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代谢组学技术在多组分中药药代动力学中的应用 被引量:6
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作者 王守丽 黄凤杰 +1 位作者 郑晓皎 陈天璐 《世界科学技术-中医药现代化》 2016年第11期2007-2012,共6页
传统的药代动力学研究的是单一或者几种有效成分在生物体内的动态变化过程。中药的多组分、多靶点、多效应等特点决定了其药代动力学的复杂性。药代动力学研究的片面性将限制人们对中药、复方制剂的药理和毒理认识的准确性,已成为中医... 传统的药代动力学研究的是单一或者几种有效成分在生物体内的动态变化过程。中药的多组分、多靶点、多效应等特点决定了其药代动力学的复杂性。药代动力学研究的片面性将限制人们对中药、复方制剂的药理和毒理认识的准确性,已成为中医药现代化研究中的瓶颈之一。代谢组学技术依托先进的高通量测试平台和多种大数据挖掘技术,能够同时获得并分析数百种甚至数千种小分子物质的波动情况,为复杂组分的PK研究提供了新的契机。本文综述了2010年以来多组分中药的药代动力学研究进展,介绍了代谢组学技术在其中的成功应用,重点介绍了两种新的整合了代谢组学和传统PK思想的中药方证代谢组学和中药多组分药代动力学研究策略(Polypharmacokinetics,Poly-PK),并展望了两种研究策略在中药药理学研究中的发展前景和所面临的技术挑战。 展开更多
关键词 药代动力学 代谢组学 多组分中药
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游离脂肪酸结构信息和保留时间相关性及预测模型的建立
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作者 王守丽 卫润民 +3 位作者 黄凤杰 赵琳静 赵爱华 陈天璐 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期143-146,共4页
目的分析游离脂肪酸(FFA)的结构与测得的保留时间(RT)之间的关系,构建和验证RT预测模型。方法利用UPLC-QTOF/MS平台检测72个FFA标准品的RT和结构信息。考察FFA的碳链长度、双键个数以及双键位置与RT的关系,建立多组广义回归模型,采用交... 目的分析游离脂肪酸(FFA)的结构与测得的保留时间(RT)之间的关系,构建和验证RT预测模型。方法利用UPLC-QTOF/MS平台检测72个FFA标准品的RT和结构信息。考察FFA的碳链长度、双键个数以及双键位置与RT的关系,建立多组广义回归模型,采用交叉验证和赤池信息量选择最佳模型。结果各种结构信息与RT之间是非线性关系;建立了最佳预测模型并评估了其性能。结论多元正交多项式回归模型能够较好地预测72种FFA标准品的RT;采用该回归模型对其他目标物质的RT进行预测,有助于对缺乏标准品的FFA进行鉴定。 展开更多
关键词 游离脂肪酸 保留时间 结构信息 回归模型
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肠道菌群与大脑双向互动的研究进展 被引量:43
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作者 游懿君 韩小龙 +2 位作者 郑晓皎 赵爱华 陈天璐 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期253-257,共5页
肠脑轴(GBA)是大脑与肠道之间由神经—内分泌介导的双向应答系统,连接着大脑的情感认知和外周肠道的功能。近年有研究发现,定植于人体肠道内的微生物在脑肠交流中起到了不可或缺的重要作用。一方面,肠道菌群可通过GBA影响大脑的发育与功... 肠脑轴(GBA)是大脑与肠道之间由神经—内分泌介导的双向应答系统,连接着大脑的情感认知和外周肠道的功能。近年有研究发现,定植于人体肠道内的微生物在脑肠交流中起到了不可或缺的重要作用。一方面,肠道菌群可通过GBA影响大脑的发育与功能;另一方面,大脑也可以通过GBA改变肠道菌群的结构组成。这些发现逐渐形成了一个新的医学研究热点,即"菌群—肠—脑轴"。该文就肠道菌群与大脑之间通过GBA进行的相互作用作一综述,希望为胃肠道和大脑功能领域的研究以及相关疾病的治疗提供一定支持。 展开更多
关键词 肠道菌群 肠脑轴 神经发育 功能性胃肠病
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代谢性疾病中胆汁酸水平变化及相关治疗策略 被引量:11
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作者 况俊良 郑晓皎 +1 位作者 赵爱华 贾伟 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期678-683,共6页
胆汁酸作为一种信号分子可以特异性地与胆汁酸受体(如法尼醇X受体、G蛋白偶联胆汁酸受体1)结合介导一系列生物调节反应。近年发现,胆汁酸在调节糖代谢、脂质代谢和能量代谢中扮演着十分重要的角色。在代谢性疾病的发生发展过程中,也常... 胆汁酸作为一种信号分子可以特异性地与胆汁酸受体(如法尼醇X受体、G蛋白偶联胆汁酸受体1)结合介导一系列生物调节反应。近年发现,胆汁酸在调节糖代谢、脂质代谢和能量代谢中扮演着十分重要的角色。在代谢性疾病的发生发展过程中,也常伴随着胆汁酸谱以及受体的改变。基于胆汁酸在代谢性疾病中的重要性,未来其可能成为临床诊断、预测、评价治疗效果的潜在生物标志物。该文对胆汁酸与代谢性疾病关系以及基于调节胆汁酸代谢治疗代谢性疾病进行综述。 展开更多
关键词 胆汁酸 代谢性疾病 法尼醇X受体 G蛋白偶联胆汁酸受体1 生物标志物
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非酒精性脂肪性肝病血清学无创诊断的研究进展 被引量:10
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作者 桑潮 梁丹丹 +2 位作者 谢国祥 贾伟 陈天璐 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期112-117,共6页
随着肥胖和代谢综合征的流行,非酒精性脂肪性肝病(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)已成为我国第一大慢性肝病。NAFLD可从单纯性脂肪肝发展为非酒精性脂肪性肝炎(non-alcoholic steatohepatitis,NASH)、NASH相关肝纤维化和肝硬... 随着肥胖和代谢综合征的流行,非酒精性脂肪性肝病(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)已成为我国第一大慢性肝病。NAFLD可从单纯性脂肪肝发展为非酒精性脂肪性肝炎(non-alcoholic steatohepatitis,NASH)、NASH相关肝纤维化和肝硬化,甚至肝细胞癌。准确评估NAFLD并尽早进行干预有利于减轻疾病负担,控制疾病进展。肝穿刺活组织检查是诊断NAFLD的“金标准”,但有一定的局限性和显著的并发症,临床应用受限。血清学检测作为一种无创的检测方法,越来越受到研究者和临床工作者的关注。了解各种NAFLD血清学无创诊断方法和指标的优缺点和应用范围,有助于增加诊断途径、提高诊断效力、降低患者痛苦、节约医疗资源。文章对NAFLD血清学无创诊断研究进展作一综述。 展开更多
关键词 非酒精性脂肪性肝病 肝脂肪变 脂肪性肝炎 肝纤维化 血清学诊断
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基于约登指数的肝纤维化诊断模型改进研究 被引量:5
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作者 桑潮 谢国祥 +3 位作者 梁丹丹 赵爱华 贾伟 陈天璐 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期1156-1161,共6页
目的·采用约登指数改进肝纤维化诊断模型的性能,解决组间样本数相差大时诊断灵敏度不平衡的问题。方法·使用在GitHub网站公开获取的来自上海中医药大学附属曙光医院的482例乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染患者和来... 目的·采用约登指数改进肝纤维化诊断模型的性能,解决组间样本数相差大时诊断灵敏度不平衡的问题。方法·使用在GitHub网站公开获取的来自上海中医药大学附属曙光医院的482例乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染患者和来自厦门市中医院的86例HBV感染患者分别作为训练集和验证集开展研究。基于HBV患者的年龄和3项血液学检查结果(血小板计数、血清中谷草转氨酶和谷丙转氨酶含量),建立线性判别分析、随机森林、梯度增强、决策树4种机器学习模型,实现早期和晚期肝纤维化的诊断,以及肝纤维化和肝硬化的诊断。借助约登指数调整模型的分类阈值和诊断结果。采用总准确率、受试者工作特征曲线下面积(area under the curve,AUC)和灵敏度等指标,比较各模型以及临床常用的基于4个因素的纤维化指数(fibrosis index based on the 4 factor,FIB-4)的诊断性能。结果·在肝纤维化诊断中,4种机器学习模型均存在组间灵敏度不平衡的现象。在向模型引入约登指数后,组间灵敏度的差别均大幅减小;机器学习模型的总准确率和AUC普遍高于FIB-4。结论·基于约登指数的诊断模型可平衡各组间的灵敏度,有助于提高肝纤维化诊断模型的综合性能。 展开更多
关键词 约登指数 机器学习 肝纤维化 疾病诊断
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代谢组学全功能软件研究进展 被引量:8
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作者 梁丹丹 李忆涛 +1 位作者 郑晓皎 陈天璐 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期805-810,共6页
高通量代谢组学研究的一大难点在于数据的处理和分析。为分析和处理此类数据,各种生物信息学工具应运而生。这些工具能够对复杂高维的数据集进行预处理、物质鉴定、统计分析和结果解释等。该文以代谢组学数据处理与分析的整体流程和方... 高通量代谢组学研究的一大难点在于数据的处理和分析。为分析和处理此类数据,各种生物信息学工具应运而生。这些工具能够对复杂高维的数据集进行预处理、物质鉴定、统计分析和结果解释等。该文以代谢组学数据处理与分析的整体流程和方法为基础,对现阶段一些常用的代谢组学全功能软件进行归纳整理,并对4种代表性软件作详细介绍和对比,为代谢组学研究提供工具选择和方法学参考。 展开更多
关键词 代谢组学 数据处理 统计分析 全功能软件
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超高效液相色谱-三重四极杆质谱定量人胃液胆汁酸 被引量:4
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作者 葛坤 王守丽 +2 位作者 达炜 贾伟 赵爱华 《分析科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期726-734,共9页
本研究建立了一种超高效液相色谱-三重四极杆质谱(UPLC-TQ-MS)联用技术定量23种人胃液胆汁酸的分析方法。采用甲醇提取人胃液胆汁酸得到上清液,将目标物在Cortecs C18色谱柱上梯度洗脱分离,质谱采用电喷雾电离负离子模式,以多重反应监测... 本研究建立了一种超高效液相色谱-三重四极杆质谱(UPLC-TQ-MS)联用技术定量23种人胃液胆汁酸的分析方法。采用甲醇提取人胃液胆汁酸得到上清液,将目标物在Cortecs C18色谱柱上梯度洗脱分离,质谱采用电喷雾电离负离子模式,以多重反应监测(MRM)模式检测,内标法定量。实验结果表明,23种胆汁酸的定量限为0.5~2 nmol/L,其中14种胆汁酸在0.02~4μmol/L、9种胆汁酸在0.2~40μmol/L浓度范围内具有良好的线性(R^(2)≥0.998)。该方法精密度高(RSD≤14.94%,n=6),准确度在82.32%~115.20%之间;稀释10倍后定量的准确度在85.11%~111.37%之间;低、中、高浓度平均加标回收率在85.02%~117.68%之间。方法相对基质效应的RSD≤12.70%,其中21种胆汁酸的绝对基质效应在-18.31%~10.62%之间。 展开更多
关键词 胆汁酸 胃液 超高效液相色谱-三重四极杆质谱
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肠道法尼醇X受体对糖脂代谢调节作用的研究进展 被引量:3
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作者 赵明亮 赵爱华 +1 位作者 郑晓皎 贾伟 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期671-677,共7页
法尼醇X受体(farnesol X receptor,FXR),又称为胆汁酸核受体,是配体依赖性的核转录因子,可分布于体内肝脏、肠道等多个组织器官;胆汁酸是其内源性天然配体。近年有研究表明,肠道FXR对于糖脂代谢调节具有不可或缺的作用,肠道特异性FXR激... 法尼醇X受体(farnesol X receptor,FXR),又称为胆汁酸核受体,是配体依赖性的核转录因子,可分布于体内肝脏、肠道等多个组织器官;胆汁酸是其内源性天然配体。近年有研究表明,肠道FXR对于糖脂代谢调节具有不可或缺的作用,肠道特异性FXR激动剂或抑制剂均可参与体内糖脂代谢调节。该文对近年来报道的肠道FXR在糖脂代谢中的作用进行系统的综述。 展开更多
关键词 法尼醇X受体 胆汁酸 糖脂代谢 激动剂 抑制剂
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代谢物批量定量工具的开发与应用 被引量:1
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作者 卫润民 黄凤杰 +4 位作者 谢燮 池逸 郑晓皎 赵爱华 陈天璐 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期146-150,共5页
目的针对代谢组学研究中的定量分析需求,开发一款可以自动绘制标准曲线和定量计算的软件工具,并采用该工具对一批临床血清样本进行定量计算。方法使用代谢物批量定量工具对临床血清样本的代谢组学检测结果进行定量计算,包括建立标准曲... 目的针对代谢组学研究中的定量分析需求,开发一款可以自动绘制标准曲线和定量计算的软件工具,并采用该工具对一批临床血清样本进行定量计算。方法使用代谢物批量定量工具对临床血清样本的代谢组学检测结果进行定量计算,包括建立标准曲线、自动拟合和手动拟合及样本中代谢物的定量。结果建立40个代谢物的标准曲线,对90例临床血清样本进行定量计算,获得绝对浓度。结论代谢物批量定量工具可以对代谢组学研究中批量样本的大量代谢产物进行快速定量计算。软件具备数据变换和缺失值补充等基本数据预处理功能。该软件的应用有助于提升代谢组学物质定量环节的自动化和标准化程度,有效降低人为因素导致的误差,提高数据分析的效率和准确性。 展开更多
关键词 代谢组学 定量 自动化
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人血浆7α-羟基-4-胆固醇烯-3-酮及胆汁酸的超高效液相色谱-串联质谱定量方法研究 被引量:1
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作者 葛坤 瞿纯 +1 位作者 贾伟 赵爱华 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期443-449,共7页
目的·建立人血浆中7α-羟基-4-胆固醇烯-3-酮(7α-hydroxy-4-cholesten-3-one,C4)以及胆酸(cholic acid,CA)、鹅去氧胆酸(chenodeoxycholic acid,CDCA)的定量方法。方法·采用乙腈提取人血浆中C4、CA、CDCA,利用超高效液相色谱... 目的·建立人血浆中7α-羟基-4-胆固醇烯-3-酮(7α-hydroxy-4-cholesten-3-one,C4)以及胆酸(cholic acid,CA)、鹅去氧胆酸(chenodeoxycholic acid,CDCA)的定量方法。方法·采用乙腈提取人血浆中C4、CA、CDCA,利用超高效液相色谱-串联质谱(ultra-high performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry,UPLC-MS/MS)技术,通过内标校正的标准曲线法定量C4、CA、CDCA含量。结果·经方法学验证,C4、CA、CDCA的检出限(limits of detection,LOD)分别为0.16、0.02、0.04 nmol/L,均具有良好的线性关系(均R2>0.998);重复性的相对标准偏差(relative standard deviation,RSD)均低于3.0%;日内及日间精密度的RSD均小于6%;4℃保存7 d结果稳定,RSD均小于10%;C4、CA和CDCA的平均加标回收率分别为97.7%、113.3%、105.0%。结论·该方法具有较高的检测灵敏度、良好的精密度和稳定性,可用于血浆生物样本的定量检测。 展开更多
关键词 7α-羟基-4-胆固醇烯-3-酮 胆酸 鹅去氧胆酸 超高效液相色谱-串联质谱 定量
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