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漆酶与酚类模式底物的结合及反应活性的理论研究
被引量:
7
1
作者
齐艳兵
朱吉人
+5 位作者
孙尧金
杜芸
褚建君
石婷
赵一雷
王晓雷
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期776-783,共8页
通过生物信息学分析、分子动力学模拟及量子化学计算,对21种邻对位取代酚类模式底物与漆酶的结合能力以及反应活性进行了探讨.生物信息学结构比对分析发现漆酶的活性口袋含有Asp/Glu206,Asn/His208,Asn264,Gly392和His458等保守的氨基...
通过生物信息学分析、分子动力学模拟及量子化学计算,对21种邻对位取代酚类模式底物与漆酶的结合能力以及反应活性进行了探讨.生物信息学结构比对分析发现漆酶的活性口袋含有Asp/Glu206,Asn/His208,Asn264,Gly392和His458等保守的氨基酸残基(氨基酸残基编号以Trametes versicolor漆酶为例,PDB:1KYA);采用MM-GBSA方法计算了21种酚类模式底物与T.versicolor漆酶的结合自由能.分子力学计算结果表明,漆酶与底物的结合力主要来自Asp206和Asn264等残基与底物分子形成的分子间氢键,并且Phe265残基和酚类底物的芳香环形成π-π相互作用.量子化学计算表明,芳环上取代基的推拉电子效应显著影响协同电子转移的底物去质子化过程,其中推电子能力较强的—NH2,—OH,—OCH3和—CH CHCH3等基团能够明显增强酚羟基反应活性,而吸电子的—CONH2和—Cl则具有相反的效应.
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关键词
漆酶
结合力
反应活性
分子力学
量子化学
酚类底物
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职称材料
题名
漆酶与酚类模式底物的结合及反应活性的理论研究
被引量:
7
1
作者
齐艳兵
朱吉人
孙尧金
杜芸
褚建君
石婷
赵一雷
王晓雷
机构
上海交通大学微生物代谢国家重点实验室及生命科学技术学院
上海
中学
出处
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期776-783,共8页
基金
国家'八六三'计划(批准号:2012AA020403)
国家'九七三'计划(批准号:2012CB721005
+10 种基金
2013CB966802)
国家自然科学基金(批准号:21377085
21303101
31121064
J1210047)
教育部新世纪优秀人才(批准号:12-0354)
高等学校博士学科点专项科研基金(批准号:20100073120062)
教育部留学回国人员科研启动基金
上海市浦江人才计划(批准号:10 PJ1405200)
'东方学者'人才计划(批准号:0900000171)
'上海交通大学-上海中学科技创新项目'资助~~
文摘
通过生物信息学分析、分子动力学模拟及量子化学计算,对21种邻对位取代酚类模式底物与漆酶的结合能力以及反应活性进行了探讨.生物信息学结构比对分析发现漆酶的活性口袋含有Asp/Glu206,Asn/His208,Asn264,Gly392和His458等保守的氨基酸残基(氨基酸残基编号以Trametes versicolor漆酶为例,PDB:1KYA);采用MM-GBSA方法计算了21种酚类模式底物与T.versicolor漆酶的结合自由能.分子力学计算结果表明,漆酶与底物的结合力主要来自Asp206和Asn264等残基与底物分子形成的分子间氢键,并且Phe265残基和酚类底物的芳香环形成π-π相互作用.量子化学计算表明,芳环上取代基的推拉电子效应显著影响协同电子转移的底物去质子化过程,其中推电子能力较强的—NH2,—OH,—OCH3和—CH CHCH3等基团能够明显增强酚羟基反应活性,而吸电子的—CONH2和—Cl则具有相反的效应.
关键词
漆酶
结合力
反应活性
分子力学
量子化学
酚类底物
Keywords
Laccase
Affinity
Reactivity
Molecular modeling
Quantum chemistry
Phenolic substrate
分类号
O641.3 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
漆酶与酚类模式底物的结合及反应活性的理论研究
齐艳兵
朱吉人
孙尧金
杜芸
褚建君
石婷
赵一雷
王晓雷
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014
7
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