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饲粮蛋白质源对断奶仔猪小肠全基因组转录谱的影响
被引量：
4
1
作者
孙云子
余冰
+1 位作者
陈代文
陈希剑
《动物营养学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期689-703,共15页
为探讨饲粮蛋白质源影响断奶仔猪小肠发育的分子机制,本试验利用猪全基因组表达谱芯片分析不同蛋白质源饲粮下断奶仔猪(断奶0、3、7和14 d)小肠转录谱,24头仔公猪随机分为2个处理,处理1采用乳源蛋白质30%替代饲粮总蛋白质,处理2采用全...
为探讨饲粮蛋白质源影响断奶仔猪小肠发育的分子机制,本试验利用猪全基因组表达谱芯片分析不同蛋白质源饲粮下断奶仔猪(断奶0、3、7和14 d)小肠转录谱,24头仔公猪随机分为2个处理,处理1采用乳源蛋白质30%替代饲粮总蛋白质,处理2采用全植物蛋白质源饲粮。结果表明:1)处理1获得370个差异表达基因(P<0.05),采用序列试验聚类分析,共获得26个表达模式,其中有3个显著表达模式,模式5和11显著性水平最高(P<0.01)。处理2获得263个差异表达基因(P<0.05),序列试验聚类分析得到26个表达模式,其中模式3和22显著水平最高(P<0.01)。2)基因共表达网络构建和分析一定程度上揭示了不同蛋白质源饲粮对肠道发育的分子调控机制,以及两者之间的差异。通过基因芯片数据,从2种蛋白质源饲粮处理下的基因调控网络中筛选出12和9个具有重要影响和研究价值的基因,以及9个在2个处理中网络调控地位发生改变的共表达基因。通过基因芯片数据,从2种蛋白质源饲粮处理下的基因调控网络中筛选出12和9个具有重要影响和研究价值的基因,以及9个在2个处理中网络调控地位发生改变的共表达基因。总之,本试验筛选出了一些在不同饲粮蛋白质源影响断奶仔猪肠道发育和功能过程中可能具有深入研究意义的候选基因。
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关键词
仔猪
基因芯片
基因调控网络
小肠
发育
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职称材料
大气细颗粒物致小鼠肺损伤的遗传易感性
2
作者
曹强
姜智海
+3 位作者
张澍
李奇
蒋蓉芳
宋伟民
《复旦学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第1期47-50,共4页
目的研究遗传背景是否为PM2.5致肺损伤的因素之一。方法采用气管滴注的染毒方法,两种品系的小鼠(C57BL/6小鼠和C3H/He小鼠)均予PM2.5染毒,连续染毒2d,最后一次染毒24h后,处死小鼠,取肺组织,并且立即置于液氮中保存。然后运用Affymetrix ...
目的研究遗传背景是否为PM2.5致肺损伤的因素之一。方法采用气管滴注的染毒方法,两种品系的小鼠(C57BL/6小鼠和C3H/He小鼠)均予PM2.5染毒,连续染毒2d,最后一次染毒24h后,处死小鼠,取肺组织,并且立即置于液氮中保存。然后运用Affymetrix Mouse430 2.0表达谱基因芯片,分析在两种品系小鼠肺部基因表达的差异情况。结果基因芯片结果表明Chi3l3、Chi3l4、Cxcl2、C4、Hc、Cp和Sirpb1基因在B6小鼠肺部的表达明显高于C3小鼠,而Igh-6、Cap1、Mtap2、Nme7和5830443L24Rik基因的表达明显低于C3小鼠。结论由于两种品系小鼠遗传背景上的差别,导致PM2.5染毒后,在两种品系小鼠肺部基因表达存在明显差异,因此遗传因素可能是PM2.5致肺损伤的易感因素之一。
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关键词
细颗粒物
基因易感性
基因芯片
肺损伤
氧化应激
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职称材料
题名
饲粮蛋白质源对断奶仔猪小肠全基因组转录谱的影响
被引量：
4
1
作者
孙云子
余冰
陈代文
陈希剑
机构
四川农业大学动物营养研究所
贵州师范大学生命科学学院
上海其明信息技术有限公司
出处
《动物营养学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期689-703,共15页
基金
四川省教育厅重点项目(仔猪肠道功能基因表达与营养调控
230.2020)
贵州省六盘水市科技局项目(52020)
文摘
为探讨饲粮蛋白质源影响断奶仔猪小肠发育的分子机制,本试验利用猪全基因组表达谱芯片分析不同蛋白质源饲粮下断奶仔猪(断奶0、3、7和14 d)小肠转录谱,24头仔公猪随机分为2个处理,处理1采用乳源蛋白质30%替代饲粮总蛋白质,处理2采用全植物蛋白质源饲粮。结果表明:1)处理1获得370个差异表达基因(P<0.05),采用序列试验聚类分析,共获得26个表达模式,其中有3个显著表达模式,模式5和11显著性水平最高(P<0.01)。处理2获得263个差异表达基因(P<0.05),序列试验聚类分析得到26个表达模式,其中模式3和22显著水平最高(P<0.01)。2)基因共表达网络构建和分析一定程度上揭示了不同蛋白质源饲粮对肠道发育的分子调控机制,以及两者之间的差异。通过基因芯片数据,从2种蛋白质源饲粮处理下的基因调控网络中筛选出12和9个具有重要影响和研究价值的基因,以及9个在2个处理中网络调控地位发生改变的共表达基因。通过基因芯片数据,从2种蛋白质源饲粮处理下的基因调控网络中筛选出12和9个具有重要影响和研究价值的基因,以及9个在2个处理中网络调控地位发生改变的共表达基因。总之,本试验筛选出了一些在不同饲粮蛋白质源影响断奶仔猪肠道发育和功能过程中可能具有深入研究意义的候选基因。
关键词
仔猪
基因芯片
基因调控网络
小肠
发育
Keywords
piglet
microarray
gene regulatory network
intestine
development
分类号
S82 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
大气细颗粒物致小鼠肺损伤的遗传易感性
2
作者
曹强
姜智海
张澍
李奇
蒋蓉芳
宋伟民
机构
复旦大学公共卫生学院环境卫生学教研室
上海
市疾病预防控制中心
上海
国际机场检验检疫局
上海其明信息技术有限公司
出处
《复旦学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第1期47-50,共4页
基金
国家自然科学基金项目(30271106)
国家自然科学基金重大项目(10490182)
文摘
目的研究遗传背景是否为PM2.5致肺损伤的因素之一。方法采用气管滴注的染毒方法,两种品系的小鼠(C57BL/6小鼠和C3H/He小鼠)均予PM2.5染毒,连续染毒2d,最后一次染毒24h后,处死小鼠,取肺组织,并且立即置于液氮中保存。然后运用Affymetrix Mouse430 2.0表达谱基因芯片,分析在两种品系小鼠肺部基因表达的差异情况。结果基因芯片结果表明Chi3l3、Chi3l4、Cxcl2、C4、Hc、Cp和Sirpb1基因在B6小鼠肺部的表达明显高于C3小鼠,而Igh-6、Cap1、Mtap2、Nme7和5830443L24Rik基因的表达明显低于C3小鼠。结论由于两种品系小鼠遗传背景上的差别,导致PM2.5染毒后,在两种品系小鼠肺部基因表达存在明显差异,因此遗传因素可能是PM2.5致肺损伤的易感因素之一。
关键词
细颗粒物
基因易感性
基因芯片
肺损伤
氧化应激
Keywords
PM2.5
genetic susceptibility
GeneChip
lung injury
oxidative stress
分类号
X513 [环境科学与工程—环境工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
饲粮蛋白质源对断奶仔猪小肠全基因组转录谱的影响
孙云子
余冰
陈代文
陈希剑
《动物营养学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
4
在线阅读
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职称材料
2
大气细颗粒物致小鼠肺损伤的遗传易感性
曹强
姜智海
张澍
李奇
蒋蓉芳
宋伟民
《复旦学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2007
0
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职称材料
已选择
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