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题名缺刻缘绿藻总RNA提取方法的比较研究
被引量:15
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作者
杜道海
周志刚
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机构
上海海洋大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室上海高校水产养殖学e-研究院
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出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2008年第B10期103-106,共4页
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基金
上海市属高校自然科学研究项目(01H04)
上海市海洋生物学重点学科资助项目(J50701)
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文摘
为了获得高质量的缺刻缘绿藻总RNA,采用CTAB法、TRIzol法和RNAplant法3种方法对该藻总RNA的提取效果进行比较分析。结果表明,采用CTAB法提取获得的总RNA产率最高,但因可能含有较多的蛋白质、多糖等杂质使得纯度最低;TRIzol法提取的总RNA纯度较CTAB法稍高,但产率最低,且仍含有DNA带;RNAplant法提取的总RNA电泳图清晰,OD260nm/OD280nm值为2.0,高于前2种方法,产率在2种方法之间,表明RNAplant法更适于缺刻缘绿藻总RNA的提取。对后者提取的总RNA,经反转录合成的cDNA产物大小在500 bp^2 kb,并能通过RT-PCR获得18 SrRNA基因的特异性片段,进一步说明利用RNAplant法可为基因克隆、表达分析等后续研究提供高质量的RNA。
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关键词
缺刻缘绿藻
RNA提取
反转录聚合酶链式反应
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Keywords
Myrmecia incisa
RNA extraction
RT-PCR
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分类号
Q813
[生物学—生物工程]
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