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基于宏基因组学的酸性森林土壤氨氧化微生物群落特征研究被引量：4: 1; 作者唐修峰秦华 +8 位作者匡璐王欣欣宋玉翔高豪刘林梦任一单军张焕朝王保战《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期1311-1321,共11页; 全球30%以上陆地面积是酸性土壤(pH<5.5),而酸性土壤中氨氧化微生物群落特征研究是破译其硝化过程微生物学机理的基础。尤其随着完全硝化微生物(Complete ammonia oxidizer,comammox)的发现,亟需重新认知酸性土壤中氨氧化微生物类群... 展开更多; 关键词酸性森林土壤氨氧化微生物 comammox AMOA基因宏基因组学; 在线阅读下载PDF 职称材料

城市五种景观植物土壤微生物多样性研究被引量：6: 2; 作者任一韩畅 +4 位作者杨慧魏岩冰曹舒阳钱宇杰唐赟《土壤》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期746-754,共9页; 绿地为城市提供广泛的生态服务,绿地土壤微生物群落是其中的关键组成部分。为探究城市绿地土壤微生物多样性及其影响因素,通过16S rRNA基因的高通量测序对城市绿地5种常见景观植物土壤微生物进行分析,发现不同景观植物土壤微生物优势物... 展开更多; 关键词城市微生物组高通量测序城市绿地微生物多样性; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于基因技术的羊绒与羊毛纤维定性鉴别方法被引量：14: 3; 作者金美菊阮勇 +2 位作者李翔石东亮叶凌《纺织学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第8期19-23,共5页; 随着羊毛改性技术的发展,传统的光学显微镜鉴别羊绒和羊毛的方法逐渐显出其局限性。为此,采用基因技术,利用山羊与绵羊之间特定碱基序列的差别,通过纯羊绒、羊毛纤维及不同比例羊绒/羊毛混合物线粒体DNA的测序实验,研究羊绒、羊毛的DNA... 展开更多; 关键词基因技术羊绒羊毛碱基序列引物定性鉴别; 在线阅读下载PDF 职称材料

羊绒羊毛纤维线粒体DNA提取方法研究被引量：6: 4; 作者金美菊阮勇 +1 位作者严冰冰石东亮《毛纺科技》 CAS 北大核心 2011年第11期53-55,共3页; 研究和开发动物纤维的DNA检测,关键的技术难点在于DNA的提取。文章就羊绒羊毛纤维线粒体DNA的提取方法进行了实验,并通过PCR扩增的方法进行了验证。结果表明:使用Promega试剂盒,将纤维样品尽量处理成粉末状,并在样品经裂解液处理后先离... 展开更多; 关键词羊绒羊毛线粒体DNA 提取方法; 在线阅读下载PDF 职称材料

南海近岸硬骨鱼鳃组织的细菌群落及多样性分析: 5; 作者郭迎香杨李玲 +3 位作者许友伟方艺菲王萌姜敬哲《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期44-53,共10页; 围绕中国南海丰富的渔业资源,采用16S rDNA扩增子测序技术,分析了南海近岸硬骨鱼类鳃组织微生物群落分布特征,并探讨了7个不同站点细菌群落结构的差异。结果显示,测序共获得有效拼接片段(Clean tags)2952366条,平均每个文库56776条。分... 展开更多; 关键词硬骨鱼鳃 16S rDNA扩增子细菌多样性南海; 在线阅读下载PDF 职称材料

羊绒羊毛纤维线粒体DNA碱基对序列研究被引量：3: 6; 作者金美菊阮勇 +1 位作者蔡宏康钱微君《毛纺科技》 CAS 北大核心 2012年第4期62-64,共3页; 物种不同,DNA序列亦不同,而生存环境、食物链等因素也会引起基因突变。文章对不同地区、不同种类的羊绒和羊毛纤维线粒体DNA进行测序实验,通过对实验所得序列的比较与分析,得出结论:羊绒羊毛纤维线粒体DNA序列的相似度达98%以上,但在特... 展开更多; 关键词羊绒羊毛线粒体DNA 碱基序列; 在线阅读下载PDF 职称材料

新型牡蛎相关圆环病毒基因组的鉴定: 7; 作者杨李玲郭迎香 +4 位作者位红颖王萌方艺菲朱鹏姜敬哲《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期65-75,共11页; 病原基因组信息的匮乏是牡蛎病害研究进展缓慢的主要原因之一。为鉴定更多牡蛎相关病毒,基于前期研究获得的华南沿海多地养殖的香港牡蛎(Crassostrea hongkongensis)病毒组测序数据进行质控、组装、物种注释后,挑选出其中疑似圆环病毒... 展开更多; 关键词圆环病毒生物信息分析香港牡蛎复制酶结构域; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于宏基因组学的酸性森林土壤氨氧化微生物群落特征研究被引量：4: 1; 作者唐修峰秦华匡璐王欣欣宋玉翔高豪刘林梦任一单军张焕朝王保战; 机构南京林业大学林学院土壤与农业可持续发展国家重点实验室(中国科学院南京土壤研究所) 浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室上海美吉生物医药科技有限公司南京农业大学生命科学学院; 出处《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期1311-1321,共11页; 基金浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室开放基金(KF2017-02) 国家自然科学基金项目(41977056,41671252)资助。; 文摘全球30%以上陆地面积是酸性土壤(pH<5.5),而酸性土壤中氨氧化微生物群落特征研究是破译其硝化过程微生物学机理的基础。尤其随着完全硝化微生物(Complete ammonia oxidizer,comammox)的发现,亟需重新认知酸性土壤中氨氧化微生物类群。以酸性马尾松林为研究对象,综合利用荧光定量PCR(qPCR)、凝胶电泳半定量和宏基因组测序等技术研究土壤中氨氧化古菌(Ammonia-oxidizing archaea,AOA)、氨氧化细菌(Ammonia-oxidizing bacteria,AOB)和Comammox的相对丰度以及群落组成特征。研究发现AOA和AOB amoA基因丰度分别为2.61×10^(6) copies·g^(-1)和1.45×10^(6)copies·g^(-1);而comammoxamoA基因qPCR结果存在显著的非特异性扩增,导致其丰度被高估,而经凝胶电泳半定量矫正后,约为(1.38~1.47)×10^(6)copies·g^(-1),该结果和土壤宏基因测序揭示的comammox相对丰度基本吻合。此外,宏基因组分析发现经典嗜酸group1.1a-associated仅占AOA总类群的12%,而group1.1b则占88%,尽管目前仍未有嗜酸group 1.1b AOA纯菌株的报道。AOB主要类群为Nitrosospira(约64%),而Nitrosomonas约占36%。Comammox主要类群为clade B(约64%),而clade A仅占36%且均隶属于clade A.1亚枝,这暗示clade B与已报道的嗜中性comammox clade A纯菌株有极大的生理代谢差异。总之,本研究提供了综合利用qPCR、半定量和宏基因组分析土壤氨氧化微生物群落的策略,并建议优化comammox的qPCR引物,同时本研究系统分析了酸性马尾松林土壤中氨氧化微生物的相对丰度和群落组成特征。; 关键词酸性森林土壤氨氧化微生物 comammox AMOA基因宏基因组学; Keywords Acidic forest soil Ammonia-oxidizing microorganisms Comammox amoA gene Metagenomics; 分类号 S154.36 [农业科学—土壤学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名城市五种景观植物土壤微生物多样性研究被引量：6: 2; 作者任一韩畅杨慧魏岩冰曹舒阳钱宇杰唐赟; 机构西南野生动植物资源保护教育部重点实验室上海美吉生物医药科技有限公司上海市川沙中学; 出处《土壤》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期746-754,共9页; 基金四川省科技厅应用基础研究项目(2020YJ0346)资助。; 文摘绿地为城市提供广泛的生态服务,绿地土壤微生物群落是其中的关键组成部分。为探究城市绿地土壤微生物多样性及其影响因素,通过16S rRNA基因的高通量测序对城市绿地5种常见景观植物土壤微生物进行分析,发现不同景观植物土壤微生物优势物种具有较高的一致性,以变形菌门、放线菌门、酸杆菌门、绿弯菌门、粘球菌门为优势门。但其α多样性和β多样性根据景观植物不同表现出明显相异性。另外,各土壤中古菌趋同性极高,几乎都属于氨氧化古菌。微生物相互作用关系主要受土壤含水量、盐离子浓度和pH等因子的影响。; 关键词城市微生物组高通量测序城市绿地微生物多样性; Keywords Urban microbiome High-throughput sequencing City greenspace Microbial diversity; 分类号 S154.36 [农业科学—土壤学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于基因技术的羊绒与羊毛纤维定性鉴别方法被引量：14: 3; 作者金美菊阮勇李翔石东亮叶凌; 机构宁波市纤维检验所上海美吉生物医药科技有限公司; 出处《纺织学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第8期19-23,共5页; 基金 2009年质检公益行业科研专项项目(200910066-02); 文摘随着羊毛改性技术的发展,传统的光学显微镜鉴别羊绒和羊毛的方法逐渐显出其局限性。为此,采用基因技术,利用山羊与绵羊之间特定碱基序列的差别,通过纯羊绒、羊毛纤维及不同比例羊绒/羊毛混合物线粒体DNA的测序实验,研究羊绒、羊毛的DNA鉴别方法。结果表明:基于基因技术的DNA测序方法可以准确定性鉴别极小比例的羊绒、羊毛纤维;对于纯羊绒、羊毛纤维,采用1组引物,即可通过特定位点特征碱基序列组来鉴别;对于羊绒/羊毛混合物,分别采用羊绒引物和羊毛引物对样品测序,通过查找羊绒、羊毛纤维各自的特征序列,可鉴别样品中是否含有羊绒或羊毛。; 关键词基因技术羊绒羊毛碱基序列引物定性鉴别; Keywords genetic technology cashmere wool base sequence primer identification; 分类号 TS102.3 [轻工技术与工程—纺织工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名羊绒羊毛纤维线粒体DNA提取方法研究被引量：6: 4; 作者金美菊阮勇严冰冰石东亮; 机构宁波市纤维检验所上海美吉生物医药科技有限公司; 出处《毛纺科技》 CAS 北大核心 2011年第11期53-55,共3页; 基金 2009年质检公益行业科研专项项目(项目编号:2009424066-02); 文摘研究和开发动物纤维的DNA检测,关键的技术难点在于DNA的提取。文章就羊绒羊毛纤维线粒体DNA的提取方法进行了实验,并通过PCR扩增的方法进行了验证。结果表明:使用Promega试剂盒,将纤维样品尽量处理成粉末状,并在样品经裂解液处理后先离心除去其中尚未完全溶解的纤维,然后进行后续操作是比较有利的,完全能够得到满足PCR扩增和DNA测序要求的线粒体DNA样品。; 关键词羊绒羊毛线粒体DNA 提取方法; Keywords cashmere wool mtDNA extraction method; 分类号 TS102.311 [轻工技术与工程—纺织工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名南海近岸硬骨鱼鳃组织的细菌群落及多样性分析: 5; 作者郭迎香杨李玲许友伟方艺菲王萌姜敬哲; 机构天津农学院水产学院中国水产科学研究院南海水产研究所/农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室上海美吉生物医药科技有限公司广州市从化区农业农村局; 出处《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期44-53,共10页; 基金中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(2020TD42) 中国水产科学研究院南海水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助(2021SD05) 广东省省级现代农业产业技术体系“水产疫病监测与综合防控共性关键技术研发创新团队”(2019KJ141)。; 文摘围绕中国南海丰富的渔业资源,采用16S rDNA扩增子测序技术,分析了南海近岸硬骨鱼类鳃组织微生物群落分布特征,并探讨了7个不同站点细菌群落结构的差异。结果显示,测序共获得有效拼接片段(Clean tags)2952366条,平均每个文库56776条。分别在门、属水平对其优势类群进行了分析,其中门水平上变形菌门(Proteobacteria)最高(71.3%),属水平上变形菌门的不动杆菌属(Acinetobacter)最高(17.2%)。不同站点的α多样性具有显著差异,其中I9和H8站点的物种丰富度(Chao1指数)最高,D3站点的多样性(Shannon指数)最高。不同站点来源样品之间的β多样性具有显著差异(P<0.05),但在宿主分类的目水平上无显著差异(P>0.05)。中国南海近岸硬骨鱼鳃组织中的细菌群落组成丰富,采样站位相比宿主分类对鳃组织上细菌群落具有更重要的影响,它们可能在辅助宿主营养物质转运及代谢方面发挥积极作用。; 关键词硬骨鱼鳃 16S rDNA扩增子细菌多样性南海; Keywords Bony fish gill 16S rDNA amplicon Bacterial diversity South China Sea; 分类号 S917.1 [农业科学—水产科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名羊绒羊毛纤维线粒体DNA碱基对序列研究被引量：3: 6; 作者金美菊阮勇蔡宏康钱微君; 机构宁波市纤维检验所上海美吉生物医药科技有限公司; 出处《毛纺科技》 CAS 北大核心 2012年第4期62-64,共3页; 基金 2009年质检公益行业科研专项项目(项目编号:2009424066-02); 文摘物种不同,DNA序列亦不同,而生存环境、食物链等因素也会引起基因突变。文章对不同地区、不同种类的羊绒和羊毛纤维线粒体DNA进行测序实验,通过对实验所得序列的比较与分析,得出结论:羊绒羊毛纤维线粒体DNA序列的相似度达98%以上,但在特定的位置有各自的特征碱基序列;不同产地、不同种类的山羊绒纤维线粒体DNA的特征碱基序列基本一致,不同产地、不同类别的绵羊毛纤维线粒体DNA的特征碱基序列亦基本一致。; 关键词羊绒羊毛线粒体DNA 碱基序列; Keywords cashmere wool mtDNA base pair sequences; 分类号 TS102.311 [轻工技术与工程—纺织工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名新型牡蛎相关圆环病毒基因组的鉴定: 7; 作者杨李玲郭迎香位红颖王萌方艺菲朱鹏姜敬哲; 机构天津农学院中国水产科学研究院南海水产研究所/农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室广州美格基因科技有限公司从化区农业农村局上海美吉生物医药科技有限公司上海海洋大学; 出处《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期65-75,共11页; 基金国家自然科学基金面上项目(31972847) 广东省省级现代农业产业技术体系“水产疫病监测与综合防控共性关键技术研发创新团队”(2019KJ141) 中国水产科学研究院科技创新团队项目(2020TD42,2021SD05)。; 文摘病原基因组信息的匮乏是牡蛎病害研究进展缓慢的主要原因之一。为鉴定更多牡蛎相关病毒,基于前期研究获得的华南沿海多地养殖的香港牡蛎(Crassostrea hongkongensis)病毒组测序数据进行质控、组装、物种注释后,挑选出其中疑似圆环病毒基因组序列进行进化树构建、基因组比较、蛋白结构域分析、三维结构预测和病毒丰度分析,在养殖牡蛎体内鉴定到了5个序列完整的新型牡蛎相关圆环病毒基因组,且5个病毒基因组在多个样品中存在。结果显示,5条病毒序列与已知的圆环病毒聚类在一个大的分支,说明其为圆环病毒科成员;5条病毒基因组序列均含有一个复制酶蛋白基因,且均与节肢动物圆环病毒复制酶蛋白序列最为相似;5条序列与另外7条公共数据库检索到的序列形成了一个独立的子分支,且该分支的序列来源多为动物相关样品。基于结构域分析软件(SMART)鉴定到多数序列中存在复制酶的保守结构域。; 关键词圆环病毒生物信息分析香港牡蛎复制酶结构域; Keywords Circovirus Bioinformatics analysis Crassostrea hongkongensis Replication Domain; 分类号 S917.4 [农业科学—水产科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于宏基因组学的酸性森林土壤氨氧化微生物群落特征研究	唐修峰秦华匡璐王欣欣宋玉翔高豪刘林梦任一单军张焕朝王保战	《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心	2021	4	在线阅读下载PDF 职称材料
2	城市五种景观植物土壤微生物多样性研究	任一韩畅杨慧魏岩冰曹舒阳钱宇杰唐赟	《土壤》 CAS CSCD 北大核心	2021	6	在线阅读下载PDF 职称材料
3	基于基因技术的羊绒与羊毛纤维定性鉴别方法	金美菊阮勇李翔石东亮叶凌	《纺织学报》 EI CAS CSCD 北大核心	2012	14	在线阅读下载PDF 职称材料
4	羊绒羊毛纤维线粒体DNA提取方法研究	金美菊阮勇严冰冰石东亮	《毛纺科技》 CAS 北大核心	2011	6	在线阅读下载PDF 职称材料
5	南海近岸硬骨鱼鳃组织的细菌群落及多样性分析	郭迎香杨李玲许友伟方艺菲王萌姜敬哲	《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心	2022	0	在线阅读下载PDF 职称材料
6	羊绒羊毛纤维线粒体DNA碱基对序列研究	金美菊阮勇蔡宏康钱微君	《毛纺科技》 CAS 北大核心	2012	3	在线阅读下载PDF 职称材料
7	新型牡蛎相关圆环病毒基因组的鉴定	杨李玲郭迎香位红颖王萌方艺菲朱鹏姜敬哲	《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心	2022	0	在线阅读下载PDF 职称材料