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猪星状病毒的流行病学调查及遗传进化分析
被引量：
5
1
作者
李本强
陶洁
+3 位作者
程靖华
石迎
乔长涛
刘惠莉
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期1046-1050,1073,共6页
为了解上海地区猪群中猪星状病毒(PAstV)的流行现状及其遗传特性,本研究于2016年~2020年间在上海不同地区10个猪场共采集了1416份仔猪腹泻粪便样品,利用RT-PCR方法及生物信息学技术进行检测与分析。结果显示,PAstV的总阳性率为26.2%,PA...
为了解上海地区猪群中猪星状病毒(PAstV)的流行现状及其遗传特性,本研究于2016年~2020年间在上海不同地区10个猪场共采集了1416份仔猪腹泻粪便样品,利用RT-PCR方法及生物信息学技术进行检测与分析。结果显示,PAstV的总阳性率为26.2%,PAstV与其他腹泻病病原的混合感染情况较复杂,二重感染率占比达56.93%,主要以PAstV/猪嵴病毒(PKoV)为主(20.07%);三重感染率占比29.41%,以PAstV/PKoV/猪流行性腹泻病毒(PEDV)(10.09%)感染模式为主;四重感染率为11.4%,以PAstV/牛病毒性腹泻病毒(BVDV)/猪札幌病毒(PoSaV)/猪萨佩罗病毒(PSV)(13.51%)感染为主。猪群中PAstV的流行与气温差有很大关系,在季节交替时节流行率较高,特别是秋冬交替时节。选取其中2个PAstV阳性样品(JS-PAstV和CM-PAstV)进行全基因组序列的测定和分析,结果显示两者的全基因组同源性不高,仅为73.8%。全基因组进化分析显示,CM-PAstV分别与挪威、日本、美国的PAstV 3型的亲缘性较近;而JS-PAstV与匈牙利的PAstV 3型的亲缘性最近。对ORF2基因进行病毒重组分析,显示JS-PAstV和CM-PAstV的ORF2基因均与人星状病毒之间存在重组现象。提示,上海地区猪群中存在PAstV 3型的流行,且遗传距离较远,但存在与人星状病毒重组的风险,需进一步监测关注。本研究数据丰富了国内PAstV的流行病学资料,可为该病的风险防控提供科学数据。
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关键词
猪星状病毒
混合感染
季节性
遗传进化分析
基因序列重组
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职称材料
猪繁殖与呼吸综合征病毒非结构蛋白NSP4细胞核定位研究
被引量：
4
2
作者
刘惠莉
方莹
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第4期89-94,共6页
为探讨PRRSV非结构蛋白4(NSP4)功能,体外构建了pEGFP-N1-nsp4真核表达载体,转染Marc-145细胞,利用NSP4-GFP融合蛋白携带的绿色荧光标记,研究NSP4蛋白在Marc-145细胞中的定位,并根据蛋白疏水性设计构建含有nsp4基因N端不同长度的重组pEGF...
为探讨PRRSV非结构蛋白4(NSP4)功能,体外构建了pEGFP-N1-nsp4真核表达载体,转染Marc-145细胞,利用NSP4-GFP融合蛋白携带的绿色荧光标记,研究NSP4蛋白在Marc-145细胞中的定位,并根据蛋白疏水性设计构建含有nsp4基因N端不同长度的重组pEGFP-N1表达载体,转染细胞以进一步了解NSP4蛋白是否存在核定位信号序列及其在细胞中的分布。试验结果表明:融合蛋白主要位于细胞核,部分在胞浆内。PRRSV NSP4蛋白铰链区(hinge region,HR)145～168氨基酸是决定蛋白核内定位的功能区,该片段缺失影响NSP4蛋白进入细胞核。结论:体外转染细胞内表达的NSP4蛋白主要分布在细胞核内,HR区是其核定位信号,NSP4蛋白通过HR区信号作用主动进入细胞核内。
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关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)
非结构蛋白4(NSP4)
核定位
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职称材料
题名
猪星状病毒的流行病学调查及遗传进化分析
被引量：
5
1
作者
李本强
陶洁
程靖华
石迎
乔长涛
刘惠莉
机构
上海市农业科学院畜牧兽医研究所/上海市农业遗传育种重点实验室
上海市
种猪工程技术中心
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期1046-1050,1073,共6页
基金
上海市科技兴农项目[沪农科创字(2019)第3-2号]。
文摘
为了解上海地区猪群中猪星状病毒(PAstV)的流行现状及其遗传特性,本研究于2016年~2020年间在上海不同地区10个猪场共采集了1416份仔猪腹泻粪便样品,利用RT-PCR方法及生物信息学技术进行检测与分析。结果显示,PAstV的总阳性率为26.2%,PAstV与其他腹泻病病原的混合感染情况较复杂,二重感染率占比达56.93%,主要以PAstV/猪嵴病毒(PKoV)为主(20.07%);三重感染率占比29.41%,以PAstV/PKoV/猪流行性腹泻病毒(PEDV)(10.09%)感染模式为主;四重感染率为11.4%,以PAstV/牛病毒性腹泻病毒(BVDV)/猪札幌病毒(PoSaV)/猪萨佩罗病毒(PSV)(13.51%)感染为主。猪群中PAstV的流行与气温差有很大关系,在季节交替时节流行率较高,特别是秋冬交替时节。选取其中2个PAstV阳性样品(JS-PAstV和CM-PAstV)进行全基因组序列的测定和分析,结果显示两者的全基因组同源性不高,仅为73.8%。全基因组进化分析显示,CM-PAstV分别与挪威、日本、美国的PAstV 3型的亲缘性较近;而JS-PAstV与匈牙利的PAstV 3型的亲缘性最近。对ORF2基因进行病毒重组分析,显示JS-PAstV和CM-PAstV的ORF2基因均与人星状病毒之间存在重组现象。提示,上海地区猪群中存在PAstV 3型的流行,且遗传距离较远,但存在与人星状病毒重组的风险,需进一步监测关注。本研究数据丰富了国内PAstV的流行病学资料,可为该病的风险防控提供科学数据。
关键词
猪星状病毒
混合感染
季节性
遗传进化分析
基因序列重组
Keywords
PAstV
co-infection
seasonality
phylogenetic analysis
virus recombinant
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
猪繁殖与呼吸综合征病毒非结构蛋白NSP4细胞核定位研究
被引量：
4
2
作者
刘惠莉
方莹
机构
上海市农业科学院畜牧兽医研究所/上海市农业遗传育种重点实验室
美国南达科塔州立大学动物
科学
系
出处
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第4期89-94,共6页
文摘
为探讨PRRSV非结构蛋白4(NSP4)功能,体外构建了pEGFP-N1-nsp4真核表达载体,转染Marc-145细胞,利用NSP4-GFP融合蛋白携带的绿色荧光标记,研究NSP4蛋白在Marc-145细胞中的定位,并根据蛋白疏水性设计构建含有nsp4基因N端不同长度的重组pEGFP-N1表达载体,转染细胞以进一步了解NSP4蛋白是否存在核定位信号序列及其在细胞中的分布。试验结果表明:融合蛋白主要位于细胞核,部分在胞浆内。PRRSV NSP4蛋白铰链区(hinge region,HR)145～168氨基酸是决定蛋白核内定位的功能区,该片段缺失影响NSP4蛋白进入细胞核。结论:体外转染细胞内表达的NSP4蛋白主要分布在细胞核内,HR区是其核定位信号,NSP4蛋白通过HR区信号作用主动进入细胞核内。
关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)
非结构蛋白4(NSP4)
核定位
Keywords
porcine reproductive and respiratory syndrome virus（PRRSV）
nonstructural protein 4
nuclear localization
分类号
S852.43 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪星状病毒的流行病学调查及遗传进化分析
李本强
陶洁
程靖华
石迎
乔长涛
刘惠莉
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
猪繁殖与呼吸综合征病毒非结构蛋白NSP4细胞核定位研究
刘惠莉
方莹
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
4
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职称材料
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