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多能干细胞关键因子Oct4 RNA结合蛋白的分离与鉴定
被引量：
1
1
作者
马姬
郭传亮
+2 位作者
范书玥
薛燕
曾凡一
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期4-10,共7页
目的·分离多能干细胞关键因子Oct4的RNA结合蛋白。方法·培养小鼠胚胎干细胞(R1),从中提取细胞总RNA,反转录为cDNA,PCR扩增Oct4并转录为m RNA。采用链霉素亲和层析和质谱技术筛选候选RNA结合蛋白,采用RNA免疫沉淀技术鉴定候选...
目的·分离多能干细胞关键因子Oct4的RNA结合蛋白。方法·培养小鼠胚胎干细胞(R1),从中提取细胞总RNA,反转录为cDNA,PCR扩增Oct4并转录为m RNA。采用链霉素亲和层析和质谱技术筛选候选RNA结合蛋白,采用RNA免疫沉淀技术鉴定候选RNA结合蛋白。结果·经高效液相色谱-质谱法鉴定和筛选出121个能与Oct4 3'非翻译区(untranslated region,UTR)和Oct45'UTR相结合的RNA结合蛋白,肽段图谱匹配数≥2的有11个。并对其中的7个候选RNA结合蛋白进行了进一步验证,结果显示Oct4可与DSP、SOD1、LMNA、NPM1、PSIP1、NCL和HDGF蛋白发生相互作用,其中HDGF与Oct4结合能力最强。结论·Oct4RNA结合蛋白的鉴定将为Oct4的调控机制提供一定理论依据,为后续其功能研究提供基础。
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关键词
OCT4
RNA结合蛋白
胚胎干细胞
RNA免疫沉淀
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题名
多能干细胞关键因子Oct4 RNA结合蛋白的分离与鉴定
被引量：
1
1
作者
马姬
郭传亮
范书玥
薛燕
曾凡一
机构
上海
交通大学基础
医学
院组织
胚胎
学与遗传发育学系
上海
交通大学附属儿童医院
上海
医学
遗传研究所
上海市胚胎与生殖工程重点实验室国家卫生和健康委员会医学胚胎分子生物学重点实验室
出处
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期4-10,共7页
基金
国家重点科学研究计划(2014CB964701
2014CB964703)
+2 种基金
国家自然科学基金(31871484)
上海市"重中之重"临床医学中心和临床重点学科建设项目(2017ZZ02019)
上海市自然科学基金(16ZR1428600)~~
文摘
目的·分离多能干细胞关键因子Oct4的RNA结合蛋白。方法·培养小鼠胚胎干细胞(R1),从中提取细胞总RNA,反转录为cDNA,PCR扩增Oct4并转录为m RNA。采用链霉素亲和层析和质谱技术筛选候选RNA结合蛋白,采用RNA免疫沉淀技术鉴定候选RNA结合蛋白。结果·经高效液相色谱-质谱法鉴定和筛选出121个能与Oct4 3'非翻译区(untranslated region,UTR)和Oct45'UTR相结合的RNA结合蛋白,肽段图谱匹配数≥2的有11个。并对其中的7个候选RNA结合蛋白进行了进一步验证,结果显示Oct4可与DSP、SOD1、LMNA、NPM1、PSIP1、NCL和HDGF蛋白发生相互作用,其中HDGF与Oct4结合能力最强。结论·Oct4RNA结合蛋白的鉴定将为Oct4的调控机制提供一定理论依据,为后续其功能研究提供基础。
关键词
OCT4
RNA结合蛋白
胚胎干细胞
RNA免疫沉淀
Keywords
Oct4
RNA binding protein
embryonic stem cell
RNA immunoprecipitation
分类号
R329.2 [医药卫生—人体解剖和组织胚胎学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
多能干细胞关键因子Oct4 RNA结合蛋白的分离与鉴定
马姬
郭传亮
范书玥
薛燕
曾凡一
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
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