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题名土壤微生物在不同纤维素富集条件下的多样性
被引量：5
- 1
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作者
张晶
张晓君
张梦晖
陈小云
赵立平
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机构
上海交通大学生命科学技术学院
南京农业大学资环学院
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出处
《农业环境科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第4期1449-1453,共5页
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基金
上海市农委攻关项目(沪农科攻字(2003)第15-2号)
教育部留学回国人员科研启动基金资助项目
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文摘
应用PCR-DGGE分子技术并结合聚类分析、主成分分析(PCA)等统计分析方法,对土壤微生物在几种不同的纤维素富集培养条件下的多样性进行分析。结果发现,不同的纤维素富集培养条件对土壤微生物的多样性有不同程度的影响:CMC和PCS两种培养基在50℃时所回收的土壤微生物的菌群结构和组成比较相似;纤维素富集培养基(J培养基)同CMC两种培养基所回收的土壤微生物菌群结构和组成却有很大的差异;50℃条件下所回收的土壤微生物其菌群结构和组成同28℃、37℃两个温度相比也相差较大。这一结果表明,组合不同的纤维素富集培养条件,结合分子和统计分析,可以对土壤样品在不同纤维素富集培养条件下微生物的多样性进行检测和评估,同时还可以为分离目标菌时富集培养条件的选择提供很有价值的参考。
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关键词
土壤微生物
纤维素富集培养
DGGE
聚类分析
主成份分析(PCA)
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Keywords
soil microbe
cellulose enrichment conditions
DGGE
Cluster analysis
PCA
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分类号
S154.36
[农业科学—土壤学]
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题名对降解喹啉的厌氧生物反应器中重要功能菌群的鉴定
被引量：4
- 2
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作者
刘彬彬
张峰
冯晓西
刘勇弟
张晓君
赵立平
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机构
上海交通大学生命科学与技术学院微生物分子生态学与生态基因组学实验室
华东理工大学资源与环境工程学院
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出处
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第5期1390-1395,共6页
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基金
国家863发展计划资助项目(2001AA214131)
国家自然科学基金资助项目(30470061)~~
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文摘
通过把微生物区系组成的分子水平的动态变化情况与微生物群落的整体功能变化相关联,鉴定重要的功能类群是微生物分子生态学研究的一个重要的策略。应用分子生物学的方法,对一个实验室规模的用于降解喹啉的厌氧反应器生物膜样品的微生物区系组成变化进行解析,找出可能的主要功能菌。通过DGGE对反应器的种子污泥和运行稳定的厌氧生物膜反应器的微生物区系组成进行了对比分析,并对主要的优势条带进行了分子鉴定。同时对以上两个样品构建16SrDNA克隆文库,通过统计学分析对克隆文库的有效性进行验证,并对文库进行测序分析。DGGE条带及克隆文库的序列分析均表明,在驯化过程中,GammaProteobacteria亚纲与Desulfobacterpostgatei种的微生物显著增加,这种动态变化表明这些细菌可能是在厌氧条件下对喹啉的降解起关键作用的微生物。
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关键词
生物膜
厌氧反应器
DGGE
16S
rDNA克隆文库
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Keywords
biofilm
anaerobic reactor
DGGE
16S rDNA clone library
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分类号
X703
[环境科学与工程—环境工程]
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题名仔猪粪样中大肠杆菌肠毒素基因的检测
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作者
孙磊
赵立平
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机构
上海交通大学生命科学技术学院微生物分子生态学与生态基因组学实验室
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出处
《动物医学进展》
CSCD
2003年第6期89-91,共3页
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文摘
本实验用针对大肠杆菌肠毒素基因 L T( heat-labile)、STa( heat-stable )、STb( heat-stable )的引物直接对从猪场采集的腹泻仔猪的粪便总 DNA进行扩增。结果表明只有 STb基因被检测到。把检测到的 DNA片段克隆测序 ,得到 1 75bp的片段 ,与 Gen Bank中大肠杆菌热稳定性肠毒素基因 STb 1 0 0 %同源。通过 South-ern blot,STb基因也能够被特异、准确、灵敏地检测出来。本实验直接检测仔猪粪样 DNA中的肠毒素基因的片段 ,为致病性大肠杆菌的检测提供了一种更快捷的方法。
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关键词
仔猪
粪样
大肠杆菌
肠毒素
基因检测
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Keywords
Escherichia coli enterotoxin gene
piglet
STb gene
fecal sample total DNA
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分类号
S858.28
[农业科学—临床兽医学]
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题名一种快速的酸奶质量跟踪监测检验新方法
被引量：2
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作者
李武
王凌华
张晓君
庞小燕
赵立平
赵勇
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机构
上海交通大学生命科学技术学院微生物分子生态学与生态基因组学实验室
南京农业大学微生物学系
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出处
《中国乳业》
2005年第9期44-47,共4页
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文摘
分析酸奶中的菌种组成是酸奶质量控制的重要指标。本文用PCR-DGGE(denaturinggra-dientgelelectrophoresis,变性梯度凝胶电泳)指纹图谱技术对市售某品牌酸奶在1个月内进行了动态监测,共收集了6个生产批次的18个酸奶样品,通过建立16SrDNAV3区PCR-DGGE分析、DGGE图谱条带割胶回收测序等一套完整的检测评价方法,结合常规分离培养方法,对样品微生物组成及其稳定性进行跟踪监测。结果显示,所有供试样品在整个动态监测期内DGGE指纹图谱都出现2条带,显示其微生物组成比较稳定,割胶回收测序结果表明其微生物组成与厂家标注完全一致,分别为Lacto-bacillusdelbrueckiisubsp.bulgaricus(保加利亚乳杆菌)和Streptococcusthermophilus(嗜热链球菌)。分离计数结果表明前者比后者低3个数量级,二者的DGGE条带亮度也有显著差别。本研究用菌种组成及其稳定性两个指标对酸奶样品质量进行评价,建立了DGGE评价方法,结果表明,该技术可以作为酸奶质量控制和动态监测的快速简便的新方法。
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关键词
酸奶
DGGE(denaturing
gradient
gel
electrophoresis
变性梯度凝胶电泳)指纹图谱
分离培养
质量控制
跟踪监测
LACTOBACILLUS
指纹图谱技术
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分类号
TS252.7
[轻工技术与工程—农产品加工及贮藏工程]
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