上海地区猪萨佩罗病毒的检测及遗传进化分析 被引量：4

1

作者 李本强 刘惠莉 +5 位作者 刘佳佳 陶洁 程靖华 石迎 乔长涛 沈晓晖 《上海农业学报》 2023年第2期64-70,共7页

为了明确猪萨佩罗病毒在仔猪腹泻病情中的作用,2016—2020年采集上海市及周边11个猪场腹泻病料,共计1446份。利用RT-PCR方法对其进行PSV筛检,并对阳性样品进行病原分离及病毒特性研究。结果显示:共筛检出256份PSV核酸阳性样品,阳性率17... 为了明确猪萨佩罗病毒在仔猪腹泻病情中的作用,2016—2020年采集上海市及周边11个猪场腹泻病料,共计1446份。利用RT-PCR方法对其进行PSV筛检,并对阳性样品进行病原分离及病毒特性研究。结果显示:共筛检出256份PSV核酸阳性样品,阳性率17.7%。从阳性样品中成功分离到2株PSV病毒,全基因序列遗传进化分析显示2株PSV分离株聚集在中国PSV毒株集群上,分离株在3D区域4696—5945 bp处存在重组区域。病毒核苷酸分析发现中国PSV毒株与韩国PSV毒株核苷酸相似性为87%—88.5%,与欧洲PSV毒株核苷酸相似性为84.9%—87.3%。对VP1基因氨基酸序列分析发现分离株与参考株存在氨基酸位点突变,中间氨基酸序列保守,无突变及插入和缺少现象。PSV分离株与参考株均含有173位潜在糖基化位点,VP1蛋白分子表面抗原表位分布均匀。该研究可为猪萨佩罗病毒病原学及其疫苗的研制奠定基础。 展开更多

关键词 猪萨佩罗病毒分离株 流行病学调查 VP1基因 遗传进化分析

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利用反向遗传学技术开发猪流行性腹泻减毒活疫苗的研究进展 被引量：4

2

作者 于瑞嵩 董世娟 陈冰清 《上海畜牧兽医通讯》 2022年第6期1-12,共12页

猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea,PED)是一种由猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起的接触性肠道传染病,严重威胁全球养猪业健康发展。疫苗接种是防控该病最有效的方法。虽然已开发出多款疫苗用于PED防... 猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea,PED)是一种由猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起的接触性肠道传染病,严重威胁全球养猪业健康发展。疫苗接种是防控该病最有效的方法。虽然已开发出多款疫苗用于PED防控,但这些疫苗对PEDV强毒株攻击的保护效力仍不尽理想。PEDV反向遗传学技术的建立为PED疫苗研发提供了新的工具。笔者在回顾PEDV反向遗传学和病毒毒力相关蛋白研究进展的基础上,讨论了如何利用反向遗传学技术构建安全、有效且遗传稳定的PED减毒活疫苗候选毒株,并对PED减毒活疫苗的研究作一简要展望,旨在为PED减毒活疫苗的研发提供参考。 展开更多

关键词 猪流行性腹泻 毒力因子 反向遗传学 减毒活疫苗

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猪德尔塔冠状病毒致病机理研究进展

3

作者 石迎 陶洁 +2 位作者 李本强 程靖华 刘惠莉 《上海农业学报》 2024年第4期127-134,共8页

猪德尔塔冠状病毒(Porcine deltacoronavirus,PDCoV)是流行于猪群中的一种新发肠道冠状病毒,能引起猪腹泻、呕吐、脱水甚至死亡,给养猪业带来巨大威胁。PDCoV可在猪、禽类和牛体内复制,甚至在人体血浆样品中检出,具有潜在的公共安全问题... 猪德尔塔冠状病毒(Porcine deltacoronavirus,PDCoV)是流行于猪群中的一种新发肠道冠状病毒,能引起猪腹泻、呕吐、脱水甚至死亡,给养猪业带来巨大威胁。PDCoV可在猪、禽类和牛体内复制,甚至在人体血浆样品中检出,具有潜在的公共安全问题,存在引发大流行的威胁,深入开展PDCoV的致病机理研究对该病的防控有重要意义。本文从其入侵宿主细胞以拮抗干扰素反应、诱导细胞凋亡、调控细胞自噬、抑制细胞焦亡途径来逃避宿主免疫应答,以及其他影响PDCoV复制的分子机制方面对其致病机理进行总结,为后续科学研究和有效防治提供借鉴。 展开更多

关键词 猪 德尔塔冠状病毒 致病机理 研究进展

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一株猪流感病毒A/swine/Shanghai/01/2019(H1N1)的分离鉴定及遗传进化分析 被引量：8

4

作者 程靖华 陶洁 +2 位作者 李本强 石迎 刘惠莉 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期830-834,共5页

为鉴定上海地区猪流感病毒的流行株及其分子生物学特征,本研究从上海地区养殖场采集疑似流感症状的猪咽拭子样品40份,采用套式PCR结合鸡胚分离鉴定方法,从中分离到1株H1N1亚型猪流感病毒(SIV),命名为A/swine/Shanghai/01/2019(H1N1)。... 为鉴定上海地区猪流感病毒的流行株及其分子生物学特征,本研究从上海地区养殖场采集疑似流感症状的猪咽拭子样品40份,采用套式PCR结合鸡胚分离鉴定方法,从中分离到1株H1N1亚型猪流感病毒(SIV),命名为A/swine/Shanghai/01/2019(H1N1)。经全基因组测定和遗传进化分析结果显示该分离株的8个基因节段与欧亚类禽H1N1 SIV同源性最高,其PB2、PB1、PA基因节段可能来源于A/swine/Jiangsu/49/2012(H1N1)病毒,NA、NP和M基因节段可能来源于A/swine/Shanghai/3/2014(H1N1)病毒。该分离病毒的HA蛋白裂解位点为PSIQSR↓GLFGAI,为低致病性流感病毒的分子特征。该分离株NA蛋白未出现与神经氨酸酶抑制剂相关的氨基酸突变,M2蛋白S31N突变表明该病毒可能对金刚烷胺类药物具有一定的耐药性。PA蛋白224S和PB2蛋白701N突变提示该分离株对哺乳动物的适应性增强,可能导致其致病性增强,需要加强对此类SIV的监测。结合近年来的监测表明,上海地区猪群中H1N1亚型SIV持续存在,需要持续跟踪监测SIV变异趋势。本研究为防控猪流感提供实验依据。 展开更多

关键词 猪流感病毒 H1N1亚型 分离鉴定 遗传进化分析

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猪星状病毒的流行病学调查及遗传进化分析 被引量：5

5

作者 李本强 陶洁 +3 位作者 程靖华 石迎 乔长涛 刘惠莉 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期1046-1050,1073,共6页

为了解上海地区猪群中猪星状病毒(PAstV)的流行现状及其遗传特性,本研究于2016年~2020年间在上海不同地区10个猪场共采集了1416份仔猪腹泻粪便样品,利用RT-PCR方法及生物信息学技术进行检测与分析。结果显示,PAstV的总阳性率为26.2%,PA... 为了解上海地区猪群中猪星状病毒(PAstV)的流行现状及其遗传特性,本研究于2016年~2020年间在上海不同地区10个猪场共采集了1416份仔猪腹泻粪便样品,利用RT-PCR方法及生物信息学技术进行检测与分析。结果显示,PAstV的总阳性率为26.2%,PAstV与其他腹泻病病原的混合感染情况较复杂,二重感染率占比达56.93%,主要以PAstV/猪嵴病毒(PKoV)为主(20.07%);三重感染率占比29.41%,以PAstV/PKoV/猪流行性腹泻病毒(PEDV)(10.09%)感染模式为主;四重感染率为11.4%,以PAstV/牛病毒性腹泻病毒(BVDV)/猪札幌病毒(PoSaV)/猪萨佩罗病毒(PSV)(13.51%)感染为主。猪群中PAstV的流行与气温差有很大关系,在季节交替时节流行率较高,特别是秋冬交替时节。选取其中2个PAstV阳性样品(JS-PAstV和CM-PAstV)进行全基因组序列的测定和分析,结果显示两者的全基因组同源性不高,仅为73.8%。全基因组进化分析显示,CM-PAstV分别与挪威、日本、美国的PAstV 3型的亲缘性较近;而JS-PAstV与匈牙利的PAstV 3型的亲缘性最近。对ORF2基因进行病毒重组分析,显示JS-PAstV和CM-PAstV的ORF2基因均与人星状病毒之间存在重组现象。提示,上海地区猪群中存在PAstV 3型的流行,且遗传距离较远,但存在与人星状病毒重组的风险,需进一步监测关注。本研究数据丰富了国内PAstV的流行病学资料,可为该病的风险防控提供科学数据。 展开更多

关键词 猪星状病毒 混合感染 季节性 遗传进化分析 基因序列重组

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猪群中牛病毒性腹泻病毒的流行病学调查 被引量：5

6

作者 陶洁 李本强 +2 位作者 程靖华 石迎 刘惠莉 《上海农业学报》 2022年第5期84-88,共5页

于2017—2020年间从上海不同区6个猪场采集1078份仔猪腹泻样品,利用多重RT-PCR方法进行检测与分析,研究了上海地区猪群中牛病毒性腹泻病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)的感染现状。结果表明:上海地区猪群BVDV的总体检出率为7.14%... 于2017—2020年间从上海不同区6个猪场采集1078份仔猪腹泻样品,利用多重RT-PCR方法进行检测与分析,研究了上海地区猪群中牛病毒性腹泻病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)的感染现状。结果表明:上海地区猪群BVDV的总体检出率为7.14%(77∕1078),且呈现逐年递增的趋势,BVDV与其他腹泻病原的混合感染率较高,其中二重感染率最高(65%,26∕40),以BVDV∕PAstV为主(61.54%,16∕26)。在此基础上,三重感染率为25%(10∕40),以BVDV∕PAstV∕PKoV(40%,4∕10)感染模式为主;四重感染率为10%(4∕40),以BVDV∕PAstV∕PEDV∕PSV(50%,2∕4)感染模式为主。猪群中BVDV流行存在一定的季节性,春季(10.36%)和秋季(13.59%)的流行率高于夏季(6.8%)和冬季(2.66%)。不同猪场BVDV阳性率存在较大差异,为0—24.07%。鉴于近年来监测发现猪场2中以PEDV为主的腹泻病原检出率一直较高,因此本研究进一步监测该猪场中BVDV的感染情况,发现该猪场在2017—2019年间BVDV检出率呈现逐年递增的趋势,2019年检出率最高(8.61%,42∕488);且BVDV与其他腹泻病原混合感染情况也较严重,二、三、四重感染率分别为57.58%(19∕32)、21.21%(7∕32)、21.21%(7∕32)。该研究丰富了上海地区猪群中BVDV的流行数据,可为猪场疫病防控提供参考。 展开更多

关键词 猪群 牛病毒性腹泻病毒 混合感染 季节性

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BPI基因生物信息学分析及其在不同猪群体中的遗传变异情况 被引量：1

7

作者 吴华莉 涂尾龙 +3 位作者 曹建国 张莺莺 王洪洋 谈永松 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期446-453,共8页

【目的】明确猪杀菌性/通透性增加蛋白(BPI)基因中可能存在的SNP位点,并探讨BPI基因外显子10在上海地区5个猪群体中的多态性及其与抗病相关的优势基因型,为揭示BPI基因在仔猪腹泻抗病机制中的作用及开展猪抗病育种提供理论依据。【方法... 【目的】明确猪杀菌性/通透性增加蛋白(BPI)基因中可能存在的SNP位点,并探讨BPI基因外显子10在上海地区5个猪群体中的多态性及其与抗病相关的优势基因型,为揭示BPI基因在仔猪腹泻抗病机制中的作用及开展猪抗病育种提供理论依据。【方法】采用在线生物信息学软件分别从碱基序列、SNP位点和蛋白氨基酸序列等角度比对分析猪BPI基因全长cDNA序列与电子克隆序列的差异,采用PCR-RFLP检测分析猪BPI基因外显子10的多态性,并检测BPI基因外显子10在杜洛克、长白、大白、申农和梅山猪群体中的基因型及基因频率。【结果】猪BPI基因电子克隆编码区(CDS)序列长度1452 bp,编码483个氨基酸,存在44个SNP位点,其中22个为同义SNP位点、22个为非同义SNP位点。猪BPI基因全长cDNA序列(EF436278.1和FJ810853.1)与电子克隆序列相比存在14处碱基差异,而对应的翻译蛋白序列存在4处氨基酸差异。猪BPI基因外显子10存在AA、BB和AB 3种基因型,各基因型在杜洛克猪、长白猪、大白猪、申农猪和梅山猪群体中的分布情况各不相同。在杜洛克猪群体中AA基因型和AB基因型呈中度多态分布(0.404和0.416),BB基因型检出比例较低(0.180);在长白猪和申农猪群体中均未检测出AA基因型,BB基因型检出比例较高,而AB基因型检出比例较低;在大白猪和梅山猪群体中均以BB基因型检出比例较高,AB基因型次之,AA基因型检出比例最低。总体来看,除了杜洛克猪群体的A等位基因频率较高外,其他4个猪群体均以B等位基因频率较高。【结论】猪BPI基因外显子10 AA基因型频率在杜洛克猪群体中最高,在大白猪和梅山群体中较低,在长白猪和申农猪群体中未检出,即AA基因型在杜洛克猪群体中比例高与其仔猪腹泻发病率低的情况一致。因此,在大白猪和梅山猪育种过程中需提高AA基因型比例,而在长白猪和申农猪育种过程中需引进AA基因型个体,降低BB和AB基因型比例,以增加仔猪的抗病能力。 展开更多

关键词 猪 杀菌性/通透性增加蛋白(BPI) SNP位点 基因型 多态性

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小型猪在人类疾病模型方面的研究进展 被引量：5

8

作者 吴华莉 涂尾龙 +5 位作者 曹建国 王洪洋 范春 王胜昌 赵莹 谈永松 《养猪》 2021年第4期63-67,共5页

小型猪作为新型的实验动物模型,已经形成自己的研发系统,目前被应用于多种人类疾病模型,其使用数量也在逐年增多,随着研究的不断深入,小型猪作为人类疾病模型在生命科学领域和医学领域的作用越来越大。文章概括介绍了国内外小型猪在人... 小型猪作为新型的实验动物模型,已经形成自己的研发系统,目前被应用于多种人类疾病模型,其使用数量也在逐年增多,随着研究的不断深入,小型猪作为人类疾病模型在生命科学领域和医学领域的作用越来越大。文章概括介绍了国内外小型猪在人类疾病模型的研究进展情况,旨在为促进小型猪在人类疾病模型的发展提供参考。 展开更多

关键词 小型猪 实验动物 疾病模型

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猪ALAS1基因内含子9多态性检测及其对繁殖性能指标的遗传效应 被引量：1

9

作者 吴华莉 曹建国 +4 位作者 张莺莺 王洪洋 涂尾龙 黄济 谈永松 《上海农业学报》 2021年第6期123-127,共5页

为考察猪ALAS1基因内含子9多态性及其对繁殖性能指标的遗传效应,采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)法,分析ALAS1基因内含子9在杜洛克猪、长白猪、大白猪和梅山猪群体内的多态性,并分析该突变位点与长白猪、大白猪繁殖... 为考察猪ALAS1基因内含子9多态性及其对繁殖性能指标的遗传效应,采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)法,分析ALAS1基因内含子9在杜洛克猪、长白猪、大白猪和梅山猪群体内的多态性,并分析该突变位点与长白猪、大白猪繁殖性状的相关性。结果显示:ALAS1基因内含子9在长白猪群体内的基因型频率为CC(0.01)、CT(0.32)和TT(0.67);在大白猪群体内的基因型频率为CC(0.23)、CT(0.40)和TT(0.38);在梅山猪群体内的基因型频率为CC(0.62)、CT(0.26)和TT(0.11);在杜洛克猪群体内只检测出TT基因型,TT基因型频率为1.00。ALAS1基因在长白猪群体内CT型的总产仔数(TNB)、产活仔数(NBA)比TT型的TNB和NBA分别高0.23头(P>0.05)和0.29头(P>0.05)。ALAS1基因在大白猪群体内的TNB和NBA均表现出CC>CT>TT的趋势。在大白猪群体内CC型的TNB、NBA比CT型的TNB、NBA分别多0.28头(P>0.05)和0.24头(P>0.05);CC型和CT的TNB比TT型的TNB分别多1.63头和1.35头(P<0.01);CC型和CT的NBA比TT型的NBA分别多1.58头和1.34头(P<0.01)。ALAS1基因在大白猪群体中CC型为影响产仔数的优势基因型,CC型和CT型的TNB、NBA均高于TT型的TNB、NBA,差异达到极显著水平。 展开更多

关键词 5-氨基乙酰丙酸合成酶1 限制性片段长度多态性 繁殖性状 多态性分析

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MMP19基因在5个猪群体内的多态性分析

10

作者 吴华莉 曹建国 +4 位作者 张莺莺 涂尾龙 王洪洋 黄济 谈永松 《养猪》 2021年第3期65-67,共3页

试验采用PCR-RFLP技术分析猪基质金属蛋白酶19基因(MMP 19基因)多态性,并检测该基因在杜洛克、长白、大白、申农和梅山猪共501头猪群体内的基因型频率和等位基因频率。结果表明,MMP 19基因在5个猪群体内呈现不同基因型。MMP 19基因在杜... 试验采用PCR-RFLP技术分析猪基质金属蛋白酶19基因(MMP 19基因)多态性,并检测该基因在杜洛克、长白、大白、申农和梅山猪共501头猪群体内的基因型频率和等位基因频率。结果表明,MMP 19基因在5个猪群体内呈现不同基因型。MMP 19基因在杜洛克、长白和梅山猪群体内检测出TT、TC和CC共3种基因型。在大白猪和申农猪群体内检测出TC和CC基因型。在杜洛克群体内的基因型频率:TT为0.01、TC为0.41、CC为0.58;在长白猪群体内的基因型频率:TT为0.01、TC为0.44、CC为0.55;在梅山猪群体内的基因型频率:TT为0.03、TC为0.84、CC为0.13;在大白猪群体的基因型频率:TC为0.03、CC为0.97;在申农猪群体内的基因型频率:TC为0.40、CC为0.60。除在梅山猪外,在其余4个猪群体内CC型为优势基因型;在5个猪群体内C等位基因为优势等位基因。 展开更多

关键词 猪 基质金属蛋白酶19 多态性

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MPDU1基因在杜洛克猪和长白猪群体内的多态性

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作者 吴华莉 曹建国 +4 位作者 张莺莺 涂尾龙 王洪洋 黄济 谈永松 《上海畜牧兽医通讯》 2021年第3期18-19,23,共3页

本实验采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)技术分析猪MPDU1基因的多态性,并检测该基因在杜洛克猪和长白猪群体内的基因型频率和等位基因频率。结... 本实验采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)技术分析猪MPDU1基因的多态性,并检测该基因在杜洛克猪和长白猪群体内的基因型频率和等位基因频率。结果表明,MPDU1基因在2个猪群体内呈现3种基因型(TT、TC和CC)。在杜洛克猪群体内TT、TC和CC的基因型频率分别为0.034、0.391和0.575,T和C等位基因频率分别为0.230和0.770;在长白猪群体内TT、TC和CC的基因型频率分别为0.014、0.125和0.861,T和C等位基因频率分别为0.076和0.924。 展开更多

关键词 猪 磷酸甘露糖长醇利用缺陷型基因 多态性 基因型 基因频率

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雌激素对猪粪细菌区系的影响

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作者 姜雪元 薛云 夏东 《上海畜牧兽医通讯》 2019年第6期38-40,共3页

为了探讨雌激素与肠道微生物之间的相互关系,本试验模拟母猪妊娠后期粪便中雌二醇(Estradiol,E2)含量为120 ng/mL,进行猪粪菌群体外厌氧培养,37℃培养8 h后,检测细菌区系多样性的变化,并测定培养液中短链脂肪酸(Short chain fatty acids... 为了探讨雌激素与肠道微生物之间的相互关系,本试验模拟母猪妊娠后期粪便中雌二醇(Estradiol,E2)含量为120 ng/mL,进行猪粪菌群体外厌氧培养,37℃培养8 h后,检测细菌区系多样性的变化,并测定培养液中短链脂肪酸(Short chain fatty acids,SCFAs)的含量.结果表明:120 ng/mL E2组的Ace、Chao、Shannon和Simpson值与对照组间无显著差异(P>0.05),但120 ng/mL E2组变形菌门(Bacteroidetes)相对丰度极显著低于对照组(P<0.01);而拟杆菌门(Proteobacteria)相对丰度极显著高于对照组(P<0.01).120 ng/mL E2组培养液中乙酸、丁酸、异丁酸及总酸的含量极显著低于对照组(P<0.01);异戊酸含量极显著高于对照组(P<0.01),但两组间丙酸及戊酸含量差异不显著(P>0.05).本研究通过猪粪菌体外培养表明,雌激素可影响粪便细菌区系的结构组成和代谢类型. 展开更多

关键词 雌激素 粪便细菌区系 短链脂肪酸 体外培养

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