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piggyBac转座子在哺乳动物中的应用
被引量：
1
1
作者
杨冠恒
曾凡一
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2013年第2期31-35,共5页
转座子(transposon)是存在于生物体基因组中的可移动的DNA片段,能够影响基因的结构和功能,广泛存在于生物演化过程中。转座子通过切离和粘贴机制介导外源基因的插入,是研究基因功能,制备转基因动物及基因治疗的优良载体。目前在哺乳动...
转座子(transposon)是存在于生物体基因组中的可移动的DNA片段,能够影响基因的结构和功能,广泛存在于生物演化过程中。转座子通过切离和粘贴机制介导外源基因的插入,是研究基因功能,制备转基因动物及基因治疗的优良载体。目前在哺乳动物中转座活性较高且研究最多的是"睡美人"转座子和piggyBac(PB)转座子。前者是目前临床前基因治疗研究中使用最为广泛的转座子,但存在剂量抑制效应和转座效率低等缺陷。而PB转座子可克服剂量抑制效应,且转座高效,转基因载量大,因此在哺乳动物中的应用越来越广泛。作者就PB转座子的作用机制、影响因素及在哺乳动物中的应用现状等进行报道。
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关键词
PIGGYBAC
转座子
转基因
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职称材料
2类小鼠胎肝基质细胞的生物学特征及表达谱分析
被引量：
1
2
作者
王沄汉
迟亚男
+4 位作者
杨冠恒
范书玥
马姬
薛燕
曾凡一
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第11期1226-1232,共7页
目的·探究不同类型小鼠胎肝基质细胞在细胞形态、分子特征和生物学功能上的差异。方法·通过体外贴壁培养的方式获取13.5 d小鼠胎肝基质细胞,根据细胞形态及其表面标志物CD44、CD29、CD106、CD45及Sca-1的表达差异,区分不同的...
目的·探究不同类型小鼠胎肝基质细胞在细胞形态、分子特征和生物学功能上的差异。方法·通过体外贴壁培养的方式获取13.5 d小鼠胎肝基质细胞,根据细胞形态及其表面标志物CD44、CD29、CD106、CD45及Sca-1的表达差异,区分不同的细胞类型。使用小鼠基因组阵列4302.0基因芯片在P<0.05、差异倍数>3或<-2的标准下筛选差异基因,并使用IPA(ingenuity pathway analysis)软件对典型信号通路和生物学功能进行分析。结果·依据细胞形态的不同,分离出2类胎肝基质细胞,即短梭形细胞(CD45^+CD106^-CD29^+CD44^+Sca-1-)和成纤维样细胞(CD45^-CD106^+CD29^+CD44^+Sca-1^-)。前者共筛选出1485个高表达基因,主要参与免疫炎症相关的信号通路;后者共筛选出3374个高表达基因,主要参与细胞外基质形成及细胞间黏附。结论·小鼠胎肝基质细胞在生物学特征及功能上具有较强的异质性,在促进造血干细胞的增殖方面可能存在差异。
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关键词
胎肝
基质细胞
造血干细胞
流式细胞术
基因芯片
IPA软件
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职称材料
多能干细胞关键因子Oct4 RNA结合蛋白的分离与鉴定
被引量：
1
3
作者
马姬
郭传亮
+2 位作者
范书玥
薛燕
曾凡一
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期4-10,共7页
目的·分离多能干细胞关键因子Oct4的RNA结合蛋白。方法·培养小鼠胚胎干细胞(R1),从中提取细胞总RNA,反转录为cDNA,PCR扩增Oct4并转录为m RNA。采用链霉素亲和层析和质谱技术筛选候选RNA结合蛋白,采用RNA免疫沉淀技术鉴定候选...
目的·分离多能干细胞关键因子Oct4的RNA结合蛋白。方法·培养小鼠胚胎干细胞(R1),从中提取细胞总RNA,反转录为cDNA,PCR扩增Oct4并转录为m RNA。采用链霉素亲和层析和质谱技术筛选候选RNA结合蛋白,采用RNA免疫沉淀技术鉴定候选RNA结合蛋白。结果·经高效液相色谱-质谱法鉴定和筛选出121个能与Oct4 3'非翻译区(untranslated region,UTR)和Oct45'UTR相结合的RNA结合蛋白,肽段图谱匹配数≥2的有11个。并对其中的7个候选RNA结合蛋白进行了进一步验证,结果显示Oct4可与DSP、SOD1、LMNA、NPM1、PSIP1、NCL和HDGF蛋白发生相互作用,其中HDGF与Oct4结合能力最强。结论·Oct4RNA结合蛋白的鉴定将为Oct4的调控机制提供一定理论依据,为后续其功能研究提供基础。
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关键词
OCT4
RNA结合蛋白
胚胎干细胞
RNA免疫沉淀
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职称材料
题名
piggyBac转座子在哺乳动物中的应用
被引量：
1
1
作者
杨冠恒
曾凡一
机构
上海
市
儿童
医院
上海交通大学附属儿童医院医学遗传研究所
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2013年第2期31-35,共5页
基金
国家"863"计划(2011AA020116)
国家杰出青年科学基金(81125003)
+2 种基金
上海市重点学科建设项目(S30201)
国家"973"计划(2010CB945200)
卫生部国家临床重点专科建设项目
文摘
转座子(transposon)是存在于生物体基因组中的可移动的DNA片段,能够影响基因的结构和功能,广泛存在于生物演化过程中。转座子通过切离和粘贴机制介导外源基因的插入,是研究基因功能,制备转基因动物及基因治疗的优良载体。目前在哺乳动物中转座活性较高且研究最多的是"睡美人"转座子和piggyBac(PB)转座子。前者是目前临床前基因治疗研究中使用最为广泛的转座子,但存在剂量抑制效应和转座效率低等缺陷。而PB转座子可克服剂量抑制效应,且转座高效,转基因载量大,因此在哺乳动物中的应用越来越广泛。作者就PB转座子的作用机制、影响因素及在哺乳动物中的应用现状等进行报道。
关键词
PIGGYBAC
转座子
转基因
Keywords
piggyBac
transposon
transgene
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
2类小鼠胎肝基质细胞的生物学特征及表达谱分析
被引量：
1
2
作者
王沄汉
迟亚男
杨冠恒
范书玥
马姬
薛燕
曾凡一
机构
上海交通大学
基础
医学
院组织胚胎学与
遗传
发育学系
上海交通大学
附属
儿童
医院
上海
医学
遗传
研究所
出处
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第11期1226-1232,共7页
基金
国家重点基础研究发展计划(2014CB964701,2014CB964703)
国家自然科学基金(31871484)
+1 种基金
上海市“重中之重”临床重点学科建设项目(2017ZZ02019)
上海市自然科学基金(16ZR1428600)~~
文摘
目的·探究不同类型小鼠胎肝基质细胞在细胞形态、分子特征和生物学功能上的差异。方法·通过体外贴壁培养的方式获取13.5 d小鼠胎肝基质细胞,根据细胞形态及其表面标志物CD44、CD29、CD106、CD45及Sca-1的表达差异,区分不同的细胞类型。使用小鼠基因组阵列4302.0基因芯片在P<0.05、差异倍数>3或<-2的标准下筛选差异基因,并使用IPA(ingenuity pathway analysis)软件对典型信号通路和生物学功能进行分析。结果·依据细胞形态的不同,分离出2类胎肝基质细胞,即短梭形细胞(CD45^+CD106^-CD29^+CD44^+Sca-1-)和成纤维样细胞(CD45^-CD106^+CD29^+CD44^+Sca-1^-)。前者共筛选出1485个高表达基因,主要参与免疫炎症相关的信号通路;后者共筛选出3374个高表达基因,主要参与细胞外基质形成及细胞间黏附。结论·小鼠胎肝基质细胞在生物学特征及功能上具有较强的异质性,在促进造血干细胞的增殖方面可能存在差异。
关键词
胎肝
基质细胞
造血干细胞
流式细胞术
基因芯片
IPA软件
Keywords
fetal liver
stromal cell
hematopoietic stem cell(HSC)
flow cytometry
microarray
ingenuity pathway analysis(IPA)
分类号
Q291 [生物学—细胞生物学]
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职称材料
题名
多能干细胞关键因子Oct4 RNA结合蛋白的分离与鉴定
被引量：
1
3
作者
马姬
郭传亮
范书玥
薛燕
曾凡一
机构
上海交通大学
基础
医学
院组织胚胎学与
遗传
发育学系
上海交通大学
附属
儿童
医院
上海
医学
遗传
研究所
上海
市胚胎与生殖工程重点实验室国家卫生和健康委员会
医学
胚胎分子生物学重点实验室
出处
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期4-10,共7页
基金
国家重点科学研究计划(2014CB964701
2014CB964703)
+2 种基金
国家自然科学基金(31871484)
上海市"重中之重"临床医学中心和临床重点学科建设项目(2017ZZ02019)
上海市自然科学基金(16ZR1428600)~~
文摘
目的·分离多能干细胞关键因子Oct4的RNA结合蛋白。方法·培养小鼠胚胎干细胞(R1),从中提取细胞总RNA,反转录为cDNA,PCR扩增Oct4并转录为m RNA。采用链霉素亲和层析和质谱技术筛选候选RNA结合蛋白,采用RNA免疫沉淀技术鉴定候选RNA结合蛋白。结果·经高效液相色谱-质谱法鉴定和筛选出121个能与Oct4 3'非翻译区(untranslated region,UTR)和Oct45'UTR相结合的RNA结合蛋白,肽段图谱匹配数≥2的有11个。并对其中的7个候选RNA结合蛋白进行了进一步验证,结果显示Oct4可与DSP、SOD1、LMNA、NPM1、PSIP1、NCL和HDGF蛋白发生相互作用,其中HDGF与Oct4结合能力最强。结论·Oct4RNA结合蛋白的鉴定将为Oct4的调控机制提供一定理论依据,为后续其功能研究提供基础。
关键词
OCT4
RNA结合蛋白
胚胎干细胞
RNA免疫沉淀
Keywords
Oct4
RNA binding protein
embryonic stem cell
RNA immunoprecipitation
分类号
R329.2 [医药卫生—人体解剖和组织胚胎学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
piggyBac转座子在哺乳动物中的应用
杨冠恒
曾凡一
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2013
1
在线阅读
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职称材料
2
2类小鼠胎肝基质细胞的生物学特征及表达谱分析
王沄汉
迟亚男
杨冠恒
范书玥
马姬
薛燕
曾凡一
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
多能干细胞关键因子Oct4 RNA结合蛋白的分离与鉴定
马姬
郭传亮
范书玥
薛燕
曾凡一
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
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