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上海市首次自腹泻患者中检出格隆柏沙门菌的表型和分子特征研究
1
作者
王闻卿
黄卫春
+6 位作者
苏靖华
尤舒琪
郑英杰
杨博雯
黄红
郝莉鹏
许学斌
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期732-738,共7页
目的研究上海市首次自腹泻患者中检出格隆柏沙门菌的表型和分子特征,为沙门菌病防控提供依据。方法对格隆柏分离株(2023JD76)进行生化鉴定、血清凝集试验、抗菌药物敏感性试验以及全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)。收集全球...
目的研究上海市首次自腹泻患者中检出格隆柏沙门菌的表型和分子特征,为沙门菌病防控提供依据。方法对格隆柏分离株(2023JD76)进行生化鉴定、血清凝集试验、抗菌药物敏感性试验以及全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)。收集全球格隆柏沙门菌全基因组序列,进行血清分型、多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、耐药基因和毒力基因预测,分析2023JD76与全球株的系统进化关系。结果2023JD76血清分型符合抗原式(Salmonella Grumpensis,13,23:d:1,7),对20种抗菌药物均敏感,MLST型预测为2060(ST2060),携带氨基糖甙类药物耐药基因aac(6′)-Iaa和5类毒力基因,包括黏附基因csg、rat,分泌和转运基因sip、inv,伤寒毒素基因cdt、plt,侵袭性基因营养代谢因子mgt和抗菌肽抗性因子mig。36株全球格隆柏菌株共携带10种耐药基因,不同毒力基因携带率为58.33%~100%。进化树将全球格隆柏沙门菌基因组分为2个支系,支系Ⅰ以ST751(88.89%,16/18)为主,支系Ⅱ以ST2060(89.47%,17/19)为主。本次分离菌株2023JD76处于支系Ⅱ内,其序列型与全球人源粪便株和人源脑脊液株全基因组序列密切相关。结论本研究首次分离国内腹泻患者中的格隆柏沙门菌,不同地理来源菌株间耐药表型差异大,应加强监测以防范全球潜在的传播风险。
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关键词
格隆柏沙门菌
全基因组测序
多位点序列分型
耐药基因
毒力基因
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职称材料
一株尿道感染黏液型圣保罗沙门菌ST50分离株的表型和基因组特征研究
2
作者
王闻卿
蒋娜
+4 位作者
梁艳茹
尤舒琪
杨博雯
郝莉鹏
许学斌
《中国人兽共患病学报》
北大核心
2025年第1期53-60,共8页
目的分析尿道感染黏液型圣保罗沙门菌分离株的表型和基因组特征,提升临床对泌尿道沙门菌感染血清型谱的诊断与治疗水平。方法对尿道感染患者中段尿进行培养和计数,分离株(2024JD5)经系统生化、飞行质谱、血清分型和抗微生物药物表型鉴定...
目的分析尿道感染黏液型圣保罗沙门菌分离株的表型和基因组特征,提升临床对泌尿道沙门菌感染血清型谱的诊断与治疗水平。方法对尿道感染患者中段尿进行培养和计数,分离株(2024JD5)经系统生化、飞行质谱、血清分型和抗微生物药物表型鉴定(AST);使用全基因组测序(WGS)预测血清型、多位点序列型(MLST)、耐药基因和毒力基因;从中国沙门菌区域血清型数据库挑选2株相同ST型的光滑型圣保罗沙门菌作为比较基因组参比菌株;文献总结全球泌尿道感染沙门菌血清型。结果2024JD5因菌苔黏液特质无法确认血清型,WGS预测为圣保罗沙门菌ST50;AST对环丙沙星、萘啶酸、氯霉素和四环素耐药,预测携带氨基糖甙类药物耐药基因aac(6')-Iaa和aph(3')-IIa,氯霉素耐药基因floR,四环素耐药基因tet和喹诺酮类耐药基因qnrS1,在喹诺酮类药物耐药决定区(QRDR)gyrA存在点突变:83位点丝氨酸被酪氨酸替换(S83Y);携带6个非质粒型可移动基因元件和144个毒力基因(分泌转运基因和菌毛黏附基因分别为71个和58个),黏液型较光滑型圣保罗沙门菌ST50缺失4个菌毛调控基因(csgB、csgC、fimW、fimY)。文献荟萃显示圣保罗沙门菌目前属全球泌尿道感染病例少见沙门菌型。结论黏液型圣保罗沙门菌ST50作为临床感染病原体具备多重耐药菌表型与基因型特征,其黏液高表达特征可能与菌毛调控基因缺失以适应定殖尿道的补偿机制有关,WGS结合中国沙门菌数据库能有效解决罕见沙门菌表型诊断与生物安全评估。
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关键词
尿道感染
圣保罗沙门菌ST50
全基因组测序
多重耐药
黏液型
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职称材料
题名
上海市首次自腹泻患者中检出格隆柏沙门菌的表型和分子特征研究
1
作者
王闻卿
黄卫春
苏靖华
尤舒琪
郑英杰
杨博雯
黄红
郝莉鹏
许学斌
机构
上海市浦东新区疾病预防控制中心微生物检验科
复旦大学
浦东
预防
医学研究院
上海
交通大学医学院附属
上海
儿童医学
中心
检验
科
复旦大学公共卫生学院
上海市
疾病预防控制中心
病原
生物
检定所
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期732-738,共7页
基金
上海市浦东新区卫生健康公共卫生高原学科项目(No.PWYggy2021-01)资助。
文摘
目的研究上海市首次自腹泻患者中检出格隆柏沙门菌的表型和分子特征,为沙门菌病防控提供依据。方法对格隆柏分离株(2023JD76)进行生化鉴定、血清凝集试验、抗菌药物敏感性试验以及全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)。收集全球格隆柏沙门菌全基因组序列,进行血清分型、多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、耐药基因和毒力基因预测,分析2023JD76与全球株的系统进化关系。结果2023JD76血清分型符合抗原式(Salmonella Grumpensis,13,23:d:1,7),对20种抗菌药物均敏感,MLST型预测为2060(ST2060),携带氨基糖甙类药物耐药基因aac(6′)-Iaa和5类毒力基因,包括黏附基因csg、rat,分泌和转运基因sip、inv,伤寒毒素基因cdt、plt,侵袭性基因营养代谢因子mgt和抗菌肽抗性因子mig。36株全球格隆柏菌株共携带10种耐药基因,不同毒力基因携带率为58.33%~100%。进化树将全球格隆柏沙门菌基因组分为2个支系,支系Ⅰ以ST751(88.89%,16/18)为主,支系Ⅱ以ST2060(89.47%,17/19)为主。本次分离菌株2023JD76处于支系Ⅱ内,其序列型与全球人源粪便株和人源脑脊液株全基因组序列密切相关。结论本研究首次分离国内腹泻患者中的格隆柏沙门菌,不同地理来源菌株间耐药表型差异大,应加强监测以防范全球潜在的传播风险。
关键词
格隆柏沙门菌
全基因组测序
多位点序列分型
耐药基因
毒力基因
Keywords
Salmonella Grumpensis
whole genome sequencing
multilocus sequence typing
antimicrobial resistance gene
virulence gene
分类号
R378.2 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
一株尿道感染黏液型圣保罗沙门菌ST50分离株的表型和基因组特征研究
2
作者
王闻卿
蒋娜
梁艳茹
尤舒琪
杨博雯
郝莉鹏
许学斌
机构
上海市浦东新区疾病预防控制中心微生物检验科
复旦大学
浦东
预防
医学研究院
上海市浦东新区
公利医院
检验
医学部
上海市
疾病预防控制中心
病原
生物
检定所
出处
《中国人兽共患病学报》
北大核心
2025年第1期53-60,共8页
基金
国家重点研发计划(No.2017YFC1600100)
上海市卫健委重点学科(No.GWVI-11.1-02-传染病学)。
文摘
目的分析尿道感染黏液型圣保罗沙门菌分离株的表型和基因组特征,提升临床对泌尿道沙门菌感染血清型谱的诊断与治疗水平。方法对尿道感染患者中段尿进行培养和计数,分离株(2024JD5)经系统生化、飞行质谱、血清分型和抗微生物药物表型鉴定(AST);使用全基因组测序(WGS)预测血清型、多位点序列型(MLST)、耐药基因和毒力基因;从中国沙门菌区域血清型数据库挑选2株相同ST型的光滑型圣保罗沙门菌作为比较基因组参比菌株;文献总结全球泌尿道感染沙门菌血清型。结果2024JD5因菌苔黏液特质无法确认血清型,WGS预测为圣保罗沙门菌ST50;AST对环丙沙星、萘啶酸、氯霉素和四环素耐药,预测携带氨基糖甙类药物耐药基因aac(6')-Iaa和aph(3')-IIa,氯霉素耐药基因floR,四环素耐药基因tet和喹诺酮类耐药基因qnrS1,在喹诺酮类药物耐药决定区(QRDR)gyrA存在点突变:83位点丝氨酸被酪氨酸替换(S83Y);携带6个非质粒型可移动基因元件和144个毒力基因(分泌转运基因和菌毛黏附基因分别为71个和58个),黏液型较光滑型圣保罗沙门菌ST50缺失4个菌毛调控基因(csgB、csgC、fimW、fimY)。文献荟萃显示圣保罗沙门菌目前属全球泌尿道感染病例少见沙门菌型。结论黏液型圣保罗沙门菌ST50作为临床感染病原体具备多重耐药菌表型与基因型特征,其黏液高表达特征可能与菌毛调控基因缺失以适应定殖尿道的补偿机制有关,WGS结合中国沙门菌数据库能有效解决罕见沙门菌表型诊断与生物安全评估。
关键词
尿道感染
圣保罗沙门菌ST50
全基因组测序
多重耐药
黏液型
Keywords
urinary tract infection
Salmonella Saintpaul ST50
whole-genome sequencing
multidrug resistance
mucoid-type
分类号
R378.2 [医药卫生—病原生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
上海市首次自腹泻患者中检出格隆柏沙门菌的表型和分子特征研究
王闻卿
黄卫春
苏靖华
尤舒琪
郑英杰
杨博雯
黄红
郝莉鹏
许学斌
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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下载PDF
职称材料
2
一株尿道感染黏液型圣保罗沙门菌ST50分离株的表型和基因组特征研究
王闻卿
蒋娜
梁艳茹
尤舒琪
杨博雯
郝莉鹏
许学斌
《中国人兽共患病学报》
北大核心
2025
0
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