光参数进行测定。结果表明... 为了解怀玉山三叶青1年生实生苗和6年生扦插苗二者之间光合效率的差异,采用Li-6400光合仪和SPAD-502Plus便携式叶绿素测定仪对怀玉山三叶青1年生实生苗和6年生扦插苗二者之间的叶绿素含量、光合特性和叶绿素荧光参数进行测定。结果表明,怀玉山三叶青1年生实生苗和6年生扦插苗的叶绿素含量间无显著差异;1年生实生苗和6年生扦插苗净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)、胞间CO_(2)浓度(Ci)和气孔限制值(Ls)间差异显著,而二者的蒸腾速率(Tr)、水分利用效率(WUE)和瞬时羧化速率(CUE)间无显著差异;在光照条件下,1年生实生苗与6年生扦插苗的PSⅡ最大量子产量(F_(v)/F_(m))差异极显著,而饱和脉冲激发最大荧光值(F_(m)’)、最小荧光值(Fo’)以及捕获激发能效率(F_(v)’/F_(m)’)无显著差异;在遮光条件下,1年生实生苗与6年生扦插苗的F_(v)/F_(m)和PSⅡ潜在活性(F_(v)/Fo)差异显著,而初始荧光(Fo)和暗时最大荧光(F_(m))间无显著差异。怀玉山三叶青6年生扦插苗光合效率强于1年生实生苗,且光合效率与Gs、Ci、Ls、F_(v)/F_(m)、F_(v)/Fo相关。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 光合特性 叶绿素荧光参数 叶绿素含量 叶形指数
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怀玉山一年生三叶青地栽和盆栽扦插苗光合特性的比较
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作者 谢菁 蔡红 +1 位作者 陈荣华 尹明华 《浙江农业科学》 2022年第4期713-716,786,共5页
以一年生怀玉山三叶青地栽扦插苗和盆栽扦插苗的叶片为研究对象,利用便携式Li-6400XT光合测定仪测量光合特征和叶绿素荧光参数。结果表明,在相同的光照条件下,一年生盆栽扦插苗的净光合速率、平均细胞间CO_(2)浓度、平均蒸腾速率、气孔... 以一年生怀玉山三叶青地栽扦插苗和盆栽扦插苗的叶片为研究对象,利用便携式Li-6400XT光合测定仪测量光合特征和叶绿素荧光参数。结果表明,在相同的光照条件下,一年生盆栽扦插苗的净光合速率、平均细胞间CO_(2)浓度、平均蒸腾速率、气孔导度、瞬时羧化速率均高于一年生地栽扦插苗。一年生盆栽扦插苗的水分利用效率、气孔限制值均低于一年生地栽扦插苗。一年生地栽扦插苗平均光下荧光和平均光下最大荧光均高于一年生盆栽扦插苗;PSⅡ有效光量子产量、光化学猝灭系数表现为一年生地栽扦插苗>一年生盆栽扦插苗;非光化学猝灭系数表现为一年生地栽扦插苗<一年生盆栽扦插苗;一年生地栽扦插苗的叶绿素相对含量高于一年生盆栽扦插苗,为其1.67倍。在叶形指数方面则是一年生盆栽扦插苗高于一年生地栽扦插苗。三叶青一年生盆栽扦插苗光合作用强于一年生地栽扦插苗。 展开更多
关键词 怀玉山三叶青 一年生盆栽扦插苗 一年生地栽扦插苗 光合特性 叶绿素荧光参数 叶形指数 叶绿素含量
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黄独微型块茎环阿屯醇合酶基因克隆与序列分析
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作者 柯维忠 曾晓健 +3 位作者 徐婷 刘霞霞 胡品书 游检 《江苏农业科学》 北大核心 2022年第4期29-35,共7页
获取黄独皂苷合成途径关键酶环阿屯醇合酶(CAS)的基因全长cDNA序列,并进行序列分析。通过黄独微型块茎转录组数据库筛选得到CAS基因的核心片段,利用RT-PCR技术获得CAS基因保守片段,采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得CAS基因的3′及5... 获取黄独皂苷合成途径关键酶环阿屯醇合酶(CAS)的基因全长cDNA序列,并进行序列分析。通过黄独微型块茎转录组数据库筛选得到CAS基因的核心片段,利用RT-PCR技术获得CAS基因保守片段,采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得CAS基因的3′及5′末端序列,并采用生物信息学方法进行序列分析。结果表明,黄独微型块茎CAS基因编码序列长2 280 bp,编码814 bp的氨基酸序列,相对分子量为86 665.17 u,等电点为6.21。CAS蛋白主要是由α螺旋(33.66%)、延伸链(21.62%)以及无规则卷曲(44.72%)构成。CAS蛋白为亲水性蛋白,无信号肽,三级结构为单体,含有CAS所必需的功能结构域,具有PLN03012多元结构域。CAS蛋白主要存在于质膜和内质网,可能为膜蛋白。黄独CAS蛋白与其他植物的CAS蛋白同源性较高,其中与菊叶薯蓣的CAS蛋白氨基酸相似性为96.05%。从黄独微型块茎中首次获得CAS基因cDNA全长序列,该基因具有CAS同源基因的典型特征。 展开更多
关键词 黄独 微型块茎 环阿屯醇合酶 基因克隆 序列分析
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