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基于SNP分型的香菇交配型AS-PCR鉴定
被引量：
13
1
作者
张美彦
宋春艳
+5 位作者
于海龙
谭琦
徐珍
王瑞娟
章炉军
尚晓冬
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2019年第2期1-9,I0001,共10页
目前食用菌的交配型鉴定通常采用单核体两两交配后镜检观察锁状联合的方式进行,工作量大,耗时长且易产生人为误检。本研究以香菇(Lentinula edodes)菌株"申香215"为例,通过对需鉴定交配型的单核体的双核体亲本菌株进行基因组...
目前食用菌的交配型鉴定通常采用单核体两两交配后镜检观察锁状联合的方式进行,工作量大,耗时长且易产生人为误检。本研究以香菇(Lentinula edodes)菌株"申香215"为例,通过对需鉴定交配型的单核体的双核体亲本菌株进行基因组重测序,获得双核体交配型A和B因子区域的序列比对信息,对交配型因子等位基因内部的SNP位点进行统计分析,选择合适位点设计引物,采用等位基因特异PCR(Allele-specificPCR,AS-PCR)技术,根据扩增结果可快速确定单核体的交配型并排除双核体和杂合体。用该方法鉴定香菇单核体的交配型,提高了鉴定效率和准确率,该方法可作为分子标记辅助育种的一种手段,为食用菌遗传育种工作提供新的技术支撑。
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关键词
香菇
交配型
单核体
SNP
AS-PCR
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职称材料
香菇F2代群体农艺性状的SSR关联分析
被引量：
6
2
作者
章炉军
高成
+5 位作者
于海龙
宋春艳
尚晓冬
谭琦
王瑞娟
张美彦
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2019年第1期1-10,100,共11页
以香菇(Lentinula edodes)"沪香F2"为亲本,构建F2代群体,测定85个F2代菌株在PDA平板上的菌丝生长速度、菌包中的菌丝生长速度、原基形成时间、出菇周期、菌盖直径、菌柄直径、菌柄长度、单包产量、单包菇数等农艺性状,利用筛...
以香菇(Lentinula edodes)"沪香F2"为亲本,构建F2代群体,测定85个F2代菌株在PDA平板上的菌丝生长速度、菌包中的菌丝生长速度、原基形成时间、出菇周期、菌盖直径、菌柄直径、菌柄长度、单包产量、单包菇数等农艺性状,利用筛选获得的32对具多态性的SSR引物对F2代群体进行基因型检测,共扩增出93个多态性条带,将观测的9个农艺性状与这93个SSR标记进行相关性分析。结果显示,有26个标记能够与这些性状发生关联,关联事件的总数为30;其中有8个标记表现为极显著关联(P<0.01),2个标记与菌柄长度极显著关联,6个标记与单包菇数极显著关联。本研究首次探索了香菇F2代群体在表型上的分化以及与分子标记之间的关联性,为分子标记辅助育种在香菇中的应用提供参考。
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关键词
遗传多样性
连锁不平衡
群体结构
等位变异
表型变异效应
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职称材料
刺芹侧耳下脚料水溶性细胞壁多糖碱提工艺优化及活性分析
被引量：
5
3
作者
刘艳芳
薛令坤
+6 位作者
唐庆九
周帅
颜梦秋
杨焱
吴迪
张忠
张劲松
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2019年第4期116-122,共7页
采用碱提法提取刺芹侧耳(Pleurotus eryngii)下脚料水溶性细胞壁多糖,以得率、多糖含量和β-葡聚糖含量为主要指标,对提取过程中的碱液浓度、料液比、提取温度和提取时间等因素进行考察,优化的提取工艺:1 mol/L的NaOH溶液为提取溶剂,料...
采用碱提法提取刺芹侧耳(Pleurotus eryngii)下脚料水溶性细胞壁多糖,以得率、多糖含量和β-葡聚糖含量为主要指标,对提取过程中的碱液浓度、料液比、提取温度和提取时间等因素进行考察,优化的提取工艺:1 mol/L的NaOH溶液为提取溶剂,料液比1∶20(g∶mL),提取温度30℃,提取时间4 h,在此条件下,所得水溶性细胞壁多糖组分得率6.25%,多糖含量74.56%,β-葡聚糖含量56.37%。高效凝胶尺寸排阻色谱-多角度激光光散射-示差折光检测仪联用法(HPSEC-MALLS-RI)分析结果显示,该组分主要含4个峰,其中峰1和峰2对应的组分相对分子质量分别为1.36×10^7和2.68×10^6,峰3和峰4对应的组分相对分子质量分别为3.15×10^5和9.82×10^3;体外免疫活性检测结果显示,该水溶性细胞壁多糖组分具有刺激巨噬细胞释放NO和促进小鼠脾淋巴细胞增殖的活性。
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关键词
刺芹侧耳下脚料
得率
多糖含量
Β-葡聚糖含量
相对分子质量
免疫活性
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职称材料
题名
基于SNP分型的香菇交配型AS-PCR鉴定
被引量：
13
1
作者
张美彦
宋春艳
于海龙
谭琦
徐珍
王瑞娟
章炉军
尚晓冬
机构
上海市农业科学院食用菌研究所农业部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心上海市农业遗传育种重点实验室
出处
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2019年第2期1-9,I0001,共10页
基金
上海市市级农口系统青年人才成长计划项目[沪农青字(2017)第1-9号]
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-20)
+1 种基金
上海市食用菌产业技术体系建设专项资金[沪农科产字(2019)第9号]
上海市科技兴农项目(2019-02-08-00-08-F01114)
文摘
目前食用菌的交配型鉴定通常采用单核体两两交配后镜检观察锁状联合的方式进行,工作量大,耗时长且易产生人为误检。本研究以香菇(Lentinula edodes)菌株"申香215"为例,通过对需鉴定交配型的单核体的双核体亲本菌株进行基因组重测序,获得双核体交配型A和B因子区域的序列比对信息,对交配型因子等位基因内部的SNP位点进行统计分析,选择合适位点设计引物,采用等位基因特异PCR(Allele-specificPCR,AS-PCR)技术,根据扩增结果可快速确定单核体的交配型并排除双核体和杂合体。用该方法鉴定香菇单核体的交配型,提高了鉴定效率和准确率,该方法可作为分子标记辅助育种的一种手段,为食用菌遗传育种工作提供新的技术支撑。
关键词
香菇
交配型
单核体
SNP
AS-PCR
Keywords
Lentinula edodes
mating type
monokaryon
SNP
AS-PCR
分类号
S646.12 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
香菇F2代群体农艺性状的SSR关联分析
被引量：
6
2
作者
章炉军
高成
于海龙
宋春艳
尚晓冬
谭琦
王瑞娟
张美彦
机构
上海市农业科学院食用菌研究所农业部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心上海市农业遗传育种重点实验室
出处
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2019年第1期1-10,100,共11页
基金
上海市市级农口系统青年人才成长计划项目[沪农青字(2016)第1-28号]
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-20)
上海市食用菌产业技术体系建设专项资金[沪农科产字(2018)第9-03号]
文摘
以香菇(Lentinula edodes)"沪香F2"为亲本,构建F2代群体,测定85个F2代菌株在PDA平板上的菌丝生长速度、菌包中的菌丝生长速度、原基形成时间、出菇周期、菌盖直径、菌柄直径、菌柄长度、单包产量、单包菇数等农艺性状,利用筛选获得的32对具多态性的SSR引物对F2代群体进行基因型检测,共扩增出93个多态性条带,将观测的9个农艺性状与这93个SSR标记进行相关性分析。结果显示,有26个标记能够与这些性状发生关联,关联事件的总数为30;其中有8个标记表现为极显著关联(P<0.01),2个标记与菌柄长度极显著关联,6个标记与单包菇数极显著关联。本研究首次探索了香菇F2代群体在表型上的分化以及与分子标记之间的关联性,为分子标记辅助育种在香菇中的应用提供参考。
关键词
遗传多样性
连锁不平衡
群体结构
等位变异
表型变异效应
Keywords
Genetic diversity
linkage disequilibrium
population structure
allelic variation
phenotypic variation effect
分类号
S646.12 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
刺芹侧耳下脚料水溶性细胞壁多糖碱提工艺优化及活性分析
被引量：
5
3
作者
刘艳芳
薛令坤
唐庆九
周帅
颜梦秋
杨焱
吴迪
张忠
张劲松
机构
上海市农业科学院食用菌研究所农业部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心上海市农业遗传育种重点实验室
出处
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2019年第4期116-122,共7页
基金
上海市农委重点攻关项目[沪农科攻字(2015)第6-1-6号]
文摘
采用碱提法提取刺芹侧耳(Pleurotus eryngii)下脚料水溶性细胞壁多糖,以得率、多糖含量和β-葡聚糖含量为主要指标,对提取过程中的碱液浓度、料液比、提取温度和提取时间等因素进行考察,优化的提取工艺:1 mol/L的NaOH溶液为提取溶剂,料液比1∶20(g∶mL),提取温度30℃,提取时间4 h,在此条件下,所得水溶性细胞壁多糖组分得率6.25%,多糖含量74.56%,β-葡聚糖含量56.37%。高效凝胶尺寸排阻色谱-多角度激光光散射-示差折光检测仪联用法(HPSEC-MALLS-RI)分析结果显示,该组分主要含4个峰,其中峰1和峰2对应的组分相对分子质量分别为1.36×10^7和2.68×10^6,峰3和峰4对应的组分相对分子质量分别为3.15×10^5和9.82×10^3;体外免疫活性检测结果显示,该水溶性细胞壁多糖组分具有刺激巨噬细胞释放NO和促进小鼠脾淋巴细胞增殖的活性。
关键词
刺芹侧耳下脚料
得率
多糖含量
Β-葡聚糖含量
相对分子质量
免疫活性
Keywords
Pleurotus eryngii leftover waste
yield
polysaccharide content
β-glucan content
relative molecular weight
immunologic activity
分类号
R28 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于SNP分型的香菇交配型AS-PCR鉴定
张美彦
宋春艳
于海龙
谭琦
徐珍
王瑞娟
章炉军
尚晓冬
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2019
13
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
香菇F2代群体农艺性状的SSR关联分析
章炉军
高成
于海龙
宋春艳
尚晓冬
谭琦
王瑞娟
张美彦
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2019
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
刺芹侧耳下脚料水溶性细胞壁多糖碱提工艺优化及活性分析
刘艳芳
薛令坤
唐庆九
周帅
颜梦秋
杨焱
吴迪
张忠
张劲松
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2019
5
在线阅读
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职称材料
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