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蛋白质指纹图谱技术在肺癌分子标志物研究中的应用 被引量:1
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作者 沙慧芳 叶剑定 +4 位作者 孙强玲 杨晓华 包国良 冯久贤 龚乐罗 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期1178-1181,1195,共5页
目的分析肺癌与肺部良性疾病及正常人血浆蛋白质指纹图谱的变化,建立肺癌血浆标志物诊断模型。方法应用蛋白质指纹图谱(SELDI-TOF-Ms)技术检测108例肺癌患者、40例肺部良性疾病患者和22例正常人血浆标本,采用层次聚类分析和主成分分析... 目的分析肺癌与肺部良性疾病及正常人血浆蛋白质指纹图谱的变化,建立肺癌血浆标志物诊断模型。方法应用蛋白质指纹图谱(SELDI-TOF-Ms)技术检测108例肺癌患者、40例肺部良性疾病患者和22例正常人血浆标本,采用层次聚类分析和主成分分析建立决策树模型,应用该模型盲筛21例肺部良性疾病和47例Ⅰ期肺癌。结果筛选到23个差异蛋白峰(P<0.001)。盲筛分析显示决策树模型诊断敏感性和特异性分别为72.34%和71.43%,阳性预测值和阴性预测值分别为85.0%和78.95%,诊断正确性为72.06%。结论应用SELDI-TOF-Ms技术初步建立的蛋白质模型为肺癌的早期诊断提供了新的技术平台。 展开更多
关键词 蛋白质指纹图谱 血浆 肺癌 蛋白质芯片 分子标志物
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应用差异凝胶电泳及质谱技术筛选肺癌患者血浆差异蛋白 被引量:3
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作者 沙慧芳 孙强玲 +6 位作者 杨晓华 储天晴 谢银银 鲁静 包国良 冯久贤 龚乐罗 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期399-403,共5页
目的建立健康者、肺部炎症患者和肺癌患者的血浆蛋白表达谱,寻找与肺癌早期发生相关的差异蛋白。方法应用差异凝胶电泳(DIGE)和基质辅助激光解吸飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)对健康者、肺部炎症患者和Ⅰ期肺癌患者血浆进行蛋白质组学比... 目的建立健康者、肺部炎症患者和肺癌患者的血浆蛋白表达谱,寻找与肺癌早期发生相关的差异蛋白。方法应用差异凝胶电泳(DIGE)和基质辅助激光解吸飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)对健康者、肺部炎症患者和Ⅰ期肺癌患者血浆进行蛋白质组学比较研究,寻找肺癌相关差异蛋白。结果应用DIGE进行分离后,成功获得了蛋白质组分辨率高、重复性好的双向凝胶电泳图谱;DeCyder 6.5软件分析获得差异大于2倍的蛋白质点共有72个;质谱鉴定去冗余后确定了12种蛋白质,其中7种与肿瘤相关,分别为酰基辅酶A合成酶家族成员3、抗血小板膜糖蛋白Ⅰb特异性抗体、γ-纤维蛋白原、4型血清淀粉样蛋白A、补体因子H、钙结合微丝蛋白、载脂蛋白Ⅰ。结论应用DIGE及MALDI-TOF-MS分离并初步鉴定了12种蛋白质,筛选出7种在肺癌患者血浆中高表达的肿瘤相关蛋白。 展开更多
关键词 差异凝胶电泳 蛋白组学 血浆 肺癌
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紫杉醇耐药与敏感细胞的差异表达蛋白分析 被引量:3
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作者 孙强玲 杨晓华 +6 位作者 储天晴 谢银银 鲁静 包国良 冯久贤 龚乐罗 沙慧芳 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期509-512,共4页
目的比较人肺腺癌细胞系A549与肺腺癌紫杉醇耐药细胞系A549-Taxol的差异表达蛋白。方法提取A549和A549-Taxol总蛋白,应用双向凝胶电泳技术(2-DE)分离,ImageMaster 5.0软件分析并筛选出两者间差异表达的蛋白点,质谱分析加以鉴定。结果获... 目的比较人肺腺癌细胞系A549与肺腺癌紫杉醇耐药细胞系A549-Taxol的差异表达蛋白。方法提取A549和A549-Taxol总蛋白,应用双向凝胶电泳技术(2-DE)分离,ImageMaster 5.0软件分析并筛选出两者间差异表达的蛋白点,质谱分析加以鉴定。结果获得分辨率高且重复性好的肺腺癌耐紫杉醇细胞系及亲代细胞系2-DE图谱。ImageMaster软件分析差异大于2倍的蛋白质点共有80个,其中33个在耐药细胞系中上调,47个下调。质谱分析鉴定出19种差异表达蛋白,其中A549-Taxol中上调蛋白11种,涉及细胞骨架蛋白、代谢酶类、分子伴侣和信号转导相关蛋白质。结论应用2-DE技术整体展示了紫杉醇耐药细胞系及敏感细胞系的蛋白表达谱,质谱法鉴定的差异蛋白为进一步从多因素角度研究紫杉醇耐药机制提供了新线索。 展开更多
关键词 双向凝胶电泳 蛋白质组学 肺癌 紫杉醇耐药
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紫杉醇耐药细胞与敏感细胞分泌蛋白差异凝胶电泳分析 被引量:2
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作者 孙强玲 杨晓华 +3 位作者 鲁静 谢银银 储天晴 沙慧芳 《中国肺癌杂志》 CAS 2009年第7期735-740,共6页
背景与目的紫杉醇是用于肺癌临床一线治疗的作用于微管蛋白的化疗药物,而耐药是影响其疗效的关键因素。本研究应用蛋白组学技术整体比较紫杉醇耐药细胞与敏感细胞分泌蛋白表达谱,以期发现肺癌紫杉醇耐药相关分泌蛋白标志物,为临床选择... 背景与目的紫杉醇是用于肺癌临床一线治疗的作用于微管蛋白的化疗药物,而耐药是影响其疗效的关键因素。本研究应用蛋白组学技术整体比较紫杉醇耐药细胞与敏感细胞分泌蛋白表达谱,以期发现肺癌紫杉醇耐药相关分泌蛋白标志物,为临床选择有针对性的化疗药物提供依据。方法收集A549亲代及耐药细胞培养液中的蛋白,应用差异凝胶电泳(DIGE)进行分离,Decyder 6.5软件分析后获得的差异蛋白点通过基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)进行鉴定。结果应用DIGE进行分离后,成功获得了蛋白质组分辨率高、重复性好的双向凝胶电泳图谱,Decyder 6.5软件分析获得差异>2倍以上的蛋白质点共有76个,经质谱鉴定了19种蛋白,鉴定的蛋白涉及代谢酶类、细胞外基质降解酶类、粘附分子、细胞因子和信号转导相关蛋白质。结论本研究首次应用双向电泳技术整体展示了紫杉醇耐药细胞株及敏感细胞株的分泌蛋白表达谱,并分析、鉴定、筛选出与紫杉醇耐药相关的差异分泌蛋白。该研究为非小细胞肺癌血清耐药标志物的筛选提供了新的方法和候选分子。 展开更多
关键词 差异凝胶电泳 蛋白组学 分泌蛋白 紫杉醇 肺肿瘤
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