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基于常染色体显性多囊肾病基因芯片数据的生物信息学分析
被引量:
5
1
作者
薛澄
周晨辰
+8 位作者
许晶
杨博
徐成钢
戴兵
刘亚伟
孙丽君
高翔
郁胜强
梅长林
《协和医学杂志》
2017年第2期171-177,共7页
目的通过GEO数据库(Gene Expression Omnibus)下载常染色体显性多囊肾病(autosomal dominant polycystic kidney disease,ADPKD)患者基因芯片数据集进行分析,得出共同差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)并进行生物信息...
目的通过GEO数据库(Gene Expression Omnibus)下载常染色体显性多囊肾病(autosomal dominant polycystic kidney disease,ADPKD)患者基因芯片数据集进行分析,得出共同差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)并进行生物信息学分析,探索ADPKD发病机制中可能的信号通路和蛋白-蛋白相互作用机制。方法通过GEO数据库下载两组关于ADPKD患者肾囊肿组织及对照组织的基因芯片数据集GSE7869和GSE35831,对其进行DEGs筛选,使用DAVID数据库和Funrich软件分析生物学信息及信号通路,使用STRING数据库分析蛋白-蛋白相互作用机制。结果 GSE7869共有3970个DEGs,GSE35831共有147个DEGs。两组DEGs有28个相同的上调基因和24个相同的下调基因:上调DEGs的功能集中在离子通道相关通路,相关信号通路富集于自噬相关通路如m TOR和PI3K/Akt通路、生长因子和整合素相关通路;下调DEGs集中于能量代谢功能和相关信号通路。结论通过分析ADPKD得出的52个DEGs和相关富集信号通路,可为疾病研究提供潜在的生物标记物和方向;调控ADPKD肾细胞自噬、延缓囊肿进展将可能成为新的研究焦点。
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关键词
多囊肾
常染色体显性
基因芯片
GO功能富集分析
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职称材料
尿毒症神经病变研究进展
被引量:
7
2
作者
高翔
梅长林
《中国血液净化》
2008年第6期329-331,共3页
尿毒症神经病变是终末期。肾病(ESRD)患者普遍存在的并发症,自从1961年第1例临床病例报道至今,人们对尿毒症神经病变的研究已有几十年。本文就尿毒症神经病变的临床研究进展作一综述。
关键词
神经病变
尿毒症
临床研究
病例报道
终末期
并发症
第1例
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职称材料
常染色体显性多囊肾病的预后评估及治疗
被引量:
4
3
作者
薛澄
周晨辰
梅长林
《协和医学杂志》
2018年第1期75-80,共6页
常染色体显性多囊肾病(autosomal dominant polycystic kidney disease,ADPKD)患病率为1‰~2‰,属于罕见病,临床主要表现为双侧肾囊肿且逐渐发展,肾脏体积进行性增大,肾功能逐步降低。PKD1基因突变约占81%,PKD2基因突变约占10.5%~22%。...
常染色体显性多囊肾病(autosomal dominant polycystic kidney disease,ADPKD)患病率为1‰~2‰,属于罕见病,临床主要表现为双侧肾囊肿且逐渐发展,肾脏体积进行性增大,肾功能逐步降低。PKD1基因突变约占81%,PKD2基因突变约占10.5%~22%。血管加压素(arginine vasopressin,AVP)和环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,c AMP)信号通路在ADPKD囊肿发展过程中发挥重要作用。近年来发表的梅奥风险评估模型和PROPKD(predicting renal outcome in polycystic kidney disease)评分是ADPKD较好的预后评估模型,已成为临床医生决策的重要依据。通过拮抗AVP受体,抑制c AMP通路的托伐普坦已成为ADPKD首个特异治疗药物,可有效抑制总肾脏体积的增长和保护肾功能。药物的长期安全性仍需进一步研究。
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关键词
多囊肾病
常染色体显性
预后评估
治疗
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职称材料
维持性血液透析患者微炎症与心室结构和功能及预后的相关研究
被引量:
7
4
作者
王维平
张玉强
梅长林
《临床荟萃》
CAS
2011年第1期1-5,共5页
目的分析超敏C反应蛋白(hsCRP)、白细胞介素6(IL-6)和肿瘤坏死因子α(TNF-α)对维持性血液透析(MHD)患者心脏结构和功能的影响。方法选择MHD患者97例,病情稳定,已排除急性感染及其他活动性疾病。根据hsCRP检测的水平分为hsCRP升高组(hs...
目的分析超敏C反应蛋白(hsCRP)、白细胞介素6(IL-6)和肿瘤坏死因子α(TNF-α)对维持性血液透析(MHD)患者心脏结构和功能的影响。方法选择MHD患者97例,病情稳定,已排除急性感染及其他活动性疾病。根据hsCRP检测的水平分为hsCRP升高组(hsCRP≥3 mg/L)和hsCRP正常组(hsCRP<3 mg/L),分别观察患者的炎症因子TNF-α、IL-6和hsCRP,并应用心脏超声心动图测定患者左心房前后径(LAD)、左心室舒张期内径(LVEDd)、左心室收缩期内径(LVEDs)、左心室舒张期后壁厚度(LVPWT)、室间隔厚度(IVST)、左心室质量指数(LVMI)和左心室射血分数(LVEF)、二尖瓣前向血流E峰与A峰比值(E/A)、心排出量(CO)等。结果 MHD患者hsCRP升高组与hsCRP正常组的血清hsCRP分别为(8.09±3.58)mg/L vs(2.06±0.56)mg/L,IL-6分别为(112.2±43.47)ng/L vs(83.3±26.79)ng/L,TNF-α分别为(5.09±2.21)μg/L vs(4.16±1.64)μg/L(P<0.05或<0.01)。hsCRP升高组LAD、LVEDd、LVEDs、LVPWT、IVST、LVMI均高于hsCRP正常组(P<0.01),hsCRP升高组LVEF,E/A,CO低于hsCRP正常组(均P<0.01)。hsCRP升高组hsCRP、IL-6、TNF-α分别与LAD、LVEDd、LVEDsI、VST、LVPWT、LVMI呈正相关(P<0.05或<0.01),与LVEF、E/A、CO呈负相关(P<0.05)。hsCRP与TNF-αI、L-6相互之间呈正相关(均P<0.01)。结论 MHD患者存在微炎症状态,并且参与了心脏结构和功能的改变。
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关键词
肾病
肾透析
炎症
C反应蛋白质
超声检查
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职称材料
免疫吸附治疗在肾移植致敏受者中的应用
被引量:
5
5
作者
孙琳琳
叶朝阳
+3 位作者
戎殳
陈静
张斌
梅长林
《中国中西医结合肾病杂志》
2007年第10期583-585,共3页
目的:探讨蛋白A免疫吸附(immunoadsorption,IA)治疗对清除肾移植致敏受者体内特异性抗HLA抗体的疗效和安全性。方法:10例肾移植致敏(PRA>50%)受者用彤新蛋白A免疫吸附柱行IA治疗,测定治疗前后血免疫球蛋白及PRA水平。结果:10例患者I...
目的:探讨蛋白A免疫吸附(immunoadsorption,IA)治疗对清除肾移植致敏受者体内特异性抗HLA抗体的疗效和安全性。方法:10例肾移植致敏(PRA>50%)受者用彤新蛋白A免疫吸附柱行IA治疗,测定治疗前后血免疫球蛋白及PRA水平。结果:10例患者IA治疗次数为4~15次(中位数9)。所有患者IA治疗后血清总IgG水平都明显下降(P<0.001),IgA和IgM也较治疗前显著降低(P<0.01)。PRA8例转阴,1例<30%,1例仍为100%。结论:对于肾移植致敏受者,IA是一种特异性高、安全有效的治疗措施。
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关键词
肾移植
群体反应性抗体
致敏受者
免疫吸附
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职称材料
题名
基于常染色体显性多囊肾病基因芯片数据的生物信息学分析
被引量:
5
1
作者
薛澄
周晨辰
许晶
杨博
徐成钢
戴兵
刘亚伟
孙丽君
高翔
郁胜强
梅长林
机构
第二军医大学
上海长征医院肾内科解放军肾脏病研究所
出处
《协和医学杂志》
2017年第2期171-177,共7页
基金
国家重点研发计划(2016YFC0901500)
上海地区慢性肾脏病早发现和诊疗体系建设与示范(GWIV-18)
国家自然科学基金面上项目(81670612)
文摘
目的通过GEO数据库(Gene Expression Omnibus)下载常染色体显性多囊肾病(autosomal dominant polycystic kidney disease,ADPKD)患者基因芯片数据集进行分析,得出共同差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)并进行生物信息学分析,探索ADPKD发病机制中可能的信号通路和蛋白-蛋白相互作用机制。方法通过GEO数据库下载两组关于ADPKD患者肾囊肿组织及对照组织的基因芯片数据集GSE7869和GSE35831,对其进行DEGs筛选,使用DAVID数据库和Funrich软件分析生物学信息及信号通路,使用STRING数据库分析蛋白-蛋白相互作用机制。结果 GSE7869共有3970个DEGs,GSE35831共有147个DEGs。两组DEGs有28个相同的上调基因和24个相同的下调基因:上调DEGs的功能集中在离子通道相关通路,相关信号通路富集于自噬相关通路如m TOR和PI3K/Akt通路、生长因子和整合素相关通路;下调DEGs集中于能量代谢功能和相关信号通路。结论通过分析ADPKD得出的52个DEGs和相关富集信号通路,可为疾病研究提供潜在的生物标记物和方向;调控ADPKD肾细胞自噬、延缓囊肿进展将可能成为新的研究焦点。
关键词
多囊肾
常染色体显性
基因芯片
GO功能富集分析
Keywords
polycystic kidney disease
autosomal dominant
gene chip
GO function enrichment analysis
分类号
R322.61 [医药卫生—人体解剖和组织胚胎学]
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职称材料
题名
尿毒症神经病变研究进展
被引量:
7
2
作者
高翔
梅长林
机构
第二军医大学
上海长征医院肾内科解放军肾脏病研究所
出处
《中国血液净化》
2008年第6期329-331,共3页
文摘
尿毒症神经病变是终末期。肾病(ESRD)患者普遍存在的并发症,自从1961年第1例临床病例报道至今,人们对尿毒症神经病变的研究已有几十年。本文就尿毒症神经病变的临床研究进展作一综述。
关键词
神经病变
尿毒症
临床研究
病例报道
终末期
并发症
第1例
分类号
R587.2 [医药卫生—内分泌]
R692.5 [医药卫生—泌尿科学]
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职称材料
题名
常染色体显性多囊肾病的预后评估及治疗
被引量:
4
3
作者
薛澄
周晨辰
梅长林
机构
第二军医大学
上海长征医院肾内科解放军肾脏病研究所
出处
《协和医学杂志》
2018年第1期75-80,共6页
基金
国家重点研发计划(2016YFC0901500)
国家自然科学基金面上项目(81670612)
上海地区慢性肾脏病早发现和诊疗体系建设与示范(GWIV-18)
文摘
常染色体显性多囊肾病(autosomal dominant polycystic kidney disease,ADPKD)患病率为1‰~2‰,属于罕见病,临床主要表现为双侧肾囊肿且逐渐发展,肾脏体积进行性增大,肾功能逐步降低。PKD1基因突变约占81%,PKD2基因突变约占10.5%~22%。血管加压素(arginine vasopressin,AVP)和环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,c AMP)信号通路在ADPKD囊肿发展过程中发挥重要作用。近年来发表的梅奥风险评估模型和PROPKD(predicting renal outcome in polycystic kidney disease)评分是ADPKD较好的预后评估模型,已成为临床医生决策的重要依据。通过拮抗AVP受体,抑制c AMP通路的托伐普坦已成为ADPKD首个特异治疗药物,可有效抑制总肾脏体积的增长和保护肾功能。药物的长期安全性仍需进一步研究。
关键词
多囊肾病
常染色体显性
预后评估
治疗
Keywords
polycystic kidney disease
autosomal dominant
prognostic evaluation
treatment
分类号
R692.1 [医药卫生—泌尿科学]
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职称材料
题名
维持性血液透析患者微炎症与心室结构和功能及预后的相关研究
被引量:
7
4
作者
王维平
张玉强
梅长林
机构
江都市人民
医院
肾
内科
第二军医大学附属
上海长征医院肾内科解放军肾脏病研究所
出处
《临床荟萃》
CAS
2011年第1期1-5,共5页
文摘
目的分析超敏C反应蛋白(hsCRP)、白细胞介素6(IL-6)和肿瘤坏死因子α(TNF-α)对维持性血液透析(MHD)患者心脏结构和功能的影响。方法选择MHD患者97例,病情稳定,已排除急性感染及其他活动性疾病。根据hsCRP检测的水平分为hsCRP升高组(hsCRP≥3 mg/L)和hsCRP正常组(hsCRP<3 mg/L),分别观察患者的炎症因子TNF-α、IL-6和hsCRP,并应用心脏超声心动图测定患者左心房前后径(LAD)、左心室舒张期内径(LVEDd)、左心室收缩期内径(LVEDs)、左心室舒张期后壁厚度(LVPWT)、室间隔厚度(IVST)、左心室质量指数(LVMI)和左心室射血分数(LVEF)、二尖瓣前向血流E峰与A峰比值(E/A)、心排出量(CO)等。结果 MHD患者hsCRP升高组与hsCRP正常组的血清hsCRP分别为(8.09±3.58)mg/L vs(2.06±0.56)mg/L,IL-6分别为(112.2±43.47)ng/L vs(83.3±26.79)ng/L,TNF-α分别为(5.09±2.21)μg/L vs(4.16±1.64)μg/L(P<0.05或<0.01)。hsCRP升高组LAD、LVEDd、LVEDs、LVPWT、IVST、LVMI均高于hsCRP正常组(P<0.01),hsCRP升高组LVEF,E/A,CO低于hsCRP正常组(均P<0.01)。hsCRP升高组hsCRP、IL-6、TNF-α分别与LAD、LVEDd、LVEDsI、VST、LVPWT、LVMI呈正相关(P<0.05或<0.01),与LVEF、E/A、CO呈负相关(P<0.05)。hsCRP与TNF-αI、L-6相互之间呈正相关(均P<0.01)。结论 MHD患者存在微炎症状态,并且参与了心脏结构和功能的改变。
关键词
肾病
肾透析
炎症
C反应蛋白质
超声检查
Keywords
nephrosis
renal dialysis
inflammation
C-reactive protein
ultrasonography
分类号
R692.5 [医药卫生—泌尿科学]
R445.1 [医药卫生—影像医学与核医学]
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职称材料
题名
免疫吸附治疗在肾移植致敏受者中的应用
被引量:
5
5
作者
孙琳琳
叶朝阳
戎殳
陈静
张斌
梅长林
机构
上海长征医院肾内科解放军肾脏病研究所
出处
《中国中西医结合肾病杂志》
2007年第10期583-585,共3页
文摘
目的:探讨蛋白A免疫吸附(immunoadsorption,IA)治疗对清除肾移植致敏受者体内特异性抗HLA抗体的疗效和安全性。方法:10例肾移植致敏(PRA>50%)受者用彤新蛋白A免疫吸附柱行IA治疗,测定治疗前后血免疫球蛋白及PRA水平。结果:10例患者IA治疗次数为4~15次(中位数9)。所有患者IA治疗后血清总IgG水平都明显下降(P<0.001),IgA和IgM也较治疗前显著降低(P<0.01)。PRA8例转阴,1例<30%,1例仍为100%。结论:对于肾移植致敏受者,IA是一种特异性高、安全有效的治疗措施。
关键词
肾移植
群体反应性抗体
致敏受者
免疫吸附
Keywords
Renal transplant Panel reactive antibedy(PRA) Sensitized recipient Immunoabsorptlon(IA)
分类号
R699 [医药卫生—泌尿科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于常染色体显性多囊肾病基因芯片数据的生物信息学分析
薛澄
周晨辰
许晶
杨博
徐成钢
戴兵
刘亚伟
孙丽君
高翔
郁胜强
梅长林
《协和医学杂志》
2017
5
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职称材料
2
尿毒症神经病变研究进展
高翔
梅长林
《中国血液净化》
2008
7
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职称材料
3
常染色体显性多囊肾病的预后评估及治疗
薛澄
周晨辰
梅长林
《协和医学杂志》
2018
4
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职称材料
4
维持性血液透析患者微炎症与心室结构和功能及预后的相关研究
王维平
张玉强
梅长林
《临床荟萃》
CAS
2011
7
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职称材料
5
免疫吸附治疗在肾移植致敏受者中的应用
孙琳琳
叶朝阳
戎殳
陈静
张斌
梅长林
《中国中西医结合肾病杂志》
2007
5
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