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基因指纹法预测鼻咽癌放射敏感性初步研究 被引量:3
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作者 陈甲信 郭懿 +5 位作者 李瑶 张政 司勇锋 冯国生 程金建 邓卓霞 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2007年第20期1141-1145,共5页
目的:研究放射敏感与放射抵抗的鼻咽癌组织基因表达差异,寻找预测鼻咽癌放射敏感性基因指纹。方法:采用BioStarH-141s(2004)型含14112点的人类全长基因cDNA表达谱芯片,对19例不同放射敏感性鼻咽癌组织进行检测,其中放射敏感8例,放射抵... 目的:研究放射敏感与放射抵抗的鼻咽癌组织基因表达差异,寻找预测鼻咽癌放射敏感性基因指纹。方法:采用BioStarH-141s(2004)型含14112点的人类全长基因cDNA表达谱芯片,对19例不同放射敏感性鼻咽癌组织进行检测,其中放射敏感8例,放射抵抗11例,用T-test检验、聚类、LOOCV等方法进行生物信息分析。结果:放射抵抗组与放射敏感组比较,表达差异的基因P<0.5有923条,P<0.01有164条,P<0.001有17条;与慢性炎症组织相比,放射敏感组70%以上病例有2倍以上表达差异的基因267条,明显高于放射抵抗组106条。这些基因包括已知的与放射敏感性密切相关的基因PRKD,DCK等;还有大部分以前没有描述与放射敏感性相关的基因,如SIRT1,RABAC1,PPP1CC,ZNF638,APPBP1,RABAC1等,它们主要与细胞周期、S期和M期调控点、细胞凋亡、细胞生长、DNA绑定,RNA绑定等功能有关;还有一些新发现的,功能尚未明确的基因,如CUTA,ZNF148,Sep15,TMTC3,TOP1等。取P<0.01的差异表达基因98条进行聚类分析,19例患者能分成放射敏感与抵抗二类,除1例外,所有病例敏感性的分类均与临床结果相符。用LOOCV验证,准确率100%。结论:不同放射敏感性的鼻咽癌组织,基因表达存在明显差异,与炎症组织比较,放射敏感组的基因表达差异更大,可利用差异基因簇进行放射敏感性分类,提示可利用基因指纹法进行鼻咽癌放射敏感性预测。 展开更多
关键词 鼻咽癌 放射敏感性 基因表达谱 基因指纹
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