期刊导航
期刊开放获取
上海教育软件发展有限公..
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
2
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
关于副本交换分子动力学模拟复杂化学反应的研究（英文）
1
作者
辛亮
孙淮
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2018年第10期1179-1188,共10页
本文研究用温度副本交换分子动力学(T-REMD)和哈密顿副本交换分子动力学(H-REMD)方法模拟复杂化学反应的问题。使用具有不同活化能和反应能的简单置换反应模型,我们检验了上述两种方法用来预测反应平衡产物的效率和应用范围。T-REMD方...
本文研究用温度副本交换分子动力学(T-REMD)和哈密顿副本交换分子动力学(H-REMD)方法模拟复杂化学反应的问题。使用具有不同活化能和反应能的简单置换反应模型,我们检验了上述两种方法用来预测反应平衡产物的效率和应用范围。T-REMD方法对具有适度活化能(约<20 kcal·mol^(-1))或者反应能量(<3 kcal·mol^(-1))的放热反应是有效的。由于在相空间的不完整采样,对于同时具有高活化能和反应能量的反应其模拟效率有严重障碍,并且对于吸热反应问题更为显着。另一方面,H-REMD对一系列具有不同活化能的反应能的模型表现出色,与T-REMD相比,H-REMD可以使用更少的副本获得优异的结果。
展开更多
关键词
副本交换
分子动力学
复杂反应
温度
哈密顿
在线阅读
下载PDF
职称材料
一种基于莫顿码及镜像编码的平衡八叉树模型
被引量：
1
2
作者
袁瑶
徐骏
顾剑锋
《计算力学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期467-473,共7页
在接触分析和动画模拟等网格规模庞大、需要实时更新的应用场景下,普遍采用莫顿码实现包围盒层次树结构的快速重构。但现有的层次树由于结构平衡性差,普遍存在搜索效率不稳定的问题,为此本文在莫顿码法的基础上提出了一种兼顾构建与搜...
在接触分析和动画模拟等网格规模庞大、需要实时更新的应用场景下,普遍采用莫顿码实现包围盒层次树结构的快速重构。但现有的层次树由于结构平衡性差,普遍存在搜索效率不稳定的问题,为此本文在莫顿码法的基础上提出了一种兼顾构建与搜索效率的平衡八叉树模型BOT树(Balanced Octree)。设计了镜像编码来保证树的上层节点均有8个分支,且同层树节点所含三角面数之差不超过1。实际算例表明,BOT树与现有模型OIOT树在CUDA并行框架下对比,构建加速比最高可达1.29×,且网格规模越大,BOT树构建效率的优势越明显。同时,与OIOT树相比BOT树的筛除率更高,在凸体接触和边缘接触算例中加速比分别达到1.13×和1.06×。
展开更多
关键词
层次包围盒树
平衡八叉树
cuda并行框架
莫顿码
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
关于副本交换分子动力学模拟复杂化学反应的研究（英文）
1
作者
辛亮
孙淮
机构
上海交通大学
化学化工学院
吉林
大学
无机合成与制备化学国家重点实验室
上海交通大学材料基因组联合研究中心
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2018年第10期1179-1188,共10页
基金
supported by the National Natural Science Foundation of China(21073119,21173146,21473112)
National Basic Research Program of China(973)(2014CB239702)~~
文摘
本文研究用温度副本交换分子动力学(T-REMD)和哈密顿副本交换分子动力学(H-REMD)方法模拟复杂化学反应的问题。使用具有不同活化能和反应能的简单置换反应模型,我们检验了上述两种方法用来预测反应平衡产物的效率和应用范围。T-REMD方法对具有适度活化能(约<20 kcal·mol^(-1))或者反应能量(<3 kcal·mol^(-1))的放热反应是有效的。由于在相空间的不完整采样,对于同时具有高活化能和反应能量的反应其模拟效率有严重障碍,并且对于吸热反应问题更为显着。另一方面,H-REMD对一系列具有不同活化能的反应能的模型表现出色,与T-REMD相比,H-REMD可以使用更少的副本获得优异的结果。
关键词
副本交换
分子动力学
复杂反应
温度
哈密顿
Keywords
Replica exchange
Molecular dynamics
Complex reaction
Temperature
Hamilton
分类号
O645 [理学—物理化学]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
一种基于莫顿码及镜像编码的平衡八叉树模型
被引量：
1
2
作者
袁瑶
徐骏
顾剑锋
机构
上海交通大学
材料
改性与数值模拟
研究
所
上海交通大学材料基因组联合研究中心
出处
《计算力学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期467-473,共7页
基金
国家重点研发计划(2018YFA0702900)资助项目.
文摘
在接触分析和动画模拟等网格规模庞大、需要实时更新的应用场景下,普遍采用莫顿码实现包围盒层次树结构的快速重构。但现有的层次树由于结构平衡性差,普遍存在搜索效率不稳定的问题,为此本文在莫顿码法的基础上提出了一种兼顾构建与搜索效率的平衡八叉树模型BOT树(Balanced Octree)。设计了镜像编码来保证树的上层节点均有8个分支,且同层树节点所含三角面数之差不超过1。实际算例表明,BOT树与现有模型OIOT树在CUDA并行框架下对比,构建加速比最高可达1.29×,且网格规模越大,BOT树构建效率的优势越明显。同时,与OIOT树相比BOT树的筛除率更高,在凸体接触和边缘接触算例中加速比分别达到1.13×和1.06×。
关键词
层次包围盒树
平衡八叉树
cuda并行框架
莫顿码
Keywords
BVH
balanced octree
cuda
Morton code
分类号
TP183 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
关于副本交换分子动力学模拟复杂化学反应的研究（英文）
辛亮
孙淮
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2018
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
一种基于莫顿码及镜像编码的平衡八叉树模型
袁瑶
徐骏
顾剑锋
《计算力学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部
