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AS-PCR技术检测20个mtDNA SNP位点及单倍型频率
被引量：
3
1
作者
聂燕钗
张晨
+4 位作者
刘亚楠
黄江平
焦海涛
吴丹
周怀谷
《法医学杂志》
CAS
CSCD
2014年第2期96-100,109,共6页
目的：基于等位基因特异性PCR（allele-specific PCR，AS-PCR）技术，建立一种三色荧光标记复合扩增检测线粒体DNA（mtDNA） SNP的方法。方法基于AS-PCR原理，选择20个mtDNA编码区SNP位点，分为两组，分别标记FAM和HEX荧光，每个位点设...
目的：基于等位基因特异性PCR（allele-specific PCR，AS-PCR）技术，建立一种三色荧光标记复合扩增检测线粒体DNA（mtDNA） SNP的方法。方法基于AS-PCR原理，选择20个mtDNA编码区SNP位点，分为两组，分别标记FAM和HEX荧光，每个位点设计具有长度差异的两条上游（下游）等位基因特异性引物以及一条下游（上游）通用引物。结合AS-PCR技术和毛细管电泳，检测200份无关个体血样。各位点随机选取至少3个样本进行直接测序验证，并进行单倍型频率调查。结果200份血样均得到清晰分型，各位点的检测结果与直接测序结果完全一致。10μL体系下，DNA最低检测浓度为0.2 pg，当模板量为0.5~5 pg时能得到较为理想的分型图谱。在200名无关个体中，共分出15种单倍型，单倍型多样性为0.9060。结论 AS-PCR技术是一种简单、快速且有效的mtDNA SNP分型方法，适用于法庭科学检验的需求。
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关键词
法医遗传学
多态性
单核苷酸
等位基因
聚合酶链反应
单倍型
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职称材料
题名
AS-PCR技术检测20个mtDNA SNP位点及单倍型频率
被引量：
3
1
作者
聂燕钗
张晨
刘亚楠
黄江平
焦海涛
吴丹
周怀谷
机构
复旦大学
上海
医学院法医学系
上海
市公安局物证鉴定中心法医物证学现场应用
技术
公安部重点实验室
上海
市现场物证重点实验室
上海锦博生物技术有限公司
出处
《法医学杂志》
CAS
CSCD
2014年第2期96-100,109,共6页
基金
公安部科技基础工作专项资助项目(2011GABJC006)
文摘
目的：基于等位基因特异性PCR（allele-specific PCR，AS-PCR）技术，建立一种三色荧光标记复合扩增检测线粒体DNA（mtDNA） SNP的方法。方法基于AS-PCR原理，选择20个mtDNA编码区SNP位点，分为两组，分别标记FAM和HEX荧光，每个位点设计具有长度差异的两条上游（下游）等位基因特异性引物以及一条下游（上游）通用引物。结合AS-PCR技术和毛细管电泳，检测200份无关个体血样。各位点随机选取至少3个样本进行直接测序验证，并进行单倍型频率调查。结果200份血样均得到清晰分型，各位点的检测结果与直接测序结果完全一致。10μL体系下，DNA最低检测浓度为0.2 pg，当模板量为0.5~5 pg时能得到较为理想的分型图谱。在200名无关个体中，共分出15种单倍型，单倍型多样性为0.9060。结论 AS-PCR技术是一种简单、快速且有效的mtDNA SNP分型方法，适用于法庭科学检验的需求。
关键词
法医遗传学
多态性
单核苷酸
等位基因
聚合酶链反应
单倍型
Keywords
forensic genetics
polymorphism,single nucleotide
alleles
polymerase chain reaction
haplotype
分类号
DF795.2 [医药卫生—法医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
AS-PCR技术检测20个mtDNA SNP位点及单倍型频率
聂燕钗
张晨
刘亚楠
黄江平
焦海涛
吴丹
周怀谷
《法医学杂志》
CAS
CSCD
2014
3
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