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HLA-DR位点的基因芯片分型与临床应用 被引量:10
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作者 李成涛 杨颖 +3 位作者 李莉 康敏华 曹慧敏 李瑶 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第11期776-782,共7页
目的 :建立一种新型的HLA DR位点的基因分型方法 ,为HLA DR的基因分型提供一个较新的思路。方法 :利用基因芯片技术 ,根据HLA不同基因亚型的独特序列设计探针 ,制成分型芯片 ;待检测样品经PCR反应标记上荧光之后 ,与芯片进行杂交 ,根据... 目的 :建立一种新型的HLA DR位点的基因分型方法 ,为HLA DR的基因分型提供一个较新的思路。方法 :利用基因芯片技术 ,根据HLA不同基因亚型的独特序列设计探针 ,制成分型芯片 ;待检测样品经PCR反应标记上荧光之后 ,与芯片进行杂交 ,根据杂交产生的荧光信号值分析确定样品DR位点的基因亚型。将这一方法应用于 70份标准DNA和 2 0 0份医院移植供受者的HLA DR基因分型并将部分样品进行基因测序。结果 :检测结果表明HLA DR基因分型芯片可准确分辨出DR位点等位基因 30大类 ,耗时 3h。结论 :基因芯片用于HLA DR的基因分型 ,分辨率高、特异性强、重复性好、操作简便 ,对比常规的PCR SSP和PCR SSO方法 ,HLA DR基因芯片方法更为直观 ,并具有集成化优势 ,可以在一张芯片上同时检测HLAI类的A、B位点 ,并实现一张芯片多人份 ,适合于临床应用和骨髓库、脐血库的建立。 展开更多
关键词 HLA-DR位点 基因芯片 临床应用 基因分型 PCR-SSP PCR-SSO
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HLA-DRB1基因分型芯片的法医物证学应用价值研究 被引量:13
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作者 李莉 李成涛 +5 位作者 柳燕 李荣宇 康敏华 林源 阙庭志 李瑶 《法医学杂志》 CAS CSCD 2004年第2期81-84,87,i010,共6页
目的对HLA-DRB1基因分型芯片在个体识别中的应用价值进行研究。方法根据HLA-DRB1基因座不同等位基因的独特序列设计探针,制成分型芯片。将待测样品DNA用末端标记了CY5的引物进行PCR扩增,产物与芯片进行杂交,根据杂交产生的荧光信号值确... 目的对HLA-DRB1基因分型芯片在个体识别中的应用价值进行研究。方法根据HLA-DRB1基因座不同等位基因的独特序列设计探针,制成分型芯片。将待测样品DNA用末端标记了CY5的引物进行PCR扩增,产物与芯片进行杂交,根据杂交产生的荧光信号值确定样品在HLA-DRB1位点的基因型。将这一方法应用于561份样本的HLA-DRB1基因分型,根据基因型分布统计分析其法医学应用价值。同时,进行了家系调查和方法灵敏度分析,并应用于部分案例。结果利用微量检材,HLA-DRB1基因芯片可检测DRB1位点等位基因26个,基因型的分布符合Hardy-Weinberg平衡定律,该位点的观察杂合度(Ho)为0.888,期望杂合度(He)为0.902,多态信息含量(PIC)为0.893,平均非父排除率(PE)为0.801。家系调查和案例运用的结果表明,HLA-DRB1位点等位基因由亲代向子代的传递符合孟德尔遗传定律。结论HLA-DRB1为高度多态位点,其基因分型芯片可在亲子鉴定和个体识别中发挥重要作用。 展开更多
关键词 HLA-DRBl基因分型芯片 法医 物证学 亲子鉴定
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运用二重PCR和DNA芯片技术检测ABO基因型 被引量:1
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作者 李莉 李成涛 +11 位作者 李荣宇 孙美倩 柳燕 李瑶 林源 阙庭志 程大霖 严品华 方建新 赵珍敏 沈敏 杜志淳 《法医学杂志》 CAS CSCD 2004年第4期193-196,F003,共5页
目的以玻片为载体,用寡核苷酸探针杂交技术检测ABO基因型。方法根据ABO基因座外显子6和外显子7的3个SNP点的序列分布特征设计4条寡核苷酸探针,制成分型芯片。将待测样品DNA用末端标记了Cy5的引物进行二重PCR扩增,产物与芯片上的探针进... 目的以玻片为载体,用寡核苷酸探针杂交技术检测ABO基因型。方法根据ABO基因座外显子6和外显子7的3个SNP点的序列分布特征设计4条寡核苷酸探针,制成分型芯片。将待测样品DNA用末端标记了Cy5的引物进行二重PCR扩增,产物与芯片上的探针进行杂交,根据杂交产生的荧光信号确定样品的ABO基因型。结果利用ABO芯片,可对血斑、毛发等微量检材进行ABO基因型检测。对115名汉族无关个体的调查表明,ABO基因型的分布符合Hardy-Weinberg平衡,等位基因杂合度观察值和期望值分别为0.591、0.616,多态信息含量为0.544,二联体和三联体非父排除率分别为0.188、0.334,个体识别能力为0.777。结论通过DNA芯片检测ABO基因型的技术适用于法医学样本,可满足高通量的检测需求。 展开更多
关键词 ABO基因型 DNA芯片 个体识别 亲子鉴定
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寡核苷酸芯片技术在HLA-A抗原基因分型中的应用研究
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作者 李成涛 李莉 +2 位作者 柳燕 康敏华 李荣宇 《法医学杂志》 CAS CSCD 2005年第4期271-273,共3页
目的建立一种HLA-A位点的基因芯片分型方法,为HLA-A位点的基因分型提供一个较新的思路。方法利用基因芯片技术,根据HLA-A位点不同基因亚型的独特序列设计探针,制成分型芯片;待检测样品经PCR反应标记上荧光之后,与芯片进行杂交,根据杂交... 目的建立一种HLA-A位点的基因芯片分型方法,为HLA-A位点的基因分型提供一个较新的思路。方法利用基因芯片技术,根据HLA-A位点不同基因亚型的独特序列设计探针,制成分型芯片;待检测样品经PCR反应标记上荧光之后,与芯片进行杂交,根据杂交产生的荧光信号值分析确定样品HLA-A位点的基因亚型。将这一方法应用于100份标准DNA和200份无关个体的HLA-A位点基因分型并将部分样品进行测序。结果检测结果表明HLA-A基因分型芯片可准确分辨出A位点等位基因20大类,耗时2.5h。结论寡核苷酸芯片技术用于HLA-A基因分型,分辨率高、特异性强、重复性好、操作简便、结果直观,适合于法医学实践和临床应用。 展开更多
关键词 寡核苷酸芯片 HLA-A 基因分型
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31个SNP位点多重PCR扩增和芯片分型技术的建立及其法医学应用 被引量:10
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作者 李莉 李荣宇 +5 位作者 李成涛 柳燕 林源 阙庭志 孙美倩 李瑶 《法医学杂志》 CAS CSCD 2005年第2期90-95,共6页
目的对SNP基因分型芯片在个体识别中的应用价值进行研究。方法根据SNP不同等位基因的序列设计探针,制成分型芯片。采用4个复合PCR体系,用末端标记了Cy5的引物进行复合PCR扩增,产物与寡核苷酸探针进行杂交,根据杂交产生的荧光信号值确定... 目的对SNP基因分型芯片在个体识别中的应用价值进行研究。方法根据SNP不同等位基因的序列设计探针,制成分型芯片。采用4个复合PCR体系,用末端标记了Cy5的引物进行复合PCR扩增,产物与寡核苷酸探针进行杂交,根据杂交产生的荧光信号值确定样品在各SNP位点的基因型。将这一方法应用于109份样本的分型,根据基因型分布统计分析31个SNP位点的法医学应用价值。同时,进行家系调查和方法灵敏度分析。结果方法的灵敏度为1ng;所检测的31个SNP位点的累积个体识别率为0.9999999999979(偶合率为2.13×10-12),二联体亲子鉴定中累积非父排除率为0.9609,三联体亲子鉴定中累积非父排除率为0.9970。家系调查的结果表明,这些位点等位基因由亲代向子代的传递符合孟德尔遗传定律。结论上述31个SNP位点为中高信息量位点,适用于法医学个体识别,可作为当前STR系统的补充。 展开更多
关键词 SNP位点 PCR扩增 法医学应用 分型技术 芯片 非父排除率 多重 寡核苷酸探针 等位基因 应用价值 个体识别 家系调查 亲子鉴定 复合PCR 灵敏度分析 基因型分布 序列设计 基因分型 末端标记 统计分析 方法应用 光信号 lng
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