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基于核酸保护原理的 DNA芯片检测技术 被引量:5
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作者 曾而良 刘建华 林志新 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期88-92,共5页
制备出 3′-末端与载玻片交联、 5′-末端用 32P标记的检测 DNA的芯片,方法以化学法合成了3′-末端为尿嘧啶核糖的寡聚脱氧核糖核苷酸片段。用 32P标记寡核苷酸的 5′-末端,经过高碘酸氧化后与玻璃基片表面的脂肪胺基缩合,并用硼氢... 制备出 3′-末端与载玻片交联、 5′-末端用 32P标记的检测 DNA的芯片,方法以化学法合成了3′-末端为尿嘧啶核糖的寡聚脱氧核糖核苷酸片段。用 32P标记寡核苷酸的 5′-末端,经过高碘酸氧化后与玻璃基片表面的脂肪胺基缩合,并用硼氢化钠还原,制成寡核苷酸 3′-末端与玻片共价交联、 5′-末端为同位素标记的 DNA芯片。将该芯片与液相中的核酸片段杂交,再用核酸酶 S1酶切。结果当液相中的核酸与玻片上共价交联的寡核苷酸片段产生特异性杂交配对时,核酸酶 S1不能酶切玻片上的寡核苷酸片段,且玻片上被保护的寡核苷酸量与液相中的与它配对的核酸量之间呈线性相关( r=0.9967,P< 0.001, n=7)。结论上述检测法可以定性和定量地检测液相中的核酸。由于该法制备的 DNA芯片各个位点的 DNA探针的含量为已知,待测的核酸样品无需进行同位素或荧光标记,操作简便,适用于对样品的 DNA或 RNA进行检测。 展开更多
关键词 DNA芯片 核酸保护 检测 RNA
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家蚕幼虫中肠细菌群落多样性的PCR-DGGE和16S rDNA文库序列分析 被引量:57
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作者 相辉 李木旺 +3 位作者 赵勇 赵立平 张月华 黄勇平 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期222-233,共12页
采用基于16S rDNA的变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)和16S rDNA文库序列分析的手段,研究了重要经济昆虫家蚕Bombyxmori2个品系——专食性品系C108和广食性品系SCN2幼虫中肠内的细菌群落多样性,同时还... 采用基于16S rDNA的变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)和16S rDNA文库序列分析的手段,研究了重要经济昆虫家蚕Bombyxmori2个品系——专食性品系C108和广食性品系SCN2幼虫中肠内的细菌群落多样性,同时还探讨了食料对家蚕中肠内细菌群落结构的影响。文库序列分析表明,PCR扩增得到的16S rDNA基因代表了家蚕中肠内的41种细菌系统发育型(phylotype),大多数属于Proteobacteria,其次是Lactobacillales。此外,还有少数属于Deinococcus-Thermus、Bacillales、Clostridiales和Actinobacteria,尚有5种系统发育型不能确定其所属类型。家蚕的这2个品系中,肠球菌属Enterococcus是其中肠细菌的优势菌群,栖热菌属Thermus是次优势菌群。优势菌肠球菌属的组成在品系和不同食料喂养条件下有着一定的变化,无桑饲料喂养条件下SCN2品系中肠内还出现了新的次优势菌葡萄球菌(Staphylococcus)。DGGE图谱显示家蚕低龄幼虫和高龄幼虫肠道细菌格局存在差异,推测可能与其发育期生理状态的差异有关。本研究结果提示家蚕肠道特殊菌群的出现可能与其特殊的食性有一定的关系,食料改变、生长受阻后肠道微生态平衡也发生变化。 展开更多
关键词 家蚕 专食性 广食性 中肠细菌 变性梯度凝胶电泳 16S rDNA文库分析
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基于电化学法的农药污染检测专用软件设计 被引量:1
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作者 洪思迁 张素 +2 位作者 唐祝昭 武爱波 陈亚珠 《中国测试》 CAS 2010年第6期57-61,共5页
为实现农药污染定量检测,通过酶水解底物发生电化学反应产生电子,用电信号减弱的比率量化酶活性被农药抑制的程度,利用抑制率与农药浓度之间的量化关系来估计农药浓度。根据这一方法设计农药污染检测专用软件,控制电化学工作站提取酶电... 为实现农药污染定量检测,通过酶水解底物发生电化学反应产生电子,用电信号减弱的比率量化酶活性被农药抑制的程度,利用抑制率与农药浓度之间的量化关系来估计农药浓度。根据这一方法设计农药污染检测专用软件,控制电化学工作站提取酶电极传感器信号,测量原始酶和被样品抑制的酶水解底物产生的电流信号大小并计算抑制率,最后搜索、比对数据库并显示样品的农药污染检测结果。利用敌敌畏与克百威两种农药配置不同浓度的样品进行实验,在检测结果判定的主要浓度范围时,专用软件的测量误差在10%以内,以抑制率大于50%作为样品呈阳性的条件,单次检测的假阴性概率小于11.1%。 展开更多
关键词 电化学生物传感器 软件 农药 检测 抑制率
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中华眼镜蛇短链神经毒素cDNA的克隆及在大肠杆菌中的表达 被引量:1
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作者 蔡勤 何志勇 +1 位作者 龚毅 杨胜利 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1999年第5期1-4,共4页
利用RT-PCR技术从中华眼镜蛇毒腺组织中成功地克隆了短链神经毒素CDNA。测序结果表明,该基因开放阅读框架编码83个氨基酸残基,其中对个为信号肽,成熟肽为62个氨基酸残基。该基因与GenBank报道的相同物种的神经毒素基因有相当的同源... 利用RT-PCR技术从中华眼镜蛇毒腺组织中成功地克隆了短链神经毒素CDNA。测序结果表明,该基因开放阅读框架编码83个氨基酸残基,其中对个为信号肽,成熟肽为62个氨基酸残基。该基因与GenBank报道的相同物种的神经毒素基因有相当的同源性,不同物种之间的信号肽序列十分保守。将短链神经毒素CDNA再经PCR扩增除去信号肽序列,克隆到pT7ZZ表达质粒中,转化E.coliBL21(DE3)后,经IPTG诱导可高效表达分子量为23kDa②左右的融合蛋白。表达产物占菌体总蛋白的25%左右。 展开更多
关键词 神经毒素 蛇毒 表达 中华眼镜蛇毒 CDNA 克隆
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中国仓鼠卵细胞二氢叶酸还原酶基因在大肠杆菌中的高效表达
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作者 蔡勤 徐晋麟 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1996年第5期27-30,共4页
本工作采用PCR法将哺乳动物表达载体pSVA75上的中国白鼠卵细胞(CHO)二氧叶酸还原酶基因扩增后插入到原核生物高效表达质粒pBV221中,构建成胞内表达载体pDHFR—1,经转化大肠杆菌(E.coliDH5α)的后获高效表达,表达量占总蛋白量的1... 本工作采用PCR法将哺乳动物表达载体pSVA75上的中国白鼠卵细胞(CHO)二氧叶酸还原酶基因扩增后插入到原核生物高效表达质粒pBV221中,构建成胞内表达载体pDHFR—1,经转化大肠杆菌(E.coliDH5α)的后获高效表达,表达量占总蛋白量的12.2%.利用这种方法不仅为深入研究该酶的结构和功能的关系及其新生肽键的折叠提供丰富的实验材料,而且也有希望成为较好的外源DNA原核扩增表达系统。 展开更多
关键词 基因表达 二氢叶酸还原酶 中国仓鼠卵细胞
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