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鲫源嗜水气单胞菌毒力基因多重PCR检测及ERIC-PCR分子分型
被引量：
9
1
作者
符贵红
肖丹
+1 位作者
胡鲲
杨先乐
《海洋渔业》
CSCD
北大核心
2014年第6期549-556,共8页
为快速了解鲫源嗜水气单胞菌株毒力基因携带情况及与菌株基因型的相关性,建立多重PCR法和ERIC-PCR分子分型,为临床快速检测、菌株分型和菌株致病性分析提供依据。通过单重PCR法检测出标准菌株ATCC7966内5个毒力基因气溶素(aerolysin,aer...
为快速了解鲫源嗜水气单胞菌株毒力基因携带情况及与菌株基因型的相关性,建立多重PCR法和ERIC-PCR分子分型,为临床快速检测、菌株分型和菌株致病性分析提供依据。通过单重PCR法检测出标准菌株ATCC7966内5个毒力基因气溶素(aerolysin,aer)、溶血素(hemolysin,hly)、细胞毒性肠毒素(cytotoxic enterotoxin,alt)、胞外蛋白酶(extracellular protease,ahp)和细胞肠兴奋性肠毒素(intestinal cells of excitatory enterotoxin,act),其扩增产物长度依次为300 bp、592 bp、442 bp、856 bp和500 bp。在此基础上,优化并建立特异性高,敏感度达7.2×102cfu·m L-1多重PCR法,用于检测从江苏射阳地区患病水产动物体内分离的17株嗜水气单胞菌5个毒力基因携带率。结果显示,毒力基因act的携带率为100%,而80%的菌株5个毒力基因均有检出。采用ERIC-PCR分子分型技术,以标准菌株ATCC7966为对照,对17株鲫源致病性嗜水气单胞菌进行基因分型,获得两种基因型,分别描述为A型和B型,其中B型菌株14株,带型与ATCC7966一致,认为是当地的主要流行株。探究菌株基因型与毒力基因分布相关性,携带5个毒力基因的均为B型菌株,而所有A型菌株存在一或多个毒力基因缺失,有可能是此类菌株更易发生毒力基因漂变,但还需进一步研究。
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关键词
嗜水气单胞菌
毒力基因
ERIC-PCR
分子分型
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职称材料
噬菌弧菌H2的分离鉴定与噬菌活性分析
被引量：
3
2
作者
侯三玲
曹海鹏
+3 位作者
李洋
何珊
胡鲲
杨先乐
《环境污染与防治》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期19-23,27,共6页
以霍乱弧菌作为宿主菌，从南美白对虾养殖水体中分离到一株具有噬菌特性的菌株H2，通过对其形态观察、特异性聚合酶链式反应（PCR）鉴定与系统发育分析，证实菌株H2为噬菌弧菌（Bacteriovoraxsp．）（GenBank登录号：JXl22409），其16Sr...
以霍乱弧菌作为宿主菌，从南美白对虾养殖水体中分离到一株具有噬菌特性的菌株H2，通过对其形态观察、特异性聚合酶链式反应（PCR）鉴定与系统发育分析，证实菌株H2为噬菌弧菌（Bacteriovoraxsp．）（GenBank登录号：JXl22409），其16SrRNA序列与GenBank基因库中噬菌弧菌属菌株的16SrRNA序列有94％～98％的同源性，而且与噬菌弧菌菌株NE1（GenBank登录号：EF092445）的亲缘关系最近。此外，菌株H2对溶藻弧菌、哈维氏弧菌、创伤弧菌、副溶血弧菌、鳗弧菌等其他弧菌也具有良好的噬菌活性，在pH=7．5、亚硝酸盐氮为0．2mg／L时具有良好的噬菌活性，在氨氮≥0．2mg／L时的噬菌活性降低。确定了噬菌弧菌H2的分类地位，分析了噬菌弧菌H2对常见弧菌的噬菌效果以及水环境因子对其噬菌活性的影响，不仅丰富了弧菌寄生菌的微生物资源，而且为其在养殖水体弧菌消除中的应用奠定了基础。
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关键词
弧菌
噬菌弧菌
鉴定
系统发育分析
噬菌活性
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职称材料
题名
鲫源嗜水气单胞菌毒力基因多重PCR检测及ERIC-PCR分子分型
被引量：
9
1
作者
符贵红
肖丹
胡鲲
杨先乐
机构
中国
水产
科学研究院东海
水产
研究所、农业部东海与远洋渔业资源开发利用实验室
湖北省武汉市黄陂区
水产
技术推广站
上海海洋大学水产与生命学院、国家水生动物病原库
出处
《海洋渔业》
CSCD
北大核心
2014年第6期549-556,共8页
基金
科技部863计划项目(2011AA10A216)
现代农业产业技术体系建设专项资金资助(CARS-46)
文摘
为快速了解鲫源嗜水气单胞菌株毒力基因携带情况及与菌株基因型的相关性,建立多重PCR法和ERIC-PCR分子分型,为临床快速检测、菌株分型和菌株致病性分析提供依据。通过单重PCR法检测出标准菌株ATCC7966内5个毒力基因气溶素(aerolysin,aer)、溶血素(hemolysin,hly)、细胞毒性肠毒素(cytotoxic enterotoxin,alt)、胞外蛋白酶(extracellular protease,ahp)和细胞肠兴奋性肠毒素(intestinal cells of excitatory enterotoxin,act),其扩增产物长度依次为300 bp、592 bp、442 bp、856 bp和500 bp。在此基础上,优化并建立特异性高,敏感度达7.2×102cfu·m L-1多重PCR法,用于检测从江苏射阳地区患病水产动物体内分离的17株嗜水气单胞菌5个毒力基因携带率。结果显示,毒力基因act的携带率为100%,而80%的菌株5个毒力基因均有检出。采用ERIC-PCR分子分型技术,以标准菌株ATCC7966为对照,对17株鲫源致病性嗜水气单胞菌进行基因分型,获得两种基因型,分别描述为A型和B型,其中B型菌株14株,带型与ATCC7966一致,认为是当地的主要流行株。探究菌株基因型与毒力基因分布相关性,携带5个毒力基因的均为B型菌株,而所有A型菌株存在一或多个毒力基因缺失,有可能是此类菌株更易发生毒力基因漂变,但还需进一步研究。
关键词
嗜水气单胞菌
毒力基因
ERIC-PCR
分子分型
Keywords
Aeromonas hydrophila
virulence gene
ERIC-PCR
molecular genotype
分类号
S941 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
噬菌弧菌H2的分离鉴定与噬菌活性分析
被引量：
3
2
作者
侯三玲
曹海鹏
李洋
何珊
胡鲲
杨先乐
机构
上海海洋大学水产与生命学院、国家水生动物病原库
上海
市闵行第五中学
出处
《环境污染与防治》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期19-23,27,共6页
基金
国家“863计划”项目(No.2011AA10A216)
国家重大科技成果转化项目(No.ZD-2012-345-5)
+4 种基金
公益性行业(农业)科技专项资金资助项目(No.201203085)
现代农业产业技术体系建设专项资金资助项目(No.CARS-46-12)
江苏省农业科技支撑计划项目(No.BE2013366)
山西省科技攻关项目(No.20120311025-4)
上海高校实验技术队伍建设计划项目
文摘
以霍乱弧菌作为宿主菌，从南美白对虾养殖水体中分离到一株具有噬菌特性的菌株H2，通过对其形态观察、特异性聚合酶链式反应（PCR）鉴定与系统发育分析，证实菌株H2为噬菌弧菌（Bacteriovoraxsp．）（GenBank登录号：JXl22409），其16SrRNA序列与GenBank基因库中噬菌弧菌属菌株的16SrRNA序列有94％～98％的同源性，而且与噬菌弧菌菌株NE1（GenBank登录号：EF092445）的亲缘关系最近。此外，菌株H2对溶藻弧菌、哈维氏弧菌、创伤弧菌、副溶血弧菌、鳗弧菌等其他弧菌也具有良好的噬菌活性，在pH=7．5、亚硝酸盐氮为0．2mg／L时具有良好的噬菌活性，在氨氮≥0．2mg／L时的噬菌活性降低。确定了噬菌弧菌H2的分类地位，分析了噬菌弧菌H2对常见弧菌的噬菌效果以及水环境因子对其噬菌活性的影响，不仅丰富了弧菌寄生菌的微生物资源，而且为其在养殖水体弧菌消除中的应用奠定了基础。
关键词
弧菌
噬菌弧菌
鉴定
系统发育分析
噬菌活性
Keywords
Vibrio sp.
Bacteriovorax sp.
identification
phylogenetic analysis
lysis activity
分类号
S941.4 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鲫源嗜水气单胞菌毒力基因多重PCR检测及ERIC-PCR分子分型
符贵红
肖丹
胡鲲
杨先乐
《海洋渔业》
CSCD
北大核心
2014
9
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
噬菌弧菌H2的分离鉴定与噬菌活性分析
侯三玲
曹海鹏
李洋
何珊
胡鲲
杨先乐
《环境污染与防治》
CAS
CSCD
北大核心
2014
3
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职称材料
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